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        基于血清四項(xiàng)腫瘤標(biāo)志物的模式識(shí)別技術(shù)對(duì)肺癌的鑒別診斷

        2020-04-18 08:10:08田剛張章劉靳波曾章銳舒靜周明術(shù)李光榮
        實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志 2020年5期
        關(guān)鍵詞:肺癌血清模型

        田剛 張章 劉靳波 曾章銳 舒靜 周明術(shù) 李光榮

        西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)部(四川瀘州646000)

        肺癌是嚴(yán)重威脅人類健康的疾病,2018年全球新發(fā)肺癌患者近210萬,其中176.6萬死亡[1]。根據(jù)我國(guó)癌癥中心2016年公布的數(shù)據(jù),肺癌在我國(guó)的發(fā)病率和病死率均居首位[2]。吸煙、乙肝病毒感染,基因和環(huán)境以及衰老等因素都與肺癌的發(fā)生、發(fā)展相關(guān)[3-4]。臨床上,近70%的肺癌患者確診時(shí)已處于中、晚期,失去了最佳治療時(shí)機(jī),故早期診斷并及時(shí)治療至關(guān)重要[5]。近年來,正電子發(fā)射計(jì)算機(jī)斷層顯像(positron emission tomogra?phy?computerized tomography,PET?CT)和核磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)等技術(shù)也被用于肺癌的鑒別診斷,但較昂貴的檢查費(fèi)用限制了臨床的廣泛應(yīng)用[5]。血清腫瘤標(biāo)志物如癌胚抗原(carcino?embryonic antigen,CEA)、神經(jīng)元特異性烯醇化酶(neuro specific enolase,NSE)、糖類抗原(carbohydrate antigen,CA125)和細(xì)胞角蛋白片段19(cyfra21?1)是臨床常用的肺癌輔助診斷指標(biāo),但單項(xiàng)指標(biāo)的靈敏度或特異度欠佳,而常用的串聯(lián)或并聯(lián)診斷模式犧牲了靈敏度或特異度,且較難對(duì)患者進(jìn)行預(yù)測(cè)分析[6-7]。因此,尋找新穎的數(shù)據(jù)處理和疾病診斷、預(yù)測(cè)模型有助于挖掘更多有用的數(shù)據(jù)信息,給臨床醫(yī)生提供輔助診斷建議。近年來,決策樹、判別分析和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等模型已用于肺癌的鑒別診斷,為腫瘤標(biāo)志物的臨床應(yīng)用提供了一種模式診斷新思路[8?10]。本研究擬采用三種模式識(shí)別技術(shù)—偏最小二乘判別分析(par?tial least squares?discrimination,PLS?DA),多層感知器?人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(multiplayer?artificial neural net?work,MPL?ANN)和支持向量機(jī)(support vector ma?chine,SVM)構(gòu)建肺癌診斷和預(yù)測(cè)模型,對(duì)肺癌相關(guān)腫瘤標(biāo)志物與肺癌、肺部良性疾病的相關(guān)性及診斷、預(yù)測(cè)價(jià)值進(jìn)行深入研究。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 納入2010年1月19日至2014年3月7日西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院470例肺癌患者(肺癌組),其中男357例,女113例,年齡18~99歲,平均年齡(61.0±13.7)歲。其中鱗癌168例,腺癌207例,小細(xì)胞癌74例,未定型肺癌21例。本研究中肺癌患者均按照2007年世界肺癌大會(huì)“第7版肺癌患者綜合分期評(píng)定標(biāo)準(zhǔn)”分類,包括Ⅰ期肺癌患者18例,Ⅱ期94例,Ⅰ-Ⅱ期140例,Ⅲ期48例,Ⅳ57例,Ⅲ-Ⅳ期50例,未知63例。早期患者(Ⅰ、Ⅱ及Ⅰ-Ⅱ期)、晚期患者(Ⅲ、Ⅳ及Ⅲ-Ⅳ)和未知分期肺癌患者的比例分別為53.6%、33.0%和13.4%。排除重復(fù)入院行放、化療肺癌及臨床資料不完整患者。肺部良性疾病患者659例(良性組),包括肺部感染102例,肺結(jié)核169例,肺炎113例,慢性阻塞性肺病170例,支氣管哮喘105例,其中男453例,女206例,年齡12~94歲,平均年齡(61.4±14.7)歲。肺癌組和良性組患者經(jīng)臨床、組織病理學(xué)或影像學(xué)等確診。另選取343例健康體檢者為對(duì)照(對(duì)照組),年齡12~90歲,平均年齡(60.2±13.8)歲。對(duì)照組肝、腎功能和腫瘤標(biāo)志物水平未見明顯異常。3組年齡比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=0.846,P=0.429)。由于本研究回顧性分析2010年1月~2014年3月本院住院患者臨床數(shù)據(jù),參照《體外診斷試劑臨床研究指導(dǎo)原則》中“客觀上不可能獲得受試者知情同意或該臨床研究對(duì)受試者幾乎沒有風(fēng)險(xiǎn),可不提交倫理委員會(huì)的審評(píng)意見及受試者的知情同意書”進(jìn)行[11]。

        1.2 儀器與檢測(cè)方法 所有患者在診斷、放療或化療前空腹靜脈采血3~5 mL(避免溶血),標(biāo)本采集后盡快送至檢驗(yàn)部分離血清、檢測(cè)。采用Roche全自動(dòng)電化學(xué)發(fā)光儀(Elecsys 2010)及配套試劑盒,按標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程在質(zhì)控在控下檢測(cè)血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1水平。參照分析儀及試劑盒的參考范圍制定血清CEA、NSE、CA125和Cy?fra21?1的參考區(qū)間,其中NSE為0~35.0 ng/mL,CEA為0~3.4 ng/mL,CA125為0~15.2 ng/mL,Cy?fra21?1為0~3.3 ng/mL。

        1.3 訓(xùn)練和測(cè)試數(shù)據(jù)的選擇 利用SPSS 25.0軟件隨機(jī)抽取70%樣本為訓(xùn)練集,建立診斷模型(729例非肺癌患者、332例肺癌患者),30%為測(cè)試集(273例非肺癌患者、138例肺癌患者)用于預(yù)測(cè)分析,分別在MPL?ANN、SVM和PLS?DA模型中驗(yàn)證。

        1.4 數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化 血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1經(jīng)歸一化處理[(測(cè)定值?均值)/標(biāo)準(zhǔn)差],以消除測(cè)定項(xiàng)目數(shù)量級(jí)和單位的差異,測(cè)定結(jié)果在[?1~1]之間。

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 25.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析并建立MPL?ANN模型。3組年齡成正態(tài)分布,用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,方差齊(F=2.422,P=0.089),3組比較采用單因素方差分析。血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1水平呈偏態(tài)分布,以中位數(shù)M(P25,P75)表示,3組間兩兩比較采用Mann?WhineyU檢驗(yàn),校正P值,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.017)。采用受試者工作特征曲線(receiver operating characteristic curve,ROC)下面積(area un?der the ROC,AUC)評(píng)估各指標(biāo)的診斷效能,P<0.05差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。采用SIMCA 13.0軟件構(gòu)建PLS?DA模型,采用MATLAB(R 2019b)建立SVM模型。

        2 結(jié)果

        2.1 血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1水平比較 與對(duì)照組比較,肺癌組和良性組血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1水平均升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.017)。肺癌組與良性組比較,血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1水平也顯著升高(P<0.017),見表1。

        表1 3組血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1水平比較Tab.1 Comparison of CEA,NSE,CA125 and cyfra21?1 levels in three groups [M(P25,P75)]

        2.2 肺癌組、良性組和對(duì)照組血清四項(xiàng)指標(biāo)的診斷效能比較 四項(xiàng)血清腫瘤標(biāo)志物中CEA、NSE和Cyfra21?1對(duì)肺癌的診斷效能較高(AUC均>0.70),CA125的診斷效能較低0.50

        圖1 血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的ROC曲線Fig.1 ROC curves of CEA,NSE,CA125 and cyfra21?1 in serum

        表2 3組血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的ROC曲線比較Tab.2 ROC curve comparison of serum CEA,NSE,CA125 and cyfra21?1 in three groups

        2.3 基于血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的PLS?DA模型分析 以隨機(jī)選取的70%患者的四項(xiàng)腫瘤標(biāo)志物建立PLS?DA模型,并提取前兩個(gè)PLS成分(即t1=29.5%和t2=14.9%),該模型對(duì)肺癌和非肺癌患者的診斷正確率分別為58.7%(195/332)和96.4%(703/729)。以另選取的273例非肺癌患者和138例肺癌患者進(jìn)行預(yù)測(cè),該模型的t1和t2分別為36.0%和20.1%,對(duì)肺癌和非肺癌患者的預(yù)測(cè)正確率分別為55.8%(77/138)和91.9%(251/273),見圖2。

        圖2 基于血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的PLS?DA預(yù)測(cè)模型(肺癌組;非肺癌組)Fig.2 PLS?DA prediction model based on serum CEA,NSE,CA125 and cyfra21?1(lung cancer group;non?lung cancer group)

        2.4 基于血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的MPL?ANN模型 以血清CEA、NSE、CA125和Cy?fra21?1建立MPL?ANN診斷模型,以概率值P>0.50判斷為肺癌,反之為非肺癌。該模型的隱含層數(shù)為2,訓(xùn)練時(shí)間0:00:00:210,交叉熵錯(cuò)誤率為5.90,對(duì)肺癌和非肺癌患者的診斷正確率分別為71.7%(238/332)和92.9%(677/729)。MPL?ANN預(yù)測(cè)模型的隱含層數(shù)2,訓(xùn)練時(shí)間為0:00:00:160,交叉熵錯(cuò)誤率為4.93,對(duì)肺癌和非肺癌患者的預(yù)測(cè)正確率分別為71.0%(98/138)和94.1%(257/273),MPL?ANN預(yù)測(cè)模型見圖3。

        圖3 基于血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的MPL?ANN預(yù)測(cè)模型Fig.3 MPL?ANN prediction model based on serum CEA,NSE,CA125 and cyfra21?1

        2.5 基于血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的SVM模型分析 以血清四項(xiàng)腫瘤標(biāo)志物依次建立線性核SVM(line SVM,L?SVM),二次核SVM(Quadratic SVM,Q?SVM),三 次 核SVM(Cubic SVM,C?SVM),精細(xì)高斯核SVM(Fine Gaussian SVM),中高斯核SVM(Medium Gaussian SVM,MG?SVM)和粗高斯核SVM(Coarse Gaussian SVM,C?SVM)6種模型。6種SVM模型對(duì)肺癌和非肺癌的總診斷正確率依次為FG?SVM(90.0%)>MG?SVM(85.2%)>L?SVM(84.8%)>Q?SVM(83.7%)>C?SVM(82.0%)>CG?SVM(81.8%),結(jié)果見表3。以診斷正確率最高的FG?SVM建立診斷模型,該模型對(duì)肺癌和非肺癌組的診斷正確率依次為72.9%(242/332)和97.8%(713/729)。以另選取138例肺癌和273例非肺癌患者進(jìn)行預(yù)測(cè),該模型對(duì)肺癌和非肺癌組的預(yù)測(cè)正確率分別為65.2%(90/138)和93.8%(256/273)。

        2.6 MPL?ANN、PLS?DA和FG?SVM模型比較 基于血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的FG?SVM和MPL?ANN模型診斷肺癌患者的正確率均高于PLS?DA模型(P<0.05)。FG?SVM模型正確率最高,MPL?ANN模型最低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。3種模型中MPL?ANN模型預(yù)測(cè)肺癌組和非肺癌組患者的準(zhǔn)確率均最高,分別為71.0%和94.1%,MPL?ANN和FG?SVM模型預(yù)測(cè)肺癌患者的準(zhǔn)確率均高于PLS?DA模型(P<0.05),見表4。

        表3 基于血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的六種SVM模型比較Tab.3 Comparison of six SVM models based on serum CEA,NSE,CA125 and cyfra21?1

        表4 基于血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的3種模型診斷和預(yù)測(cè)正確率比較Tab.4 Comparison of diagnosis and prediction accuracy of three models based on serum CEA,NSE,CA125 and cyfra21?1

        3 討論

        血清腫瘤標(biāo)志物是早期診斷肺癌的有效手段,具有簡(jiǎn)單、快速、創(chuàng)傷小且成本較低等優(yōu)點(diǎn),但目前尚無理想的肺癌標(biāo)志物[12]。CEA是肺癌常用的腫瘤標(biāo)志物,在肺癌的篩查、診斷、轉(zhuǎn)移和療效監(jiān)測(cè)中扮演著重要角色[6]。Cyfra21?1是細(xì)胞角蛋白19片段,與鱗狀細(xì)胞癌抗原、硫氧還蛋白聯(lián)合檢測(cè)有助于肺癌的診斷、轉(zhuǎn)歸和病理組織分型[13]。NSE是公認(rèn)的小細(xì)胞肺癌較特異的標(biāo)志物,有助于評(píng)估抗腫瘤藥物對(duì)小細(xì)胞肺癌的治療效果[14]。CA125在肺腺癌中的含量和陽性率均顯著高于小細(xì)胞肺癌和肺鱗癌,有助于肺癌的病理分型和指導(dǎo)治療[10,15]。本研究中,肺癌組患者血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1水平均顯著高于良性組和對(duì)照組,表明四項(xiàng)腫瘤標(biāo)志物有助于肺癌的鑒別診斷,與馬志紅等[16]報(bào)道一致。本研究中,四項(xiàng)標(biāo)志物的AUC均較低(0.578~0.796)且診斷肺癌的靈敏度也不理想(42.1%~61.5%),可能與研究中有較多早期肺癌患者(53.6%)有關(guān)。四項(xiàng)標(biāo)志物的診斷效能均較低也提示單項(xiàng)指標(biāo)輔助診斷肺癌效果較差,需聯(lián)合檢測(cè)提高肺癌診斷的正確率。

        PLS?DA、MPL?ANN和SVM模型是多維數(shù)據(jù)分析中常用的有監(jiān)督模式識(shí)別技術(shù)。該技術(shù)與多指標(biāo)聯(lián)合檢測(cè)的主成分分析或因子分析相比,最大的優(yōu)點(diǎn)是能綜合多指標(biāo)進(jìn)行診斷和預(yù)測(cè)分析,避免單一指標(biāo)絕對(duì)值增加或降低對(duì)臨床的誤導(dǎo)、使結(jié)論更科學(xué)、合理[15]。ANN以大腦神經(jīng)元的活動(dòng)規(guī)律為背景,通過抽象、簡(jiǎn)化和模仿人腦的某些特征提高分析、處理數(shù)據(jù)信息的效率,有助于解決肺癌精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展遇到的問題[18]。MPL?ANN相對(duì)于單層感知器不僅能很好地處理線性問題,還能處理非線性可分離問題,在肺癌的鑒別診斷中顯示了一定的應(yīng)用潛力。前期研究表明,MPL?ANN模型對(duì)肺癌有較好的診斷準(zhǔn)確率(80.7%,100/124)和預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率(82.3%,102/124)[19]。NARESH等[20]采用ANN模型實(shí)現(xiàn)了92.7%肺癌患者的鑒別診斷和95.1%患者的預(yù)后分析。FENG等[21]聯(lián)合CEA、NSE等六種腫瘤標(biāo)志物建立ANN模型,能有效鑒別診斷肺癌、肺良性疾病和三種胃腸腫瘤。本研究中MPL?ANN對(duì)肺癌的診斷和預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率分別為73.0%(336/460)和93.2%(934/1002),診斷和預(yù)測(cè)結(jié)果與以上報(bào)道相似。PLS?DA是代謝組學(xué)中常用的數(shù)據(jù)處理模型,該模型可以減少變量間多重共線性,在樣本數(shù)目小于測(cè)量指標(biāo)時(shí)仍有很好的分類效果。課題組前期研究發(fā)現(xiàn),基于血清中CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1的PLS?DA模型對(duì)肺癌和肺良性疾病均有較好的鑒別診斷價(jià)值[19]。本研究中PLS?DA模型的診斷正確率低于前期小樣本探索研究,可能與增大樣本量和納入更多早期肺癌患者和對(duì)照人群有關(guān)。

        SVM使用核函數(shù)將輸入特征從低維空間映射到高維空間,實(shí)現(xiàn)比傳統(tǒng)線性分類方法更好的分類能力,已用于醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。王洪凱等[22]利用SVM模型,實(shí)現(xiàn)了PET?CT影像中非小細(xì)胞肺癌縱膈淋巴結(jié)良、惡性分類。紀(jì)鵬慧等[23]建立血清10項(xiàng)指標(biāo)的SVM模型并通過內(nèi)代法驗(yàn)證,該模型的預(yù)測(cè)正確率為90.3%,優(yōu)于Fisher線性判別分析模型。本研究發(fā)現(xiàn),利用不同核函數(shù)建立SVM模型對(duì)肺癌的診斷正確率均有差異,基于非線性核函數(shù)建立5種SVM模型中有3種的診斷正確率均高于線性核函數(shù)模型(L?SVM)。此外,基于FG?SVM模型和MPL?ANN的非線性模型的診斷準(zhǔn)確率也優(yōu)于PLS?DA線性模型。以上結(jié)果表明,模式識(shí)別技術(shù)的應(yīng)用效果與數(shù)據(jù)類型密切相關(guān),尋找最優(yōu)的模型才能挖掘更多有價(jià)值的數(shù)據(jù)信息,提高診斷和預(yù)測(cè)的正確率。

        大數(shù)據(jù)時(shí)代,由于海量數(shù)據(jù)不斷產(chǎn)生,采用多種模型對(duì)比分析更有助于數(shù)據(jù)的合理利用和臨床精準(zhǔn)診斷。本研究基于血清CEA、NSE、CA125和Cyfra21?1構(gòu)建了3種數(shù)據(jù)挖掘模型,其中FG?SVM和MPL?ANN模型在診斷和預(yù)測(cè)中顯示了更優(yōu)的效果,為模型識(shí)別技術(shù)在肺癌的鑒別診斷和預(yù)測(cè)分析提供了參考依據(jù)。但是,本研究也有一定的應(yīng)用局限性。由于本研究采用臨床上常見的腫瘤標(biāo)志物且類型偏少,3種模型對(duì)肺癌診斷的正確率最高僅有73%。因此,本實(shí)驗(yàn)室在后續(xù)肺癌的數(shù)據(jù)挖掘和構(gòu)建診斷、預(yù)測(cè)模型時(shí)需要考慮增加新檢測(cè)指標(biāo)及樣本量,提高肺癌診斷的正確率和實(shí)用性。此外,本研究中研究對(duì)象主要為肺癌患者,未能納入其它腫瘤患者進(jìn)行對(duì)比研究,還需后續(xù)需增加非肺癌患者進(jìn)行對(duì)比研究,使結(jié)論更嚴(yán)謹(jǐn)、準(zhǔn)確可靠。

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