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        解淀粉芽孢桿菌β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因的克隆表達及其酶學表征

        2020-04-25 05:37:26陳寶莉趙黎明
        食品科學 2020年8期
        關(guān)鍵詞:幾丁質(zhì)糖苷酶乙酰

        陳寶莉,秦 臻,趙黎明

        (華東理工大學生物工程學院,發(fā)酵工業(yè)分離提取技術(shù)研發(fā)中心,生物反應(yīng)器工程國家重點實驗室,上海 200237)

        幾丁質(zhì)是一種由N-乙酰氨基葡萄糖(N-acetylglucosamine,GlcNAc)通過β-1,4-糖苷鍵連接形成的天然聚糖,在自然界中來源廣泛,其年儲量僅次于纖維素[1-2]。以GlcNAc為代表的幾丁質(zhì)水解產(chǎn)物具有促進骨損愈合、增強免疫系統(tǒng)功能、調(diào)節(jié)腸道和改善皮膚保水性等生理功能,且易溶于水、生物相容性好[3],被廣泛應(yīng)用于食品、醫(yī)藥和化妝品等多個領(lǐng)域[4]。通過降解幾丁質(zhì)制備GlcNAc的方法主要有化學、物理和酶法,酶法由于較前兩者成本低、環(huán)境污染小、操作簡單,因而成為研究熱點[5-6]。

        β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(EC 3.2.1.52)作為一類糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH),可作用于幾丁寡糖的非還原端,將其降解為GlcNAc。該酶是生物體降解幾丁質(zhì)和肽聚糖的關(guān)鍵酶,可替代化學水解方法,用于GlcNAc的工業(yè)制備,實現(xiàn)綠色高效生產(chǎn)。除此之外,β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶也是真菌和昆蟲形成細胞壁的重要參與者,且與糖尿病、腎病有緊密的聯(lián)系,所以該酶被作為害蟲綠色防控技術(shù)中的分子靶標[7]與上述疾病診療中的重要檢測指標[8]。β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶因其在農(nóng)業(yè)、醫(yī)學、食品和水產(chǎn)[9]等各方面都有重要的應(yīng)用價值,受到了越來越多的關(guān)注。

        根據(jù)碳水化合物代謝酶CAZy數(shù)據(jù)庫(http://www.cazy.org)的分類,目前β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶分布在GH3、GH20、GH84、GH73和GH116家族中。該酶的來源多樣,存在于多種動物組織、植物、細菌和真菌中[10-12]。例如Serratia marcescens和Aspergillus oryzae等來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶由于其具有酶活力高、性質(zhì)穩(wěn)定等優(yōu)點,可用于酶法水解幾丁質(zhì)制備N-乙酰氨基葡萄糖[13-14]。但相對于其他類型的糖苷酶,β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶的研究仍較少,大部分已有報道的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶活力較低,對其蛋白結(jié)構(gòu)和反應(yīng)機理之間的關(guān)系也有待深入研究。

        解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)是一種革蘭氏陽性菌,其基因組中含有豐富的幾丁質(zhì)代謝酶系,其中殼聚糖酶[15]、內(nèi)切幾丁質(zhì)酶[16]都已被研究報道,也具有發(fā)掘高效β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶的潛力。本研究從B. amyloliquefaciens中克隆得到一個新型β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因BaNagase,在大腸桿菌(Escherichia coli)中異源表達,通過對其蛋白質(zhì)序列分析、酶學性質(zhì)和水解歷程的研究,旨在為進一步分子改造和實現(xiàn)β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶在高效降解幾丁質(zhì)的應(yīng)用中提供理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        B. amyloliquefaciensYX-01和pET-28a(+)載體均由本實驗室保存;E. coliDH5α、BL21(DE3) 上??禐槭兰o生物科技有限公司;DNA Marker DL2000、蛋白Marker、限制性內(nèi)切酶NheI和XhoI 寶生物工程(大連)有限公司;TaqDNA聚合酶 南京Vazyme生物科技有限公司;T4連接酶 美國New England Biolabs公司;對硝基苯基-β-D-乙酰氨基葡萄糖苷(4-nitrophenyl-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside,pNPGlcNAc)、幾丁二糖 美國Sigma公司;其他試劑均為國產(chǎn)或進口分析純。

        1.2 儀器與設(shè)備

        MyCycler聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴增儀、Power Pac Basic電泳儀美國Bio-Rad公司;JY92-IIN超聲波細胞破碎儀 寧波新芝生物科技股份有限公司;UV765紫外-可見分光光度計上海佑科儀器有限公司。

        1.3 方法

        1.3.1BaNagase序列分析與結(jié)構(gòu)模擬

        根據(jù)NCBI提供的B. amyloliquefaciens來源潛在的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因BaNagase的編碼序列(GenBank登錄號:CBI41296.1),用SighnalP 4.0 sever(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)對其核苷酸序列中的信號肽進行分析;使用DNAMAN軟件對其核酸序列進行分析;用Primer Premier 5軟件設(shè)計引物。根據(jù)CAZy數(shù)據(jù)庫提供的GH3家族中已有報道的糖苷酶基因序列,使用軟件MEGA7按照Neighbor-Joining運算方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[17];利用ClustalX2軟件進行多重基因序列比對,并利用ESPrit3.0在線軟件(http://espript.ibcp.fr/ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi)進行二級結(jié)構(gòu)預測[18-19]。利用ExPASy(https://web.expasy.org)在線軟件對蛋白質(zhì)的等電點和分子質(zhì)量進行預測。

        基于Swiss-Model在線建模服務(wù)器(https://www.swissmodel.expasy.org/),進行BaNagase蛋白結(jié)構(gòu)的預測,篩選與其氨基酸序列一致性高于30%的模板蛋白,利用Swiss-Model的自動模式建立模型[20]。利用SwissDock系統(tǒng)進行β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶與幾丁二糖對接構(gòu)象的預測;利用PyMOL作圖軟件繪制蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)和對接構(gòu)象。

        1.3.2BaNagase基因擴增與重組質(zhì)粒的構(gòu)建

        以B. amyloliquefaciensYX-01菌株為模板進行PCR擴增,用于PCR擴增的引物分別為BaNagase-For(ATTCTA GCTAGCTCGACAAAACCGGACATTCC)和BaNagase-Rev(ATTCCGCTCGAGTTAAAGCGGTTTTCCGTTTT TTAGAT)(下劃線部分別為NheI和XhoI限制性內(nèi)切酶酶切位點)。PCR體系:菌液模板1.0 μL、上下游引物(10 μmol/L)各1.0 μL、2×TaqMaster Mix 25 μL,用雙蒸水補足至50 μL。PCR程序為:94 ℃預變性2 min,94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸2 min,共30 個循環(huán),72 ℃終延伸10 min。PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,按SanPrep柱式DNA膠回收試劑盒說明進行膠回收。凝膠回收片段經(jīng)NheI和XhoI雙酶切后,在T4連接酶作用下與經(jīng)NheI和XhoI雙酶切的表達載體pET-28a(+)連接。將其熱激轉(zhuǎn)化至E. coliDH5α感受態(tài)細胞中,通過含卡那霉素的LB固體培養(yǎng)基篩選陽性菌落,并在菌落PCR測序鑒定后,成功構(gòu)建得到的重組質(zhì)粒命名為pET-28a-BaNagase。

        1.3.3 BaNagase誘導表達與分離純化

        將成功構(gòu)建的重組質(zhì)粒熱激轉(zhuǎn)化至E. coliBL21(DE3)感受態(tài)細胞中,挑取轉(zhuǎn)化子接入LB液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)至OD600nm達到0.6~0.8,加入1‰ 1 mol/L的異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG),30 ℃誘導培養(yǎng)10 h。菌液離心后收集細胞棄上清液,用平衡緩沖液(20 mmol/L Tris-HCl,500 mmol/L NaCl,20 mmol/L咪唑)吹打沉淀至懸浮,超聲波破碎細胞。10 000 r/min離心5 min,收集上清液,使用Ni-IDA親和層析柱進行蛋白純化。Ni-IDA親和層析柱在經(jīng)5 倍柱體積的平衡緩沖液預平衡后上樣,用平衡緩沖液沖洗至OD280nm小于0.05,用含有40 mmol/L咪唑的Tris-HCl緩沖液(20 mmol/L Tris-HCl,500 mmol/L NaCl,40 mmol/L咪唑)進一步除去非特異性結(jié)合蛋白,至OD280nm小于0.05。最后用洗脫緩沖液(20 mmol/L Tris-HCl,500 mmol/L NaCl,200 mmol/L咪唑)洗脫并收集目的蛋白。分別取上清液和目的蛋白洗脫液加入蛋白電泳緩沖液,沸水浴煮沸10 min,用十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE,分離膠12.5%,濃縮膠4%)對蛋白分子質(zhì)量進行檢測。使用低分子質(zhì)量蛋白標準品進行校準,其中含有磷酸化酶B(97.2 kDa)、牛血清白蛋白(66.4 kDa)、卵清蛋白(44.3 kDa)、碳酸酐酶(29.0 kDa)和胰蛋白酶抑制劑(20.1 kDa)。

        1.3.4 酶活力的測定

        蛋白含量測定[21]:以牛血清白蛋白為標準品繪制標準曲線,采用考馬斯亮藍法測定蛋白含量。取100 μL適當稀釋的蛋白溶液,加入1 mL Bradford工作液,迅速混勻。室溫反應(yīng)3 min后,以加入等量蒸餾水為空白對照,使用分光光度計檢測595 nm波長下的吸光度。

        參照Yang Shaoqing等[22]的比色法測定β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶活力,取100 μL 2mmol/L pNP-GlcNAG為底物,加入50 μL 200 mmol/L磷酸鹽緩沖液(pH 6.0),混勻,65 ℃預熱1 min,然后加入50 μL適當稀釋的酶液,反應(yīng)10 min后,加入200 μL 0.5 mol/L NaOH溶液終止反應(yīng)。待冷卻后,以等量蒸餾水為空白對照,使用分光光度計檢測410 nm波長下的吸光度。酶活力單位(U)定義:在上述條件下,每分鐘生成1 μmoL對硝基苯酚所需的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶量為1 個酶活力單位。酶比活力為每毫克蛋白質(zhì)所具有的酶活力(U/mg)。

        1.3.5 重組酶BaNagase的酶學性質(zhì)分析

        1.3.5.1 最適溫度及溫度穩(wěn)定性的測定

        將BaNagase溶液適當稀釋于200 mmol/L pH 6.0的磷酸鹽緩沖液中,在不同溫度(40~75 ℃)條件下按1.3.4節(jié)標準酶活力方法測定其酶活力,以酶活力的最高點為100%,確定其最適反應(yīng)溫度。

        將BaNagase溶液適當稀釋于200 mmol/L pH 6.0的磷酸鹽緩沖液中,分別在不同溫度下(40~80 ℃)孵育30 min,然后于冰水浴中冷卻10 min后,按1.3.4節(jié)標準酶活力方法測定殘余酶活力,以未經(jīng)處理酶液的酶活力為100%,確定其溫度穩(wěn)定性。

        1.3.5.2 最適pH值及pH值穩(wěn)定性的測定

        將BaNagase溶液適當稀釋于不同緩沖體系(檸檬酸鹽緩沖液:pH 4.0~6.5;磷酸鹽緩沖液:pH 5.5~8.0;Tris-HCl:pH 7.5~9.0;甘氨酸-NaOH:pH 9.0~10.5)中,在65 ℃條件下按1.3.4節(jié)標準酶活力方法測定其酶活力,以酶活力的最高點為100%,確定其最適反應(yīng)pH值。

        將BaNagase溶液分別稀釋于以上不同pH值的緩沖體系中,置于65 ℃水浴中孵育30 min,然后于冰水浴中冷卻10 min后,按1.3.4節(jié)標準酶活力方法測定殘余酶活力,以未經(jīng)處理酶液的酶活力為100%,確定pH值穩(wěn)定性。

        1.3.5.3 BaNagase底物特異性分析

        分別以天然聚/寡糖(殼二糖、殼聚糖、幾丁二糖和幾丁質(zhì))和人工合成的對硝基苯基糖苷(對硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷、pNP-GlcNAc)為底物,聚/寡糖與酶液按一定比例混合后于50 ℃孵育24 h。通過薄層層析法(展開劑為異丙醇-水-氨水15∶1∶7.5)對產(chǎn)物組成進行分析。對硝基苯基糖苷水解酶活力按照1.3.4節(jié)標準酶活力方法進行測定,以水解釋放出對硝基苯酚速率計算酶活力。

        1.3.5.4 BaNagase動力學參數(shù)的測定

        用50 mmol/L pH 6.0磷酸緩沖液配制10 個不同濃度(0.015、0.03、0.045、0.06、0.075、0.09、0.105、0.12、0.135、0.15 mmol/L)的pNP-GlcNAc作為酶水解的底物,然后加入適量的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶在65 ℃反應(yīng)5 min,通過Sigma Plot軟件計算出Vmax、Km值和標準偏差。

        1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析

        酶學性質(zhì)表征中,運用軟件Origin 9.0對實驗數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析和圖形繪制,數(shù)據(jù)用 ±s表示。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 BaNagase的序列分析與結(jié)構(gòu)模擬

        NCBI數(shù)據(jù)庫中BLAST結(jié)果顯示,BaNagase氨基酸序列與GH3家族中B. subtilis(AIY91451.1)來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶序列相似度最高,達76.97%。系統(tǒng)發(fā)育樹分析結(jié)果(圖1)顯示BaNagase與GH3家族Clostridium paraputrificum(BAC56177.1)[23]、Rhizomucor miehei(AGC24356.1)[22]、Cellulomonas fimi(AAQ05801.1)[24]等來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶屬于同一分支,其中BaNagase與B. subtilis(AAA64351.1)[25]來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶的進化關(guān)系最近;而與GH3家族中β-D-葡萄糖苷酶和β-木糖苷酶親緣關(guān)系較遠。BaNagase與GH3家族中其他基因來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶多重序列比對結(jié)果(圖2)顯示,有多處高度保守的氨基酸序列重合,如底物結(jié)合位點氨基酸Asp118、Arg126和Arg186以及活性位點氨基酸Asp227、His229和Asp313,尤其是與GH3家族β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因序列中高度保守的KHFPGHGDTxxDSH序列(KHFPGHGDTDVDSH)也完全一致[26]。從蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)看,其含有的α-螺旋和β-折疊在數(shù)量和位置上也與GH3家族中其他來源的蛋白序列保持一致。綜合以上,判斷BaNagase應(yīng)歸屬于GH3家族。

        圖 1 BaNagase氨基酸序列系統(tǒng)發(fā)育樹分析Fig. 1 Phylogenetic analysis of β-N-acetylglucosaminidase from B. amyloliquefaciens YX-01 based on amino acid sequence

        通過Swiss-Model在線建模服務(wù)器對BaNagase的一級氨基酸序列進行檢索,發(fā)現(xiàn)模型蛋白4gyk.1與目的蛋白的序列甄別率最高75.48%,序列相似度為53%,覆蓋率達98%,故選取其為模板蛋白[25]。通過SwissDock預測BaNagase與幾丁二糖對接構(gòu)象,結(jié)果如圖3所示。通過序列比對及同源建模結(jié)果預測BaNagase的蛋白結(jié)構(gòu)由雙結(jié)構(gòu)域組成,N端是GH3家族催化結(jié)構(gòu)域,為典型的(β/α)8TIM桶結(jié)構(gòu);C端是α/β/α三明治構(gòu)造,為非催化結(jié)構(gòu)域。結(jié)合目前已有的研究發(fā)現(xiàn),GH3家族中的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶為保留型GH,采用雙置換機制催化水解反應(yīng)[27]。BaNagase中參與催化反應(yīng)的關(guān)鍵氨基酸位點預測為作為催化親核體的Asp313,以及保守序列KHFPGHGDTxxDSH中作為廣義酸/堿對的Asp227(加粗)和His229(加粗)[28],且底物結(jié)合位點Asp118、Arg126、Arg186、Asp227、His229和Asp313都位于N端TIM桶催化結(jié)構(gòu)域中。

        圖 2 BaNagase與GH3家族其他來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶氨基酸序列比對圖Fig. 2 Partial multiple sequence alignment of β-N-acetylglucosaminidase cloned from B. amyloliquefaciens and other sources in GH3 family

        圖 3 BaNagase結(jié)合幾丁二糖的結(jié)構(gòu)模擬Fig. 3 Structural simulation of BaNagase binding to chitin disaccharides

        2.2 基因克隆與重組質(zhì)粒的構(gòu)建

        以B. amyloliquefaciensYX-01基因組DNA為模板,PCR擴增獲得目的片段,1%瓊脂糖凝膠電泳顯示在2 000 bp左右有一條特異的DNA擴增條帶,大小與預期結(jié)果一致。經(jīng)過雙酶切和連接反應(yīng),構(gòu)建得到重組質(zhì)粒pET-28a-BaNagase。測序結(jié)果顯示B. amyloliquefaciens來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶的核氨酸序列長度為1 851 bp,編碼616 個氨基酸殘基,N端帶有組氨酸標簽。通過軟件預測其等電點為9.33,分子質(zhì)量為67.50 kDa。

        2.3 重組質(zhì)粒的誘導表達及分離純化

        將成功構(gòu)建的重組質(zhì)粒pET-28a-BaNagase轉(zhuǎn)入E. coliBL21(DE3)感受態(tài)細胞中。在30 ℃、200 r/min的條件下,經(jīng)1‰ 1 mol/L的IPTG溶液誘導培養(yǎng)10 h,成功獲得可溶性表達的目的蛋白。超聲波細胞破壁后的上清液經(jīng)Ni-IDA親和層析柱分離純化后,得到高純度的目的蛋白。通過SDS-PAGE檢測分析(圖4),結(jié)果顯示純化后得到了單一的目的蛋白條帶,分子質(zhì)量約為67 kDa,與BaNagase的理論分子質(zhì)量大小一致。該重組蛋白以pNPGlcNAG為底物,比活力為16.42 U/mg。

        圖 4 SDS-PAGE分析重組蛋白BaNagase的表達和純化Fig. 4 Expression and purification of BaNagase as shown by SDS-PAGE

        2.4 BaNagase酶學性質(zhì)分析

        2.4.1 最適溫度和溫度穩(wěn)定性

        測定BaNagase在不同溫度下(40~75 ℃)的酶活力,在65 ℃時酶活力最高(圖5A),β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶的最適溫度多在37~60 ℃之間,BaNagase的最適反應(yīng)溫度相較其他來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶而言更高[29]。將酶液在40~75 ℃的條件下分別孵育30 min,在溫度低于55 ℃的條件下BaNagase較穩(wěn)定,殘余酶活力保持在70%以上;在60 ℃條件孵育30 min后仍保持50%的酶活力(圖5B)。研究發(fā)現(xiàn)大部分β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶在不高于40 ℃的條件下穩(wěn)定性較高;在45~60 ℃時其熱穩(wěn)定性都較差,Microbacteriumsp.和Shinellasp.來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶在45 ℃時半衰期分別只有3 min和2 min[14,30-31];目前已有報道的穩(wěn)定性最高的是Trichoderma reesei來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶,在60 ℃時半衰期可長達8 h[32],而其他來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶在60 ℃條件下半衰期都普遍低于15 min[29,33]。相較于其他來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶,BaNagase展現(xiàn)出了更高的熱穩(wěn)定性,在較高溫度反應(yīng)條件的工業(yè)生產(chǎn)中具有應(yīng)用潛力。

        圖 5 重組蛋白BaNagase的最適溫度(A)、溫度穩(wěn)定性(B)、最適pH值(C)及pH值穩(wěn)定性(D)Fig. 5 Optimum temperature (A), thermostablity (B), optimum pH (C)and pH stability (D) of the purified recombinant BaNagase

        2.4.2 最適pH值和pH值穩(wěn)定性

        測定在pH 4.0~10.5不同緩沖液體系中BaNagase活力,在pH 6.0時BaNagase催化活力最高(圖5C)。將酶液在不同pH值的緩沖液中孵育30 min,BaNagase在較廣的pH值范圍內(nèi)(pH 4.5~11.0)都展現(xiàn)出了很高的穩(wěn)定性,殘余酶活力均保持在70%以上(圖5D)。BaNagase具有良好的pH值穩(wěn)定性,適用于大部分食品、化學和醫(yī)藥工業(yè)的生產(chǎn)條件。

        2.4.3 重組蛋白BaNagase的底物特異性和動力學參數(shù)

        實驗分別以天然糖類(殼二糖、殼聚糖、幾丁二糖和幾丁質(zhì))和人工合成的pNP-糖苷(對硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷、pNP-GlcNAc)為底物。結(jié)果顯示,BaNagase對幾丁二糖(圖6)和pNP-GlcNAc表現(xiàn)出最高的水解活性,在4 h內(nèi)可將1%的幾丁二糖基本水解為GlcNAc。薄層層析檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn)重組蛋白BaNagase對天然聚糖幾丁質(zhì)的水解率很低,且不能水解殼二糖、殼聚糖及其他人工合成的pNP底物。結(jié)果顯示BaNagase對幾丁二糖和pNP-GlcNAc有較高的催化活性,而對氨基葡萄糖類底物沒有催化活性。表明BaNagase具有嚴格的底物特異性,與已報道的大部分β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶底物特異性類似[32,34]。以pNP-GlcNAc為底物研究BaNagase的Vmax及Km分別為20.02 μmol/(min·mg)和0.055 mmol/L。

        圖 6 薄層層析檢測BaNagase水解幾丁二糖的反應(yīng)歷程Fig. 6 TLC analysis of the time course of chitin disaccharide hydrolyzed by the purified recombinant β-N-acetylglucosaminidase

        3 結(jié) 論

        β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶是生物降解法制備GlcNAc的工業(yè)生產(chǎn)中具有重要意義的一類水解酶。本研究發(fā)掘得到了一種B. amyloliquefaciens來源的新型β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因(BaNagase)。BaNagase屬于GH3家族,基因序列長度為1 851 bp,共編碼616 個氨基酸殘基,與GH3家族β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶分支的親緣關(guān)系最近,與GH3家族B. subtilis來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶具有最高的序列相似度;同源建模結(jié)果顯示BaNagase為雙結(jié)構(gòu)域蛋白,3 個催化殘基(親核體Asp313和廣義酸/堿對Asp227/His229)以及底物結(jié)合位點Asp118、Arg126、Arg186、Asp227、His229和Asp313都位于N端TIM桶結(jié)構(gòu)域中。酶學性質(zhì)研究結(jié)果表明,BaNagase以pNP-GlcNAc為底物的比活力為16.42 U/mg,對pNP-GlcNAc和幾丁二糖有較高的催化活性。該酶在4 h內(nèi)可將幾丁二糖基本水解得到GlcNAc;在溫度低于55 ℃的條件下,BaNagase能保持相對酶活力高于70%,相比其他來源的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶具有更高的熱穩(wěn)定性,適用于對熱穩(wěn)定性要求較高的生產(chǎn)應(yīng)用。研究結(jié)果拓展了β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶酶庫資源,為GlcNAc酶法制備及β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基礎(chǔ)研究提供了理論支持。

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