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        薏苡附子敗醬散治療潰瘍性結(jié)腸炎的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)機(jī)制*

        2020-06-04 03:19:02周步高劉馥春張曉云劉端勇趙海梅江西中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院南昌330004江西中醫(yī)藥大學(xué)科技學(xué)院南昌330004
        江西中醫(yī)藥 2020年5期
        關(guān)鍵詞:信號(hào)研究

        ★ 周步高 劉馥春 張曉云 劉端勇 趙海梅*(.江西中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院 南昌 330004;.江西中醫(yī)藥大學(xué)科技學(xué)院 南昌 330004)

        潰瘍性結(jié)腸炎(UC)是一種非特異性炎癥性腸病,根據(jù)其臨床表現(xiàn),在中醫(yī)學(xué)上可歸屬為“腸癖”“泄瀉”“痢疾”范疇,但結(jié)合UC腸黏膜損傷的病理特征,則與“腸癰”更為接近[1-2],尤其是重度UC。曹穎甫[3]將膿成描述為:《金匱》所謂未成已成之膿所包至廣,一切炎性滲出物、腐化之白血球、腐爛之腸壁皮肉等均是,要在當(dāng)去之例一也?!吨T病源候論》曰:“大便膿血,似赤白下痢,而實(shí)非者,

        是腸癰也,卒得腸癰不曉,治之錯(cuò)在殺人?!庇纱丝芍c癰與UC的相似性。薏苡附子敗醬散(YFBP)

        出自于仲景張機(jī)的《金匱要略》,用于治療膿成之腸癰。臨床上,YFBP治療UC的有效性也有相關(guān)報(bào)道[4-5]。實(shí)驗(yàn)研究表明,YFBP可增強(qiáng)UC小鼠抗氧化應(yīng)激能力[6],調(diào)節(jié) Claudin蛋白的表達(dá)[7],也可通過恢復(fù)Treg/Th17平衡來達(dá)到改善UC的目的[8]。

        但是,YFBP治療UC的有效成分以及作用機(jī)制仍然顯得模糊不清。本研究借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)YFBP治療UC的有效成分以及作用機(jī)制進(jìn)行了預(yù)測與分析,為下一步的深入研究提供參考。

        1 方法

        1.1 薏苡附子敗醬散有效成分的篩選分別以“薏苡仁”“附子”“敗醬草”為檢索詞,OB(生物利用度)≥ 30%,DL(類藥性)≥ 0.18,MW(相對(duì)分子質(zhì)量)< 500為過濾條件[9],從TCMSP數(shù)據(jù)庫中篩選出三味中藥的有效成分。

        1.2 有效成分藥物靶點(diǎn)的收集根據(jù)上一步篩選出的有效成分,在TCMSP數(shù)據(jù)庫中獲取其藥物靶點(diǎn),對(duì)沒有藥物靶點(diǎn)信息的有效成分給予剔除,并通過Uniprot數(shù)據(jù)庫( http ://www.uniprot.org /uploadlists/)獲取藥物靶點(diǎn)蛋白的基因名(Gene cards)。

        1.3 UC基因靶點(diǎn)的收集以“Ulcerative Colitis”為關(guān)鍵詞,從Geencard數(shù)據(jù)庫中獲取UC的Gene Symbol,結(jié)果保存在Excel中。

        1.4 求藥物靶點(diǎn)與UC靶點(diǎn)的交集運(yùn)行R語言,得到藥物靶點(diǎn)與UC靶點(diǎn)的重疊部分。

        1.5 PPI網(wǎng)絡(luò)分析將薏苡附子敗醬散活性成分的作用靶點(diǎn)導(dǎo)入String數(shù)據(jù)庫中,選擇物種為“homo sapiens(人類)”,獲得蛋白互作關(guān)系,結(jié)果以TSV格式保存,對(duì)網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)(靶點(diǎn))的度值進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

        1.6 KEGG通路富集分析應(yīng)用R語言3.5.3加載 chusterprofiler[10]包,對(duì) YFBP作用于 UC 的相關(guān)靶點(diǎn)進(jìn)行進(jìn)行KEGG分析,設(shè)定P<0.05。

        2 結(jié)果

        2.1 有效成分與靶點(diǎn)根據(jù)“1.1”初步收集到薏苡仁、附子、敗醬草的有效成分分別有8個(gè)、14個(gè)、11個(gè),其中,sitosterol為三味中藥所共有,Stigmasterol為薏苡仁和敗醬草所共有,故有30個(gè)候選的有效成分。但是,在這30個(gè)化合物中,有10個(gè)化合物未檢索到其藥物靶點(diǎn)信息,故給予剔除。從Geencard數(shù)據(jù)庫中獲得3738個(gè)UC靶點(diǎn)。最后,求藥物靶點(diǎn)與UC靶點(diǎn)的交集,結(jié)果有18個(gè)有效成分的122個(gè)靶點(diǎn)與UC靶點(diǎn)重疊,如表1和圖1-2所示。

        表1 附子薏苡敗醬散活性成分基本信息

        圖1 中藥-化合物網(wǎng)絡(luò)

        圖2 化合物-靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)

        2.2 PPI網(wǎng)絡(luò)分析如圖3所示,縱坐標(biāo)為靶點(diǎn)名稱,橫坐標(biāo)為度值,其中,度值排名前七的靶點(diǎn)有絲氨酸/蘇氨酸激酶1(AKT1)、白細(xì)胞介素-6(IL-6)、血管內(nèi)皮生長因子A(VEGFA)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、JUN、前列腺素內(nèi)過氧化物合酶2(PTGS2)、表皮生長因子受體(EGFR)等。

        圖3 靶點(diǎn)信息條形圖

        2.3 KEGG通路分析如圖4所示,橫軸表示該信號(hào)通路的靶基因個(gè)數(shù),縱軸是對(duì)通路的描述,顏色表示P值大小。YFBP作用于UC的相關(guān)靶點(diǎn)主要富集于PI3K-Akt信號(hào)通路、乙肝信號(hào)通路、巨細(xì)胞病毒性感染通路、AGE-RAGE信號(hào)通路、流體剪切應(yīng)力和動(dòng)脈粥樣化等,本研究主要對(duì)靶基因富集最多的PI3K/Akt信號(hào)通路和P值最小的AGERAGE信號(hào)通路進(jìn)行分析。

        圖4 靶基因富集通路信號(hào)通路

        3 討論

        YFBP作為治療腸癰的經(jīng)典配方,在UC的臨床應(yīng)用與實(shí)驗(yàn)研究中的改善作用是已知的。中藥復(fù)方化學(xué)成分與靶點(diǎn)的多樣性,使其治療疾病的有效成分和內(nèi)在機(jī)制難以揭示、難以可視化。在本研究中,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)盡可能最大化地預(yù)測和展示了YFBP治療UC的潛在化合物和靶標(biāo)。

        YFBP的化學(xué)成分經(jīng)過層層篩選與剔除后,最終獲得治療UC的18種有效成分,其中,潛在靶標(biāo)最多的是槲皮素(quercetin),高達(dá)99個(gè),其次為木樨草素(luteolin),41個(gè)靶標(biāo)。近年來,國內(nèi)外已開展了不少槲皮素、木樨草素治療UC的相關(guān)研究,其內(nèi)在機(jī)制也得到了不同程度的揭示。如槲皮素可通過調(diào)節(jié)M1/M2巨噬細(xì)胞的平衡來增強(qiáng)腸道的抗炎、抗菌作用[11],可抑制NF-κB的激活和iNOS的表達(dá)而發(fā)揮抗炎作用[12];木樨草素可通過激活Nrf2信號(hào)通路來增強(qiáng)實(shí)驗(yàn)性UC的抗氧化能力[13]。但是,根據(jù)本研究的預(yù)測結(jié)果,它們的內(nèi)在機(jī)制遠(yuǎn)不于此,因此還有很大的探索空間。

        PPI網(wǎng)絡(luò)是對(duì)靶蛋白與靶蛋白之間的相互作用力的強(qiáng)度進(jìn)行分析的一種方式,靶蛋白的度值越高,即該靶蛋白在PPI網(wǎng)絡(luò)中的重要性越強(qiáng)。在本研究中,度值前三名的靶蛋白分別是Akt1,IL6和VEGFA。Akt1是絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族的成員之一,對(duì)eNOS的誘導(dǎo)和內(nèi)皮細(xì)胞的功能至關(guān)重要,對(duì)巨噬細(xì)胞的極化也起著重要的調(diào)節(jié)作用,Akt1的敲除可加重DSS誘導(dǎo)的結(jié)腸炎[14]。IL-6是一種致炎因子,主要來源于巨噬細(xì)胞、淋巴細(xì)胞及上皮細(xì)胞,其基因的表達(dá)水平在活動(dòng)性UC患者中是顯著增加的[15]。VEGF-A是一種促血管生成因子,過量的表達(dá)將會(huì)導(dǎo)致病理性血管的生成和白細(xì)胞的募集,使腸粘膜炎癥加重[16]。以上靶點(diǎn)在UC中所扮演的角色和在PPI網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn)重要性提示,它們很可能是YFBP治療UC的關(guān)鍵靶點(diǎn)之一。

        本研究主要對(duì)靶基因富集最多的PI3K/Akt信號(hào)通路和P值最小的AGE-RAGE信號(hào)通路進(jìn)行闡述。磷酸肌醇3-激酶[17](PI3K)廣泛地參與了細(xì)胞的生長、代謝和增殖等生物學(xué)活動(dòng);Akt[18]是PI3K的下游效應(yīng)器,可由PI3K、炎癥、DNA損傷等因素激活。研究表明,PI3K/Akt信號(hào)通路密切參與了TNF-α等促炎因子的調(diào)控和釋放,是UC的重要發(fā)病機(jī)制之一[19]。同時(shí),干預(yù)該條信號(hào)通路也是諸多藥物有效治療UC的相關(guān)機(jī)制,如四神丸[20]、氧化苦參堿[21]、美沙拉嗪[22]等。28 個(gè)靶蛋白基因富集在PI3K/Akt信號(hào)通路,由此可推測該條通路對(duì)YFBP改善UC的重要性。晚期糖基化終末產(chǎn)物受體(RAGE)是免疫球蛋白超家族的跨膜受體,可識(shí)別包括晚期糖基化終末產(chǎn)物AGEs在內(nèi)的多種配體[23]。RAGE的刺激導(dǎo)致NF-κB的激活和易位,誘導(dǎo)促炎細(xì)胞因子的釋放與氧化應(yīng)激的產(chǎn)生,從而引起炎癥反應(yīng)[24]。目前,促炎性AGERAGE信號(hào)通路與UC的關(guān)系研究較少。但已有研究表明,UC患者腸粘膜炎癥部位的RAGE的表達(dá)水平顯著高于非炎癥部位[25]。由此可見,干預(yù)該條通路也可能是治療UC的潛在策略之一。

        網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是對(duì)現(xiàn)有研究數(shù)據(jù)的整合利用和再分析,在一定程度上可提高實(shí)驗(yàn)研究的針對(duì)性。本研究預(yù)測了YFBP的到18個(gè)治療UC的潛在有效成分,122個(gè)可能靶點(diǎn)、144條信號(hào)通路,并擇取其中幾個(gè)研究價(jià)值較大的成分、靶點(diǎn)、信號(hào)通路進(jìn)行了分析。如槲皮素的靶點(diǎn)數(shù)達(dá)到99個(gè);Akt1節(jié)點(diǎn)在PPI網(wǎng)絡(luò)中的度值高達(dá)99,這充分暗示了其研究價(jià)值所在。因此,值得通過實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證和探究。

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