包丹 羅德紅,2*
鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)在中國華南地區(qū)常見,超過70%的病人在發(fā)病時(shí)即為晚期[1],治療前準(zhǔn)確分期或預(yù)測疾病風(fēng)險(xiǎn)、治療后及時(shí)評估療效可以提高病人生存率。MRI是鼻咽癌診斷、分期和治療隨診中最常用的影像學(xué)檢查方法之一,但傳統(tǒng)MR和功能MR成像僅提供主觀信息或組織結(jié)構(gòu)學(xué)參數(shù)進(jìn)行評價(jià)與診斷[2]。近來不斷發(fā)展的影像組學(xué)是基于醫(yī)學(xué)影像可以反映腫瘤內(nèi)在生物學(xué)及生理學(xué)特征關(guān)鍵信息的假設(shè),對影像特征數(shù)據(jù)進(jìn)行量化分析,進(jìn)而為腫瘤的分期、治療方式的選擇、療效評價(jià)和預(yù)后預(yù)測等提供依據(jù)[3-4]。本文對基于MRI的影像組學(xué)在鼻咽癌中的研究現(xiàn)狀進(jìn)行綜述。
影像組學(xué)在鼻咽癌應(yīng)用的基本流程:①圖像采集。為了減少噪聲、消除影像失真等以保證影像數(shù)據(jù)的可靠性和可重復(fù)性,對多參數(shù)MR影像進(jìn)行預(yù)處理,主要采用濾波器[5],還可以采用重采樣方案或者影像像素標(biāo)準(zhǔn)化等方式[6-7]。MRI可選擇不同的序列,增強(qiáng)T1WI聯(lián)合T2WI是目前最推薦的且最常用的序列[5]。②圖像分割。大部分研究中鼻咽癌興趣區(qū)(ROI)僅由有經(jīng)驗(yàn)的專家手動(dòng)分割[8-9],如何細(xì)化鼻咽部的組織結(jié)構(gòu)輪廓以便應(yīng)用自動(dòng)或半自動(dòng)分割方法有待進(jìn)一步探討。三維分析是目前應(yīng)用較多的分割方法,雖然可能更能代表腫瘤組織內(nèi)的異質(zhì)性,但三維與二維分析對鼻咽癌影像組學(xué)的影響尚不明確。③特征提取。特征提取是影像組學(xué)的關(guān)鍵步驟,目前應(yīng)用最多的軟件是Matlab(MathWorks,Natick,MA,USA)[10]。影像組學(xué)特征包括形狀大小、一階特征、二階(紋理)特征、更高階的統(tǒng)計(jì)特征。一階特征(如峰度)和二階(紋理)特征(如灰度共生矩陣,gray level co-occurrence matrices,GLCM)是目前已開展的鼻咽癌研究之間普遍共享的兩類影像組學(xué)特征。④特征選擇。最常用的方法是最小絕對收縮和選擇算子 (the least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)Cox回歸模型。最終的影像組學(xué)標(biāo)簽包含的特征數(shù)一般為幾個(gè)至十幾個(gè),GLCM是鼻咽癌相關(guān)研究中唯一共享的特征類別,有望成為鼻咽癌新的腫瘤標(biāo)志物。⑤構(gòu)建模型。Logistic回歸模型是最受歡迎且常用的監(jiān)督分類器之一。Zhang等[11]基于預(yù)測晚期鼻咽癌的復(fù)發(fā)及轉(zhuǎn)移研究提出隨機(jī)森林法(random forest,RF)、自適應(yīng)增強(qiáng)法(adaptive boosting,AdaBoost)和線性支持向量機(jī)(support vector machines,SVM)算法,這 3種分析方法是NPC影像組學(xué)的首選,但目前尚沒有形成規(guī)范。模型的性能通過測試集的敏感度、特異度、準(zhǔn)確度和曲線下面積(area under curve,AUC)來估計(jì)。
2.1 臨床分期 TNM分期系統(tǒng)是目前應(yīng)用最廣泛的預(yù)測鼻咽癌病人生存結(jié)局及風(fēng)險(xiǎn)評估的工具,但是相同分期的病人往往會出現(xiàn)不同的治療結(jié)果[12-13]。Zhang等[14]研究表明影像組學(xué)有助于提高鼻咽癌分期的準(zhǔn)確性,通過提取118例鼻咽癌病人的MR影像組學(xué)特征發(fā)現(xiàn),中位數(shù)、均值、最大3D值與腫瘤總體分期和T分期均呈明顯正相關(guān),加入影像組學(xué)標(biāo)簽?zāi)苊黠@改善TNM分期系統(tǒng)的效能 (C指數(shù)為0.761和0.514),也能明顯改善臨床變量的預(yù)測效能(C指數(shù)為0.776和0.649)。Zhuo等[10]也提出基于MR影像組學(xué)的模型對鼻咽癌病人預(yù)后的分層性能優(yōu)于T分期和TNM分期且更穩(wěn)定,但該研究中只納入原發(fā)腫瘤灶,并沒有納入淋巴結(jié)相關(guān)的信息,也沒有納入轉(zhuǎn)移性鼻咽癌病人。Yang等[8]發(fā)現(xiàn)基于淋巴結(jié)提取的容量、峰度和GLCM等特征是鼻咽癌3年無進(jìn)展生存(progression-free survival,PFS)的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,其與TNM分期聯(lián)合建立的諾模圖預(yù)測晚期鼻咽癌PFS的性能(C指數(shù)為0.811)優(yōu)于單獨(dú)的TNM分期系統(tǒng)(C指數(shù)為0.613)。影像組學(xué)特征能夠反映腫瘤內(nèi)部的異質(zhì)性,彌補(bǔ)了TNM分期系統(tǒng)只是基于解剖結(jié)構(gòu)的侵犯導(dǎo)致的不足,具有良好的臨床應(yīng)用前景。
2.2 治療方法的選擇 MR影像組學(xué)在鼻咽癌治療方法選擇方面的研究尚不多見。調(diào)強(qiáng)放療加/不加誘導(dǎo)化療或輔助化療是鼻咽癌的標(biāo)準(zhǔn)治療方法[12]。Yu等[5]從70例晚期鼻咽癌病人治療前增強(qiáng)T1WI、T2WI影像中提取影像組學(xué)特征建立模型預(yù)測自適應(yīng)放療的可行性,發(fā)現(xiàn)提取自聯(lián)合序列的峰度、偏度、GLCM、灰度相關(guān)矩陣 (gray level dependence matrix,GLDM)構(gòu)建的模型具有最佳預(yù)測效能,AUC為0.930。有研究[15]證實(shí)放療過程中腫瘤體積明顯縮小是實(shí)行自適應(yīng)放療的標(biāo)準(zhǔn),由此可見影像組學(xué)特征與治療后腫瘤體積的變化有關(guān),能夠在治療前識別需應(yīng)用自適應(yīng)放療的高危病人;但這項(xiàng)回顧性研究樣本人群太小,病人隨診過程中受多因素影響導(dǎo)致了數(shù)據(jù)不平衡。影像組學(xué)在鼻咽癌治療方式選擇方面的應(yīng)用有待基于前瞻性大樣本人群的研究。
2.3 療效評估 由于腫瘤及病人的異質(zhì)性,鼻咽癌對治療的應(yīng)答率并不穩(wěn)定[16]。一個(gè)可靠、準(zhǔn)確的腫瘤治療反應(yīng)預(yù)測指標(biāo)能夠預(yù)先選擇治療應(yīng)答者并給予病人更個(gè)性化的治療選擇。Wang等[17]分析120例Ⅱ~Ⅳ期鼻咽癌病人的MR影像組學(xué)特征,結(jié)果顯示均值、GLCM及Gabor是預(yù)測誘導(dǎo)化療反應(yīng)(無反應(yīng)、部分反應(yīng)、完全反應(yīng))的穩(wěn)定特征,從T1WI、T2WI、T2WI/抑脂序列、增強(qiáng)T1WI聯(lián)合提取的15個(gè)特征最有價(jià)值,其AUC為0.822。Liu等[6]的研究中分析了常規(guī) T2WI、增強(qiáng) T1WI、擴(kuò)散加權(quán)成像(DWI),從 3 個(gè)序列影像中提取的紋理特征均能區(qū)分對放化療有無應(yīng)答的鼻咽癌病人(分類準(zhǔn)確度為85%~100%),而從增強(qiáng)T1WI序列提取的特征參數(shù) [包括GLCM,灰度梯度共生矩陣(gray level gradient co-occurrence matrix,GLGCM)]預(yù)測的準(zhǔn)確度最高(訓(xùn)練集/驗(yàn)證集:0.952/0.939)。增強(qiáng)T1WI序列在鼻咽癌影像組學(xué)中的應(yīng)用價(jià)值得到了進(jìn)一步肯定,將功能MRI[如DWI、對比增強(qiáng)MRI等]與鼻咽癌影像組學(xué)結(jié)合有待進(jìn)一步深入研究。Zhao等[18]結(jié)合123例非流行區(qū)鼻咽癌病人臨床資料與MR影像組學(xué)建立模型,結(jié)果顯示影像組學(xué)標(biāo)簽 (18個(gè)紋理特征,1個(gè)一階特征)能夠區(qū)分誘導(dǎo)化療應(yīng)答者與非應(yīng)答者,影像組學(xué)特征的加入能夠改善臨床諾模圖(性別與治療前白細(xì)胞水平)的預(yù)測準(zhǔn)確性(C指數(shù)分別為0.863和0.549,P<0.01),腫瘤內(nèi)異質(zhì)性與臨床變量之間的協(xié)同作用得以發(fā)揮。上述3個(gè)研究中,增強(qiáng)T1WI以及多序列聯(lián)合提取影像組學(xué)特征在預(yù)測鼻咽癌治療反應(yīng)中有重要作用,紋理特征GLCM可以作為鼻咽癌治療反應(yīng)的共性的獨(dú)立預(yù)測因子。隨著影像組學(xué)的不斷發(fā)展和數(shù)據(jù)處理分析的不斷完善,未來基于鼻咽癌MR影像組學(xué)的特征可為腫瘤治療提供早期反應(yīng)性指標(biāo),以達(dá)到精準(zhǔn)醫(yī)療的目的。
2.4 預(yù)后分析
2.4.1 遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移 鼻咽癌病人發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移后5年生存率<10%[19],大多數(shù)病人由于轉(zhuǎn)移導(dǎo)致病情進(jìn)展而迅速死亡。Zhang等[9]通過分析176例鼻咽癌病人治療前的MR影像,最終提取了6個(gè)紋理特征均為遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的獨(dú)立危險(xiǎn)因子,其中灰度級大小區(qū)域矩陣(gray level size zone matrix,GLSZM)與遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)具有最強(qiáng)的正相關(guān)性(風(fēng)險(xiǎn)回歸系數(shù)5.500 4)。GLSZM代表的灰度值變異性越大,腫瘤內(nèi)異質(zhì)性越大、轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)更高。結(jié)合特征建立的評估模型成功將病人分為遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組 (截?cái)嘀?.37,P<0.001)。影像組學(xué)特征與臨床變量(N分期和血漿EBV DNA水平)結(jié)合的諾模圖(AUC 0.792)更適用于預(yù)測鼻咽癌轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)。
2.4.2 局部區(qū)域復(fù)發(fā) 約11%的鼻咽癌病人在接受標(biāo)準(zhǔn)治療后會發(fā)生局部區(qū)域復(fù)發(fā)[20]。一項(xiàng)納入了140例鼻咽癌病人的研究[21]發(fā)現(xiàn),治療前基于MRI提取的影像組學(xué)特征構(gòu)建的Rad-score(影像組學(xué)評分,即所選特征與其非零系數(shù)組合)能夠?qū)⒉∪朔譃榫植繌?fù)發(fā)高、低風(fēng)險(xiǎn)組(中位評分5.50,P=0.008)。影像組學(xué)特征與臨床變量結(jié)合是預(yù)測鼻咽癌復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)最可靠的手段(C指數(shù)為0.74)。Zhang等[22]對多中心的737例T4期鼻咽癌病人進(jìn)行影像分析,沒有直接從增強(qiáng)T1WI中提取影像組學(xué)特征,而是利用IBEX軟件將增強(qiáng)T1WI與平掃T1WI影像相減,得到反映腫瘤強(qiáng)化水平的減影圖像,最終提取的11個(gè)特征中有7個(gè)為GLCM,5個(gè)來自減影圖像,且對Rad-score貢獻(xiàn)最大的特征(GLCM,加權(quán)回歸系數(shù)-1.039)來自減影圖像。因此,GLCM可能是預(yù)測鼻咽癌復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)最有力的影像組學(xué)特征之一,腫瘤新生血管越多復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)可能也越高。影像組學(xué)可以作為一種定量化反映腫瘤內(nèi)復(fù)發(fā)相關(guān)異質(zhì)性的可視化的有效方法。
2.4.3 生存期 鼻咽癌病人生存期的MR影像組學(xué)研究中,大多將3年P(guān)FS設(shè)定為臨床終點(diǎn)。Zhang等[14]納入118例晚期鼻咽癌病人,分析治療前T2WI、增強(qiáng)T1WI影像,聯(lián)合2個(gè)序列提取的影像組學(xué)特征對晚期鼻咽癌病人3年P(guān)FS具有較好的預(yù)測能力(C 指數(shù) 0.737),比單獨(dú)采用增強(qiáng) T1WI(C 指數(shù)0.724)或T2WI(C指數(shù)0.682)序列的預(yù)測效能更好。Richard等[23]的多中心研究中加入了Shapley添加解釋(Shapley additive explanations,SHAP)框架(該方法能夠提高傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)模型的可解釋性),對最終提取的影像組學(xué)特征球度、平均絕對偏差、灰度運(yùn)行長度矩陣(gray level run length matrix,GLRLM)及GLCM進(jìn)行解釋,結(jié)果表明只有球度、平均絕對偏差是鼻咽癌3年疾病進(jìn)展評估的重要因素,球度降低、平均絕對偏差升高均提示疾病進(jìn)展風(fēng)險(xiǎn)增加。Mao等[24]對79例鼻咽癌病人治療前的T2WI及增強(qiáng)T1WI影像進(jìn)行紋理分析,PFS定義為2年。研究發(fā)現(xiàn)體積越?。ǎ?1.699 cm3)、均勻性越大(>0.856),病人預(yù)后越好且生存期延長,影像組學(xué)特征的加入能夠改善腫瘤體積或總體分期單獨(dú)建立模型的預(yù)測效能。Ming等[25]的研究中不僅選取鼻咽癌原發(fā)灶,還納入了頸部轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)MRI,其中鼻咽癌灶的峰度值和GLCM是預(yù)測總生存期(overall survival,OS)和無疾病生存期(disease-free survival,DFS)的影像組學(xué)特征,峰度值越高、GLCM值越低則OS及DFS風(fēng)險(xiǎn)越高;而從頸部轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)中提取的影像組學(xué)特征沒有顯示預(yù)后相關(guān)的信息(P=0.315),并且該研究中沒有明確指出評判頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的標(biāo)準(zhǔn)。影像組學(xué)可以在治療前評估病人生存期,為病人提供與臨床資料互補(bǔ)的預(yù)后信息,從而得到更準(zhǔn)確、個(gè)性化的治療方式及護(hù)理規(guī)范。
2.5 其他 白[26]提出基于多模態(tài)MR的影像組學(xué)分析方法能夠有效預(yù)測鼻咽癌病人的血漿EB病毒DNA狀態(tài),使用SMOTE算法后神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的預(yù)測能力最高,AUC可達(dá)0.929,敏感度、特異度分別達(dá)0.946和0.868,部分形狀類特征被證實(shí)能夠反映血漿EB病毒DNA高危水平。連[27]分析了200例存在顳葉放射性腦損傷的鼻咽癌病人顳葉MR數(shù)據(jù),結(jié)果顯示GLCM、GLSZM等紋理特征可以比現(xiàn)有臨床數(shù)據(jù)提前1年預(yù)測潛在可能發(fā)生的顳葉放射性腦損傷(AUC:0.76),能夠提示臨床縮短復(fù)查時(shí)間或提前干預(yù)治療。
3.1 樣本量的選擇及影像的獲取和標(biāo)準(zhǔn)化 現(xiàn)有的關(guān)于影像組學(xué)方法在鼻咽癌領(lǐng)域的研究都是回顧性分析,經(jīng)過嚴(yán)格的入組標(biāo)準(zhǔn)篩選后樣本量過小,基于小樣本得出的結(jié)果不能說明影像組學(xué)的泛化性和魯棒性。不同的掃描設(shè)備上MR掃描模式、參數(shù)會有所不同,這可能影響圖像的可重復(fù)性,進(jìn)而影響由其衍生的紋理特征。為了提高模型的臨床效能、特征的可重復(fù)性及穩(wěn)定性,需要在鼻咽癌流行區(qū)和非流行區(qū)具有更大樣本量的多中心進(jìn)行前瞻性試驗(yàn)來全面評估,以證明其實(shí)際效益。
3.2 圖像分割及特征穩(wěn)定性 鼻咽部本身及周圍組織解剖結(jié)構(gòu)較復(fù)雜,手動(dòng)分割不僅耗時(shí)費(fèi)力,其產(chǎn)生的分割變異性在特征提取時(shí)還會導(dǎo)致偏倚,并且NPC有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移也是影響分割結(jié)果的關(guān)鍵因素[28]。由于醫(yī)學(xué)影像設(shè)備缺乏統(tǒng)一的圖像數(shù)據(jù)獲取標(biāo)準(zhǔn),基于不穩(wěn)定圖像質(zhì)量的影像提取的特征穩(wěn)定性也比較差,所以如何提取到獨(dú)立性強(qiáng)、穩(wěn)定可重復(fù)的特征也很困難。
3.3 特征選擇與模型建立 選擇合適的特征,運(yùn)用恰當(dāng)?shù)慕7椒?,是提高影像組學(xué)特征預(yù)測能力的關(guān)鍵。每項(xiàng)研究都會選擇一個(gè)獨(dú)特的影像組學(xué)標(biāo)簽,但需要考慮計(jì)算結(jié)果的可重復(fù)性和可靠性,因此對于研究之間所選擇的所有特征進(jìn)行比較并不是完全可行的。每一個(gè)問題都有其相關(guān)的變量,沒有哪一種機(jī)器學(xué)習(xí)算法能夠永遠(yuǎn)占據(jù)優(yōu)勢,目前也沒有統(tǒng)一選擇的應(yīng)用于鼻咽癌研究的建模方法,所以研究者根據(jù)不同的問題選擇合適的特征提取方法及模型仍然具有一定的難度。
3.4 研究方向 影像組學(xué)技術(shù)能夠在基因組學(xué)、蛋白組學(xué)等水平上實(shí)現(xiàn)高通量的克隆,產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),結(jié)合生物信息學(xué)工具可以得到新的生物標(biāo)志物。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了大量與鼻咽癌不同病理生理狀態(tài)相關(guān)的潛在生物標(biāo)志物,例如鼻咽癌細(xì)胞外泌體數(shù)量增加、致癌和抑癌miRNAs失衡,可能影響細(xì)胞抑制藥物的抗增殖和轉(zhuǎn)移抑制作用[29];腫瘤抑制因子FOXO1低表達(dá)和MYH9高表達(dá)的聯(lián)合存在提示NPC總體生存率最差等[30]?;?影像組學(xué)建立了基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)和影像學(xué)特征間的關(guān)聯(lián),已經(jīng)應(yīng)用于前列腺癌等的研究[31-32]。目前缺乏研究將影像組學(xué)與基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等整合應(yīng)用于鼻咽癌,有望通過影像-基因組學(xué)、影像-蛋白組學(xué)等了解鼻咽癌的基因、蛋白表達(dá)譜,從而成為診療問題的一個(gè)突破口。此外,未來更多的研究還可以但不局限于探討影像組學(xué)在鼻咽癌病理診斷、預(yù)測放療相關(guān)的毒副作用,或估計(jì)鼻咽周圍相關(guān)器官體積等的變化。
基于MR的影像組學(xué)能夠提供肉眼無法觀察的鼻咽癌相關(guān)的診斷、預(yù)后或預(yù)測信息,在研究醫(yī)學(xué)影像與疾病發(fā)生發(fā)展的臨床應(yīng)用中顯示出巨大的潛力。隨著醫(yī)療大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來和發(fā)展,計(jì)算機(jī)及機(jī)器學(xué)習(xí)方法聯(lián)合應(yīng)用,使得影像組學(xué)在鼻咽癌的應(yīng)用具有廣闊的前景,期待未來能將影像組學(xué)與基因組學(xué)等多組學(xué)相結(jié)合,為鼻咽癌的診療提供新的平臺。