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        貴州金花茶種質(zhì)資源ISSR分析及指紋圖譜庫構(gòu)建

        2020-09-02 12:10:00羅在柒李榮京珍李蘭
        鄉(xiāng)村科技 2020年22期
        關(guān)鍵詞:金花條帶多態(tài)性

        羅在柒 陸 俊 李榮京 李 治 珍李蘭

        (貴州省林業(yè)科學(xué)研究院,貴州貴陽550005)

        貴州金花茶的模式標(biāo)本于1958年由中國(guó)科學(xué)院植物研究所的曹子余先生采自貴州省冊(cè)亨縣山區(qū),被鑒定為中越山茶(Camellia indochinensisMerr),1993年昆明植物所的閣天綠等將其定名為貴州金花茶[1],但張宏達(dá)等進(jìn)一步將分布在冊(cè)亨的論證為離蕊金花茶(Camellia liberofilamentaH.T.Chang et C.H.Yan)[2],分布于貴州省南部羅甸縣大亭鄉(xiāng)的金花茶為貴州金花茶。貴州金花茶自然分布地域狹窄、種群數(shù)量少,加之遭受人為采挖、生境破壞等影響,如今野生植株數(shù)量甚微,野生種群處于瀕危滅絕的狀態(tài)。

        貴州金花茶除了歸屬金花茶組共享“植物界的大熊貓”“茶族皇后”等聲譽(yù)外,其皆具觀賞價(jià)值、開發(fā)應(yīng)用價(jià)值和科學(xué)研究?jī)r(jià)值。其花具有極高的觀賞價(jià)值,富含微量元素、氨基酸,以及黃酮、多糖等400多種人體必需的活性成分物質(zhì)[3-5]。前期研究表明,貴州金花茶除具備茶飲保健功能外,還具有藥用功效,尤其在眼疾、皮膚病、心腦血管類后遺癥、糖尿病、高血壓、高膽固醇、高血脂和腸胃消化系統(tǒng)等疾病康復(fù)方面均有不俗表現(xiàn)[6-9],具備食用和藥用開發(fā)價(jià)值。

        簡(jiǎn)單重復(fù)序列間區(qū)(Inter-simple Sequence Repeat,ISSR)[10]分子標(biāo)記技術(shù)的引物設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單,多態(tài)性豐富,重復(fù)性好,成本低,同時(shí)兼有擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)、簡(jiǎn)單重復(fù)序列標(biāo)記(Simple Sequence Repeats,SSR)和隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA標(biāo) 記(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)分子標(biāo)記的優(yōu)點(diǎn),已被應(yīng)用于植物品種鑒定、遺傳圖譜構(gòu)建、基因定位和輔助育種等研究[11,12]。

        近年來,貴州省羅甸縣把金花茶產(chǎn)業(yè)作為發(fā)展地方經(jīng)濟(jì)、助力脫貧攻堅(jiān)的主抓產(chǎn)業(yè),但是產(chǎn)業(yè)發(fā)展面臨種苗繁育、種植問題,尤其是急需摸清種質(zhì)資源特征,因此要把好種苗源頭關(guān)。因此,本研究采用ISSR分子標(biāo)記技術(shù),開展對(duì)現(xiàn)存資源遺傳多樣性和DNA指紋圖譜特性的研究,對(duì)進(jìn)一步深度開發(fā)和利用貴州金花茶奠定理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        貴州金花茶(Camellia guizhouensisS.Y.Liang et T.L.Ming)新鮮葉片分別采集于羅甸縣冒井鎮(zhèn)大亭社區(qū)原生地周邊村寨、羅甸境內(nèi)企業(yè)以及貴州省林業(yè)科學(xué)研究院樹木園引種植株(見表1)。試驗(yàn)采用3個(gè)原生植株和8個(gè)引種植株,將普通油茶(Camellia oleiferaAbel.)作為對(duì)照。

        表1供試樣品采集信息

        由加拿大哥倫比亞大學(xué)設(shè)計(jì)100條ISSR引物序列UBC,編號(hào)依次為UBC 001~100。DNA提取試劑盒、瓊脂糖、Good View核酸染料、100 bp DNA ladder、2×Tap Master Mix和50×loading Buffer等均為BIOMIGA公司產(chǎn)品。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 DNA提取及檢測(cè)。稱取0.5 g新鮮葉片,液氮磨碎,使用BIOMIGA公司試劑盒提取DNA樣品,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,電泳條件為110 V、30 min。將成功提取的DNA樣品放入-40℃冰箱保存。

        1.2.2 PCR擴(kuò)增及檢測(cè)。使用上海生物技術(shù)有限公司合成的100對(duì)ISSR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,選出其中多態(tài)性條帶較好的20對(duì)引物進(jìn)行多態(tài)性擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系為總量20μL,其中2×Tap Master Mix 10μL、引物2μL、DNA模板1μL、ddH2O 7μL。

        PCR擴(kuò)增程序如下:95℃預(yù)變性5 min,95℃變性30 s,52℃退火30 min,72℃延伸30 min,35個(gè)循環(huán),72℃退火5 min。

        PCR檢測(cè)采用2%瓊脂糖凝膠電泳對(duì)PCR擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行電泳,電泳條件為電壓110 V、80 min。之后在Tanon-2500數(shù)碼凝膠圖像分析儀上拍照保存,進(jìn)行條帶分析。

        1.2.3 數(shù)據(jù)分析。使用NTSYS2.1軟件對(duì)各樣品的PCR擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行聚類分析,做出相應(yīng)聚類圖,分析各品種間的遺傳距離。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 PCR擴(kuò)增與遺傳多樣性分析

        獲得高質(zhì)量的DNA為模板,對(duì)100對(duì)通用引物進(jìn)行篩選,共選出22對(duì)擴(kuò)增效果較好、條帶清晰的引物序列。擴(kuò)增出的條帶大小在100~1 300 bp,共擴(kuò)增出440條帶,其中多態(tài)性條帶為385條,多態(tài)性占比為87.5%,結(jié)果表明供試材料的ISSR多態(tài)性較豐富。

        利用5條引物擴(kuò)增出來的440譜帶建立11個(gè)金花茶品種的遺傳相似系數(shù)矩陣,見表2。各樣品之間的相似系數(shù)在0.39~0.84,平均相似系數(shù)為0.66,說明貴州金花茶樣品具有較高的遺傳多樣性。其中,田壩組1號(hào)和縣城益豐緣苗圃基地相似系數(shù)最大,為0.84,表明2個(gè)樣品之間的親緣關(guān)系相對(duì)較近;五湖公司基地9號(hào)與普通油茶相似系數(shù)最小,僅為0.39,表明9號(hào)與其他樣品的親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),該植株為廣西引種,是否為貴州金花茶需進(jìn)一步鑒定。

        2.2 貴州金花茶親緣關(guān)系聚類分析

        對(duì)這22對(duì)引物做進(jìn)一步篩選,共篩選出擴(kuò)增效果較好、特異性強(qiáng)的UBC817、UBC825、UBC827、UBC844和UBC845這5對(duì)引物,共擴(kuò)增出76個(gè)不同位點(diǎn),其中多態(tài)性位點(diǎn)為63處,多態(tài)性為82.89%。Ntsys2.10軟件對(duì)11種金花茶的ISSR結(jié)果進(jìn)行聚類分析,結(jié)果見圖1,系數(shù)為0.693時(shí),10個(gè)貴州金花茶供試樣品分為2個(gè)組,即1號(hào)、2號(hào)、3號(hào)、4號(hào)、7號(hào)為一組,5號(hào)、6號(hào)、9號(hào)、10號(hào)為另一組,8號(hào)普通油茶作為對(duì)照組。

        2.3 特異條帶分析與指紋圖譜構(gòu)建

        使用選定的5個(gè)擴(kuò)增條數(shù)多、條帶清晰、特異性強(qiáng)的引物用作11供試樣品的指紋圖譜構(gòu)建。擴(kuò)增結(jié)果如圖2至圖6所示,U817號(hào)引物擴(kuò)增的條帶大小在130~700 bp,共擴(kuò)增出18位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)為14處,多態(tài)性占比77.7%,可區(qū)分1號(hào)、2號(hào)、5號(hào)、7號(hào)、11號(hào);U825號(hào)引物擴(kuò)增的條帶大小在190~1 100 bp,共擴(kuò)增出19條帶,多態(tài)性條帶為17條,多態(tài)性占比89.5%,可區(qū)分6號(hào)、9號(hào)、11號(hào);U827號(hào)引物擴(kuò)增的條帶大小在200~1 250 bp,共擴(kuò)增出16條帶,多態(tài)性條帶為12條,多態(tài)性占比75%,可區(qū)分4號(hào);U844號(hào)引物擴(kuò)增的條帶大小在100~600 bp,共擴(kuò)增出12條帶,多態(tài)性條帶為8條,多態(tài)性占比66.6%,可區(qū)分3號(hào)。U845號(hào)引物擴(kuò)增的條帶大小在120~830 bp,共擴(kuò)增出12條帶,多態(tài)性條帶為8條,多態(tài)性占比66.6%,可區(qū)分3號(hào)。根據(jù)10個(gè)ISSR引物的擴(kuò)增結(jié)果,篩選出引物UBC017、UBC025、UBC027和UBC045擴(kuò)增的51個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)構(gòu)建的DNA指紋圖譜,可用于鑒定供試10個(gè)貴州金花茶樣本。

        表2遺傳相似系數(shù)矩陣

        3 結(jié)論與討論

        本試驗(yàn)采用ISSR分子標(biāo)記對(duì)10份貴州金花茶材料進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果表明貴州金花茶材料之間遺傳變異較豐富,同時(shí)呈現(xiàn)地域差異小的特點(diǎn)。樣品遺傳聚類分為2組,與調(diào)查過程中發(fā)現(xiàn)花瓣小花和大花2個(gè)類型相吻合,小花類型相對(duì)原生性相對(duì)較強(qiáng),大花類型形態(tài)與離蕊金花茶較為相似,兩者之間的親緣關(guān)系仍值得深入研究。

        本研究結(jié)果表明ISSR分子標(biāo)記對(duì)貴州金花茶的親緣關(guān)系具有很好的分類效果,可為貴州金花茶育種的親本、雜種優(yōu)勢(shì)選擇以及苗木品質(zhì)鑒別提供理論基礎(chǔ),對(duì)物種保護(hù)和產(chǎn)業(yè)化育苗種苗鑒別提供技術(shù)支持。

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