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        基于網(wǎng)絡藥理學和分子對接探討新香沖劑治療流感的作用機制*

        2020-04-19 07:12:32羅子清唐麗娟劉云濤張忠德

        羅子清 ,唐麗娟 ,劉云濤 ,3,張忠德 **

        (1. 廣州中醫(yī)藥大學第二臨床醫(yī)學院 廣州 510405;2. 廣州中醫(yī)藥大學第二附屬醫(yī)院 廣東省中醫(yī)院 廣州510405;3. 廣東省中醫(yī)急診研究重點實驗室 廣州 510405)

        流感暴發(fā)造成的人類健康和社會經(jīng)濟損失仍然是一個全球性的公共衛(wèi)生問題[1,2]。病毒的侵襲激活肺上皮、內皮細胞迅速產(chǎn)生大量的細胞因子如白介素1(Interleukin 1 Alpha/Beta, IL-1α/β)、白 介 素 6(Interleukin 6,IL-6)、γ 干擾素(Interferon-γ,IFN-γ)、腫瘤壞死因子α(Tumor Necrosis Factors,TNF-α)、環(huán)氧合酶(Cyclooxygenase 2,COX2)等[3],對機體進行猛烈攻擊的現(xiàn)象,稱為“細胞因子風暴”。流感患者往往不是死于病毒的直接攻擊,機體免疫系統(tǒng)紊亂所引發(fā)的“細胞因子風暴”才是流感患者的奪命殺手?!凹毎蜃语L暴”能直接損傷內皮細胞,或招募巨噬細胞和嗜中性粒細胞誘導肺泡上皮-內皮屏障損傷,導致肺泡內的纖維蛋白、紅細胞和炎性細胞的蛋白質水腫液累積,進一步減少肺泡的氣體交換,引發(fā)急性呼吸窘迫綜合征(Acute Respiratory Distress Syndrome,ARDS)[4]。流感的嚴重性在于炎癥浸潤導致的急性肺損傷(Acute Lung Injury,ALI),可在短時間內引起呼吸衰竭,此為流感患者最常見的死亡原因。支持性護理和抗病毒藥物是流感的主要治療手段,藥物當中以神經(jīng)氨酸酶抑制劑(Neuraminidase Inhibitors,NAIs)[5],如奧司他韋、扎那米韋和帕拉米韋等最為常用。美國感染病學會流感指南[6]推薦盡早啟用NAIs 進行抗病毒治療,超過48小時后使用NAIs的臨床獲益將減少,但臨床上錯過最佳治療時機的患者不在少數(shù)。流感中后期可以出現(xiàn)病毒性心肌炎、病毒性腦炎、膿毒性休克、多器官功能衰竭等嚴重并發(fā)癥[7]。傳統(tǒng)的抗病毒藥物僅針對病毒本身進行打擊,如何降低細胞因子水平、改善由于炎癥浸潤引起的ALI 和ARDS 尚未引起足夠重視。使用NAIs是否能減少患者由于免疫紊亂罹患的并發(fā)癥、減少重癥發(fā)生率仍缺乏有力的臨床證據(jù)。此外,流感病毒存在抗原漂移和抗原轉化的問題[8],導致病毒持續(xù)變異[9],這無疑加大了抗病毒藥物研發(fā)的成本和難度。綜上,宿主免疫功能失衡、炎癥反應劇烈增加了重癥流感患者的不良結局,這使得從減輕炎性損傷、調節(jié)免疫、保護宿主的角度出發(fā),研發(fā)新型流感藥物有其必要性和重要性。

        已有研究表明中藥抗流感病毒的有效性毋庸置疑,其抗炎、免疫調節(jié)以及宿主保護的作用也不容忽視。新香沖劑系全國名老中醫(yī)周仲瑛教授師法《溫病條辨》中的新加香薷飲,以清熱解表祛濕法為指導,基于嶺南濕熱為患的致病特點擬定。后由廣東省中醫(yī)院在嶺南道地藥材資源基礎上,結合嶺南地區(qū)居民身體素質特點將其發(fā)展為院內制劑。新香沖劑由香薷、廣藿香、青蒿、扁豆花、黃芩、連翹、鴨跖草、柴胡、前胡共9 味藥物組成。周老認為流感的治療重在“芳香宣透”[9],因此取香薷作為君藥以芳香化濕、祛暑解表,輔以青蒿、黃芩為臣藥清透血熱,佐以廣藿香、扁豆花、鴨跖草、連翹、柴胡、前胡共奏清熱祛濕、解表透邪之功。在臨床研究中發(fā)現(xiàn),新香沖劑對急性病毒性上呼吸道感染有良好的治療效果,可明顯解熱鎮(zhèn)痛,改善患者頭身困重、乏力等癥狀,且未見明顯不良反應[10-12]。同時周老認為中醫(yī)對病毒感染疾患的治療不應單純針對病毒,更應重視調整人體的整體機能、充分發(fā)揮其非特異性治療作用[13]。周老所強調的“抗病毒”“調機能”雙管齊下的思想,與研發(fā)兼?zhèn)淇共《尽⒖寡?、調節(jié)免疫等多效用的流感新藥的思想,有異曲同工之妙。因此,本研究基于中醫(yī)理論、新香沖劑的有效性和安全性,使用網(wǎng)絡藥理學和分子對接的方法,闡明新香沖劑的物質基礎,嘗試從多角度探索新香沖劑治療流感的作用機制,以期將其在臨床進一步推廣應用。

        1 材料和方法

        1.1 新香沖劑的成分收集與篩選

        新香沖劑由9 味中藥組成,分別是香薷、廣藿香、青蒿、扁豆花、黃芩、連翹、鴨跖草、柴胡、前胡?;赟ymMap 數(shù)據(jù)庫[14](https://www.symmap.org/)搜集以上9味中藥的化合物成分,在PubChem 數(shù)據(jù)庫[15](https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)獲取成分的Canonical SMILES 號。為了嚴格甄選新香沖劑的活性成分,首先通過FAF-Drugs4 平臺[16](http://fafdrugs4.mti.univparis-diderot.fr/)評價化合物的吸收、分布、代謝和消除(Absorption, Distribution, Metabolism and Elimination,ADME)參數(shù),選取評價為“accept”的成分。再利用TargetNet數(shù)據(jù)庫[17](http://targetnet.scbdd.com/)評價成分的里賓斯基五規(guī)則(Lipinski Rules of Five,LR)得分,選取LR得分≥75%的活性成分。

        1.2 新香沖劑靶點預測

        利用活性成分的Canonical SMILES 號,通過TargetNet 平臺預測各成分的靶點,收集Prob=1 的靶點,形成新香沖劑的靶點集。

        1.3 流感靶點的獲取

        為了得到更貼近臨床真實情況的流感疾病靶點集,以“influenza”為關鍵詞,檢索GEO 數(shù)據(jù)庫[18](https://www. ncbi. nlm. nih. gov/gds/),選 取 物 種 為“Homo Sapiens”的芯片數(shù)據(jù)(編號:GSE101702)。該數(shù)據(jù)集包括了107 個流感樣本,和52 個健康人樣本。進行GEO2R 分析,選取|logFC|>1.5,P<0.05 的靶點,利用GSEA 軟件對芯片靶點名稱進行注釋,利用UniProt 網(wǎng)站[19](https://www.uniprot.org/)篩選人源化靶點,最終形成人類流感疾病的靶點集。

        1.4 網(wǎng)絡構建及拓撲結構分析

        構建新香沖劑中藥-成分、成分-靶點網(wǎng)絡圖,進行網(wǎng)絡拓撲結構分析,找出網(wǎng)絡中的關鍵節(jié)點。HINT數(shù)據(jù)庫[20](http://hint.yulab.org/)是一個高質量的PPI 數(shù)據(jù)庫,其數(shù)據(jù)主要來源于高通量測序和經(jīng)由文獻報道的實驗。利用 Cytoscape3.6.0 軟件[21],以 HINT 數(shù)據(jù)庫獲得的人類疾病基因作為背景網(wǎng)絡,分別構建新香沖劑靶點網(wǎng)絡和PPI 網(wǎng)絡,流感疾病靶點網(wǎng)絡和PPI 網(wǎng)絡。使用Merge功能,取新香沖劑PPI網(wǎng)絡和人類流感疾病PPI網(wǎng)絡的交集,提取交集網(wǎng)絡,形成新香沖劑靶向流感的核心子網(wǎng)絡。對核心子網(wǎng)絡進行網(wǎng)絡拓撲結構分析,根據(jù)連接度(Degree)和介數(shù)中心性(Betweenness Centrality),篩選關鍵靶點(Hub-target)。

        1.5 GO分析和KEGG通路富集分析

        利用DAVID6.8 在線分析工具[22](https://david.ncifcrf.gov/)對核心子網(wǎng)絡的靶點進行GO 分析和KEGG[23]通路富集分析。選擇生物過程、分子功能、細胞組分3 個模塊,利用Graphpad Prism5.0 繪制條形圖;利用OmicShare tool 在線平臺(http://www.omicshare.com/tools)繪制通路富集氣泡圖。

        1.6 分子對接驗證關鍵化合物與關鍵靶點的相互作用關系

        基于網(wǎng)絡拓撲結構分析甄選出的關鍵化合物和關鍵靶點,利用分子對接的方法驗證二者的相互作用關 系 。 利 用 ChemBio3D Ultra13.0[24]和 Autodock Tool1.5.6[25]對關鍵化合物和靶點的結構進行優(yōu)化,過程包括能量最小化、去除水分子、合并非極性氫。隨后利用Vina1.1.2 軟件[25]進行盲法對接(Blind Docking),能量范圍(Energy Range)設置為5,精度(Exhaustiveness)為100,輸出20 個預測結果。選取其中結合能得分(Affinity Score)最小的對接模型,利用LigPlus1.4[26]、PyMOL1.7[27]軟件對其進行可視化分析,明確關鍵靶點與關鍵化合物的結合位點和相互作用關系。

        2 結果

        2.1 新香沖劑的活性成分

        從新香沖劑中搜集到了126個滿足條件的活性成分。一個中藥中包含多個活性成分;同一個活性成分可以存在多個中藥當中。在新香沖劑中,至少對應3個或以上中藥的活性成分,分別有槲皮素,丁香酚,芹菜素,木犀草素,1,8-桉葉素,山柰酚,廣藿香醇,百里香酚,阿魏酸(圖1)。

        2.2 新香沖劑靶點和流感疾病靶點

        TargetNet 成功預測了126 個活性成分的靶點,其中香薷 84 個、廣藿香 82 個、青蒿 75 個、扁豆花 35 個、黃芩 97 個、連翹 101 個、鴨跖草 54 個、柴胡 107 個、前胡88 個,除重后總共得到新香沖劑的140 個靶點。芯片分析得到86個流感疾病靶點。

        2.3 網(wǎng)絡構建及拓撲結構分析結果

        新香沖劑中藥-成分網(wǎng)絡(圖1)中包括131 個節(jié)點,167 條邊;成分-靶點網(wǎng)絡(圖2)中包括264 個節(jié)點,2943 條邊。根據(jù)節(jié)點的連接度調節(jié)其形狀大小,連接度越大,則節(jié)點形狀越大,連接度越小,則節(jié)點形狀越小,連接度越大的節(jié)點在網(wǎng)絡中的位置越重要。對成分-靶點網(wǎng)絡進行拓撲結構分析,連接度排在前9 名的活性成分為芹菜素,木犀草素,阿魏酸,丁香酚,1,8-桉葉素,對香豆酸,咖啡酸,丹皮酚,槲皮素,它們是新香沖劑中的重要活性成分。芹菜素的連接度在所有重要活性成分中排名第1,是整個網(wǎng)絡中的關鍵成分。

        新香沖劑靶點網(wǎng)絡和流感疾病靶點網(wǎng)絡的唯一共同靶點是基質金屬蛋白酶9(Matrix Metalloproteinase-9,MMP9),因此 MMP9 為這兩個網(wǎng)絡中的關鍵靶點。將新香沖劑PPI 網(wǎng)絡與流感疾病PPI網(wǎng)絡取交集(圖3A),從而形成核心子網(wǎng)絡(圖3B)。該核心子網(wǎng)絡中有119個節(jié)點,921條邊。對核心子網(wǎng)絡進行拓撲結構分析,篩選出連接度≥8、介數(shù)中心性≥0.014 的靶點,分別為熱休克蛋白90(Heat Shock Protein 90,HSP90)、細胞分裂周期蛋白37(Cell Division Cycle Protein 37, CDC37)、表皮生長因子受體(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR),它們是整個核心子網(wǎng)絡中的關鍵靶點。

        2.4 基因本體和通路富集分析

        對核心子網(wǎng)絡的119 個靶點進行基因本體(GO)分析,選擇P<0.05的生物過程、分子功能、細胞組分3個模塊繪制條形圖(圖4)。在生物學過程中,涉及了一氧化氮(Nitric Oxide,NO)生物合成過程的正向調節(jié),缺氧反應,Notch信號,IFN-γ介導的信號通路調控,核因子κB 抑制劑 (Inhibitor of NF-κB,I-κB)激酶/核因子 κB(Nuclear Factor kappa-B,NF-κB)信號通路的正向調節(jié),I 型干擾素(Type I Interferons,IFNs)生產(chǎn)的正向調節(jié),細胞對TNF-α 的反應,細胞對過氧化氫的反應,細胞增殖調節(jié),一氧化氮合酶活性的正向調節(jié),EGFR 信號通路的正向調節(jié),病毒過程,IFNs 介導的信號通路的調控,細胞周期,轉化生長因子β(Transforming Growth Factor Beta,TGF-β)受體信號通路,細胞凋亡,絲裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)活性激活,對氧化應激的反應等。在分子功能中,涉及了組蛋白結合,鈣粘附素與細胞間粘附的關系,酶結合,p53結合,一氧化氮合酶調節(jié)活性,熱休克蛋白結合等。在細胞組分中,核染色體,蛋白復合物,核小體,核質等項目排名靠前。

        圖1 新香沖劑中藥-成分網(wǎng)絡圖

        圖2 新香沖劑成分-靶點網(wǎng)絡圖

        圖3 A.流感靶點PPI-新香沖劑PPI交集B.新香沖劑靶向流感的核心子網(wǎng)絡

        KEGG 通路分析共獲得 51 條通路,以P<0.05,基因數(shù)≥4 為度,顯著富集的通路有44 條,與流感疾病顯著相關的重要通路12 條(圖5)。結果顯示,核心子網(wǎng)絡的靶點涉及的疾病通路為甲型流感通路。與免疫系統(tǒng)相關的通路有3 條,分別是TLR(Toll Like Receptors,TLR)信號通路,核苷酸結合寡聚化結構域(Nucleotide-binding Oligomerization Domain,NOD)樣受體信號通路,RLR(RIG-I like Receptor,RLR)信號通路。涉及信號轉導的通路有6 條,分別為低氧誘導因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信號通路,磷脂酰肌醇 3 激酶( Phosphatidylinositol 3 Kinase ,PI3K)/蛋白激酶B(Protein Kinase B,PKB/AKT)信號通路,叉頭家族轉錄因子(Forkhead Box O,FoxO)信號通路,TGF-β信號通路,Notch 信號通路,NF-κB 信號通路。涉及細胞生長和死亡的通路有2 條,分別為有細胞凋亡,p53 信號通路。

        2.5 關鍵化合物與關鍵靶點的分子對接結果

        基于網(wǎng)絡拓撲結構分析可知,芹菜素是成分-靶點網(wǎng)絡中的關鍵成分,MMP9 是PPI 網(wǎng)絡中的關鍵靶點。盲法對接后產(chǎn)生了20 個配體-蛋白結合預測模型,對結合能最低的Mode 1 進行可視化分析(圖6、圖7)。由亮氨酸、組氨酸、脯氨酸、精氨酸、纈氨酸、蘇氨酸等氨基酸殘基形成結合口袋,芹菜素與MMP9 的谷氨酸、丙氨酸、酪氨酸、蛋氨酸、精氨酸之間通過7個氫鍵結合,形成穩(wěn)定的結合力,表明芹菜素與MMP9的結合較為緊密。

        圖4 新香沖劑靶向流感的核心子網(wǎng)絡靶點的GO分析

        圖5 新香沖劑靶向流感核心子網(wǎng)絡的靶點KEGG通路富集氣泡圖

        3 討論

        中藥復方藥味多,成分繁雜,強調君臣佐使的配伍原則,一直是中醫(yī)藥現(xiàn)代化研究的難題。網(wǎng)絡藥理學基于系統(tǒng)生物學、計算機科學、統(tǒng)計學、藥理學等學科,構建復雜網(wǎng)絡,從宏觀的角度探索生物網(wǎng)絡中各要素的相互作用[28]。網(wǎng)絡藥理學的宏觀視野和中醫(yī)治病提倡的“整體觀念”是不謀而合的[29]。分子對接是研究配體與受體之間相互作用,預測其結合模式和親合力,實現(xiàn)基于結構相似性輔助藥物設計的方法[30]。采用網(wǎng)絡藥理學和分子對接的方法,有望對新香沖劑的復雜組方進行抽絲剝繭的分析,從整體的角度理解其治療流感的現(xiàn)代藥理學內涵。

        3.1 新香沖劑對流感的治療作用

        新香沖劑的君藥為香薷,臣藥為青蒿和黃芩,廣藿香、扁豆花、鴨跖草、連翹、前胡、柴胡均為佐使藥物。香薷,有發(fā)汗解表,化濕和中之功效,臨床上主要用于惡寒發(fā)熱、暑濕感冒等[31]。香薷的主要成分黃酮類是發(fā)揮解熱抗炎、增強免疫作用的主要成分[32]。經(jīng)香薷乙醇提取物喂養(yǎng)的小鼠對流感病毒感染有保護作用且肺組織的病毒滴度較低;另外香薷水提物能降低脂多糖致熱大鼠的肛溫,降低TNF-α、環(huán)磷酸腺苷(Cyclic Adenosine Monophosphate,cAMP)、IL-1β 和過氧化物酶的表達水平,亦能增強體液免疫[33]。青蒿能截瘧解暑,用于暑邪發(fā)熱等。青蒿水提物中的多種成分如總香豆素等,能降溫解熱,通過下調誘導型一氧化氮合酶蛋白表達,抑制炎癥因子的表達[34]。黃芩清熱解毒,具有抗炎、抗病毒、抗腫瘤的功效,其提取物能顯著抑制流感病毒的活性,誘導T細胞和NK細胞產(chǎn)生IFN-γ,減輕IL-1β 誘導的炎癥損傷[35]。本次研究對新香沖劑“君、臣、佐、使”的配伍規(guī)律進行了科學的解釋。通過成分-靶點網(wǎng)絡分析發(fā)現(xiàn),在9種最重要的活性成分中,其中7種來源于香薷,由此體現(xiàn)出香薷的君藥地位。青蒿-黃芩的共同靶點集與香薷靶點集有64.8%的共同靶點,說明青蒿、黃芩作為臣藥可以協(xié)同增強香薷之藥效。

        圖6 芹菜素與MMP9相互作用的二維平面圖

        圖7 芹菜素與MMP9相互作用的三維示意圖

        新香沖劑成分-靶點網(wǎng)絡中的重要成分芹菜素、木犀草素、槲皮素屬黃酮類化合物,它們對流感的治療作用不僅體現(xiàn)在抑制病毒的血凝素蛋白和神經(jīng)氨酸酶(Neuraminidase,NA)的活性,還能保護宿主、降低病毒感染后的免疫炎性損傷。黃酮類化合物的抗病毒和抗炎的分子機制各異[36]。芹菜素通過抑制AKT的磷酸化降低病毒的復制效率[37],通過阻斷NO介導的COX2 表達減輕炎癥反應[38]。木犀草素可通過干擾外殼蛋白I復合物表達降低甲型流感病毒的產(chǎn)量[39],通過調控NF-κB 通路中TGF-β 活化的激酶結合蛋白2(TGF-beta-activated Kinase Binding Protein 2, TAB2)和NF-κB 等因子的表達量,減少下游炎性因子IL-1β、TNF-α 以及 COX2 的轉錄表達[40,41],且抑制 MMP9 的分泌[42]。槲皮素、阿魏酸、咖啡酸的抗氧化活性強,能清除自由基,保護宿主細胞免受活性氧誘導的損傷[43-45]。阿魏酸抑制COX2 啟動子活性從而降低COX2 的轉錄表達水平[46],阻斷前列腺素合成從而發(fā)揮鎮(zhèn)痛作用,抑制血小板聚集繼而改善肺部微循環(huán)[47]。丁香酚調節(jié)鈣鈉離子通道發(fā)揮鎮(zhèn)痛作用[48],抑制巨噬細胞的IL-1β,TNF-α 和 COX2 的 mRNA 表達[49]。1,8-桉葉素是桉樹油的主要成分,可以減少由炎癥介導產(chǎn)生的粘液,用于氣道炎性疾病中改善呼吸困難的癥狀、改善肺功能[50]。接受1,8-桉葉素作為補充治療的小鼠存活時間更長,炎癥反應更輕,肺指數(shù)、病毒滴度和死亡率較低[51]。

        EGFR 是新香沖劑靶向流感的核心子網(wǎng)絡中的關鍵靶點,TGF/EGFR 信號通路可增強人類肺泡上皮細胞和支氣管上皮細胞的天然免疫反應[52],這表明新香沖劑可能靶向EGFR 調控天然免疫治療流感。GO 分析發(fā)現(xiàn)核心子網(wǎng)絡靶點涉及的生物學過程有IFNs 的產(chǎn)生和信號通路的調控,KEGG 分析發(fā)現(xiàn)了TLR 信號通路、NOD 樣受體信號通路、RLR 信號通路等免疫系統(tǒng)相關的通路。以上均佐證了新香沖劑具有調節(jié)免疫的作用。KEGG 分析涉及的疾病通路是甲型流感通路,說明新香沖劑對甲型流感有一定的靶向性。

        綜上,新香沖劑對流感的治療作用包括:抑制病毒復制增殖,降低細胞因子的表達水平,減輕炎癥反應,兼以調節(jié)免疫,抗氧化保護宿主細胞,改善肺部微循環(huán),鎮(zhèn)痛等。這體現(xiàn)了新香沖劑通過多物質,作用于多靶點,經(jīng)由多途徑治療流感的特點和優(yōu)勢。

        3.2 新香沖劑治療流感的潛在藥靶

        本研究發(fā)現(xiàn)MMP9是新香沖劑靶點網(wǎng)絡和流感疾病靶點網(wǎng)絡的直接共同靶點,MMP9 的重要性不言而喻。MMP9 是基質金屬蛋白酶家族成員,由宿主的正常肺泡巨噬細胞和粒細胞產(chǎn)生,參與細胞因子介導、中性粒細胞遷移,巨噬細胞分化等生物學過程[53]。MMP9與流感、哮喘、慢性阻塞性肺疾病等多種急慢性呼吸道疾病密切相關,MMP9 的高表達量和肺功能的低水平呈相關性[54]。甲型流感病毒能誘導MMP9 在巨噬細胞中的高表達[55],增加MMP9 在血清、肺和心臟中的表達,從而降解細胞外間質,參與流感的病理過程?!凹仔土鞲胁《?細胞因子-胰蛋白酶/基質金屬蛋白酶循環(huán)”是重癥流感患者多器官功能衰竭的重要機制之一[56,57]。因此阻斷 MMP9 表達,降低 MMP9 的表達水平,是減輕流感炎癥反應、降低流感重癥轉化率的途徑之一。在感染早期,克拉霉素可通過減少心臟和肺的炎性細胞聚集,明顯抑制血清中MMP9 的表達[58]。黏膜相關淋巴組織淋巴瘤易位蛋白1 也能對MMP9 起到間接抑制作用,它是NF-κB 的陽性調節(jié)因子,可以降低肺泡巨噬細胞中負調節(jié)因子,從而減少MMP9 的表達[59]。治療流感的方劑,例如由金銀花、連翹、板藍根組成的疏風宣肺方和麻黃、石膏、羌活組成的解表清理方,也有抑制MMP9 的作用[60]。本次研究發(fā)現(xiàn),芹菜素與MMP9可以通過多個氫鍵緊密結合。新香沖劑組方中有9 種藥物,其中5 種含芹菜素,它們分別是香薷、青蒿、黃芩、廣藿香、扁豆花?;诖耍覀兺茢嘈孪銢_劑的作用途徑之一是通過調控宿主細胞MMP9的表達發(fā)揮其治療流感的作用。MMP9 是流感、哮喘等多種呼吸道疾病的重要靶點,芹菜素靶向MMP9 治療多種呼吸道疾病的具體機制有待深入研究。

        盡管本次研究有一些新的發(fā)現(xiàn),但仍然存在局限性。第一,對于免疫低下或免疫缺陷的特殊人群,例如老人、器官移植術后患者、艾滋病人等,基于調節(jié)免疫、減輕炎癥損傷發(fā)揮作用的新香沖劑對該類人群的流感治療效果難以評價。第二,數(shù)據(jù)庫搜集藥物成分時,受限于現(xiàn)有的科研條件,缺失Canonical SMILES 號的化合物沒被納入做ADME 參數(shù)評價,這可能會剔除了名稱未被規(guī)范、但有研究價值的化合物。第三,中藥數(shù)據(jù)庫中扁豆花、鴨跖草等冷門生僻的藥物成分信息少,不能反映藥物的真實全貌,這可能會錯失一些新發(fā)現(xiàn)。由此引出對未來研究的啟示,一是針對病毒本身進行打擊的藥物靶點仍不失其研究價值;二是需要建立更多信息完善的、高質量的中藥數(shù)據(jù)庫,以方便進行中藥網(wǎng)絡藥理學的研究。

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