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        棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基基因克隆及表達(dá)分析

        2020-07-09 10:51:12陳嘉潔王夢(mèng)珂付曉政李瑞趙特周琳

        陳嘉潔,王夢(mèng)珂,付曉政,李瑞,趙特,周琳

        (1.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,河南 鄭州 450002; 2.河南省新型農(nóng)藥創(chuàng)制與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南 鄭州 450002;3.河南省綠色農(nóng)藥創(chuàng)制工程技術(shù)研究中心,河南 鄭州450002)

        20世紀(jì)80年代首次在酵母細(xì)胞的液泡膜上發(fā)現(xiàn)了一類(lèi)運(yùn)輸H+的三磷酸腺苷酶,命名為液泡型H+-ATP酶(Vacuolar-type proton ATPase),簡(jiǎn)稱(chēng)V-ATP酶[1]。V-ATP酶是一種多亞基蛋白復(fù)合物,由V1和V0兩個(gè)結(jié)構(gòu)域組成。V1結(jié)構(gòu)域包括A、B、C、D、E、F、G和H共8個(gè)亞基,負(fù)責(zé)ATP的水解;V0結(jié)構(gòu)域包括a、c、c′、c″、d和e共6個(gè)亞基,負(fù)責(zé)質(zhì)子的轉(zhuǎn)運(yùn)[2]。V-ATP酶是一種真核細(xì)胞的陽(yáng)離子轉(zhuǎn)運(yùn)ATP酶,廣泛存在于原生質(zhì)膜和細(xì)胞器的內(nèi)膜系統(tǒng),包括核內(nèi)體、高爾基體、溶酶體及網(wǎng)格蛋白包被囊泡等,對(duì)維持細(xì)胞器的酸性環(huán)境具有重要作用[3]。它能酸化所有真核細(xì)胞的亞細(xì)胞間隔和高等生物某些特殊組織的細(xì)胞外環(huán)境,為細(xì)胞各種生理活動(dòng)提供最佳的pH值[3-4]。如在骨骼中,破骨細(xì)胞利用V-ATP酶為骨吸收創(chuàng)造一個(gè)至關(guān)重要的局部酸性環(huán)境;在附睪中,V-ATP酶酸化腔室這一過(guò)程對(duì)精子正常成熟和儲(chǔ)存至關(guān)重要[5]。昆蟲(chóng)V-ATP酶主要存在于馬氏管、中腸、唾液腺等的上皮細(xì)胞質(zhì)膜上[6-7],在腸道堿化、營(yíng)養(yǎng)吸收和離子調(diào)控中發(fā)揮重要功能[8]。近年來(lái),對(duì)昆蟲(chóng)V-ATP酶的結(jié)構(gòu)與功能研究取得了一定進(jìn)展,且研究表明V-ATP酶在昆蟲(chóng)生長(zhǎng)發(fā)育中起著重要作用。通過(guò)RNAi技術(shù)沉默黑胸大蠊PeriplanetafuliginosaB亞基,其幼蟲(chóng)生長(zhǎng)受到抑制,并表現(xiàn)出明顯的蛻皮缺陷[9];利用RNAi技術(shù)沉默東方粘蟲(chóng)MythimnaseparataV-ATP酶H亞基,試驗(yàn)組黏蟲(chóng)出現(xiàn)發(fā)育緩慢、體型減小的現(xiàn)象[10]。果蠅Drosophilamelanogaster、粉虱Triboliumcastaneum、豌豆蚜Acyrthosiphonpisum、煙草天蛾Manducasexta[11]和玉米根螢葉甲Diabroticavirgiferavirgifera[12]通過(guò)攝取V-ATP酶E亞基dsRNA,導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)量部分下調(diào),幼蟲(chóng)致死率顯著上升 ,這表明干擾V-ATP酶E亞基正常表達(dá)對(duì)昆蟲(chóng)是致命的。

        棉鈴蟲(chóng)Helicoverpaarmigera(Hübner)屬鱗翅目夜蛾科,是一種全球性農(nóng)林業(yè)害蟲(chóng),多食且分布廣泛,具有較強(qiáng)的繁殖和環(huán)境適應(yīng)能力,其寄主植物高達(dá)20多科200余種[13],包括棉花、小麥、玉米和花生等農(nóng)作物以及蘋(píng)果、棗樹(shù)、辣椒和番茄等果樹(shù)和蔬菜[14-15],在棉花、玉米和蔬菜等重要作物生產(chǎn)中造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失[16]。棉鈴蟲(chóng)在中國(guó)各地均有發(fā)生,且世代較多,內(nèi)蒙及新疆地區(qū)每年發(fā)生3代,北方地區(qū)每年發(fā)生3~4代,長(zhǎng)江流域及華南地區(qū)每年發(fā)生5~6代,個(gè)別地區(qū)如云南每年可發(fā)生7代。隨著棉鈴蟲(chóng)對(duì)化學(xué)殺蟲(chóng)劑和Bt棉抗性的產(chǎn)生和發(fā)展,其防治難度越來(lái)越大,因此,尋找并挖掘新的防治靶標(biāo)顯得尤為重要。本研究通過(guò)克隆V-ATP酶E亞基,并采用熒光定量技術(shù)對(duì)該亞基基因在棉鈴蟲(chóng)整個(gè)發(fā)育期及不同組織中的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行分析,以便進(jìn)一步深入研究V-ATP酶在棉鈴蟲(chóng)生命過(guò)程中的作用,為V-ATP酶可否作為防治棉鈴蟲(chóng)的潛在靶標(biāo)提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 供試?yán)ハx(chóng) 棉鈴蟲(chóng)為河南省新型農(nóng)藥創(chuàng)制與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室飼養(yǎng)的室內(nèi)種群,飼養(yǎng)條件為溫度(26 ± 1)℃、光照周期14 L∶10 D、相對(duì)濕度60%~85%。飼喂人工飼料,人工飼料的配制和養(yǎng)蟲(chóng)器具的消毒參照梁革梅等[17]的方法。

        1.1.2 試劑及儀器 Trizol Reagent購(gòu)自Ambion公司,凝膠回收試劑盒、反轉(zhuǎn)錄試劑盒及熒光定量試劑盒購(gòu)自Takara公司,TA克隆試劑盒及大腸桿菌EscherichiacoliDH5α感受態(tài)細(xì)胞購(gòu)自北京莊盟國(guó)際生物基因科技有限公司,質(zhì)粒DNA小量提取試劑盒購(gòu)自Solarbio公司。采用儀器有DYY-6C電泳儀(北京六一儀器廠(chǎng))、InGeniusLHR凝膠成像系統(tǒng)(Syngene公司)、Infinite M2000 PRO酶標(biāo)儀(Tecan公司)、QuantStudio 3 Real-Time PCR System(美國(guó)ABI公司)等。引物合成和測(cè)序工作由鄭州擎科生物技術(shù)有限公司完成。

        1.2 方法

        1.2.1 棉鈴蟲(chóng)總RNA的提取和cDNA的合成 供試材料為棉鈴蟲(chóng)卵、1~5齡整頭幼蟲(chóng)、預(yù)蛹期幼蟲(chóng)、雌蛹、雄蛹、雌蛾、雄蛾,處于交配期雌雄成蟲(chóng)的觸角、頭(去除觸角)、胸(去除翅和足)、腹節(jié)(去除外生殖器)、足、翅、外生殖器(雌性產(chǎn)卵器和雄性交配器)以及4齡幼蟲(chóng)的中腸。蟲(chóng)體和組織液氮研磨后按照Trizol法提取總RNA,提取的總RNA經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳和酶標(biāo)儀檢測(cè)濃度后放入-80 ℃保存?zhèn)溆?。基因克隆和熒光定量PCR所用的cDNA模板按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)制備。

        1.2.2 棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基的基因克隆 從棉鈴蟲(chóng)轉(zhuǎn)錄組中獲得V-ATP酶E亞基的核苷酸序列,利用DNAMAN9軟件在其開(kāi)放閱讀框序列兩端設(shè)計(jì)1對(duì)特異性引物HAE-F和HAE-R(表1),以合成的cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。50 μL PCR反應(yīng)體系:2×MasterMix 25 μL,10 μmol·L-1正反向引物各2 μL,cDNA模板2 μL,ddH2O 19 μL。離心混勻后放入PCR儀。PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性15 s,60 ℃退火15 s,72 ℃延伸30 s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);然后72 ℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行分離,切膠后的回收產(chǎn)物與T載體連接轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞中,氨芐抗性篩選陽(yáng)性克隆,挑取白色單菌落進(jìn)行菌液PCR,將正確的菌落擴(kuò)大培養(yǎng),提取質(zhì)粒并酶切鑒定目的片段。檢測(cè)成功的質(zhì)粒送鄭州擎科生物科技有限公司測(cè)序。

        1.2.3 生物信息學(xué)分析 將得到的測(cè)序結(jié)果拼接成全長(zhǎng)序列,使用NCBI的Blast程序進(jìn)行不同物種間的同源性比較,用DNAMAN9軟件進(jìn)行基因一致性分析,用分子進(jìn)化遺傳分析軟件MEGA 7.0分析不同物種間V-ATP酶E亞基的進(jìn)化關(guān)系,用ProtParam軟件進(jìn)行相對(duì)分子質(zhì)量、等電點(diǎn)及蛋白的親疏水性等理化性質(zhì)分析,用SOPMA軟件預(yù)測(cè)蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu),用Phyre 2軟件預(yù)測(cè)蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)。

        表1 RT-PCR及熒光定量PCR反應(yīng)所用引物Table 1 List of primers used in RT-PCR and qRT-PCR reactions

        1.2.4 熒光定量PCR 根據(jù)棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基基因序列設(shè)計(jì)1對(duì)特異熒光定量PCR引物QG-F和QG-R,為了消除樣本的差異,以GAPDH為內(nèi)參基因設(shè)計(jì)上下游引物GAPDH-F和GAPDH-R(表1),參照熒光定量試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行熒光定量PCR 反應(yīng)。12 μL反應(yīng)體系:TB Green Premix ExTaqⅡ(Tli RNaseH Plus)6 μL、10 μmol·L-1正反向引物各0.5 μL、cDNA模板1 μL、OX Reference Dye Ⅱ 0.24 μL、ddH2O 3.76 μL。反應(yīng)條件:50 ℃ 2 min,95 ℃預(yù)變性2 min;兩步法95 ℃變性15 s,60 ℃退火30 s,40個(gè)循環(huán);溶解曲線(xiàn)95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min。每個(gè)樣品設(shè)置3個(gè)重復(fù),反應(yīng)結(jié)束后收集Ct值。

        1.2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析 數(shù)據(jù)分析采用2-ΔΔCt公式法計(jì)算,ΔCt樣品=Ct目的基因-Ct內(nèi)參基因,ΔΔCt=ΔCt樣品-ΔCt參照樣品。采用EXCEL計(jì)算各重復(fù)平均值與標(biāo)準(zhǔn)差,用SPSS 19.0軟件進(jìn)行差異顯著性分析,組間比較采用單因素方差分析和鄧肯式新復(fù)極差法檢驗(yàn)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 基因克隆及生物信息學(xué)分析

        通過(guò)特異性引物HAE-F和HAE-R擴(kuò)增出棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基,獲得E亞基的開(kāi)放閱讀框序列。測(cè)序結(jié)果顯示,序列全長(zhǎng)681 bp,編碼226個(gè)氨基酸,其核苷酸序列如圖1所示,并翻譯成對(duì)應(yīng)的氨基酸序列,5′端起始密碼子ATG和3′端終止密碼子TAA已用黑色方框標(biāo)出。

        圖1 棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶 E亞基基因的核苷酸和氨基酸序列Fig.1 Nucleotide and amino acid sequences of V-ATPase subunit E gene of Helicoverpa armigera

        氨基酸同源性分析結(jié)果表明,棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基氨基酸序列與斜紋夜蛾Spodopteralitura、粉紋夜蛾Trichoplusiani的一致性分別高達(dá)92%和91%,與其他鱗翅目昆蟲(chóng)一致性也較高,表明該基因在進(jìn)化上較為保守。不同昆蟲(chóng)V-ATP酶E亞基氨基酸序列N末端前70位完全保守,差異主要存在于中間大約100~200位(圖2)。將棉鈴蟲(chóng)與其他昆蟲(chóng)的E亞基氨基酸序列進(jìn)行比較,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖3),可以看出棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基與斜紋夜蛾、粉紋夜蛾聚集在同一進(jìn)化枝上,表明它們親緣關(guān)系最近。

        表2 不同昆蟲(chóng)V-ATP酶 E亞基氨基酸同源性分析Table 2 Holomogy analysis of amino acid sequences of V-ATPase subunit E gene of different insects %

        圖3 不同昆蟲(chóng)V-ATP酶E亞基氨基酸序列系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)Fig.3 Phylogenetic tree based on amino acid sequences of V-ATPase subunit E in different insects

        預(yù)測(cè)棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基的蛋白相對(duì)分子量約為26.1 kD,理論等電點(diǎn)pI為8.30,親水性平均系數(shù)GRAVY為-0.501,表明E亞基是一個(gè)親水性蛋白。通過(guò)蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)(圖4)可以發(fā)現(xiàn),E亞基由72.12%的α-螺旋(Alpha helix)、14.60%的無(wú)規(guī)則卷曲(Random coil)、9.29%的延伸鏈(Extended strand)和3.98%的β-轉(zhuǎn)角(Beta turn)組成,在整個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中,α-螺旋是最主要的結(jié)構(gòu)元件。蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)(圖5)結(jié)果表明,該蛋白質(zhì)由一個(gè)長(zhǎng)的α-螺旋和一個(gè)松散的球狀蛋白構(gòu)成,其空間結(jié)構(gòu)主要包含 α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲兩種元件。

        注:α-螺旋,藍(lán)色;無(wú)規(guī)則卷曲,紫色;延伸鏈,紅色;β-轉(zhuǎn)角,綠色。Note:Blue is used for alpha helix; Purple for random coil; Red for extended strand; and green for beta turn.

        圖5 棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Fig.5 The protein tertiary structure prediction of V-ATPase subunit E of Helicoverpa armigera

        2.2 棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基基因的表達(dá)分析

        以棉鈴蟲(chóng)卵V-ATP酶E亞基基因表達(dá)量作為基準(zhǔn)含量,進(jìn)行不同發(fā)育階段的基因表達(dá)分析。結(jié)果表明(圖6),V-ATP酶E亞基在棉鈴蟲(chóng)各個(gè)發(fā)育階段均有表達(dá)且表達(dá)量存在差異。5齡幼蟲(chóng)的表達(dá)量最高,蛹期的表達(dá)量最低。基因表達(dá)量從卵到幼蟲(chóng)期逐漸增加,預(yù)蛹期基因表達(dá)量出現(xiàn)大幅度降低,蛹期繼續(xù)減少,成蟲(chóng)期有所增加。

        以棉鈴蟲(chóng)雌蛾翅部V-ATP酶 E亞基基因表達(dá)量作為基準(zhǔn)含量,進(jìn)行不同組織的基因表達(dá)分析。結(jié)果表明(圖7),V-ATP酶E亞基在棉鈴蟲(chóng)各個(gè)組織均有表達(dá),其中,在中腸內(nèi)的表達(dá)量最高,為其他組織中表達(dá)量的3-25倍;而在雌蛾腹節(jié)的表達(dá)量最低。在成蟲(chóng)中,以觸角的表達(dá)量為最高,且雄蛾觸角表達(dá)量顯著高于雌蛾;雌雄成蟲(chóng)其他組織中表達(dá)差異不明顯。

        圖6 V-ATP酶E亞基基因在棉鈴蟲(chóng)不同發(fā)育階段的表達(dá)量Fig.6 The relative expression levels of the V-ATPase subunit E gene in different developmental stages of Helicoverpa armigera

        圖7 V-ATP酶E亞基基因在棉鈴蟲(chóng)不同組織中的表達(dá)量Fig.7 The relative expression levels of the V-ATPase subunit E gene in different tissues of Helicoverpa armigera

        3 討論

        V-ATP酶的E亞基和G亞基組成EG-異二聚體(EG-heterodimers),該二聚體在V1和V0結(jié)構(gòu)域組裝及解離過(guò)程中具有重要作用[18]。本研究成功獲得了棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基基因,氨基酸序列與近源物種V-ATP酶E亞基具有很高同源性,表現(xiàn)出高度的保守性。MARSHANSKY等人[19]解析了釀酒酵母SaccharomycescerevisiaeV-ATP酶E亞基的蛋白結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)E亞基含有一個(gè)長(zhǎng)的N末端α-螺旋(110個(gè)氨基酸)和一個(gè)球狀C末端,本研究預(yù)測(cè)的棉鈴蟲(chóng)V-ATP酶E亞基的蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)與上述研究結(jié)果一致。

        本研究發(fā)現(xiàn),V-ATP酶E亞基在棉鈴蟲(chóng)不同發(fā)育階段及組織中均有表達(dá)?;虮磉_(dá)量與昆蟲(chóng)發(fā)育階段的能量代謝高低呈正相關(guān),幼蟲(chóng)期取食量大,各項(xiàng)生理生命活動(dòng)旺盛,需要V-ATP酶的參與,基因表達(dá)量均較高;昆蟲(chóng)在卵和蛹期幾乎沒(méi)有活動(dòng)量,亦不需進(jìn)食,積蓄能量為后期孵化和羽化做準(zhǔn)備,故基因表達(dá)量較低;到成蟲(chóng)時(shí)期表達(dá)量再次升高,可能與成蟲(chóng)的飛行、交配等活動(dòng)需要耗能有關(guān)。已有研究表明,V-ATP酶在昆蟲(chóng)中腸離子轉(zhuǎn)運(yùn)生理學(xué)中起著核心作用,中腸含有多種與消化食物、吸收養(yǎng)分有關(guān)的蛋白酶,V-ATP酶通過(guò)水解ATP產(chǎn)生能量,將中腸腸腔中的H+轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞外,同時(shí)將K+運(yùn)送至腸腔中,以維持中腸適宜的pH環(huán)境而保證蛋白酶的活性[20]。中腸V-ATP酶還能堿化原生質(zhì)膜,并為氨基酸的吸收提供能量。昆蟲(chóng)中腸杯狀細(xì)胞頂端膜中存在高密度的V-ATP酶[4],并已從中腸獲得大量(以毫克量計(jì)算)純化的V-ATP酶[21]。本研究結(jié)果顯示,棉鈴蟲(chóng)中腸的表達(dá)量顯著高于其他組織,這與上述研究結(jié)果一致。另外,V-ATP酶在信號(hào)通路的直接調(diào)節(jié)中起作用[22],觸角作為感覺(jué)系統(tǒng)的重要組成部分,進(jìn)行著大量的神經(jīng)信號(hào)傳導(dǎo),本研究中棉鈴蟲(chóng)觸角中的基因表達(dá)量較高,推測(cè)其在昆蟲(chóng)的聯(lián)絡(luò)、覓食和交配等生命活動(dòng)中發(fā)揮著重要作用。

        V-ATP酶在棉鈴蟲(chóng)的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮著重要作用,是一個(gè)具有潛力的防治靶標(biāo),可利用基因編輯工具對(duì)V-ATP酶進(jìn)行更深入的功能挖掘和機(jī)理研究,為相關(guān)抑制劑及新農(nóng)藥的開(kāi)發(fā)提供重要參考,以探索害蟲(chóng)防治的新思路。

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