趙 蘭,劉詩(shī)夢(mèng),秦漢雄,王亞南,樊占青,閔偉紅
(吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,小麥和玉米深加工國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室,吉林 長(zhǎng)春 130118)
甲硫氨酸是生命體不可缺少的唯一含硫必需氨基酸,作為多種重要代謝物質(zhì)的合成前體,參與機(jī)體細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)甲基和轉(zhuǎn)硫基過程,對(duì)生物體新陳代謝起重要作用[1]。由于動(dòng)物體內(nèi)無法自身合成,必須從外部食物中獲取,因此被廣泛應(yīng)用于食品、飼料、醫(yī)藥等多個(gè)領(lǐng)域,需求量巨大且附加值較高[2]。目前,甲硫氨酸的生產(chǎn)方法主要為化學(xué)合成法,該方法存在污染大、耗能高且產(chǎn)物不易分離等諸多不利因素[3],國(guó)內(nèi)外研究學(xué)者及生產(chǎn)者不斷尋求環(huán)境友好的微生物發(fā)酵法替代此方法生產(chǎn)。
但目前微生物發(fā)酵法難以實(shí)現(xiàn)工業(yè)化生產(chǎn),其主要原因?yàn)槲⑸矬w內(nèi)合成的代謝系統(tǒng)較為復(fù)雜,受到嚴(yán)格的調(diào)控作用,使得碳流競(jìng)爭(zhēng)激烈無法為甲硫氨酸提供足夠碳骨架[4-5]。甲硫氨酸合成途徑中的關(guān)鍵酶,受到副產(chǎn)物賴氨酸及蘇氨酸嚴(yán)格反饋抑制及反饋?zhàn)瓒?,影響了甲硫氨酸的合成[6]。需要改造具有解除末端氨基酸抑制作用的高酶活性突變菌,促使更多的碳流量進(jìn)入甲硫氨酸合成途徑。研究學(xué)者已相繼解析了合成途徑關(guān)鍵酶天冬氨酸激酶(aspartate kinase,AK)及高絲氨酸脫氫酶(homoserine dehydrogenase,HSD)的晶體結(jié)構(gòu)、抑制方式、調(diào)節(jié)機(jī)制和效應(yīng)物結(jié)合位點(diǎn),為改造氨基酸生產(chǎn)菌株提供新的參考[7-11]。其次蘇氨酸及賴氨酸支路對(duì)碳流量競(jìng)爭(zhēng)激烈,影響了甲硫氨酸的合成。合成過程中,因碳流存在優(yōu)先合成天冬氨酸半醛的調(diào)控機(jī)制使得蘇氨酸與甲硫氨酸競(jìng)爭(zhēng)更為激烈[12],又因單一敲除蘇氨酸支路會(huì)導(dǎo)致菌株代謝不平衡,難以正常生長(zhǎng)[13],因此可考慮采用系統(tǒng)代謝工程[14]獲得弱化蘇氨酸支路的生產(chǎn)菌株。使所合成蘇基酸量?jī)H供應(yīng)菌株生長(zhǎng),同時(shí)解除其對(duì)AK及HSD的抑制作用,最終提高產(chǎn)量。本實(shí)驗(yàn)室以抗結(jié)構(gòu)類似物北京棒桿菌(Corynebacterium pekinense)E31為基礎(chǔ),對(duì)天冬氨酸族氨基酸代謝途徑的關(guān)鍵酶進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)了單體酶AK,篩選出影響AK及HSD活性的多個(gè)關(guān)鍵殘基位點(diǎn),構(gòu)建了多株高酶活性且解除反饋抑制作用的菌株[15-17]。
谷氨酸棒桿菌具有代謝調(diào)控系統(tǒng)簡(jiǎn)單、遺傳背景清晰且無致病性等優(yōu)點(diǎn),常被用來生產(chǎn)天冬氨酸家族氨基酸[18-21]。本研究對(duì)谷氨酸棒桿菌代謝途徑進(jìn)行改造,通過不同遺傳操作手段逐步探究合成途徑阻遏關(guān)鍵位點(diǎn)。在對(duì)合成途徑關(guān)鍵酶AK、HSD及高絲氨酸乙酰基轉(zhuǎn)移酶(homoserine acetyltransferase,HAT)[22]進(jìn)行改造的基礎(chǔ)上構(gòu)建串聯(lián)過表達(dá)載體,以增強(qiáng)各關(guān)鍵酶的表達(dá)量,最終通過實(shí)時(shí)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)、高效液相色譜分析基因表達(dá)情況及氨基酸變化情況,探究碳流阻遏點(diǎn)。并對(duì)蘇氨酸支路thrB的底物高絲氨酸結(jié)合位點(diǎn)A20進(jìn)行酸性、堿性、極性和非極性4 種類型8 種不同氨基酸定點(diǎn)突變研究,篩選相比于原菌酶活性降低的突變體。以期為規(guī)?;⑸锇l(fā)酵法生產(chǎn)提供理論基礎(chǔ)。
1.1.1 菌株與質(zhì)粒
谷氨酸棒桿菌ATCC13032、北京棒桿菌AS1.299、天冬氨酸重組載體(PET28a-lysC)及HSD重組質(zhì)粒(PMD18T-hom)、克隆宿主大腸桿菌DH5α和表達(dá)宿主大腸桿菌BL21(DE3)均由實(shí)驗(yàn)室提供;穿梭表達(dá)載體PECXK99E 湖南豐暉生物科技有限公司。
1.1.2 試劑與培養(yǎng)基
MiniBEST Bacteria Genomic DNA Extraction Kit Ver.3.0、ExTaq?Prime STAR?HS DNA Polymerase、T4 DNA Ligase、pMD?18-T Vector Cloning Kit、DpnI消化酶 TaRaKa(大連)有限公司;ClonExpress MultiS One Step Cloning Kit 諾唯贊生物科技有限公司;BamHI、EcoRI、HindIII、salI、sacI等限制性核酸內(nèi)切酶 莫納(蘇州)生物科技有限公司;DiaSpin Plasmid Mini-Preps Kit、DiaSpin DNA Gel Extraction Kit生工生物工程(上海)股份有限公司;real-time PCR相關(guān)試劑盒TransGen Biotech試劑公司;丙基硫代-β-D-半乳糖苷(isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG)、氨芐霉素、卡那霉素 北京鼎國(guó)生物公司;SB C18柱(150.0 mm×4.6 mm,5 μm) 安捷倫科技(中國(guó))有限公司。
LB培養(yǎng)基:蛋白胨10 g/L,酵母浸粉5 g/L,NaCl 10 g/L(固體培養(yǎng)基另外添加20 g/L瓊脂糖)。種子培養(yǎng)基:葡萄糖25 g/L,玉米漿20 g/L,尿素1.25 g/L,KH2PO41 g/L,MgSO45 g/L,pH 7.2。發(fā)酵培養(yǎng)基:葡萄糖30 g/L、玉米漿10 g/L、生物素0.05 mg/L、KH2PO40.5 g/L、VB10.5 mg/L、VB63.0 mg/L、VB120.1 g/L、(NH4)2SO410 g/L、MnSO45 mg/L、FeSO45 mg/L、MgSO40.25 g/L及CaCO310 g/L,pH 7.2。谷氨酸棒桿菌感受態(tài)制備培養(yǎng)基:酵母浸粉2.5 g/L,蛋白胨10 g/L,NaCl 10 g/L,甘氨酸3 g/L,吐溫80 0.1%。谷氨酸棒桿菌電轉(zhuǎn)化恢復(fù)培養(yǎng)基:酵母浸提物2.5 g/L,蛋白胨5 g/L,NaCl 5 g/L,D-山梨醇91 g/L,腦心浸液18.5 g/L。固體培養(yǎng)基加入瓊脂粉20 g/L。必要時(shí)添加質(zhì)量濃度為30 μg/mL的卡那霉素。
DYCP-31DN核酸電泳儀 北京市六一儀器廠;Research plus移液槍 德國(guó)Eppendorf公司;WFH-201BJ瓊脂糖凝膠像成像儀 美國(guó)GE公司;TissuePrep快速組織細(xì)胞破碎儀 杰靈科技有限公司;Mx3000P熒光定量PCR儀、XDB-C18液相色譜柱 安捷倫科技有限公司;DL-CJ-2N熒光定量PCR工作臺(tái) 北京東聯(lián)哈爾儀器制造有限公司;ACQUITY高效液相色譜 沃特世科技(上海)有限公司。
1.3.1 載體與引物
表1 本研究構(gòu)建質(zhì)粒Table 1 Plasmids and strains used in this study
本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建載體如表1所示。NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)谷氨酸棒桿菌ATCC13032基因組序列為基礎(chǔ),利用Primer 5.0軟件進(jìn)行目的基因克隆引物設(shè)計(jì),通過南京諾唯贊生物科技有限公司CE Design V1.04及Primer 5.0軟件進(jìn)行同源臂擴(kuò)增引物設(shè)計(jì),并由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,具體引物設(shè)計(jì)如表2所示。
表2 PCR擴(kuò)增引物Table 2 Sequences of primers used for PCR
續(xù)表2
1.3.2 關(guān)鍵酶過表達(dá)載體構(gòu)建與發(fā)酵分析
(二)文藝影視及文學(xué)作品中的經(jīng)典臺(tái)詞。影視作品的熱播、文學(xué)作品出爐以及許多文藝節(jié)目的火爆,往往使其中的經(jīng)典臺(tái)詞備受關(guān)注,成為流行語。如:
1.3.2.1 過表達(dá)載體構(gòu)建
同源臂引物擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室篩選并保存的北京棒桿菌高酶活性目的基因AKM372I/T379W(簡(jiǎn)稱lysCm)及帶有SD序列的目的基因homL206D(簡(jiǎn)稱homm),從谷氨酸棒桿菌基因組上擴(kuò)增HAT編碼基因metX,并連接于PMD-18T重組載體上,重組載體上擴(kuò)增帶有SD序列的目的片段SD-metX。PCR條件:94 ℃預(yù)變性4 min,94 ℃變性45 s,48 ℃退火30 s,72 ℃延伸20 s,72 ℃終延伸5 min,4 ℃保存10 min。通過ClonExpress MultiS One Step Cloning Kit連接試劑盒構(gòu)建重組載體PEC-lysCm-SD-homm-SD-metX,按照說明書添加相應(yīng)試劑,混合后37 ℃反應(yīng)30 min,立即置于冰上冷卻,將待轉(zhuǎn)入100 μL的DH5α感受態(tài)細(xì)胞置于冰上解凍,取10 μL重組產(chǎn)物反應(yīng)液加入感受態(tài)細(xì)胞中,緩慢吹打混勻,冰上預(yù)冷30 min,42 ℃熱激90 s后立即冰上孵育10 min,添加600 mL LB培養(yǎng)基中,水平搖床37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)30 min后離心去上清液,剩余菌液涂布于含30 μg/mL卡那霉素抗生素平板上進(jìn)行修復(fù)培養(yǎng),挑取單菌落送于生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。并將測(cè)序成功的重組載體電轉(zhuǎn)入谷氨酸棒桿菌。
1.3.2.2 real-time PCR分析
首先進(jìn)行引物濃度優(yōu)化,選擇200 nmol/L為引物終濃度。選取經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后的菌體進(jìn)行real-time PCR檢測(cè)。利用液氮組織研磨機(jī)對(duì)菌株進(jìn)行破碎處理,根據(jù)TransZol Up Plus RNA Kit細(xì)菌RNA提取試劑盒提取總RNA。測(cè)定RNA提取質(zhì)量,選取R值在1.8~2.0之間質(zhì)量較好的樣品進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),獲取cDNA模板進(jìn)行realtime PCR驗(yàn)證。PCR條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性15 s,55 ℃退火15 s,72 ℃延伸30 s;72 ℃終延伸5 min。其中步驟2~4重復(fù)40 個(gè)循環(huán),采集退火時(shí)間段內(nèi)熒光信號(hào)。參照-2-ΔΔCt模型處理數(shù)據(jù)。
1.3.3 過表達(dá)菌株發(fā)酵高效液相色譜分析
對(duì)構(gòu)建的過表達(dá)菌株WTg1/PEC-lysCm-SD-homm-SD-metX和野生WTg1進(jìn)行72 h發(fā)酵培養(yǎng),每6 h留取樣品,測(cè)定還原糖含量及生長(zhǎng)曲線[23-25]。對(duì)谷氨酸棒桿菌天冬氨酸家族幾種重要的氨基酸變化情況進(jìn)行分析,尋找代謝途徑阻遏原因。
配制天冬氨酸、蘇氨酸、賴氨酸、甲硫氨酸和異亮氨酸標(biāo)準(zhǔn)品,每種氨基酸濃度為10 nmol/μL,根據(jù)安捷倫提供advance Bio AAA試劑和標(biāo)準(zhǔn)品說明書配制17 種氨基酸混合標(biāo)準(zhǔn)品。以鄰苯二甲醛及9-氯甲酸芴甲酯進(jìn)行發(fā)酵液柱前衍生,17 種氨基酸混合標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行液相色譜條件摸索,直到在38 min內(nèi)各峰均分離良好。流動(dòng)相A、B見表3,A、B相均用0.45 μm再生纖維素膜過濾,超聲處理充分混合。柱溫40 ℃,流速1.2 mL/min,檢測(cè)波長(zhǎng)338 nm(高絲氨酸265 nm),進(jìn)樣量9 μL。具體的梯度洗脫程序如表3所示。
表3 梯度洗脫程序Table 3 Gradient elution program
1.3.4 蘇氨酸支路thrB突變體酶活性分析
1.3.4.1 HSK體外載體構(gòu)建
采用常規(guī)CaCl2法制備BL21宿主感受態(tài),提取谷氨酸棒桿菌基因組,同源臂引物擴(kuò)增thrB目的基因并與帶有組蛋白(His)的原核表達(dá)質(zhì)粒PET-28a連接,構(gòu)建重組表達(dá)載體PET-thrB。
根據(jù)谷氨酸棒桿菌ATCC13032的thrB基因序列及其與大腸桿菌共同偏好密碼子設(shè)計(jì)引物,對(duì)thrB重組載體的底物高絲氨酸結(jié)合位點(diǎn)A20定點(diǎn)突變[26],經(jīng)DpnI消化后熱激法轉(zhuǎn)入BL21感受態(tài),活化培養(yǎng)后送于生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。
1.3.4.2 酶促動(dòng)力學(xué)分析
將測(cè)序成功菌株按2%接種量轉(zhuǎn)接到100 mL LB搖瓶?jī)?nèi)進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng)。當(dāng)菌體濃度(OD600nm)達(dá)到0.6時(shí),添加終濃度為1 mmol/L的IPTG誘導(dǎo)蛋白表達(dá),25 ℃、130 r/min過夜培養(yǎng),4 ℃、8 000 r/min離心10 min收集菌體,加入10 mL預(yù)冷磷酸鹽緩沖溶液重懸菌體,超聲破碎離心后取上清液進(jìn)行0.22 μm濾膜處理即為AK粗酶液,通過非變性鎳柱不同濃度咪唑溶液梯度洗脫去除雜蛋白,最后經(jīng)500 mmol/L咪唑洗脫得到的溶液即為thrB突變體純化液[27]。對(duì)野生型和突變體分別進(jìn)行十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)[28]分析。
HSK活性測(cè)定參照Lee等[29]方法略有改動(dòng),每組3 個(gè)平行實(shí)驗(yàn)。測(cè)定0.5~15 mmol/L不同底物濃度條件下thrB突變體純化酶活性,以米氏方程進(jìn)行非線性擬合,得到酶動(dòng)力學(xué)曲線。300 μL反應(yīng)終濃度體系:0.5 mmol/L NADH,10 mmol/L MgSO4,1.2 mmol/L磷酸烯醇丙酮酸,7 mmol/L KCl,3 mmol/L ATP,10 U丙酮酸激酶,15 U乳酸脫氫酶,50 mmol/L Tris-HCl(pH 8.4),3 mol/L高絲氨酸。25 ℃溫育10 min連續(xù)監(jiān)測(cè)法實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)OD340nm的降低,進(jìn)而確定HSK催化L-高絲氨酸的反應(yīng)速度,每分鐘催化1 μmol高絲氨酸轉(zhuǎn)化O-磷酸高絲氨酸所需酶量為1 個(gè)酶活性單位,計(jì)算Vmax及Km值。其中Vmax表示在一定酶量下的最大反應(yīng)速率,即酶完全被底物飽和時(shí)的反應(yīng)速度,與酶濃度呈正比。Km值表示酶促反應(yīng)的初速率為Vmax一半時(shí)的底物濃度,單位為mmol/L。
1.3.4.3 酶學(xué)性質(zhì)表征
最適溫度:野生型純化后WT-thrB酶活性最適溫度為25 ℃,反應(yīng)體系不變的情況下,在不同溫度(18、20、24、28、32、36、 40、44、48 ℃)下連續(xù)監(jiān)測(cè)反應(yīng)30 min,每組樣品3 次平行,最高酶活性定義為100%。
最適pH值:野生型純化后WT-thrB酶活性最適pH 8.0,反應(yīng)體系不變的情況下,調(diào)節(jié)反應(yīng)體系中Tris-HCl緩沖液pH值(6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5、10.0),連續(xù)監(jiān)測(cè)反應(yīng)30 min,每組樣品3 次平行,最高酶活性定義為100%。
穩(wěn)定性:在最適溫度和最適pH值下,將thrB突變體純化酶加入反應(yīng)體系中,反應(yīng)連續(xù)4.5 h內(nèi)測(cè)定酶活性,初始酶活性定義為100%,并以時(shí)間為橫坐標(biāo),相對(duì)酶活性為縱坐標(biāo),每隔30 min檢測(cè)酶活性,每組樣品3 次平行。
本研究組已對(duì)北京棒桿菌AS1.299基因組AK及HSD進(jìn)行克隆、突變和篩選研究,并對(duì)所得突變體進(jìn)行酶動(dòng)力學(xué)分析,其中AK M372、T379位點(diǎn)是抑制劑賴氨酸結(jié)合口袋的關(guān)鍵殘基且高度保守,突變體AKM372I/T379W有效削弱了賴氨酸與結(jié)合口袋附近殘基的結(jié)合,解除了賴氨酸對(duì)AK的反饋抑制作用,突變后最適pH值減小,耐受范圍變廣,半衰期有所延長(zhǎng),相比WT AK活性提高36.37 倍。HSD第206位點(diǎn)在家族中高度保守,參與底物的結(jié)合,突變成異亮氨酸后側(cè)鏈官能團(tuán)減小,空間位阻降低,更有利于與底物結(jié)合,HSDL200D相比于WT HSD活性提高了17.68 倍[30]?;驍U(kuò)增及載體構(gòu)建結(jié)果如圖1所示。圖1A中,擴(kuò)增AK目的基因lysCm為1 274 bp,擴(kuò)增HSD目的基因homm為1 338 bp,擴(kuò)增HAT目的基因metX為1 140 bp。擴(kuò)增所得長(zhǎng)度與目的片段大小相符,證明各連接目的片段擴(kuò)增成功。圖1B中,穿梭表達(dá)載體PECXK99E大小為7 018 bp,重組載體擴(kuò)增得到4 000 bp左右lysCm-SD-homm-SD-metX連接片段,證明過表達(dá)載體構(gòu)建成功。
圖1 過表達(dá)基因擴(kuò)增(A)及載體構(gòu)建核酸電泳驗(yàn)證(B)Fig.1 Amplification of the overexpressed genes (A) and nucleic acid electrophoresis verification of the constructed vector (B)
以谷氨酸棒桿菌的DnaE基因作為內(nèi)參基因,對(duì)野生型谷氨酸棒桿菌WTg1及過表達(dá)菌株WTg1/PEC-lysCm-SD-homm-SD-metX中l(wèi)ysC、hom和metX基因進(jìn)行real-time PCR分析。結(jié)果顯示,WTg1/PEC-lysCm-SD-homm-SD-metX中l(wèi)ysC、hom和metX的表達(dá)量分別為出發(fā)菌株WTg1中對(duì)應(yīng)基因表達(dá)量的6.896、2.378 倍和1.659 倍,表明AK、HSD及HAT基因串聯(lián)過量表達(dá)有效。
分別對(duì)野生型菌株WTg1和過表達(dá)菌株WTg1/PEC-lysCm-SD-homm-SD-metX進(jìn)行微生物發(fā)酵培養(yǎng),并對(duì)72 h發(fā)酵上清液進(jìn)行反相高效液相色譜檢測(cè)[31-34],結(jié)果如表4所示。過表達(dá)菌株天冬氨酸、谷氨酸積累量降低顯著,無明顯積累;蘇氨酸和異亮氨酸產(chǎn)量同步降低;賴氨酸產(chǎn)量相應(yīng)提高,甲硫氨酸產(chǎn)量明顯提高。
表4 發(fā)酵液氨基酸質(zhì)量濃度Table 4 Concentrations of amino acids in fermentation broths g/L
過表達(dá)AK使得碳源流經(jīng)三羧酸循環(huán)后更易流經(jīng)天冬氨酸下游支路氨基酸的合成,使得Glu產(chǎn)量由原菌的1.45 g/L減少到0.07 g/L。real-time PCR分析可見過表達(dá)后HSD轉(zhuǎn)錄水平提高到2.378 倍,使得天冬氨酸積累量降低至0.09 g/L,碳流量途經(jīng)中間酶AK及HSD不會(huì)產(chǎn)生過多積累,更有利于下游氨基酸的合成。過表達(dá)HAT使蘇氨酸由原菌2.93 g/L降至1.61 g/L,賴氨酸產(chǎn)量變化不大,甲硫氨酸產(chǎn)量相比原菌提高到2.26 倍,達(dá)到4.14 g/L。
結(jié)合real-time PCR及液相色譜氨基酸分析,改造并過表達(dá)甲硫氨酸支路關(guān)鍵酶可有效促進(jìn)碳流量,減少谷氨酸棒桿菌代謝途徑中主要谷氨酸積累,提高了甲硫氨酸產(chǎn)量。同時(shí)發(fā)現(xiàn),經(jīng)改造后菌株WTg1/PEC-lysCm-SD-homm-SD-metX代謝途徑中蘇氨酸積累量過多,是甲硫氨酸合成途徑碳流競(jìng)爭(zhēng)的第一大氨基酸。推測(cè)如果有效減少蘇氨酸產(chǎn)量將更有利于提高甲硫氨酸產(chǎn)量,故本實(shí)驗(yàn)試圖對(duì)蘇氨酸支路首個(gè)關(guān)鍵酶thrB進(jìn)行弱化研究。
本實(shí)驗(yàn)從谷氨酸棒桿菌基因組上擴(kuò)增HSK目的基因thrB進(jìn)行PET-28a表達(dá)載體連接。進(jìn)行1%瓊脂糖核酸電泳驗(yàn)證,圖2A中,基因組擴(kuò)增thrB靶片段為1 000 bp,重組載體PET-thrB為6 369 bp,連接載體雙酶切驗(yàn)證,兩條明顯條帶分別于1 000 bp及5 000 bp左右,這與目的片段及線性化載體大小相符。圖2B為重組載體突變后PCR擴(kuò)增電泳,證明質(zhì)粒在引物作用下實(shí)現(xiàn)了大量的復(fù)制。目的片段送于生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序,連接成功。
圖2 載體構(gòu)建(A)及突變PCR產(chǎn)物(B)瓊脂糖核酸電泳Fig.2 Agarose gel electrophoresis of PCR products of the constructed vector (A) and site-directed mutations (B)
野生型和突變體經(jīng)非變性鎳柱純化后進(jìn)行12% SDSPAGE驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(圖3)。野生型和突變體純化酶在12%SDS-PAGE的37 kDa左右處均存在單一明亮條帶,表明thrB突變體蛋白在誘導(dǎo)劑IPTG的作用下表達(dá)成功,可用于酶動(dòng)力學(xué)測(cè)定及酶學(xué)性質(zhì)表征。
圖3 12%SDS-PAGE分析Fig.3 12% SDS-PAGE analysis of the overexpressed protein
本實(shí)驗(yàn)對(duì)thrB進(jìn)行酸、堿、極性和非極性4 種性質(zhì)8 種氨基酸進(jìn)行定點(diǎn)突變,并對(duì)突變體進(jìn)行酶動(dòng)力學(xué)研究及酶學(xué)性質(zhì)表征,結(jié)果如表5所示。HSK 20位點(diǎn)丙氨酸突變成8 種不同氨基酸后酶活性多數(shù)降低,由各菌株Vmax可以看出其中突變體thrB-A20H及thrB-A20Y的酶活性降低較為顯著,分別為WT-thrB的43%及39%,最適溫度升高至30 ℃和35 ℃。堿性氨基酸組氨酸最適pH值增加至8.5,半衰期延長(zhǎng),更有利于微生物發(fā)酵生產(chǎn)蛋氨基酸。
表5 各菌株HSK活性Table 5 HSK activity of each strain
突變體thrB-A20Y酶活性降至原菌39%,酶活性降低最為顯著,對(duì)該突變位點(diǎn)進(jìn)行原子間靜電力及Pymol圖譜分析,見圖4。靜電勢(shì)由±74.552 kJ/mol變?yōu)椤?4.573 kJ/mol,這可能是由于非極性氨基酸丙氨酸突變?yōu)闃O性氨基酸酪氨酸,導(dǎo)致氫鍵供體數(shù)增加,極性表面積增大。酪氨酸側(cè)鏈較大,與底物高絲氨酸的空間位阻增大距離變遠(yuǎn),導(dǎo)致高絲氨酸不能很好地進(jìn)入底物結(jié)合口袋,影響酶與底物結(jié)合效率,使酶活性降低。
圖4 thrB-A20Y突變后氨基酸靜電勢(shì)及與底物之間Pymol圖Fig.4 Electrostatic potential of amino acids and Pymol diagram between amino acids and substrate after thrB-A20Y mutation
本實(shí)驗(yàn)通過在谷氨酸棒桿菌內(nèi)串聯(lián)表達(dá)合成途徑關(guān)鍵酶基因LysCm、homm和metX,獲得菌株WTg1/PEC-lysCm-SD-homm-SD-metX,有效增加了合成途徑的碳流量,使積累量大幅度提高,達(dá)到4.14 g/L,實(shí)現(xiàn)了產(chǎn)量的提高。實(shí)驗(yàn)對(duì)蘇氨酸支路關(guān)鍵酶thrB基因進(jìn)行定點(diǎn)突變研究,獲得多株酶活性降低突變株,其中thrB-A20Y活性降至原菌39%,為微生物體內(nèi)弱化蘇氨酸支路、增強(qiáng)甲硫氨酸積累提供理論基礎(chǔ)。