張金勇,張 赫,孫文超,肖朋朋,南福龍,4,韓繼成,解長占,哈 卓,莊忻雨,許 汪,魯會軍*,金寧一*
(1.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 動(dòng)物科技學(xué)院,吉林 長春 130118;2.軍事科學(xué)院 軍事獸醫(yī)研究所,吉林 長春 130122;3.溫州大學(xué) 病毒學(xué)研究所,浙江 溫州 325035;4.吉林大學(xué) 動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,吉林 長春 130062)
塞尼卡病毒(Seneca Valley virus,SVV)也被稱為A型塞內(nèi)卡病毒(Senecavirus A,SVA),該病毒最早由美國的研究人員從污染的人胚胎視網(wǎng)膜細(xì)胞(PER.C6)中分離出來,命名SVV-001[1]。SVV可作為一種溶瘤候選藥物進(jìn)行研發(fā),SVV-001治療小細(xì)胞肺癌(small-cell lung cancer,SCLC)已經(jīng)完成了臨床Ⅰ期研究[2]。
2007年,加拿大首次報(bào)道豬感染SVV,隨后在美國部分豬場檢測到SVV[3]。近年來,SVV在美國、巴西、加拿大、泰國、哥倫比亞、越南等國家小范圍流行[4-8];我國于2015年在廣東省某豬場首次確診豬群感染SVV,并分離CH-01-2015病毒毒株[9-10],隨后陸續(xù)在湖北、黑龍江、福建、河南、甘肅等省份檢測并分離出SVV病毒毒株[7,11];研究人員對我國2016-2018年的部分省份進(jìn)行回顧性研究發(fā)現(xiàn),遼寧、山東、云南、湖南、新疆、湖北、廣西、四川、貴州、上海等多個(gè)省份均出現(xiàn)豬群感染SVV[7]。塞尼卡病毒病臨床癥狀與豬口蹄疫、豬水皰病、豬水皰疹病以及水皰性口炎臨床癥狀極為相似;急性主要表現(xiàn)為鼻鏡、口腔、舌、蹄冠部等部位出現(xiàn)皮膚或者黏膜出現(xiàn)水皰,輕者表現(xiàn)為發(fā)熱、嗜睡、厭食等臨床癥狀,臨床癥狀可持續(xù)2~14 d[12-14];此外,5日齡以內(nèi)新生仔豬對該病毒較為敏感,病死率可達(dá)70%[6,15]。
SVV屬于小RNA病毒科塞尼卡病毒屬的唯一成員;該病毒為單股正鏈RNA病毒,基因組全長約7.3 kb,由5′非編碼區(qū)域(untranslated region,UTR)、1個(gè)開放閱讀框(open reading frame,ORF)、3′非編碼區(qū)域(untranslated region,UTR)以及poly尾巴組成,構(gòu)成小RNA病毒科L-4-3-4標(biāo)準(zhǔn)結(jié)構(gòu)布局[1,16]。其中,SVV的開放閱讀框(長度約2 180個(gè)氨基酸)在自身蛋白酶的作用下可以裂解為前導(dǎo)蛋白L以及P1、P2、P3。P1主要編碼病毒衣殼結(jié)構(gòu)蛋白,在蛋白酶的作用下進(jìn)一步裂解為VP0、VP3、VP1,成熟的VP0裂解為VP2與VP4;P2與P3編碼與病毒復(fù)制的相關(guān)蛋白,在蛋白酶的作用下依次裂解為2A、2B、2C、3A、3B、3C以及3D[16-17]。SVV的衣殼結(jié)構(gòu)蛋白較為保守,且含有主要的抗原表位,能夠與宿主細(xì)胞結(jié)合產(chǎn)生特異性免疫應(yīng)答,其已經(jīng)作為SVV診斷的主要診斷靶抗原進(jìn)行研究。
本試驗(yàn)擬通過原核表達(dá)系統(tǒng)成功表達(dá)并純化SVV VP1與VP3蛋白,為下一步單克隆抗體與多克隆抗體制備、相關(guān)ELISA檢測方法以及基因工程相關(guān)疫苗等研究奠定基礎(chǔ)。
1.1 菌種、質(zhì)粒Trans1-T1、E.coliBL21 (DE3)化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;原核表達(dá)載體pET32a(+)由本實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2 主要試劑BamHⅠ、XhoⅠ限制性內(nèi)切酶均購自Thermo Scientific公司; IPTG購自Sigma公司;鼠源His單克隆抗體、HRP標(biāo)記的山羊抗鼠IgG抗體購自碧云天公司;DL2000 DNA Marker、T4DNA連接酶、ExTaq PCR酶均購自TaKaRa公司;Blue Plus Marker、His標(biāo)簽鎳離子蛋白純化柱均購于北京全式金公司;DL5000 DNA Marker購自諾唯贊生物科技有限公司。
1.3 引物設(shè)計(jì)參照SVV CH-01-2015病毒毒株序列(GenBank登陸號:KT321458.1)及本研究所需的酶切位點(diǎn),設(shè)計(jì)SVV VP1與VP3引物(表1),引物由吉林省庫美生物科技有限公司合成。
1.4 目的基因獲取與擴(kuò)增參考SVV CH-01-2015病毒毒株序列(GenBank登錄號:KT321458.1),將VP1與VP3基因片段交由上海捷瑞生物工程有限公司合成。以獲取的SVV cDNA為模板擴(kuò)增VP1與VP3片段。PCR反應(yīng)體系為25 μL體系:在PCR管中依次加入ddH2O 13.75 μL, 10×Ex Taq Buffer 2.5 μL,2.5 mmol/L dNTPs Mixture 2.5 μL、10 μmol/L上游引物、下游引物各1 μL ,模板4 μL、Ex Taq酶 0.25 μL;SVV VP1與VP3基因的擴(kuò)增條件為:95℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,66℃退火30 s,72℃延伸45 s,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,回收目的片段備用。
表1 擴(kuò)增SVV VP1與VP3所需引物
注:下劃線部分為酶切位點(diǎn),括號內(nèi)為酶切位點(diǎn)名稱
1.5 重組表達(dá)質(zhì)粒pET32a-VP1與pET32a-VP3的構(gòu)建使用BamHⅠ/XhoⅠ分別雙酶切VP1片段、VP3片段以及pET32a質(zhì)粒,純化回收目的片段。分別將VP1與VP3連接至pET32a目的載體,對獲得的質(zhì)粒分別命名為pET32a-VP1、pET32a-VP3,并進(jìn)行雙酶切鑒定,鑒定正確的質(zhì)粒送往吉林省庫美生物科技有限公司進(jìn)行測序。將鑒定正確的pET32a-VP1、pET32a-VP3轉(zhuǎn)化至E.coliBL21(DE3) 感受態(tài),挑取單克隆菌落,震蕩培養(yǎng)12~14 h 后,保存菌液并提取質(zhì)粒鑒定。
1.6 VP1與VP3重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)復(fù)蘇保存的pET32a-VP1、pET32a-VP3重組菌液,37℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)至菌液D600為0.4~0.6時(shí),加入IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),收集菌液超聲處理后,以10%的分離膠進(jìn)行SDS-PAGE試驗(yàn)。
1.7 Western blot試驗(yàn)使用1.6蛋白樣品,以10%的分離膠進(jìn)行SDS-PAGE,將蛋白轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜,5%脫脂乳封閉2 h,鼠源His抗體孵育過夜,TBST洗滌3次,5 min/次,使用HRP標(biāo)記的山羊抗小鼠二抗室溫孵育40 min,TBST洗滌3次后,5 min/次,顯影。
1.8 VP1與VP3重組蛋白表達(dá)形式分析復(fù)蘇保存的pET32a-VP1、pET32a-VP3重組菌(參照1.6方法),加入IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),收取菌液,經(jīng)超聲破碎后,5 000 r/min離心10 min,收取上清,取適量的PBS重懸沉淀,分別取上清、細(xì)菌包涵體制備樣品,用10%的分離膠進(jìn)行SDS-PAGE試驗(yàn)。
1.9 VP1與VP3重組蛋白表達(dá)條件優(yōu)化
1.9.1時(shí)間條件優(yōu)化 向試管中加入等量的VP1或VP3重組菌,37℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)至菌液D600為0.4~0.6時(shí),加入等量的IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)。分別于誘導(dǎo)0,1,2,3,4,5,6,7,8 h取等量的菌液,制備蛋白樣品,以10%分離膠進(jìn)行SDS-PAGE試驗(yàn),分析誘導(dǎo)表達(dá)的最佳時(shí)間。
1.9.2誘導(dǎo)劑濃度優(yōu)化 向試管中加入等量的SVV VP1或VP3表達(dá)菌,37℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)至菌液D600為0.4~0.6時(shí),分別加入0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0 mmol/L的IPTG誘導(dǎo)劑,誘導(dǎo)5 h后,收集菌液,制備蛋白樣品,用10%分離膠進(jìn)行SDS-PAGE試驗(yàn),分析最佳誘導(dǎo)劑濃度。
1.9.3誘導(dǎo)溫度優(yōu)化 向試管中加入等量的VP1或VP3重組菌,振蕩培養(yǎng)至菌液D600為0.4~0.6時(shí),加入0.6 mmol/L的IPTG誘導(dǎo)劑,分別置于25,37℃誘導(dǎo)5 h,收集菌液,制備蛋白樣品,用10%分離膠進(jìn)行SDS-PAGE試驗(yàn),分析最佳誘導(dǎo)溫度。
1.10 SVV VP1與VP3蛋白純化復(fù)蘇VP1或VP3重組菌,轉(zhuǎn)移至300 mL培養(yǎng)基中,于37℃條件下震蕩培養(yǎng)至菌液D600為0.4~0.6時(shí),加入0.6 mmol/L 的IPTG誘導(dǎo)劑,培養(yǎng)5 h,收集蛋白。參照說明書利用Ni2+-NTA金屬螯合蛋白質(zhì)純化柱進(jìn)行純化,制備蛋白樣品,用10%分離膠進(jìn)行SDS-PAGE試驗(yàn),分析蛋白純化效果。
2.1 SVV VP1與VP3基因擴(kuò)增利用VP1與VP3引物分別擴(kuò)增出約792,717 bp的產(chǎn)物,與預(yù)期大小一致(圖1)。
圖1 SVV VP1(A)與VP3(B)基因擴(kuò)增結(jié)果 M.DL2000 DNA Marker;A1:VP1 PCR產(chǎn)物;A2.陰性對照;B1.VP3 PCR產(chǎn)物;B2.陰性對照
2.2 重組表達(dá)質(zhì)粒pET32a-VP1與pET32a-VP3的構(gòu)建及鑒定將SVV VP1與VP3基因片段克隆至pET32a載體,獲取質(zhì)粒后,經(jīng)BamHⅠ/XhoⅠ分別雙酶切pET32a-VP1與pET32a-VP3進(jìn)行鑒定,VP1與VP3基因片段成功克隆至pET32a載體(圖2)。
圖2 重組質(zhì)粒pET32a-VP1(A)與pET32a-VP3(B)酶切鑒定 M1.DL5000 DNA Marker;M2.DL2000 DNA Marker;A1.pET32a-VP1重組質(zhì)粒;A2.pET32a-VP1質(zhì)粒酶切產(chǎn)物;B1.pET32a-VP3重組質(zhì)粒;B2.pET32a-VP3質(zhì)粒酶切產(chǎn)物
2.3 VP1與VP3重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)收取誘導(dǎo)后的菌液,SDS-PAGE試驗(yàn)結(jié)果表明pET32a-VP1重組菌經(jīng)誘導(dǎo)后在約50 000處有明顯條帶,pET32a-VP3重組菌經(jīng)誘導(dǎo)后在約48 000處有明顯條帶(圖3);Western blot試驗(yàn)結(jié)果表明2種重組菌均可見單一目的條帶(圖4)。
2.4 VP1與VP3重組蛋白表達(dá)形式分析分別收取pET32a-VP1與pET32a-VP3重組菌,分別獲取破碎細(xì)菌后的上清與包涵體, SDS-PAGE結(jié)果表明,2種重組菌均以包涵體的形式表達(dá)蛋白(圖5)。
圖3 SVV VP1蛋白(A)與VP3蛋白(B)表達(dá)SDS-PAGE驗(yàn)證 M.Blue Plus蛋白Marker;A1.pET32a空載蛋白;A2:pET32a-VP1蛋白;B1.pET32a空載蛋白;B2.pET32a-VP3蛋白
圖4 SVV VP1蛋白(A)與VP3蛋白(B)表達(dá)Western blot驗(yàn)證結(jié)果 M.Blue Plus蛋白Marker;A1.pET32a-VP1;A2.pET32a空載體;B1.pET32a-VP3;B2.pET32a空載
圖5 SVV VP1蛋白(A)與VP3蛋白(B)表達(dá)形式驗(yàn)證結(jié)果 M.Blue Plus蛋白Marker;A1.pET32a-VP1重組菌上清;A2.pET32a-VP1重組菌包涵體; B1.pET32a-VP3重組菌上清;B2.pET32a-VP3重組菌包涵體
2.5 VP1與VP3重組蛋白表達(dá)條件優(yōu)化
2.5.1優(yōu)化誘導(dǎo)時(shí)間 于誘導(dǎo)后0、1、2、3、4、5、6、7、8 h取等量的菌液,制備蛋白樣品,進(jìn)行SDS-PAGE試驗(yàn),結(jié)果表明:pET32a-VP1與pET32a-VP3重組菌均在誘導(dǎo)5 h后表達(dá)量最高(圖6)。
2.5.2優(yōu)化誘導(dǎo)劑濃度 向等量重組菌加入0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0 mmol/L IPTG誘導(dǎo)劑,SDS-PAGE試驗(yàn)結(jié)果表明pET32a-VP1與pET32a-VP3重組菌均在誘導(dǎo)劑濃度大于等于0.6 mmol/L時(shí)表達(dá)量最高(圖7)。
2.5.3優(yōu)化誘導(dǎo)溫度 將重組菌分別置于25,37℃誘導(dǎo)5 h, SDS-PAGE試驗(yàn)結(jié)果表明pET32a-VP1與pET32a-VP3重組菌均在37℃表達(dá)量較高(圖8)。
圖6 SVV VP1蛋白(A)與VP3蛋白(B)誘導(dǎo)表達(dá)時(shí)間分析結(jié)果 M.Blue Plus蛋白Marker;A1~A9,B1~B9.誘導(dǎo)時(shí)間分別為0,1,2,3,4,5,6,7,8 h
圖7 SVV VP1蛋白(A)與VP3蛋白(B)誘導(dǎo)劑濃度分析結(jié)果 M.Blue Plus蛋白Marker;A1~A6,B1~B6.誘導(dǎo)濃度分別為0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0 mmol/L
圖8 SVV VP1蛋白(A)與VP3蛋白(B)誘導(dǎo)劑溫度分析結(jié)果 M.Blue Plus蛋白Marker;A1.37℃誘導(dǎo)pET32a-VP1重組菌;A2.25℃誘導(dǎo)pET32a-VP1重組菌;B1.37℃誘導(dǎo)pET32a-VP3重組菌;B2.25℃誘導(dǎo)pET32a-VP3重組菌
2.6 VP1與VP3重組蛋白純化大量培養(yǎng)pET32a-VP1與pET32a-VP1重組菌,收集蛋白樣品,參照Ni2+-NTA金屬螯合蛋白質(zhì)純化柱說明書對蛋白進(jìn)行純化,結(jié)果表明成功純化VP1與VP3重組蛋白(圖9)。
圖9 SVV VP1蛋白(A)與VP3蛋白(B)蛋白純化分析結(jié)果 M.Blue Plus蛋白Marker;A1.pET32a-VP1重組菌蛋白純化后;A2.pET32a-VP1重組菌蛋白純化前;B1.pET32a-VP3重組菌蛋白純化后;B2.pET32a-VP3重組菌蛋白純化前
自2007年首次于加拿大豬群分離到該病毒株以來,全球已經(jīng)有多個(gè)國家相繼報(bào)道SVV感染豬群的病例[7]。2015年以來,多個(gè)國家相繼報(bào)道SVV流行與小范圍暴發(fā),作為一種新發(fā)傳染病,已經(jīng)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。研究表明,SVV在感染的豬群中可存在7~21 d,臨床癥狀持續(xù)12~14 d,病毒血癥持續(xù)1~10 d[18]。SVV與其他豬原發(fā)性水皰病癥狀基本類似,臨床上很難診斷。截止目前為止,尚未見研究證實(shí)SVV存活的環(huán)境以及其傳播方式的報(bào)道;然而,研究人員在小鼠腸道以及糞便中、家蠅中均檢測到SVV,表明這些物種可能會攜帶病原進(jìn)行傳播[19]。我國自2015年首次發(fā)現(xiàn)并分離SVV毒株以來,已經(jīng)有多個(gè)省份報(bào)道檢測到SVV;研究人員對2016-2018年的部分省份樣品進(jìn)行回顧性檢測,發(fā)現(xiàn)我國的部分省份早在2016年即已經(jīng)存在SVV感染豬群[7]。
研究人員使用pET24b系統(tǒng)表達(dá)SVV VP1、VP2、VP3蛋白,并建立間接ELISA方法,研究顯示使用VP2蛋白包被建立的ELISA方法優(yōu)于VP1與VP3蛋白包被建立的ELISA方法[20]。SVV VP1、VP3蛋白含有多個(gè)抗原表位,是新型疫苗研發(fā)的首選蛋白區(qū)域[21],尚未見研究利用SVV VP1、VP3表達(dá)的蛋白建立中和等檢測方法的報(bào)道。本試驗(yàn)將SVV VP1與VP3的基因片段克隆至pET32a(+)載體,利用大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)對SVV VP1與VP3區(qū)域蛋白進(jìn)行表達(dá),結(jié)果顯示分別以包涵體的形式表達(dá)出約50 000,48 000的重組蛋白;并對兩者的表達(dá)條件進(jìn)行優(yōu)化。利用Ni2+-NTA金屬螯合蛋白質(zhì)純化柱對原核表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)的SVV VP1與VP3蛋白進(jìn)行純化,成功純化出SVV VP1與VP3蛋白。SVV VP1與VP3蛋白的表達(dá)與純化,為下一步研究SVV單克隆及多克隆抗體的制備、新型疫苗研發(fā)及血清學(xué)檢測方法等奠定基礎(chǔ)。