郝鑫宇，馮 健，孫延曉，陳琳琳，王起山，潘玉春,3*

（1.上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院，上海 200240；2.山東省萊蕪市萊蕪豬原種場(chǎng)有限公司，山東萊蕪 271100；3.上海市獸醫(yī)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，上海 200240）

經(jīng)過幾千年的自然與人工選擇，我國(guó)培育出了大量地方品種豬。根據(jù)第二次全國(guó)畜禽遺傳資源普查及其后續(xù)補(bǔ)充調(diào)查，目前我國(guó)尚存83 個(gè)豬地方品種，其中有6 個(gè)品種含多個(gè)地方類群，亦即品種/類群共有105 個(gè)[1]。這些遺傳資源是在我國(guó)特定的地理、生態(tài)環(huán)境下形成的，與傳統(tǒng)的社會(huì)、經(jīng)濟(jì)條件相適應(yīng)，因此大多數(shù)具有肉質(zhì)鮮美、產(chǎn)仔數(shù)多、適應(yīng)性強(qiáng)等特點(diǎn)。

為保障養(yǎng)豬業(yè)的可持續(xù)發(fā)展，滿足人們?nèi)找嬖鲩L(zhǎng)并且不斷變化的消費(fèi)需求，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部已組織開展了一系列保種工作。首先，完善了組織體系與法制法規(guī)。1997年成立了國(guó)家畜禽遺傳資源委員會(huì)。根據(jù)《畜牧法》，頒布了《國(guó)家級(jí)畜禽遺傳資源保護(hù)名錄》，制定了《畜禽新品種配套系審定和遺傳資源鑒定辦法》《畜禽新品種配套系審定和遺傳資源鑒定技術(shù)規(guī)范》《畜禽遺傳資源保種場(chǎng)保護(hù)區(qū)和基因庫(kù)管理辦法》等。其次，完善了原產(chǎn)地保護(hù)和異地保護(hù)相結(jié)合、活體保種和遺傳物質(zhì)保存互為補(bǔ)充的地方畜禽遺傳資源保護(hù)體系。目前，44個(gè)豬地方品種/類群被列入國(guó)家級(jí)保護(hù)名錄，建立了55個(gè)國(guó)家級(jí)保種場(chǎng)、6 個(gè)保護(hù)區(qū)。同時(shí)，搶救性保護(hù)了大蒲蓮豬、深縣豬等遺傳資源。

但在《畜禽遺傳資源保種場(chǎng)保護(hù)區(qū)和基因庫(kù)管理辦法》中，只對(duì)國(guó)家級(jí)保種場(chǎng)的群體規(guī)模及家系數(shù)量做了規(guī)定——母豬100 頭以上，公豬12 頭以上，三代之內(nèi)沒有血緣關(guān)系的家系數(shù)不少于6 個(gè)。實(shí)踐當(dāng)中，大多數(shù)國(guó)家級(jí)保種場(chǎng)均力爭(zhēng)滿足這些要求，并且高度重視系譜。系譜（Pedigree）是指反映動(dòng)物本身及其祖先的信息資料，可以用于指導(dǎo)選配、選種，進(jìn)而控制群體遺傳結(jié)構(gòu)、保持群體內(nèi)的遺傳多樣性。各保種場(chǎng)對(duì)系譜記錄及其檔案管理傾注了大量心血，并且因時(shí)制宜地提出和采納了一些應(yīng)用系譜進(jìn)行保種的措施。但是實(shí)際工作情況及應(yīng)用系譜對(duì)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析效果如何？實(shí)踐中對(duì)保種的理解、措施，例如家系、血統(tǒng)及其劃分，是否適應(yīng)新的時(shí)代？對(duì)于這些問題有必要開展調(diào)查研究。

萊蕪豬是原產(chǎn)于山東省萊蕪市的地方品種，歷史悠久，并以肌內(nèi)脂肪含量高聞名于世。2006 年，萊蕪豬被列入《國(guó)家級(jí)畜禽遺傳資源保護(hù)名錄》；2009 年，萊蕪豬原種豬場(chǎng)成為國(guó)家級(jí)畜禽遺傳資源保種場(chǎng)。本研究以萊蕪豬保種群為例，分析我國(guó)當(dāng)前保種實(shí)踐中在系譜記錄、檔案管理、系譜應(yīng)用中存在的共性問題，進(jìn)而提出合理、有效的措施與解決方案。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)材料 本研究以山東省萊蕪市萊蕪豬原種場(chǎng)保種群作為調(diào)研對(duì)象，統(tǒng)計(jì)場(chǎng)內(nèi)2018 年12 月的在群種豬個(gè)體信息，并向前追溯了這些個(gè)體的系譜，包括個(gè)體耳號(hào)、出生日期、親本信息等。

1.2 系譜分析

1.2.1 近交系數(shù)與親緣系數(shù) 本研究對(duì)在群個(gè)體系譜數(shù)據(jù)進(jìn)行梳理，并將梳理后的系譜數(shù)據(jù)整理成包含個(gè)體、父親、母親、出生日期4 列信息的文件格式。首先利用R 語(yǔ)言order 函數(shù)對(duì)個(gè)體進(jìn)行排序，之后利用R 語(yǔ)言 pedigree 包（https://CRAN.R-project.org/package=pedigree）計(jì)算萊蕪豬保種群個(gè)體加性遺傳相關(guān)矩陣（A）。該矩陣由個(gè)體間的親緣系數(shù)r組成，根據(jù)計(jì)算出的A矩陣，列出矩陣對(duì)角線Djj，根據(jù)公式Ft=Djj-1得到每個(gè)個(gè)體的近交系數(shù)。

1.2.2 實(shí)際的群體有效含量 群體有效含量（Ne）是指與實(shí)際群體有相同基因頻率方差或相同雜合度衰減率的理想群體含量。在此，理想群體是指群體足夠大，群體內(nèi)雌雄個(gè)體數(shù)相同并隨機(jī)交配，每個(gè)個(gè)體產(chǎn)生的后代數(shù)相同，無世代重疊，無選擇、突變、遷移等因素影響群體遺傳平衡現(xiàn)象發(fā)生的群體。根據(jù)數(shù)量遺傳學(xué)理論Falconer[2]，若群體中種公、母畜分別為Nm和Nf，則群體在各家系等量留種的情況下有效含量為：

假設(shè)起始群體的近交系數(shù)為0，則t 世代的近交系數(shù)為：

而群體每一世代的近交系數(shù)增量為：

進(jìn)一步地，根據(jù)《家畜遺傳資源瀕危等級(jí)評(píng)定（NY/T 2995-2016）》，假定2.5 年1 個(gè)世代，可以計(jì)算出經(jīng)歷過去一段時(shí)間內(nèi)后當(dāng)代的平均近交系數(shù)（Ft。），比較Ft。與實(shí)際的群體平均近交系數(shù)Ft可對(duì)過去的留種方式、群體有效含量等做出有效的掌握和判斷。

1.2.3 家系的數(shù)量及其分布 根據(jù)A矩陣，通過聚類分析法對(duì)個(gè)體聚類，具體利用R 語(yǔ)言中hclust函數(shù)中的最長(zhǎng)距離法進(jìn)行分類，畫出系譜聚類圖，決定分類的數(shù)目和各分類的個(gè)體。個(gè)體間遺傳距離（D）：D=1－r，r為個(gè)體間親緣系數(shù)。利用perl 腳本將A矩陣處理為MEGA 7[3]遺傳結(jié)構(gòu)分析軟件的文件格式，用此構(gòu)建反映個(gè)體間遺傳關(guān)系的系統(tǒng)進(jìn)化樹（Neighbor-joining tree，NJ-tree），以此構(gòu)建萊蕪豬系譜結(jié)構(gòu)圖。

據(jù)劉亞楠、許燕等人的統(tǒng)計(jì)，至2010年時(shí)全球已有15個(gè)國(guó)家進(jìn)行了400 多項(xiàng)有關(guān)TMT的研究，多數(shù)研究證實(shí)了其基本假設(shè)。[4] 但隨著研究的不斷深入和涉及范圍的不斷擴(kuò)大，也出現(xiàn)了很多對(duì)TMT不利的證據(jù)，引發(fā)了大量的爭(zhēng)論和質(zhì)疑，繼而延伸出了許多新的研究熱點(diǎn)。 但令人遺憾的是，這些研究中的絕大多數(shù)都是在西方文化背景中進(jìn)行的，國(guó)內(nèi)相關(guān)研究仍然非常缺乏，由于死亡覺知具有明顯的文化約束性，探索中國(guó)人獨(dú)特的恐懼管理機(jī)制，將是國(guó)內(nèi)研究者努力的方向。

2 結(jié)果與討論

2.1 系譜記錄

2.1.1 連續(xù)性與完整性 調(diào)查發(fā)現(xiàn)，場(chǎng)內(nèi)在群個(gè)體系譜僅可向前追溯至2009 年的數(shù)據(jù)，2009 年以前的系譜由于數(shù)據(jù)的大量缺失導(dǎo)致無法繼續(xù)追溯。檔案記錄顯示，萊蕪市于1973 年建立了國(guó)營(yíng)豬場(chǎng)——萊蕪豬保種繁育場(chǎng)；1978 年組建了保種選育群進(jìn)行保種繁育，同時(shí)在萊蕪市建立了2 個(gè)繁育場(chǎng)；1982 年對(duì)豬群進(jìn)行整頓，同時(shí)在面廣量大的萊蕪市及周邊地區(qū)再次進(jìn)行豬源調(diào)查，重新組建了75 頭含6 個(gè)血統(tǒng)、26 個(gè)祖系的保種選育基礎(chǔ)群和40 頭規(guī)模的繁育群；1991 年，萊蕪市種豬場(chǎng)（萊蕪豬種豬繁育場(chǎng)）在萊蕪市萊城區(qū)孫故事村建成投入使用，原苗山萊蕪豬原種場(chǎng)撤銷，原種場(chǎng)萊蕪豬豬群整體轉(zhuǎn)入該場(chǎng)；1993 年原泰安市楊莊萊蕪豬種豬場(chǎng)移交給萊蕪市；2000 年在萊蕪市種豬繁育場(chǎng)建立了存養(yǎng)萊蕪基礎(chǔ)母豬200 頭，占地33333 m2建筑面積為4 000 m2的高標(biāo)準(zhǔn)原種場(chǎng)，并新組建了無病原豬群體?？紤]到由于萊蕪豬場(chǎng)歷史變遷等原因?qū)е聶n案可能出現(xiàn)不連續(xù)不完整的情況，因此保種場(chǎng)應(yīng)及時(shí)對(duì)場(chǎng)內(nèi)時(shí)刻動(dòng)態(tài)變化的豬群建立電子檔案，并在地方豬品種登記平臺(tái)上隨時(shí)登記個(gè)體信息，保證系譜信息在各個(gè)階段連續(xù)與完整。此外，對(duì)于之前缺失無法挽回的數(shù)據(jù)造成系譜不完整，可能導(dǎo)致在其應(yīng)用分析過程中A矩陣準(zhǔn)確性下降。為此，需要進(jìn)一步利用分子標(biāo)記構(gòu)建系譜。

2.1.2 正確性與準(zhǔn)確性 在整理已知的系譜數(shù)據(jù)過程中發(fā)現(xiàn)的具體問題見表1。

表1 系譜中存在的問題

根據(jù)地方豬品種登記管理辦法（http://klab.sjtu.edu.cn/pigbreeds/index.html）[4]，個(gè)體號(hào)實(shí)行全國(guó)統(tǒng)一的編號(hào)規(guī)則，編號(hào)由15 位字母和數(shù)字構(gòu)成，如圖1 所示，各保種場(chǎng)應(yīng)按照自己的實(shí)際情況，建立起屬于自己的編號(hào)系統(tǒng)，避免耳號(hào)出現(xiàn)重復(fù)、錯(cuò)誤等問題。

圖1 種豬個(gè)體編號(hào)

具體編號(hào)原則：前2 位用英文字母表示品種；第3～7 位用英文字母或數(shù)字表示場(chǎng)號(hào)（由農(nóng)業(yè)農(nóng)村部統(tǒng)一認(rèn)定）及分場(chǎng)號(hào)；第8～9 位用公元年份最后二位數(shù)字表示個(gè)體出生時(shí)的年度；第10～13 位用數(shù)字表示場(chǎng)內(nèi)窩序號(hào)；第14～15 位用數(shù)字表示窩內(nèi)個(gè)體號(hào)，公豬用奇數(shù)表示、母豬用偶數(shù)表示。

對(duì)耳號(hào)重復(fù)且并無法區(qū)分、記錄錯(cuò)誤以及可能為雜交個(gè)體的萊蕪豬進(jìn)行過濾后，現(xiàn)有純種萊蕪豬163 頭，其中公豬18 頭，母豬145 頭。將萊蕪豬的在群個(gè)體電子檔案上傳至地方豬登記平臺(tái)上，并追溯到保種群的上溯3 個(gè)世代共360 頭萊蕪豬個(gè)體信息。

2.2 親緣系數(shù)與近交系數(shù)

2.2.1 計(jì)算方法 系譜記錄最主要的目的在于指導(dǎo)選配，進(jìn)而控制近交、避免遺傳多樣性的流失。所以，保種當(dāng)中特別重視個(gè)體的近交程度和兩兩個(gè)體間的親緣關(guān)系。

衡量近交程度可用近交系數(shù)。近交系數(shù)定義：近交系數(shù)是指?jìng)€(gè)體所由形成的2 個(gè)配子的加性基因效應(yīng)間的相關(guān)[5]；近交系數(shù)可定義為一個(gè)個(gè)體任一基因座上2 個(gè)等位基因?yàn)橥聪嗤母怕蔥6]。依據(jù)后一定義，假設(shè)一個(gè)個(gè)體x的近交系數(shù)Fx，追溯出x的所有共同祖先，計(jì)算Fx公式如下：

式中，k為共同祖先數(shù)，F(xiàn)i為第i個(gè)共同祖先，ni1與ni2分別為由x的父母到第i個(gè)共同祖先的代數(shù)。

然而，在實(shí)踐中要追溯每個(gè)個(gè)體2 個(gè)親本間的共同祖先及其世代傳遞路徑是極其困難的且易發(fā)生錯(cuò)誤。因此，近交系數(shù)計(jì)算也可采用另外一種方法——共親系數(shù)[6]。任意2 個(gè)個(gè)體的共親系數(shù)是從這2 個(gè)個(gè)體所產(chǎn)生的配子中各隨機(jī)抽取一個(gè)所攜帶的基因同源相同的概率，所以等于二者交配時(shí)所生后代的近交系數(shù)，亦即：

據(jù)此可以相對(duì)簡(jiǎn)單地計(jì)算出任意一個(gè)個(gè)體的近交系數(shù)，因?yàn)橹恍枰?jì)算該個(gè)體的2 個(gè)親本間的共親系數(shù)即可。由于實(shí)踐當(dāng)中自起始群體開始個(gè)體隨著時(shí)間推移逐漸產(chǎn)生，每個(gè)個(gè)體的父母較易準(zhǔn)確記錄、追溯，且當(dāng)群體不大時(shí)其父母間的共親系數(shù)也較易記錄、存貯，所以這種方法較之（1）式更為實(shí)用一些。但當(dāng)群體較大或歷史較長(zhǎng)時(shí)，沒有軟件和計(jì)算機(jī)，這種方法應(yīng)用起來仍較困難。

控制近交系數(shù)高低，關(guān)鍵在于配種個(gè)體間的親緣系數(shù)——2 個(gè)個(gè)體因?yàn)榫哂泄餐嫦榷斐傻募有曰蛐?yīng)間的相關(guān)。對(duì)應(yīng)（1）式，2 個(gè)個(gè)體s、d 間的親緣系數(shù)可以如下計(jì)算：

同理，利用共親系數(shù)的概念，采用下式計(jì)算親緣系數(shù)更加實(shí)用：

調(diào)查發(fā)現(xiàn)，無論哪種方法在實(shí)踐中都是困難的，且在實(shí)踐中并沒有參考群體中個(gè)體的近交系數(shù)和親緣系數(shù)進(jìn)行選配。出現(xiàn)這種情況的原因在于除了檔案記錄之外，還需要花費(fèi)大量時(shí)間和精力對(duì)檔案進(jìn)行整理和計(jì)算。為此，各個(gè)保種場(chǎng)通過地方豬登記平臺(tái)對(duì)場(chǎng)內(nèi)個(gè)體信息登記并利用育種軟件計(jì)算近交系數(shù)及親緣系數(shù)進(jìn)行快捷的選擇選配是十分有必要的。

2.2.2 計(jì)算結(jié)果 親緣系數(shù)與近交系數(shù)的評(píng)估是估計(jì)群體內(nèi)個(gè)體間的關(guān)系的重要指數(shù)，同時(shí)也是選配與保護(hù)利用的依據(jù)所在。本研究針對(duì)2009—2018 年的360 條記錄進(jìn)行分析，并計(jì)算了163 個(gè)個(gè)體近交系數(shù)和13 203對(duì)親緣關(guān)系對(duì)，統(tǒng)計(jì)結(jié)果見表2。結(jié)果顯示，163 頭保種群萊蕪豬平均近交系數(shù)為0.034，平均親緣系數(shù)為0.106；145 頭萊蕪母豬平均近交系數(shù)0.035，平均親緣系數(shù)為0.105；18 頭萊蕪公豬平均近交系數(shù)0.028，平均親緣系數(shù)為0.1?？梢钥吹焦i間的親緣系數(shù)和近交系數(shù)相對(duì)母豬較低一些。

表2 近交系數(shù)和親緣系數(shù)描述性統(tǒng)計(jì)

近交系數(shù)和親緣系數(shù)分布情況見圖2，個(gè)體近交系數(shù)和親緣系數(shù)分布在各個(gè)區(qū)間內(nèi)。大部分個(gè)體沒有近交情況，絕大多數(shù)個(gè)體近交系數(shù)在0～0.15，少部分個(gè)體近交程度比較高，近交系數(shù)最高為0.25。絕大部分個(gè)體間的親緣系數(shù)在0～0.35，親緣系數(shù)最高的為0.579。群體整體近交程度較低，個(gè)體間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

圖2 近交系數(shù)（A）和親緣系數(shù)(B)分布圖

2.3 實(shí)際群體有效含量 對(duì)萊蕪豬2009—2018 年的保種群個(gè)體劃分為4 個(gè)世代，根據(jù)145 頭母豬、18 公豬按照各家系等量留種方式計(jì)算群體有效含量為92.19 頭，平均近交系數(shù)年增量為0.5424%。理論上按照等量留種的方式萊蕪豬當(dāng)代群體平均近交系數(shù)Ft應(yīng)為2.15%，實(shí)際上當(dāng)代的群體近交系數(shù)Ft。為3.50%。出現(xiàn)Ft。大于Ft這種現(xiàn)象的原因在于在過去一段時(shí)間的生產(chǎn)實(shí)踐中群體內(nèi)沒有按照等量留種的方式，部分個(gè)體采了隨機(jī)留種的方式。隨機(jī)留種相較于各家系等量留種會(huì)使群體有效含量降低，群體近交增量提高，并且對(duì)于這種偏移家系留種的方式，會(huì)導(dǎo)致群體近交程度的升高甚至出現(xiàn)基因遺傳漂變。因此，保種僅通過控制公母數(shù)量、家系數(shù)量的要求不足以控制群體近交增量。然而在實(shí)際中由于疾病疫情等因素，實(shí)踐中幾乎無法嚴(yán)格按照等量留種方式留種，故應(yīng)盡量考慮公母比例及血統(tǒng)關(guān)系，盡量保證群體有效含量，保持群體動(dòng)態(tài)平衡。

2.4 家系數(shù)量及其分布

2.4.1 全群 依據(jù)農(nóng)業(yè)農(nóng)村部頒布的《畜禽遺傳資源保種場(chǎng)保護(hù)區(qū)和基因庫(kù)管理辦法》，符合種用標(biāo)準(zhǔn)的單品種基礎(chǔ)畜禽數(shù)量要求母豬100 頭以上，公豬12 頭以上，3代之內(nèi)沒有血緣關(guān)系的家系數(shù)為6 個(gè)以上。3 代之內(nèi)沒有血緣關(guān)系，則2 個(gè)個(gè)體間親緣系數(shù)應(yīng)該小于0.062 5（圖3）?；贏 矩陣構(gòu)建個(gè)體間聚類圖，由圖3 可知，現(xiàn)存萊蕪豬保種群家系均劃分為13 個(gè)家系，大部分家系群體數(shù)量較為合理，但部分家系個(gè)體比較少，如7 號(hào)和12 號(hào)家系。

圖3 萊蕪豬親緣系數(shù)聚類圖

2.4.2 公豬 利用本研究的系譜聚類法對(duì)18 頭萊蕪公豬進(jìn)行聚類分析，其親緣系數(shù)聚類圖見圖4。根據(jù)3 代之內(nèi)沒有血緣關(guān)系的原則，當(dāng)親緣系數(shù)取0.0625 時(shí)，18頭豬可以分成7 個(gè)血統(tǒng)，當(dāng)親緣系數(shù)取0.2 時(shí)，18 頭豬可以分成10 個(gè)血統(tǒng)。表明隨著親緣系數(shù)的增加，血統(tǒng)數(shù)量也將增加，這也與王起山等[7]研究結(jié)果相一致。

利用加性遺傳關(guān)系A(chǔ)矩陣構(gòu)建的反映鄰近個(gè)體關(guān)系的萊蕪豬群體內(nèi)系譜結(jié)構(gòu)見圖5， 18 頭公豬在各個(gè)家系中整體分布較為均勻。

圖4 18 頭萊蕪公豬親緣系數(shù)聚類圖

2.4.3 問題 因?yàn)閷?shí)踐當(dāng)中近交系數(shù)、親緣系數(shù)難以計(jì)算，人們采用了變通措施——家系。通過以家系為抓手，在實(shí)際生產(chǎn)實(shí)踐中采用不同家系中的個(gè)體進(jìn)行選配，這種方式相較于根據(jù)個(gè)體間親緣系數(shù)選配會(huì)因?yàn)閭€(gè)別家系數(shù)量少或選配中混淆家系個(gè)體等情況出現(xiàn)近交。調(diào)查發(fā)現(xiàn)，雖然萊蕪豬家系數(shù)量較多，但家系中個(gè)體數(shù)量分布不均衡，保種過程中存在著關(guān)注家系的數(shù)量，卻忽視了家系結(jié)構(gòu)的現(xiàn)象。

圖5 18 頭公豬分布情況

此外，家系劃分通常是基于起始群體中的個(gè)體都假定為無親緣關(guān)系的個(gè)體。本研究利用聚類分析將可追溯的第3 世代的個(gè)體當(dāng)作起始群體。然而，這些個(gè)體可能存在一定的親緣關(guān)系，因此，如果能追溯更多代的祖先則可以更準(zhǔn)確反映群體結(jié)構(gòu)。另外，保種群之前的共同祖先造成了大量基因位點(diǎn)的同態(tài)相同，而遺傳多樣性同基因組中同態(tài)相同的基因位點(diǎn)數(shù)密切相關(guān)。因此，在基因組時(shí)代，應(yīng)關(guān)注基于分子標(biāo)記構(gòu)建系譜，切實(shí)反映群體真實(shí)的血統(tǒng)關(guān)系。

豬的常規(guī)保種主要是以維持群體遺傳結(jié)構(gòu)不變作為目標(biāo)。為此，根據(jù)Hardy-Weinberg 定律，通常建議采取如下保種措施：①盡量擴(kuò)大群體規(guī)模；②公母數(shù)量盡量趨近；③各家系盡量等量留種，在此家系是指成為下一世代繁殖個(gè)體的1 個(gè)個(gè)體的后裔數(shù)目；④親本貢獻(xiàn)盡量一致；⑤各世代的群體規(guī)模盡量不要突然向下波動(dòng)；⑥世代間隔盡量延長(zhǎng)。

3 結(jié) 論

本研究以萊蕪豬保種群系譜檔案作為案例，探析了當(dāng)前保種場(chǎng)系譜記錄、管理及應(yīng)用系譜對(duì)群體遺傳結(jié)構(gòu)效果分析中存在的共性問題。對(duì)于大部分保種場(chǎng)，系譜中仍存在不完整、不連續(xù)及準(zhǔn)確性等問題。因此各個(gè)保種場(chǎng)應(yīng)加強(qiáng)檔案管理，及時(shí)建立電子檔案及規(guī)范耳號(hào)編號(hào)、系譜記錄流程，避免給后續(xù)的育種分析帶來困難與阻礙。應(yīng)用系譜分析時(shí)應(yīng)與時(shí)俱進(jìn)，各家系盡可能等量留種，但在選配中不應(yīng)過多的強(qiáng)調(diào)家系和血統(tǒng)，在實(shí)踐中充分重視中國(guó)地方豬品種登記平臺(tái)的信息登記、儲(chǔ)存及軟件利用。此外，本研究?jī)H局限于系譜對(duì)保種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析，由于系譜缺陷和孟德爾抽樣誤差等原因，可能無法反映群體真實(shí)的遺傳結(jié)構(gòu)。因此，后續(xù)在基于系譜分析遺傳結(jié)構(gòu)的同時(shí)，有必要進(jìn)一步通過結(jié)合分子標(biāo)記優(yōu)化遺傳結(jié)構(gòu)，從而有助于種質(zhì)資源的有效保護(hù)及合理利用。