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        靶向MSTN基因shRNA表達(dá)載體的構(gòu)建與鑒定

        2020-07-03 00:47:18王麗俊鈕利喜
        醫(yī)學(xué)研究雜志 2020年5期
        關(guān)鍵詞:小鼠檢測(cè)

        王麗俊 鈕利喜

        肌肉生長(zhǎng)抑制素(myostatin,MSTN),簡(jiǎn)稱抑肌素,又名生長(zhǎng)分化因子8(GDF-8),是TGF-β超家族成員之一,其功能主要是作為一種骨骼肌生長(zhǎng)的負(fù)調(diào)控因子,限制肌肉超常發(fā)育[1]。該基因的缺失或突變會(huì)使肌細(xì)胞增生和肥大,機(jī)體表現(xiàn)為雙肌性狀[2,3]。對(duì)MSTN基因的深入研究在畜牧業(yè)及醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有重要意義。近年來(lái),研究發(fā)現(xiàn)MSTN不僅可調(diào)控肌肉生長(zhǎng)發(fā)育,在肌肉穩(wěn)態(tài)中起關(guān)鍵作用,而且還影響脂肪形成和骨骼發(fā)育,并與胰島素敏感度有關(guān)[4~6]。因此,有關(guān)MSTN基因與多種疾病的關(guān)系及其在機(jī)體代謝中的作用受到廣泛關(guān)注。RNA干擾(RNA interference, RNAi)是指在進(jìn)化過(guò)程中高度保守的、由雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)誘發(fā)的、同源mRNA高效特異性降解的現(xiàn)象[7]。該技術(shù)可以簡(jiǎn)便、快速、高效、特異性地抑制基因的表達(dá),因此受到了各個(gè)領(lǐng)域研究者的重視。該技術(shù)主要應(yīng)用于探查基因功能、基因和轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究等領(lǐng)域。本研究旨在構(gòu)建具有良好干擾效果的pSIREN-MSTN-shRNA表達(dá)載體,為后續(xù)通過(guò)RNA干擾技術(shù)調(diào)控MSTN基因表達(dá)以改善和治療MSTN相關(guān)疾病奠定基礎(chǔ)。

        材料與方法

        1.主要試劑和實(shí)驗(yàn)材料:限制性核酸內(nèi)切酶BamH Ⅰ和EcoR Ⅰ(1010S和1040S,日本TaKaRa公司);T4 DNA連接酶(2011A,日本TaKaRa公司);質(zhì)粒小量提取試劑盒(D1100,北京索萊寶科技有限公司);SYBR?Premix Ex Taq TMⅡ(Tli RNaseH Plus)試劑盒(RR820A,日本TaKaRa公司);GDF-8抗體(sc-134345,美國(guó)Santa Cruz公司);GAPDH抗體(MB001,南京巴傲得生物科技有限公司);m-lgGk BP-HRP二抗(sc-516102,美國(guó)Santa Cruz公司);瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(D2500-01,美國(guó)Omega Bio-Tek公司);通用RT-PCR試劑盒(M-MLV)(RP1100,北京索萊寶科技有限公司);RIPA組織/細(xì)胞裂解液(R0020,北京索萊寶科技有限公司);shRNA序列合成、引物序列合成(深圳華大基因公司)。健康ICR小鼠購(gòu)自山西醫(yī)科大學(xué)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中心,雄性,6~8周齡,20只。

        2.MSTN shRNA序列的設(shè)計(jì)與合成:根據(jù)Genbank上已公布的小鼠MSTN基因的mRNA序列(NM_010834.3),選用Invitrogen的BLOCK-iTTMRNAi Designer軟件,在線設(shè)計(jì)siRNA序列并挑選出3條可能具有良好干擾效果的siRNA序列,設(shè)計(jì)成包含正義鏈、loop環(huán)、反義鏈、轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)和酶切位點(diǎn)的shRNA寡核苷酸單鏈[8]。其序列詳見表1。

        3.pSIREN-MSTN-shRNA表達(dá)載體的構(gòu)建:將設(shè)計(jì)合成的shRNA引物進(jìn)行退火形成雙鏈,同時(shí)使用限制性內(nèi)切酶BamH Ⅰ和EcoR Ⅰ對(duì)載體pSIREN-DNR-DsRed-Express進(jìn)行雙酶切,1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定并用膠回收試劑盒回收酶切產(chǎn)物,與退火產(chǎn)物相連接(T4 DNA 連接酶,16℃水浴過(guò)夜)。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞,涂布于含有氨芐青霉素(100μg/ml)的固體LB平板上,37℃恒溫培養(yǎng)。挑取陽(yáng)性單菌落于5ml含有氨芐青霉素的液體LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)10~12h,提取質(zhì)粒,送至上海生工生物工程有限公司進(jìn)行測(cè)序,鑒定重組質(zhì)粒。將構(gòu)建好的質(zhì)粒命名為pSIREN-M664、pSIREN-M791和pSIREN-M819。

        表1 設(shè)計(jì)合成的shRNA序列

        4.shRNA表達(dá)載體導(dǎo)入小鼠體內(nèi):將6~8周齡的小鼠隨機(jī)分為4組:pSIREN-M664實(shí)驗(yàn)組、pSIREN-M791實(shí)驗(yàn)組和pSIREN-M819實(shí)驗(yàn)組及陰性對(duì)照組(NC組)。采用肌內(nèi)注射的方法將重組質(zhì)粒載體導(dǎo)入小鼠體內(nèi)。取100μg去內(nèi)毒素質(zhì)粒載體稀釋于200μl的PBS(pH 7.4)溶液中,吸入1ml注射器,并將稀釋液注入小鼠右后腿肌肉[9,10]。注射3天后,采用斷頸法處死小鼠,取其右后腿部肌肉組織,用于下一步實(shí)驗(yàn)。

        5.qRT-PCR檢測(cè)干擾后MSTN的mRNA表達(dá)水平:取各組小鼠肌肉組織,通過(guò)Trizol法提取總RNA,按照通用RT-PCR試劑盒說(shuō)明書,將RNA反轉(zhuǎn)錄合成為cDNA,利用SYBR法的real-time PCR試劑盒,以GAPDH為內(nèi)參基因,進(jìn)行實(shí)時(shí)定量PCR反應(yīng)。用于定量檢測(cè)的MSTN引物序列和GAPDH的引物序列如下:MSTN-上游引物為AACCTTCCCAGGACCAGGAGAA;MSTN-下游引物為GGCTTCAAAATCGACCGTGAGG;GAPDH-上游引物為ATCACTGCCACCCAGAAGACTG;GAPDH-下游引物為ATGCCAGTGAGCTTCCCGTTCAG。qRT-PCR反應(yīng)體系為25μl:SYBR Premix Ex Taq Ⅱ(2×)12.5μl、上下游引物(10μmol/L)各1μl、模板cDNA 2μl、ddH2O 8.5μl。每份樣品重復(fù)3次,結(jié)果采用 2-ΔΔct法進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。

        6.Western blot法檢測(cè)干擾后MSTN的蛋白質(zhì)表達(dá):各組取一定量的小鼠肌肉組織,充分剪碎后置于1.5ml的無(wú)菌EP管中,按照每20mg組織加入150~250μl裂解液的比例加入RIPA組織/細(xì)胞裂解液,混合均勻,冰浴30min后,12000r/min、4℃離心30min,上清液即為所提取的總蛋白。調(diào)節(jié)上樣量至每孔60μg蛋白樣品進(jìn)行12%的聚丙烯酰胺凝膠電泳分離。將蛋白轉(zhuǎn)印至PVDF膜上,5%脫脂奶粉室溫封閉1h,加入GDF-8一抗工作液(1∶200稀釋)和GAPDH一抗工作液(1∶10000稀釋)孵育,4℃過(guò)夜。TBST漂洗3次,加入HRP標(biāo)記的二抗工作液(1∶1000稀釋)后37℃ 孵育1h。TBST漂洗3次,ECL顯色。

        7.統(tǒng)計(jì)學(xué)方法:運(yùn)用Excel進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理。采用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行單因素方差分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié) 果

        1.pSIREN-DNR-DsRed-Express載體的酶切:對(duì)載體pSIREN-DNR-DsRed-Express進(jìn)行BamH Ⅰ和EcoR Ⅰ雙酶切,酶切后的質(zhì)粒載體條帶大小正確(圖1)。

        圖1 pSIREN-DNR-DsRed-Express載體的酶切結(jié)果M.DL5000 DNA Marker;1.未經(jīng)酶切的載體;2.經(jīng)過(guò)酶切的載體

        2.pSIREN-MSTN-shRNA表達(dá)載體的鑒定:由于插入的shRNA片段較小,不能通過(guò)PCR法或酶切鑒定,因此,將構(gòu)建好的重組質(zhì)粒送往上海生工生物公司測(cè)序鑒定,測(cè)試報(bào)告中的插入序列與所設(shè)計(jì)的shRNA引物序列完全一致,表明pSIREN-MSTN-shRNA表達(dá)載體構(gòu)建成功,可以用于后續(xù)的干擾實(shí)驗(yàn)。測(cè)序結(jié)果詳見圖2。

        3.shRNA干擾后MSTN的mRNA表達(dá)水平檢測(cè):利用qRT-PCR法檢測(cè)干擾后小鼠肌肉組織中的MSTN mRNA表達(dá)水平,其檢測(cè)結(jié)果詳見圖3。從條形圖中可以看出3個(gè)干擾RNA實(shí)驗(yàn)組MSTN mRNA表達(dá)都有所降低,pSIREN-NC組與其他各組MSTN mRNA表達(dá)水平差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。干擾質(zhì)粒組pSIR-M664、pSIR-M791和pSIR-M819與對(duì)照組中MSTN基因mRNA相對(duì)表達(dá)量比較,分別降低65%、61%和71%。

        圖3 MSTN的mRNA表達(dá)水平檢測(cè)與pSIREN-NC組比較,*P<0.01

        4.免疫印跡分析(Western blot, WB):WB法檢測(cè)干擾后的 MSTN蛋白表達(dá)水平,結(jié)果詳見圖4。3個(gè)MSTN shRNA實(shí)驗(yàn)組較對(duì)照組的MSTN蛋白表達(dá)量有一定程度的減少,表明pSIR-M664、pSIR-M791和 pSIR-M819均能降低MSTN蛋白的表達(dá)。

        圖4 MSTN的蛋白表達(dá)水平檢測(cè)A.Western blot法:1為shRNA陰性對(duì)照組,2~4分別為pSIREN-M664、pSIREN-M791和pSIREN-M819 shRNA表達(dá)載體干擾組;B.灰度分析MSTN蛋白質(zhì)相對(duì)表達(dá)量;與pSIREN-NC組比較,*P<0.01

        討 論

        小干擾RNA(small interfering RNA, siRNA)是能夠引起RNA干擾的小片段雙鏈RNA分子。siRNA可以整合到RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RISC)中,隨后雙鏈被分開,其中一條鏈在RISC作用下特異性與靶mRNA識(shí)別結(jié)合,通過(guò)降解mRNA來(lái)阻斷靶基因的表達(dá)[11]。siRNA阻斷基因的表達(dá)具有高效性、特異性、操作簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn)[12]。但siRNA的半衰期短,而shRNA可以克服這一缺點(diǎn),能夠持續(xù)性地干涉靶基因[13]。因此,與直接合成siRNA比較,利用shRNA表達(dá)載體表達(dá)來(lái)研究基因沉默要更為有效。對(duì)于RNA干擾載體,目前已經(jīng)開發(fā)了許多病毒和非病毒載體,但病毒載體的安全性問(wèn)題仍然存在。與使用病毒載體的方法比較,使用質(zhì)粒DNA的基于非病毒載體的方法可能為誘導(dǎo)RNAi的更安全的方法[14]。因此,本研究選用pSIREN-DNR-DsRed-Express質(zhì)粒構(gòu)建shRNA表達(dá)載體,以期得到具有顯著干擾效果的shRNA分子,為后續(xù)通過(guò)RNA干擾技術(shù)調(diào)控MSTN基因表達(dá)來(lái)改善和治療MSTN相關(guān)疾病奠定基礎(chǔ)。

        MSTN是可以調(diào)控肌肉生長(zhǎng)和發(fā)育的重要功能基因,其基因序列,尤其是外顯子序列,在不同物種間高度同源,十分保守。MSTN主要在骨骼肌中表達(dá),在心肌、脂肪組織、淋巴組織、肺部、脾臟和小腸等其他組織或器官中也有不同程度的表達(dá)[15]。隨著不斷深入的研究,發(fā)現(xiàn)MSTN基因除了可以負(fù)調(diào)控肌肉生長(zhǎng)外,在脂代謝、糖代謝、骨形成和骨吸收中也起著重要的調(diào)節(jié)作用,具有廣闊的應(yīng)用前景和商業(yè)價(jià)值。MSTN基因的敲減或敲除有助于提高家畜家禽酮體的瘦肉率,從而提高飼料利用率、降低飼養(yǎng)成本,促進(jìn)家畜家禽的肌肉生長(zhǎng)和肉類生產(chǎn)[16]。近年來(lái),對(duì)家畜家禽MSTN基因做了大量研究,已有文獻(xiàn)報(bào)道了牛、山羊、綿羊、豬、雞、鴨的shRNA真核表達(dá)載體和慢病毒載體或腺病毒載體,但其大多是在細(xì)胞水平中驗(yàn)證載體干擾效果[17~20]。在醫(yī)學(xué)研究中MSTN基因已被確立為治療肌肉萎縮、肌營(yíng)養(yǎng)不良等肌變性疾病的一個(gè)新的靶標(biāo)分子。通過(guò)抑制MSTN的表達(dá)來(lái)改善肌肉萎縮。此外,深入探討MSTN基因?qū)θ祟愄悄虿 ⒎逝职Y、骨質(zhì)疏松癥及其他慢性疾病甚至癌癥惡病質(zhì)的治療具有重要意義。MSTN基因的siRNA、miRNA、MSTN抗體、MSTN抑制劑等藥物方面的研究,在臨床醫(yī)學(xué)上體現(xiàn)出很高的應(yīng)用價(jià)值。

        綜上所述,本研究運(yùn)用qRT-PCR和WB法分別從mRNA水平和蛋白質(zhì)水平來(lái)驗(yàn)證所設(shè)計(jì)和構(gòu)建的pSIREN-MSTN-shRNA表達(dá)載體在小鼠體內(nèi)的干擾效果,為下一步建立動(dòng)物模型研究MSTN的siRNA質(zhì)粒治療效果奠定工作基礎(chǔ)。

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