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        原發(fā)性骨髓纖維化ASXLl基因突變的臨床意義

        2020-04-27 11:26:06王彥麗王正閆世彬夏景清
        醫(yī)藥前沿 2020年4期
        關(guān)鍵詞:基因突變分析檢測

        王彥麗 王正 閆世彬 夏景清

        (臨沂市中心醫(yī)院 山東 臨沂 276000)

        骨髓增殖性腫瘤(myeloproliferative neoplasms,MPN)是一組起源于骨髓多能造血干細胞克隆惡性血液系統(tǒng)疾病。原發(fā)性骨髓纖維化(PMF)是MPN的一個亞型,是MPN中最具侵襲性的一種克隆性疾病,其臨床特征是進行性貧血、脾大、髓外造血,伴全身癥狀,易進展為急性白血病。自2005年MPN患者高頻獲得JAK2V617F基因突變[1-3],從此人們對MPN的發(fā)病機制有了新的認識。2013年,在JAK2V617F及 MPLW515陰性的ET及PMF患者中發(fā)現(xiàn)CALRexon9突變的檢出率高達 50%以上[4-5]。JAK2、MPL、CALR基因的發(fā)現(xiàn)使得約80%的MPN患者的發(fā)病機制有了新的生物學(xué)標(biāo)志及預(yù)后指標(biāo),但不能解釋不同 MPN的顯著差異。研究顯示,幾乎所有髓系腫瘤中都有ASXLl突變檢出,并與其他基因事件共同作用參與了腫瘤的發(fā)生發(fā)展,但ASXL1在PMF中的突變情況及臨床意義尚不明確[6-7]。本文分析了41例PMF患者中ASXL1基因突變情況,并與JAK2V617F、CALR及MPL等單基因突變進行比較分析,初步探討其臨床意義。

        1.資料和方法

        1.1 病歷資料

        選取2014年1月-2019年6月我院血液科診斷的骨髓纖維化患者41例。男23例,女18例;年齡52~75歲,中位年齡65歲。均符合2008年WHO診斷標(biāo)準(zhǔn)[8]。41例均有不同程度脾大,其中13例為巨脾。

        1.2 JAK2、CALR、MPL和ASXL1基因突變檢測

        用血液基因組DNA提取試劑盒(QIAamp DNA Mini Kit,生產(chǎn)商:QIAGEN)提取骨髓樣本中基因組DNA。CALRexon9突變檢測采用PCR法。其上游引物序列為:FAM-CTGGTCCTGGTCCTGATGT;下游引物序列為:TCTCACAGAGACATTATTTGGC。PCR擴增后產(chǎn)物經(jīng)純化后,使用3500XL測序儀進行高分辨率毛細管凝膠電泳,實驗數(shù)據(jù)采用片段分析軟件GENEMAPPERID V4.1進行分析。MPLexon10突變檢測采用Sanger測序法。其上游引物序列為:TGACCTTGCGGGCCGAC;下游引物序列為:GATCTGGGGTCACAGAGCGA。PCR擴增后產(chǎn)物經(jīng)純化、測序反應(yīng)后使用3730XL測序儀進行高分辨率毛細管凝膠電泳,實驗數(shù)據(jù)采用DNA序列分析軟件Sequencher V4.5進行突變分析。JAK2基因V617F突變采用等位基因特異性聚合酶鏈反應(yīng)(ASPCR)+熒光探針法進行定量檢測,試劑盒由上海源奇生物醫(yī)藥科技有限公司提供。ASXL1基因突變檢測采用二代測序法。ASXL1exon12經(jīng)探針捕獲和建庫后,使用Illumina公司的Nextseq500測序儀進行雙端測序,測序長度為2×150bp。測序數(shù)據(jù)經(jīng)生物信息學(xué)分析后,最后人工篩選和確認變異位點。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)處理

        數(shù)據(jù)采用SPSS21.0統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析,計數(shù)資料采用率(%)表示,進行χ2檢驗,計量資料采用(±s)表示,進行t檢驗,P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2.結(jié)果

        2.1 ASXL1、CALR、JAK2V617F、MPL基因突變分析

        ASXLl結(jié)果:41例患者中,共有7例檢出ASXLl突變,突變率為17.1%(7/41),ASXL1突變主要類型為:Gly646Trpfs(n=4)、Pro808Leufs(n=1)、Thr823X(n=1)、Glu768X(n=1)。ASXLl突變患者的平均年齡為56歲(52~60歲),見表1。

        Table 1.Clinical characteristics of 7 patients with ASXLl mutation

        CALR基因分析結(jié)果:CALR基因突變率為19.5%(8/41),主要突變類型包括:I型(p.L367fs*46 del52bp)5例(62.5%)、Ⅱ型(p.K385fs*47 ins5bpTTGTC)3例(37.5%)。CALR突變患者的平均年齡為57歲(53~71歲)。JAK2V617F突變的發(fā)生率為56.1%(23/41),JAK2V617F突變患者的平均年齡為57歲(53~72歲)。MPL基因突變發(fā)生率為2.4%(1/41),突變類型為MPLW515K。

        2.2 ASXLl突變患者部分臨床特點及其與單突變、突變陰性患者的比較

        41例患者中,有36(87.8%)例患者至少攜帶1個基因突變,3例(7.3%)患者同時伴有2個基因突變,為ASXLl/CALR基因突變共存(n=2),ASXLl/JAK2V617F基因突變共存(n=1)。ASXLl突變患者外周血:白細胞(3.7±1.5)×109/L,血紅蛋白(56±7.8)g/L,血小板(89±38)×109/L。與CALR基因單突變相比,ASXLl基因突變組PMF患者有更低的血紅蛋白水平及較低的血小板計數(shù),但在白細胞計數(shù)方面無差異。與JAK2V617F基因單突變患者相比,ASXLl突變組患者血紅蛋白水平低于JAK2V617F突變組,血小板數(shù)也低于JAK2V617F突變組。與突變均陰性組相比,ASXL1突變組血小板與血紅蛋白水平低于陰性組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),見表2。

        Table 2.Clinical and laboratorial features of patients subdivided by different mutation type(±s)

        Table 2.Clinical and laboratorial features of patients subdivided by different mutation type(±s)

        parameter ASXL1+ CALR+ JAK2 + MPL+ Negative mutated Number of patients 7 8 23 1 5 Median age(years)56±1.9 48±2.5 54±2.7 57 55±2.9 Male/Female 4:3 5:3 12:11 1 2:3 WBC(×109/L)3.7±1.5 7.6±2.1 5.8±0.6 6.2 5.5±1.7 Hb(g/L)56±7.8 81±7.2 65±10.5 74 76±2.7 Plt(×109/L)89±38 161±31 128±29 202 159±18

        3.討論

        表觀遺傳調(diào)節(jié)是細胞維持其基因表達模式的重要機制,其中維持基因表達穩(wěn)態(tài)的兩類重要表觀遺傳調(diào)節(jié)蛋白為polycomb家族(polycomb group,PcG)和Trithorax家族(Trithorax group,TrxG)。PcG蛋白的主要功能是保持發(fā)育過程中同源異形基因的沉默,而TrxG蛋白則負責(zé)維持基因的活化狀態(tài)。人類ASXLl基因定位于染色體20ql l,編碼由1541個氨基酸組成的核蛋白,是trxG(trithorax-group)和PRC(Polycomb-group repressor complex)的增強子,具有抑制/激活雙重特性,在包括血液細胞等多種組織中廣泛表達。ASXLl編碼的蛋白質(zhì)表達于所有造血細胞,具有對轉(zhuǎn)錄的雙向激活與抑制作用。Fisher等[9]人建立了ASXL1敲除的小鼠模型。敲除后的小鼠淋系和髓系分化中都發(fā)生異常,表明ASXL1對于維持正常的造血功能是必須的。

        作為表觀遺傳調(diào)節(jié)子基因,ASXLI在MPN可與JAK2V617F、TET2、RUNXl、CEBPA等基因突變共存。高通量DNA測序發(fā)現(xiàn),90%以上的MPN 患者至少攜帶1個突變基因,具有多個基因突變共存者其轉(zhuǎn)化白血病的風(fēng)險增加[10]。國內(nèi)研究顯示,ASXLl突變在MPN發(fā)生率達36%。ASXLl突變的頻率在PMF為12%~13%,Pv/ET-MF為23%[11],這一結(jié)果表明,PMF是具有多基因改變的疾病,多基因檢測可以為PMF生物標(biāo)志的篩選及預(yù)后分層提供更多依據(jù)[12]。單變量分析中發(fā)現(xiàn)了ASXL1突變對PMF生存的不利影響[13]。有研究報道,ASXLl+CALR+PMF患者OS下降,但ASXLl+CALR-患者的預(yù)后最差[14]。CALR+ASXL1-中位生存期最長(平均10.4年),CALR-ASXL1+患者最短(平均2.3年)。CALR+ASXLl+和CALR-ASXL1-患者具有相似的生存率,并被歸為中等風(fēng)險類別(平均5.8年)[13]。

        本組研究對41例PMF患者進行了多基因檢測。結(jié)果發(fā)現(xiàn),93.5%的患者存在單基因突變,ASXLl基因總的突變發(fā)生率為17.1%,均為移碼突變、點突變或無義突變,大部分ASXLl突變與其它基因突變共存,7.3%的患者存在雙基因突變,其中雙基因突變患者中均攜帶ASXLl突變,且這一結(jié)果與既往研究基本一致[15]。在3例基因雙突變患者中,2例為ASXLl/CALR突變共存,未檢測到CALR/JAK2V617F突變共存。目前,關(guān)于ASXLl突變在PMF中的研究鮮見報道。與單CALR基因突變患者相比,本研究中ASXLl突變患者的血紅蛋白、血小板計數(shù)水平明顯降低,這提示ASXLl突變患者的紅系、巨核系受抑更為明顯,但尚需進一步擴大樣本并長期隨訪尚能明確。綜上,ASXL1基因突變是繼MPN患者中JAK2、CALR、MPL基因突變之后的又一重要生物學(xué)標(biāo)志。PMF的發(fā)生可能由于一個或多個基因的共同作用結(jié)果,如JAK/STAT通路相關(guān)基因、表觀遺傳調(diào)控相關(guān)基因及剪接因子相關(guān)基因等[16]。針對PMF發(fā)病過程中起決定作用的基因,研制更多的靶向藥物,是根本改變PMF預(yù)后的關(guān)鍵。

        未來隨著基因測序技術(shù)的提高發(fā)現(xiàn)更多的協(xié)同致病基因并進行深入的功能研究,可能會為詮釋PMF復(fù)雜的致病機制提供更多有力的理論依據(jù),將對我們認識PMF的發(fā)病機制,預(yù)后和治療發(fā)揮重要的作用。

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