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        新疆和靜縣綿羊細(xì)粒棘球蚴流行株基因分型研究

        2020-07-23 06:24:30薛新梅齊萌陶大勇
        中國奶牛 2020年6期
        關(guān)鍵詞:新疆

        薛新梅,齊萌,陶大勇

        (塔里木大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院,阿拉爾 843300)

        棘球蚴病(Echinococcosis)又稱包蟲病,是由棘球絳蟲(Echinococcus)的幼蟲棘球蚴(Echinococcus cyst)寄生于人畜體內(nèi)引起的一種嚴(yán)重危害人體健康和畜牧業(yè)發(fā)展的人畜共患寄生蟲病。目前公認(rèn)的棘球?qū)俳{蟲有4個種,而我國主要是細(xì)粒棘球絳蟲(E.granulosus)[1]。該病呈世界分布,廣泛流行于亞洲、拉丁美洲、南歐、大洋洲及冰島等畜牧業(yè)發(fā)達(dá)的國家及地區(qū),主要以發(fā)展中國家流行強(qiáng)度較高[2,3]。在我國主要以新疆、云南、陜西、青海、甘肅、西藏、寧夏、內(nèi)蒙古和四川西部等地區(qū)流行為主,嚴(yán)重危害畜牧業(yè)生產(chǎn)和人類健康,造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失[4,5]。近年來由于分子生物學(xué)在寄生蟲領(lǐng)域的應(yīng)用,能夠在基因水平上進(jìn)行細(xì)粒棘球蚴病的診斷。應(yīng)用PCR測定線粒體細(xì)胞色素c氧化酶亞基1(Cytochrome c oxidase subunit 1,COx1)基因的序列可用于鑒定細(xì)粒棘球蚴的基因變異,并可作為細(xì)粒棘球蚴進(jìn)化變異的指示器,因此許多學(xué)者常常把其作為細(xì)粒棘球蚴的基因分型、進(jìn)化關(guān)系分析和重新分類等的重要依據(jù)[6,7]。

        和靜縣作為畜牧業(yè)大縣,牲畜存欄104.3萬頭(只),其中羊存欄88.5萬只,已成為新疆現(xiàn)代畜牧業(yè)的重要組成部分,因此肝包蟲的防控顯得日益重要。為了弄清新疆和靜縣綿羊細(xì)粒棘球蚴病的感染情況及其流行株基因分型,筆者于2019年9~10月對來源于新疆和靜縣屠宰場1 115只1歲以上綿羊采取剖檢的方法進(jìn)行了細(xì)粒棘球蚴病的感染情況調(diào)查和統(tǒng)計,并對隨機(jī)分離的10個包囊病灶利用線粒體細(xì)胞色素氧化酶基因1(mtCO1)通過PCR擴(kuò)增、克隆測序的方法進(jìn)行了細(xì)粒棘球蚴流行株的基因分型,以確定和靜縣綿羊細(xì)粒棘球蚴的感染情況和主要流行基因型,為該地區(qū)綿羊細(xì)粒棘球蚴病的科學(xué)防控提供參考。

        1 材料和方法

        1.1 取樣地區(qū)概述

        和靜縣隸屬于新疆巴音郭楞蒙古自治州,位于巴音郭楞蒙古自治州西北部,下轄1個區(qū)公所(巴音布魯克區(qū)公所)、4個鎮(zhèn)、8個鄉(xiāng),其中農(nóng)區(qū)有5個鄉(xiāng)鎮(zhèn)、牧區(qū)有7個鄉(xiāng)鎮(zhèn),擁有草場面積達(dá)214.79萬hm2,是全國面積最大的高山天然草原。

        1.2 病例來源

        來源于2019年9~10月和靜縣屠宰場屠宰綿羊(主要來自和靜縣農(nóng)區(qū)和牧區(qū))。

        1.3 主要儀器及試劑

        離心機(jī)和PCR儀,購自Eppendorf中國有限公司;JY系列電泳儀,購自北京六一生物科技有限公司;凝膠成像分析系統(tǒng),購自BioRad公司;組織DNA提取試劑盒、Taq plus DNA聚合酶、dNTP、瓊脂糖凝膠回收試劑盒、瓊脂糖、DNAMarker及其他生化試劑,購自上海生物工程公司;pMD18-T載體,購自大連TaKara公司;大腸桿菌 (E.coli) DH5α感受態(tài)細(xì)胞,石河子大學(xué)寄生蟲實驗室提供。

        1.4 病原學(xué)檢測

        進(jìn)行剖解檢查:待羊屠宰后,取出肝、肺等臟器,經(jīng)肉眼觀察和觸摸仔細(xì)檢查肝臟和肺臟表面有無棘球蚴包囊,并記錄綿羊的來源地和細(xì)粒棘球蚴的感染數(shù),然后將帶有棘球蚴包囊的臟器帶回實驗室。

        1.5 病料的采集及DNA的提取

        從和靜縣屠宰場收集感染細(xì)粒棘球蚴綿羊的臟器,以一只羊肝臟或肺臟臟器的包囊為一份陽性病料,用5mL注射器共抽取10份感染病料囊液于1.5mL EP管中,8 000r/min離心8min,將上清液置于-20℃保存,將含有原頭細(xì)粒棘球蚴的樣品用TIANamp UenomicDNA Kit提取基因組DNA,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.6 PCR擴(kuò)增及測序

        以提取的基因組DNA為模板,依據(jù)文獻(xiàn)報道的目的基因進(jìn)行測試[8],引物由北京六合華大基因生物公司合成。首先擴(kuò)增線粒體細(xì)胞色素氧化酶基因1(mtCO1)。mtCO1上游引物:5'- TTT TTT GGG CAT CCT GAG GTT TAT-3',mtCO1下游引物:5'-TAA AGA AAG AAC ATA ATG AAA ATG-3';采用20μL反應(yīng)體系:ddH2O 9μL,2×PCR Mix 8μL,模板2μL,上、下游引物各0.5μL。PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5min,94℃變性30s,50℃退火45s,72℃延伸35s,38個循環(huán),最后72℃延伸10min。PCR產(chǎn)物用1.3%瓊脂糖凝膠電泳檢測。然后用瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒切膠回收PCR產(chǎn)物中的目的片段,并與載體pMD19-T在4℃條件下過夜連接;12h后將產(chǎn)物轉(zhuǎn)化于E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞中。在氨芐青霉素平板上進(jìn)行篩選,然后做菌液PCR反應(yīng),進(jìn)一步篩選驗證。將驗證正確的重組載體產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)有限公司測序,以確定在新疆和靜縣流行的細(xì)粒棘球蚴的基因型。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 綿羊細(xì)粒棘球蚴感染情況

        經(jīng)對2019年9~10月和靜縣屠宰場屠宰的1 115只綿羊細(xì)粒棘球蚴病的感染情況進(jìn)行調(diào)查和統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)有88只綿羊臟器表面有棘球蚴包囊,感染率為7.89%,其中來自農(nóng)區(qū)的綿羊感染率為3%(10/331),來自牧區(qū)的綿羊感染率為9.9%(78/784),見表1。

        表1 綿羊細(xì)粒棘球蚴的感染情況

        2.2 細(xì)粒棘球蚴mtCOl基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果

        通過mtCO1引物PCR擴(kuò)增后的目的基因產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測,獲得特異性的PCR產(chǎn)物,片段長度為446bp(圖1)??寺∞D(zhuǎn)化后,隨機(jī)挑取單菌落,做菌液PCR篩選驗證,成功得到陽性轉(zhuǎn)化子(圖2)。

        圖1 細(xì)粒棘球蚴mtCO1基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果

        圖2 菌液PCR擴(kuò)增結(jié)果

        2.3 細(xì)粒棘球蚴mtCO1基因的序列比對分析

        經(jīng)測序,新疆和靜縣綿羊細(xì)粒棘球蚴線粒體細(xì)胞色素氧化酶基因1(mtCO1)的片段長度為446 bp。對10個綿羊細(xì)粒棘球蚴流行株的mtCO1基因序列通過NCBI中的Blast功能比對,發(fā)現(xiàn)與登錄號為KT446001.1、KT968706.1、HF947595.1的同源性為99%~100%,證實新疆和靜縣綿羊細(xì)粒棘球蚴流行株基因型為G1型。

        3 討論

        細(xì)粒棘球絳蟲自1905年我國青島首次報道以來,國內(nèi)外學(xué)者對其感染情況進(jìn)行了大量調(diào)查研究。Kamal等于2011年對非洲蘇丹地區(qū)待屠宰的4 378只綿羊的細(xì)粒棘球蚴感染情況進(jìn)行了調(diào)查統(tǒng)計,結(jié)果顯示有26只綿羊感染,感染率為0.6%[9]。宋雪梅于2013年8~11月對新疆塔城地區(qū)沙灣縣屠宰場屠宰的1 040只綿羊細(xì)粒棘球蚴病感染情況進(jìn)行了調(diào)查統(tǒng)計,結(jié)果顯示綿羊棘球蚴平均感染率為4.3%[10]。本研究通過對和靜縣源自農(nóng)區(qū)和牧區(qū)的綿羊進(jìn)行細(xì)粒棘球蚴感染情況調(diào)查統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)來自牧區(qū)的綿羊細(xì)粒棘球蚴病感染率為7.89%,明顯高于農(nóng)區(qū)感染率的3%。分析其原因,可能與綿羊飼養(yǎng)方式有關(guān)。根據(jù)走訪調(diào)查發(fā)現(xiàn),牧區(qū)多以放牧的形式進(jìn)行飼養(yǎng),由于羊群數(shù)量龐大,常伴有牧羊犬看護(hù),牧羊犬往往造成驅(qū)蟲給藥預(yù)防不及時,再加上防控意識缺乏,常有牧民把感染包蟲囊的內(nèi)臟給牧羊犬吞食;最后由于放牧區(qū)域經(jīng)常轉(zhuǎn)場,加大了其傳播風(fēng)險。而農(nóng)區(qū)多以圈養(yǎng)形式飼養(yǎng),降低了以上感染風(fēng)險。針對這一現(xiàn)狀,建議采取以下措施來控制和靜縣牧區(qū)包蟲病的流行:①加強(qiáng)牧區(qū)包蟲病的預(yù)防工作;②對包蟲病感染臟器進(jìn)行無害化處理,嚴(yán)格控制其流向牧羊犬;③定期對牧羊犬進(jìn)行驅(qū)蟲,并對糞便進(jìn)行深埋處理;④加強(qiáng)和普及綿羊細(xì)粒棘球蚴的疫苗免疫工作,并及時做好監(jiān)測;⑤控制牧羊犬的數(shù)量。由于犬作為細(xì)粒棘球絳蟲的終末宿主,糞便中的蟲卵量很大,易污染牧場環(huán)境,因此應(yīng)將和靜縣包蟲病的防控重點放在牧羊犬?dāng)?shù)量的控制上,從而有效控制包蟲病在人畜間的流行[11]。

        養(yǎng)羊業(yè)是新疆和靜縣畜牧業(yè)的主要經(jīng)濟(jì)支柱,由于草場資源豐富,多選擇放牧的形式飼養(yǎng),使該地區(qū)成為人畜包蟲病的高發(fā)區(qū)。近些年來,國外學(xué)者借助分子生物學(xué)方法以及細(xì)粒棘球蚴絳蟲基因組的特征,把其分為10種(G1-G10),其中G1為最常見的綿羊株[12,13]。Vural等對土耳其綿羊源細(xì)粒棘球蚴分離株樣品進(jìn)行擴(kuò)增測序,發(fā)現(xiàn)G1型基因廣泛存在于綿羊體內(nèi),且同時發(fā)現(xiàn)G3型[14]。張學(xué)勇等對青海天峻地區(qū)16份綿羊源和2份人源細(xì)粒棘球蚴分離株樣品進(jìn)行COx1基因PCR擴(kuò)增、測序,發(fā)現(xiàn)人和綿羊細(xì)粒棘球蚴流行株的基因型均屬于G1型[15]。本研究對源自新疆和靜縣農(nóng)區(qū)和牧區(qū)的10份綿羊細(xì)粒棘球蚴分離株樣品進(jìn)行了線粒體細(xì)胞色素氧化酶基因1(mtCO1)的擴(kuò)增、克隆測序,通過NCBI中的Blast功能比對發(fā)現(xiàn),和靜縣綿羊細(xì)粒棘球蚴流行株均為G1型,未發(fā)現(xiàn)其他型,這可能與采樣基數(shù)偏少有關(guān)。確定和靜縣綿羊細(xì)粒棘球蚴流行株的基因型,為該地區(qū)綿羊包蟲病防控工作和分子流行病學(xué)調(diào)查提供了科學(xué)依據(jù)以及數(shù)據(jù)支持。

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