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        泌尿生殖道脲原體喹諾酮類耐藥機(jī)制的初步研究

        2020-04-22 10:09:52程燦燦朱劍霞古裕蓮陳順儀張金枚
        醫(yī)學(xué)綜述 2020年7期
        關(guān)鍵詞:原體喹諾酮氧氟沙星

        程燦燦,朱劍霞,古裕蓮,陳順儀,張金枚

        (1.廣州市番禺區(qū)中心醫(yī)院檢驗(yàn)科,廣州 511400; 2.江門市中心醫(yī)院中山大學(xué)附屬江門醫(yī)院產(chǎn)科,廣東 江門 529000)

        引起泌尿生殖道感染的常見支原體有脲原體、人型支原體以及生殖支原體。脲原體屬有Parvo和T960兩個(gè)生物型,其是兩個(gè)獨(dú)立的種。具有Parvo生物群特征的脲原體又被稱為微小脲原體(Ureaplasma parvum,Up),而有T960生物群特征的支原體被稱為解脲脲原體(Ureaplasma urealyticum,Uu)[1]。在臨床工作中,常規(guī)支原體培養(yǎng)及藥敏檢測(cè)尚不能區(qū)分Uu和Up[2],本研究收集的脲原體包括這兩個(gè)種。由于脲原體結(jié)構(gòu)和代謝上的特殊性,導(dǎo)致用于臨床治療的抗菌藥物有限,目前主要有喹諾酮類、大環(huán)內(nèi)酯類和四環(huán)素類藥物。近年來支原體的耐藥呈現(xiàn)逐年升高的趨勢(shì),其對(duì)喹類藥物的敏感性顯著降低,耐藥現(xiàn)象尤為嚴(yán)重[3]。研究顯示,喹諾酮耐藥決定區(qū)域(quinolone resistance determining regions,QRDRs)基因突變與脲原體對(duì)該類藥物的耐藥相關(guān)[4]。本研究針對(duì)性地檢測(cè)脲原體gyrA、gyrB、parC、parE基因中QRDRs的突變情況,初步探討泌尿生殖道脲原體對(duì)喹諾酮類的耐藥機(jī)制。

        1 材料與方法

        1.1一般材料

        1.1.1菌株來源 選擇2017年2月在廣州市番禺區(qū)中心醫(yī)院就診的556例泌尿生殖道感染患者為樣本來源,患者年齡16~64歲,平均(33±8)歲,無其他嚴(yán)重基礎(chǔ)疾病。由接診醫(yī)師進(jìn)行標(biāo)本采集。男性清洗及消毒尿道口后,用尿道拭子插入患者尿道口2~4 cm處輕旋1周,停留片刻后取出;女性清洗及消毒外陰后,用拭子插入患者宮頸口1~2 cm處輕旋1周,停留片刻后取出。標(biāo)本無菌密封并立即送檢。

        1.1.2主要儀器和試劑 Veriti FAST 96-WELL型聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增儀(美國Applied Biosystems公司);Gel Doc XR+凝膠成像儀(美國Bio-Rad公司);Taq DNA聚合酶(批號(hào):AH0645A)、DNA Marker 2000(批號(hào):A2201C)均購自TaKaRa公司[日本寶生物工程(大連)有限公司];DNA提取液購自中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司(批號(hào):2017001);支原體培養(yǎng)、鑒定、藥物敏感一體化試劑盒購自珠海麗珠生物技術(shù)有限公司(批號(hào):2016119809);引物合成及測(cè)序服務(wù)均由生工生物工程(上海)股份有限公司提供。

        1.2實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1支原體培養(yǎng)及藥敏試驗(yàn) 嚴(yán)格按照支原體培養(yǎng)、鑒定、藥物敏感一體化試劑盒說明書進(jìn)行標(biāo)本的接種、鑒定及藥物敏感結(jié)果判定。具體操作為:溶解培養(yǎng)小瓶中的培養(yǎng)基后,取50 μL培養(yǎng)基加入C-空白孔中,然后將無菌拭子采集的樣本插入培養(yǎng)基中,擠壓旋轉(zhuǎn)拭子數(shù)次,棄拭子,將混勻的液體培養(yǎng)基分別加入試劑條所有鑒定及藥敏孔中(除C-外)。最后在每一孔中滴加一滴無菌液體石蠟并密封。將含有剩余培養(yǎng)基的培養(yǎng)小瓶與試劑條一起置于35 ℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),分別于24、48 h后觀察鑒定及藥敏結(jié)果。其中,試劑條喹諾酮類藥物的藥敏孔為氧氟沙星(4 mg/L和8 mg/L)、左氧氟沙星(2 mg/L和8 mg/L)和司帕沙星(1 mg/L 和4 mg/L),3種藥物分別設(shè)置高、低兩個(gè)濃度,每個(gè)濃度設(shè)置1孔。在檢驗(yàn)結(jié)果鑒定為脲原體陽性的標(biāo)本中,對(duì)應(yīng)藥物的兩個(gè)濃度藥敏孔均不變色提示對(duì)該藥物敏感,對(duì)應(yīng)藥物的兩個(gè)濃度藥敏孔均變?yōu)榧t色提示對(duì)藥物高度耐藥,低濃度孔變紅色、高濃度孔不變色提示低度耐藥。從中篩選出對(duì)喹諾類藥物低度耐藥和高度耐藥的脲原體陽性的培養(yǎng)基(菌液),并于-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2脲原體DNA提取 選取7株有代表性的菌株(對(duì)至少1種喹諾酮類藥物高度耐藥)提取DNA并進(jìn)行基因擴(kuò)增和測(cè)序。取上述保存?zhèn)溆玫木暌后w培養(yǎng)物400 μL,12 879×g離心5 min后棄上清,加滅菌的0.9%氯化鈉溶液1 mL,充分混勻后12 879×g離心5 min并棄上清液;沉淀物中加入50 μL DNA提取液,充分混勻后100 ℃溫浴10 min,冷卻后12 879×g離心5 min,取上清液備用。

        1.2.3PCR擴(kuò)增及測(cè)序 以提取的脲原體DNA為模板,PCR擴(kuò)增gyrA、gyrB、parC、parE基因。所涉及的引物序列[5]見表1。PCR反應(yīng)條件為:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性15 s,退火30 s(各片段退火溫度見表1),72 ℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。PCR反應(yīng)結(jié)束后用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,并將擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物送公司進(jìn)行純化測(cè)序。

        表1 引物列表

        1.3觀察指標(biāo) 根據(jù)鑒定及藥敏結(jié)果分析脲原體感染和耐藥情況。對(duì)測(cè)序基因進(jìn)行序列分析,參照已報(bào)道的脲原體標(biāo)準(zhǔn)株Up ATCC 27815(GenBank序列號(hào):CP000942)[6]和Uu ATCC 33699(GenBank序列號(hào):CP001184)[7]的gyrA、gyrB、parC、parE基因分析并確定耐藥菌株的QRDRs序列的突變情況,并進(jìn)行氨基酸預(yù)測(cè)。

        2 結(jié) 果

        2.1引起泌尿生殖道感染的支原體菌株分布及藥敏結(jié)果 本研究共有556份標(biāo)本送檢,其中支原體陽性標(biāo)本314例,單純脲原體感染246例。支原體陽性率達(dá)44.2%(246/556)。菌株藥敏試驗(yàn)顯示,43例對(duì)3種喹諾酮類藥物均敏感,占17.5%;38例對(duì)至少1種藥物高度耐藥,占15.4%。對(duì)氧氟沙星高度耐藥的菌株有36例,占14.6%,對(duì)司帕沙星敏感的菌株有88例,占35.8%,見表2。

        表2 246例單純脲原體感染病例對(duì)喹諾酮類藥物的耐藥情況

        2.27株菌株的PCR擴(kuò)增結(jié)果及分析 PCR擴(kuò)增7株菌株的gyrA、gyrB、parC、parE基因片段,經(jīng)電泳檢測(cè)在250~500 bp有一明亮清晰條帶,與目標(biāo)片段大小一致,見圖1。

        M:marker 2000;1-7泳道分別為1-7號(hào)標(biāo)本對(duì)應(yīng)的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物

        圖1 gyrA、gyrB、parC、parE基因片段電泳圖

        PCR產(chǎn)物經(jīng)純化測(cè)序,得到的DNA序列與標(biāo)準(zhǔn)菌株(ATCC 27815)相應(yīng)的基因序列進(jìn)行比較。結(jié)果顯示,7株菌株的gyrA和gyrB片段與Up ATCC 27815的相應(yīng)基因序列相似度為100%,而與Uu ATCC 33699的相應(yīng)基因序列相似度則較低,7株菌株可能均為Up而非Uu。耐藥菌株的parC和parE片段與ATCC 27815的相應(yīng)基因序列比較,7株耐藥菌株的parC均可見C248T突變,parE均可見T1473C突變。見表3。在這些突變點(diǎn)中,只有C248T為非同義突變,造成parC的第83位氨基酸由絲氨酸變?yōu)榱涟彼?S83L),其余突變位點(diǎn)均為同義突變,未導(dǎo)致氨基酸改變。

        3 討 論

        因脲原體無細(xì)胞壁,所以對(duì)作用于微生物細(xì)胞壁的抗菌藥物如β-內(nèi)酰胺類、萬古霉素等天然抵抗;又由于其生長(zhǎng)繁殖過程不合成葉酸,因此對(duì)磺胺類及甲氧芐啶也不敏感;此外,對(duì)氨基糖苷類、多黏菌素、利福平等也高度耐藥。泌尿生殖道支原體感染

        表3 7株耐藥菌株parC和parE基因的變異情況

        治療首選大環(huán)內(nèi)酯類、喹諾酮類以及四環(huán)素類藥物。喹諾酮類是一類人工合成的廣譜抗生素,對(duì)脲原體有較好的抗菌活性,可口服用藥,因不良反應(yīng)少而被廣泛應(yīng)用。本地區(qū)之前的研究顯示,脲原體對(duì)喹諾酮類藥物(氧氟沙星、左氧氟沙星和司帕沙星)的全敏感率為12.24%[8],本研究結(jié)果(17.5%)與此接近。脲原體對(duì)喹諾酮藥物不同程度的耐藥在本地區(qū)及其他地區(qū)已相當(dāng)嚴(yán)重,因此探討耐藥機(jī)制十分必要。

        喹諾酮類藥物是通過抑制Ⅱ型拓?fù)洚悩?gòu)酶活性(包括旋轉(zhuǎn)酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ),阻止細(xì)菌DNA復(fù)制,從而導(dǎo)致細(xì)菌不能正常繁殖傳代。旋轉(zhuǎn)酶是由gyrA和gyrB基因編碼,而拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ是由parC和parE編碼。這4個(gè)基因的突變均可導(dǎo)致酶結(jié)構(gòu)或空間構(gòu)象的改變,進(jìn)而導(dǎo)致藥物不能與靶酶結(jié)合而產(chǎn)生耐藥。本研究選取的是對(duì)至少1種喹諾酮類藥物高度耐藥的菌株。這7株菌的旋轉(zhuǎn)酶基因gyrA、garB的保守性較高,在所測(cè)序列位置未發(fā)現(xiàn)堿基突變。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ基因的突變較多。與標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC 27815序列進(jìn)行比較,parC基因C248T(S83L)突變模式在7株菌中均存在。有文獻(xiàn)報(bào)道,C248T是否發(fā)生與喹諾酮類藥物敏感性密切相關(guān)[9-10]。近年來,這一突變?cè)谂R床分離的耐喹諾酮的Up與Uu中被頻繁檢出,成為中國地區(qū)QRDRs最普遍的突變[7]。S83L在parC上的突變?cè)谌蚋鞯仡l繁出現(xiàn),歐洲[11]、北美[4]、亞洲等地都有報(bào)道。Kawai等[10]采用軟件對(duì)S83L和S83W進(jìn)行結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn),這兩個(gè)突變的氨基酸位點(diǎn)均可通過位阻作用干擾菌株與喹諾酮類藥物的結(jié)合,但在體外實(shí)驗(yàn)中并未觀察到該突變直接導(dǎo)致脲原體耐藥的證據(jù)。S83L和S83W形成的耐藥性可針對(duì)氧氟沙星、左氧氟沙星和司帕沙星3種喹諾酮類藥物。雖然該突變與喹諾酮類藥物的耐藥機(jī)制相關(guān),但這7株帶有相同耐藥突變位點(diǎn)的菌株對(duì)這3種喹諾酮類藥物的敏感性不完全相同,提示極有可能存在其他的耐藥機(jī)制。有報(bào)道指出,脲原體細(xì)胞膜通透性的改變可能是耐氟喹諾酮類機(jī)制其中之一[12]。

        本研究結(jié)果顯示,parC、parE基因存在較多的同義突變位點(diǎn)。parC基因的突變G270C、T408C和parE基因的突變T1473C在本研究中也較普遍,但未發(fā)生氨基酸突變,可能是基因的多態(tài)性位點(diǎn)。對(duì)于gyrA基因,最常見的非同義突變是L176F,其次是Up中的 F67I、K78I、G179D、S174R,以及Uu中的 D77V[3]。研究顯示,與喹諾酮相關(guān)的parC和gyrA突變類型可能存在地區(qū)差異[13]。因此,有必要進(jìn)行大樣本耐藥基因的調(diào)查分析,了解本地區(qū)脲原體QRDRs突變特點(diǎn),以明確本地區(qū)脲原體對(duì)喹諾酮類藥物的耐藥機(jī)制。

        7株臨床株經(jīng)擴(kuò)增后測(cè)序發(fā)現(xiàn),gyrA、gyrB、parC和parE基因與標(biāo)準(zhǔn)菌株的序列比較,提示屬于Up的可能較大。目前,Uu和Up的劃分主要依據(jù)基因組之間的差異,核酸檢測(cè)能進(jìn)行區(qū)分[14],但尚未應(yīng)用于臨床診斷。文獻(xiàn)報(bào)道,Up的檢出率明顯高于Uu,甚至健康體檢人群也攜帶Up[15],但截至目前尚不能證明哪一種脲原體的致病性更強(qiáng)。在女性下生殖道標(biāo)本中脲原體的定植較常見,因此臨床工作中Uu及Up的區(qū)分也十分必要。但在對(duì)喹諾酮藥物如氧氟沙星、左氧氟沙星的體外敏感性上,Uu及Up的差異并不大[16-17],parC基因的C248T突變?cè)斐傻陌被酳83L改變?cè)趦煞N脲原體中均有檢出,并未發(fā)現(xiàn)在哪一種脲原體中獨(dú)立存在。許多研究致力于脲原體耐藥機(jī)制的探索,但其耐藥機(jī)制復(fù)雜,目前尚無確定的單一耐藥機(jī)制。目前認(rèn)為主要是gyrA、gyrB、parC以及parE基因的突變導(dǎo)致脲原體對(duì)氟喹諾酮類藥物不敏感[18],但有報(bào)道顯示形成生物被膜與喹諾酮類藥物敏感性降低有關(guān)[19-20]。有專家研究了基于脲原體管家基因(ftsH、rpL22、valS、thrS)的多位點(diǎn)序列分型方案,試圖通過研究脲原體的不同克隆群特點(diǎn)分析多位點(diǎn)序列分析與脲原體藥物敏感性的關(guān)系[21]。

        綜上所述,喹諾酮類藥物對(duì)本地區(qū)的脲原體存在較低的體外敏感性,并檢測(cè)到脲原體存在與喹諾酮耐藥相關(guān)的基因突變,即parC基因C248T(S83L)突變。由于本研究的限制及現(xiàn)有的耐藥機(jī)制研究并不能完全解釋脲原體臨床分離株對(duì)喹諾酮的耐藥機(jī)制,因此持續(xù)監(jiān)測(cè)解脲脲原體喹諾酮類藥物的耐藥情況并進(jìn)一步探討脲原體喹諾酮耐藥機(jī)制十分必要。

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