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        基于SSR分子標(biāo)記的藥用黃芪遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)分析

        2020-08-17 23:29:26奚華英
        特別健康·下半月 2020年8期

        奚華英

        【摘要】目的:探討基于簡單重復(fù)序列(SSR)分子標(biāo)記的藥用黃芪遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)研究開展價(jià)值。方法:收集來自不同產(chǎn)地的400份藥用黃芪樣本,其中90份膜莢黃芪,310份蒙古黃芪,均施以遺傳多樣性與結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果:1、膜莢黃芪與蒙古黃芪均有較高遺傳多樣性,且蒙古黃芪遺傳多樣性高于膜莢黃芪。2、藥用黃芪遺傳變異主要發(fā)生于居群內(nèi)。根據(jù)黃芪居群遺傳結(jié)構(gòu)分析,可把黃芪不同居群分成3個(gè)亞群,其中,膜莢黃芪為1亞群,內(nèi)蒙古區(qū)與少數(shù)山西居群為1亞群,多數(shù)山西產(chǎn)地居群為1亞群。結(jié)論:在SSR標(biāo)記基礎(chǔ)上實(shí)施藥用黃芪多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)分析的開展,可有效了解藥用黃芪遺傳特點(diǎn),從而為藥用黃芪育種、利用、研發(fā)優(yōu)質(zhì)黃芪資源提供參考。

        【關(guān)鍵詞】藥用黃芪;遺傳結(jié)構(gòu);遺傳多樣性

        【中圖分類號(hào)】 R567.239

        【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A

        【文章編號(hào)】2095-6851(2020)08-098-02

        黃芪又名綿芪,具有抗衰老、抗應(yīng)激、利尿、保肝、降壓、抗菌等作用,多見于陜西、黑龍江、甘肅、山西、內(nèi)蒙古等地。黃芪屬中醫(yī)方劑內(nèi)常用補(bǔ)氣藥物,常被用于表虛自汗、陰虛盜汗、肺氣虛證等治療中,目前已有2000多年的藥用歷史[1]?,F(xiàn)階段,黃芪不再僅限于藥物治療中,逐漸開始被人們用于食療與保健中。但由于黃芪資源需求的增大,導(dǎo)致近年來野生黃芪資源幾乎枯竭,人工培養(yǎng)黃芪已成市場潮流。但人工培養(yǎng)黃芪種質(zhì)較為混雜,生產(chǎn)水平較低,易造成用藥療效不佳。因此,需規(guī)范黃芪人工育種。鑒于此,藥用黃芪遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)分析研究的開展十分必要,其能幫助人們掌握黃芪遺傳多樣性、變異程度與居群構(gòu)成,從而為黃芪育種提供理論依據(jù)。

        1?材料和方法

        1.1?材料

        收集400份藥用黃芪,其中90份膜莢黃芪,310份蒙古黃芪,包括吉林、遼寧、黑龍江、山西、蒙古5個(gè)省份22個(gè)自然居群。

        1.2?方法

        基因組DNA提?。阂允榛谆寤@法分別提取每個(gè)樣本基因組DNA,通過核酸蛋白檢測儀,利用瓊脂糖凝膠電泳法,檢測所提取DNA濃度,將最終DNA濃度調(diào)成50ng/ul,放于-20℃條件下備用。

        PCR擴(kuò)增與檢測:參照SSR通用性特點(diǎn),以同科植物甘草64對SSR引物,實(shí)施多態(tài)性篩選,選取10對重復(fù)性、多態(tài)性較高的SSR引物進(jìn)行試驗(yàn)。PCR擴(kuò)增體系結(jié)合以往研究進(jìn)行,以全自動(dòng)毛細(xì)管電泳檢測擴(kuò)增產(chǎn)物。

        SSR數(shù)據(jù)處理:判定并記錄毛細(xì)管電泳檢查結(jié)果,以PowerMarker軟件處理SSR位點(diǎn)多態(tài)信息值(PIC),通過GenAIEx6.503軟件分析遺傳分化與遺傳多樣性,包括:有效等位基因(Ne)、等位基因數(shù)(Na)、遺傳多樣性(H)、觀測雜合度(Ho)、期望雜合度(He)。

        2?結(jié)果

        2.1?藥用黃芪遺傳多樣性分析

        基于物種層次上,對膜莢黃芪與蒙古黃芪實(shí)施遺傳多樣性分析(表2),發(fā)現(xiàn)膜莢黃芪、蒙古黃芪H分別為0.756、0.807,平均為0.781,總體而言以上兩種黃芪遺傳多樣性均較高,其中,膜莢黃芪遺傳多樣性低于蒙古黃芪。兩種黃芪的居群觀測雜合度皆低于期望雜合度,并F均高于零,這提示兩種黃芪居群有雜合子缺陷。

        2.2?藥用黃芪遺傳結(jié)構(gòu)分析

        通過GenAlEx6.503軟件,對膜莢黃芪、蒙古黃芪居群內(nèi)、居群間遺傳變異實(shí)施分子方差分析(表3),發(fā)現(xiàn)黃芪居群內(nèi)遺傳變異率為84%,居群間遺傳變異率為6%,種間遺傳變異率為8%,這表示遺傳變異主要存在于居群內(nèi)。以STRUCTURE軟件對黃芪居群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,把分組數(shù)K設(shè)置為2~10,每個(gè)K值反復(fù)測試10次,結(jié)果顯示,△K到達(dá)最大值時(shí),

        K為3,故而可把黃芪22個(gè)居群分成3個(gè)亞群,即膜莢黃芪為1個(gè)亞群,內(nèi)蒙古區(qū)與少數(shù)山西居群為1亞群,多數(shù)山西產(chǎn)地居群為1亞群。

        3?討論

        近年來,由于分子標(biāo)記技術(shù)的快速發(fā)展,臨床上已將多種分子標(biāo)記用于遺傳圖譜組建、核心種質(zhì)構(gòu)建、親緣關(guān)系鑒定、植物遺傳多樣性分析等中[2]。SSR屬于共顯性標(biāo)記,由于其具有多態(tài)性高、重復(fù)性好、操作便利等優(yōu)勢,目前已成為最有效、理想的一種分子標(biāo)記,并被廣泛用于黨參、甘草等多種藥物遺傳多樣性分析中[3]。故而,本研究中以SSR分子標(biāo)記來分析不同產(chǎn)地的藥用黃芪遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu),掌握不同物種不同居群藥用黃芪遺傳特點(diǎn)、變異情況與居群結(jié)構(gòu),以期為黃芪優(yōu)質(zhì)育種與保護(hù)工作提供理論支持。

        本研究中,經(jīng)對400個(gè)樣本遺傳多樣性分析,得出藥用黃芪具有較好遺傳多樣性,其中蒙古黃芪遺傳多樣性更豐富,這表示蒙古黃芪在不斷生長與進(jìn)化中,累積了多種等位變異基因,較膜莢黃芪,其環(huán)境適應(yīng)能力更強(qiáng),遺傳進(jìn)化更有潛力。膜莢黃芪與蒙古黃芪居群間、物種間的分子方差分析結(jié)果提示:以上兩種黃芪遺傳變異主要存在于居群內(nèi)。膜莢黃芪與蒙古黃芪均屬于異花授粉植物,此特點(diǎn)促使黃芪于生長繁殖期間居群內(nèi)部更易發(fā)生基因交流與變異,所以,這可能為黃芪變異主要存在于居群內(nèi)的原因。黃芪居群遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示:膜莢黃芪為1亞群,蒙古黃芪分為2個(gè)亞群,一個(gè)為內(nèi)蒙古區(qū)與一些山西居群,1個(gè)為多數(shù)山西產(chǎn)地居群,這可能是由于內(nèi)蒙古地區(qū)與山西地區(qū)均為藥用黃芪主要生產(chǎn)地,因人為因素導(dǎo)致兩地區(qū)黃芪出現(xiàn)種質(zhì)交流;加之兩地地理環(huán)境較為相似,生長期間可能會(huì)出現(xiàn)變異與同等分化。

        綜上,藥用黃芪遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)分析的開展,能幫助人們了解黃芪遺傳多樣性、變異特點(diǎn)與居群構(gòu)成,有助于黃芪優(yōu)質(zhì)育種、利用、開發(fā)工作的開展。

        參考文獻(xiàn):

        [1]?劉蓬蓬,陳江寧,孟莉,等. 基于Illumina MiSeq高通量測序分析黃芪內(nèi)生細(xì)菌多樣性[J]. 中草藥,2018,49(11):214-216.

        [2]?王剛,曹佩. 分子標(biāo)記技術(shù)在藥用植物種質(zhì)資源研究中的應(yīng)用[J]. 中國現(xiàn)代中藥,2019,21(11):1435-1444.

        [3]?楊育峰,史典義,王雁楠,等. 基于轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的甘薯SSR標(biāo)記開發(fā)及群體聚類分析[J]. 分子植物育種,2018,23(11):3569-3579.

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