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        高效藤壺賴氨酰氧化酶的體外重組表達(dá)體系構(gòu)建*

        2020-08-26 12:02:42劉偉治滕潞瑤張小康王露露
        關(guān)鍵詞:藤壺結(jié)構(gòu)域可溶性

        劉偉治,滕潞瑤,張小康,王露露

        ( 中國海洋大學(xué)海洋生命學(xué)院 海洋生物遺傳學(xué)與育種教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東 青島 266003)

        藤壺(Balanus)是世界沿海港口和海灣的主要污損生物,分布范圍涵蓋了潮間帶至潮下帶,通過分泌粘性極強(qiáng)、可在水下交聯(lián)聚合的膠粘物,牢固地附著在水下物體表面[1]。藤壺膠由分泌腺合成并分泌,通過導(dǎo)管系統(tǒng)輸送至附著界面,6 h內(nèi)聚合成不透明的膠塊,其蛋白含量超過90%[2]。研究發(fā)現(xiàn)在藤壺的粘附膠固化過程中酶的作用十分關(guān)鍵,Cheung[3]等早在四十多年前就發(fā)現(xiàn)藤壺膠生物合成需要賴氨酰氧化酶(Lysyl oxidase,LOX)參與。LOX在哺乳動物體內(nèi)可催化膠原蛋白和彈性蛋白中賴氨酸和羥賴氨酸的交聯(lián),增強(qiáng)蛋白穩(wěn)定性[4-6]。Christopher等通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析,在藤壺膠中發(fā)現(xiàn)了幾種一級結(jié)構(gòu)由富含Gly/Ser/Thr/Ala的低復(fù)雜性結(jié)構(gòu)域和富含Lys和Arg的復(fù)雜性結(jié)構(gòu)域交替組成的蛋白,這與膠原蛋白和彈性蛋白序列具有相似性,且賴氨酸含量超過10%,可作為交聯(lián)位點(diǎn)[7],推測交聯(lián)可以改變粘附蛋白的物理狀態(tài)和性能[8]。而且進(jìn)一步研究證實(shí)在藤壺膠中存在LOX活性,且在藤壺中發(fā)現(xiàn)了與果蠅LOX具有同源性的蛋白序列[9-10]。但因藤壺膠極易固化,造成了LOX提取困難;所以研究人員一直希望通過基因工程實(shí)現(xiàn)有活性的藤壺LOX重組制備。但迄今為止,尚未有文獻(xiàn)報(bào)道,說明LOX在原核生物中重組表達(dá)難度較大[11-12],已成為藤壺膠形成機(jī)制研究的瓶頸。

        此前基于多組學(xué)技術(shù)在藤壺膠內(nèi)鑒定到了與人LOX家族成員序列具相似性的蛋白[19-23],命名為BalLOX。為獲得有活性的BalLOX,本研究通過對BalLOX表達(dá)序列的長度和表達(dá)載體進(jìn)行篩選,首次獲得了重組BalLOX的可溶性表達(dá),為后續(xù)藤壺粘附膠組成機(jī)制的研究奠定了基礎(chǔ)。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        pET-28a、pET-32a、pGEX-6p-1、pMCSG 9 表達(dá)載體質(zhì)粒和感受態(tài)細(xì)胞大腸桿菌 BL21 (DE3)為本實(shí)驗(yàn)室保存;所有引物合成及 Sanger 測序委托生工生物工程股份有限公司; PrimeSTAR ? GXL DNA Polymerase、EcoRI和NotI內(nèi)切酶、T4連接酶購買于 Takara;辣根過氧化物酶和各種生化試劑購買自BBI;3-氨基丙腈(β-BAPN,Alfar Aesar)、1,5-二氨基戊烷和各種常規(guī)化學(xué)試劑購買自國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司; Amplex Red(Invitrogen)。

        1.2 方法

        1.2.1 BalLOX氨基酸序列分析 通過SMART(Simple Modular Architecture Research Tool)對蛋白的全長氨基酸序列進(jìn)行信號肽及功能結(jié)構(gòu)域的預(yù)測,再通過NCBI在線BLAST(Basic Lacol Alignment Search Tool)在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中尋找與BalLOX催化區(qū)域序列相似性較高的蛋白,利用BioEdit軟件進(jìn)行序列比對分析。

        1.2.2 BalLOX重組表達(dá)載體的構(gòu)建 根據(jù)BalLOX的全長基因序列,設(shè)計(jì)并合成PCR引物。分別設(shè)計(jì)只含催化區(qū)域(命名為BalLOX_CD)以及含1個/2個富含半胱氨酸的清道夫受體(Scavenger receptor cysteine-rich domain,SRCR)結(jié)構(gòu)域和催化區(qū)域的亞克隆(分別命名為BalLOX_CD+1 SRCR和 BalLOX_CD+2 SRCR),引物序列如表1,5’端具有EcoRI酶切位點(diǎn),3’端具有NotI酶切位點(diǎn),以BalLOX的全長基因?yàn)槟0?,PCR擴(kuò)增基因序列。將PCR擴(kuò)增的DNA片段凝膠回收,分別連接至pET-28a、pET-32a、pGEX-6p-1、pMCSG9載體上,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)中,對所有重組表達(dá)載體進(jìn)行測序。

        表1 PCR引物列表

        1.2.3 重組蛋白的表達(dá)和優(yōu)化 將含目的序列的單克隆菌株以1%的接種量接種于1 L含有卡那(Kan)/氨芐霉素(Amp)的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)至菌體生長達(dá)到對數(shù)生長期(OD600≈0.8)。加入0.5 mmol/L IPTG誘導(dǎo)劑誘導(dǎo),37 ℃/16 ℃繼續(xù)誘導(dǎo)培養(yǎng)。培養(yǎng)結(jié)束后離心收集菌體,加入20 mmol/L Tris-HCl pH=8.0/500 mmol/L NaCl緩沖液重懸超聲破碎菌體,離心留取上清溶液作為粗酶。

        1.2.4 BalLOX_CD酶活檢測 由于LOX是一種銅依賴性的胺氧化酶,銅是LOX的重要輔基,只有與銅結(jié)合酶才具有活性[15-16]。所以將BalLOX_CD粗酶于20 mmol/L Tris-HCl pH=8.0、1 mmol/L CuSO4透析外液中4 ℃下透析3 h,利用考馬斯亮藍(lán)法檢測粗酶溶液中全蛋白濃度。為了排除MBP標(biāo)簽對酶活的影響,添加同樣方法處理得到的MBP標(biāo)簽蛋白組和不加酶組作為空白對照。

        根據(jù)Palamakumbura等描述的 Amplex red熒光法[17]檢測酶活,以β-BAPN孵育后的酶作為陰性對照,檢測反應(yīng)前后熒光強(qiáng)度變化。Δ熒光強(qiáng)度=實(shí)驗(yàn)組(反應(yīng)前-反應(yīng)后)-β-BAPN對照組(反應(yīng)前-反應(yīng)后)。一個單位的胺氧化酶活性定義為在37 ℃下每分鐘氧化1 μmol/L 1,5-二氨基戊烷底物的活性,底物的反應(yīng)濃度由H2O2生成濃度確定[18]。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算H2O2生成濃度,因此單位酶活計(jì)算公式為:單位酶活(U/mg)=H2O2生成濃度(μmol/L)/加酶量(mg)/ 反應(yīng)時間(min)。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        2.1.1 BalLOX氨基酸序列分析 BalLOX全長517個氨基酸,前18個氨基酸為信號肽序列,76~182和207~297處的氨基酸序列為兩個SRCR結(jié)構(gòu)域,305~517處的氨基酸序列為LOX催化結(jié)構(gòu)域(見圖1)。將BalLOX的催化區(qū)域氨基酸序列進(jìn)行BLAST比對分析,BalLOX_CD與人LOX家族5個成員的蛋白序列催化區(qū)域有35%~42%的相似性[19-23],且與催化區(qū)域中的兩個保守區(qū)域氨基酸都具有一致性(見圖2),第一個區(qū)域?yàn)殂~結(jié)合部位,含有四個組氨酸;第二個區(qū)域位于C 末端,含有高度保守的酪氨酸殘基,為催化區(qū)域,可以與賴氨酸殘基一起參與形成賴氨酰酪氨基醌( lysine tyrosyl quinone, LTQ),因此推測BalLOX_CD可能具有LOX的活性。

        圖1 BalLOX結(jié)構(gòu)域示意圖Fig.1 The domain of BalLOX

        (4 His和LTQ為文中所述LOX家族成員中兩個高度保守的區(qū)域。4 His and LTQ are two highly conserved Domain in the LOX family. GenBank ID:lysyl oxidase [AAB23549.1],Lysyl oxidase-like 1 [AAH68542.1],Lysyl oxidase-like 2 [AAH00594.1],lysyl oxidase-like 3 protein [AAK63205.1],lysyl oxidase-like 4 [AAL27543.1])

        2.1.2 BalLOX 基因片段的克隆 考慮到SRCR結(jié)構(gòu)域富含半胱氨酸(每個SRCR結(jié)構(gòu)域含6個Cys),可能會發(fā)生交聯(lián)降低蛋白的溶解度,因此設(shè)計(jì)了不同長度的亞克隆(分別命名為BalLOX_CD+2 SRCR、 BalLOX_CD+1 SRCR和BalLOX_CD),研究是否會對蛋白的表達(dá)產(chǎn)生影響。PCR擴(kuò)增出3個基因片段(見圖3)。

        (泳道:1和2顯示BalLOX_CD+1 SRCR基因片段條帶;3和4顯示BalLOX_CD基因片段條帶;5和6顯示BalLOX_CD+2 SRCR基因片段條帶。Lane M: DL 2000 DNA Maker. Lane 1&2: The target bands of BalLOX_CD+1 SRCR gene fragments; Lane 3&4: The target bands of BalLOX_CD gene fragments; Lane 5&6: The target bands of BalLOX_CD+2 SRCR gene fragments.)

        2.1.3 高效 BalLOX表達(dá)體系的構(gòu)建和篩選

        2.1.3.1 不同的重組表達(dá)標(biāo)簽對不同長度BalLOX 表達(dá)的影響 考慮到不同的表達(dá)標(biāo)簽蛋白會對重組蛋白的折疊和溶解性有重要影響。本研究選擇了pET-28a、pET-32a、pGEX-6p-1、pMCSG9這4種不同系統(tǒng),分別對應(yīng)了4種不同的可溶性標(biāo)簽: His標(biāo)簽、Trx(硫氧還蛋白)標(biāo)簽、GST(谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶)標(biāo)簽和MBP(麥芽糖結(jié)合蛋白)標(biāo)簽,連接至亞克隆蛋白序列的N末端,來研究不同標(biāo)簽對蛋白表達(dá)的影響,同時對比了不同誘導(dǎo)溫度(37和16 ℃)對重組蛋白表達(dá)的影響(見圖4)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)攜帶SRCR結(jié)構(gòu)域的兩個亞克隆連接pET-32a、pGEX-6p-1、pMCSG9載體后均不能在37 ℃表達(dá),且連接pET-28a載體后于16 ℃下誘導(dǎo)表達(dá)目的蛋白均出現(xiàn)在菌體超聲破碎離心后的沉淀中(見圖5),說明SRCR區(qū)對BalLOX的體外重組表達(dá)有較大影響;單獨(dú)的BalLOX_CD在兩個誘導(dǎo)溫度下均能表達(dá),考慮到本研究以獲得高活性的酶為目的,因而選擇BalLOX_CD進(jìn)行后續(xù)研究。

        (上圖中的SDS-PAGE電泳蛋白樣品均為未超聲裂解的全菌。泳道:M為Marker;0 為未誘導(dǎo)菌液;1為37 ℃下誘導(dǎo);2為16 ℃下誘導(dǎo)。箭頭處為目的蛋白條帶。圖A和B分別為BalLOX_CD+2 SRCR和BalLOX_CD+1 SRCR連接如圖上標(biāo)注的4個載體后在37和16 ℃誘導(dǎo)下的表達(dá)情況。連接pET-28a載體后蛋白于兩個誘導(dǎo)溫度下均表達(dá),連接其他3個載體后僅16 ℃誘導(dǎo)下表達(dá)。圖C為BalLOX_CD連接如圖上標(biāo)注的4個載體后在37 和16 ℃誘導(dǎo)下的表達(dá)情況。連接pET-28a、pET-32a、pGEX-6p-1、pMCSG9載體后蛋白于兩個誘導(dǎo)溫度下均能表達(dá)。The SDS-PAGE electrophoresis protein samples are whole bacterial without ultrasonication. M: Marker; 0: Uninduced bacterial solution; 1: Induction temperature is 37 ℃; 2: Induction temperature is 16 ℃. The arrows point to the band of target proteins. Figure A and B show the expressions of BalLOX_CD + 2 SRCR and BalLOX_CD + 1 SRCR with the four vectors marked on the figures were induced by 37 and 16 ℃. The proteins with pET-28a vector were expressed at two induction temperatures, and with the other three vectors were expressed only at 16 ℃. Figure C shows the expression of BalLOX_CD with the four vectors marked on the figure under the induction of 37 and 16 ℃. The proteins with pET-28a, pET-32a, pGEX-6p-1, and pMCSG9 vectors were expressed at both induction temperatures.)

        (泳道M為Marker;1為菌體超聲破碎離心后上清溶液;2為離心后沉淀。箭頭處為目的蛋白條帶。M:Marker;1:Supernatant after ultrasonication and centrifugation of E.coli BL21; 2. Precipitate. The arrows point to the band of target proteins.)

        2.1.3.2 BalLOX_CD 可溶性表達(dá)載體的篩選 考慮到通常情況下低溫可以減緩菌體生長和蛋白表達(dá)及折疊速度,降低錯誤折疊形成包涵體的概率,從而提高外源蛋白表達(dá)的可溶性[24-26]。因此選擇在誘導(dǎo)溫度為16 ℃的條件下,篩選能夠?qū)崿F(xiàn)BalLOX_CD可溶性表達(dá)的標(biāo)簽。除了pMCSG9-BalLOX_CD外,其它表達(dá)系統(tǒng)中獲得的重組蛋白均出現(xiàn)在菌體超聲破碎離心后的沉淀中,說明其以包涵體的形式存在(見圖6)。因此最終選擇攜帶MBP標(biāo)簽的BalLOX_CD蛋白用于后續(xù)酶活性的檢測。

        2.1.4 酶活測定 BalLOX_CD在大腸桿菌中實(shí)現(xiàn)可溶性表達(dá)后,在含Cu2+的Tris-HCl透析外液中透析后可獲得純度較高的BalLOX_CD蛋白樣品(見圖7a)。向反應(yīng)體系中分別加入1 μg 酶和MBP蛋白,檢測反應(yīng)前后熒光強(qiáng)度變化(見圖7b)。在此測活條件下根據(jù)單位酶活計(jì)算公式計(jì)算得到MBP標(biāo)簽單位質(zhì)量酶活為約0.018 U/mg,而攜帶MBP標(biāo)簽的BalLOX_CD的單位質(zhì)量酶活為(0.119± 0.012)U/mg。

        (a. 為MBP和BalLOX_CD蛋白透析后SDS-PAGE電泳圖。b. 不同酶濃度下反應(yīng)結(jié)束后熒光強(qiáng)度變化。a. The recombinant expression of MBP and BalLOX_CD. b. Changes in fluorescence intensity at the end of the reaction at different enzyme concentrations. The fluorescence intensity in the figure is the value obtained by subtracting the β-BAPN negative control.)

        2.2 討論

        目前,對于藤壺水下粘附機(jī)制及藤壺膠的固化機(jī)制仍未明確。Christopher等首次通過質(zhì)譜在網(wǎng)紋藤壺膠中鑒定到了賴氨酰氧化酶AaLOX(KY762300),還檢測到醛/酮以及LOX活性的存在,推測LOX在藤壺膠中發(fā)揮的作用與在彈性蛋白中類似[9-10],因此LOX在藤壺成膠粘附過程中發(fā)揮著重要作用。但由于藤壺來源的LOX蛋白序列,與哺乳動物的LOX同源性較低,如與人成熟的LOX(從Asp 169開始)序列(GenBank Accession No. M94054)同源性為21%[14],與人成熟的LOXL(從Asp 135開始)序列(GenBank Accession No. L21186)同源性為26%[11-14],因此,LOX在藤壺中的作用機(jī)制并不能完全用在哺乳動物體內(nèi)的催化機(jī)制來解釋,還需要進(jìn)一步研究闡明。所以迫切需要對藤壺LOX進(jìn)行重組表達(dá)和活性研究,但之前文獻(xiàn)報(bào)道提示藤壺LOX在原核表達(dá)系統(tǒng)中重組表達(dá)困難。文獻(xiàn)調(diào)研發(fā)現(xiàn)即使是人LOX在體外表達(dá)的過程中也易發(fā)生沉淀和聚集,主要以包涵體的形式存在,需要重折疊以獲得活性酶,這個過程不僅耗時且易導(dǎo)致蛋白質(zhì)產(chǎn)量和酶活性的損失,因此通過體外重組表達(dá)的方式,得到具有活性的LOX具有一定難度[11-12]。本研究首次將藤壺賴氨酰氧化酶BalLOX進(jìn)行了重組表達(dá),通過基因長度,表達(dá)載體和表達(dá)條件的篩選,最終獲得了可溶性表達(dá)的藤壺重組LOX催化區(qū)域亞克隆蛋白,產(chǎn)量能達(dá)到0.28 g/L培養(yǎng)基,且攜帶MBP標(biāo)簽的蛋白單位質(zhì)量酶活在0.119 U/mg左右。此前Smith等在人LOX上添加Nus-A標(biāo)簽后同樣獲得了可溶性蛋白,但最終酶產(chǎn)量僅0.75 mg /L培養(yǎng)基,攜帶Nus-A標(biāo)簽后單位質(zhì)量酶活性約0.11 U /mg[12]。相比之下,本研究獲得的BalLOX酶活性基本相同,但酶產(chǎn)量提高了373倍。

        綜上所述,本研究首次成功表達(dá)了藤壺來源的具有催化活性的LOX,并實(shí)現(xiàn)了酶的高效可溶性表達(dá),實(shí)現(xiàn)了藤壺LOX的體外高效重組表達(dá),為后續(xù)藤壺膠的形成機(jī)制研究奠定了基礎(chǔ)。

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