陳 末,朱新萍,蔣靖佰倫,買迪努爾·阿不來孜,孫 濤,賈宏濤,2*
(1.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)與環(huán)境科學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830052;2.新疆土壤與植物生態(tài)過程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,烏魯木齊 830052)
濕地生態(tài)系統(tǒng)單位面積儲(chǔ)存的碳遠(yuǎn)高于任何其他生態(tài)系統(tǒng)[1],因而引起廣泛關(guān)注。其中,高寒濕地生態(tài)系統(tǒng)因植被類型較為單一而更加脆弱,其有機(jī)質(zhì)含量高且分解比較緩慢對(duì)氣候變化極為敏感,是溫室效應(yīng)的指示器[2]。土壤微生物作為濕地生態(tài)系統(tǒng)功能過程的關(guān)鍵媒介[3],在驅(qū)動(dòng)物質(zhì)循環(huán)和能量流動(dòng)過程中具有重要作用[4]。
凍融是全球中高緯度和高海拔地區(qū)的常見現(xiàn)象,全球氣候變暖導(dǎo)致高寒濕地的凍融格局更加多變。相關(guān)研究證明濕地土壤微生物的生命活動(dòng)可以從非生長季持續(xù)到冬季[5-6],但其生理活性會(huì)受凍融期內(nèi)土壤溫度[7-8]、土壤濕度[9-10]、積雪厚度[11]和土壤養(yǎng)分[12]等因子劇烈變化的影響。尤其在融凍期間,冰雪融化促使地表形成活躍層,進(jìn)一步加強(qiáng)微生物復(fù)活后的生存能力[13]。并且,微生物代謝活動(dòng)的變化,可能會(huì)潛在形成正反饋回路,改良表層土壤的解凍條件[14]。通常在這一階段,微生物群落會(huì)出現(xiàn)呼吸峰值,更多的猜測這可能是一種應(yīng)激反應(yīng)[15]。
當(dāng)前,凍融對(duì)土壤微生物的研究多基于時(shí)空尺度上微生物生物量[16-18]、土壤養(yǎng)分[19-20]、土壤溫室氣體排放通量[21]的監(jiān)測,因地域條件等因素的限制,關(guān)于高寒濕地土壤微生物群落的研究極為少見。相較于平原濕地,高寒濕地土壤微生物群落中可能含有較多的嗜冷微生物類群,對(duì)氣候變化響應(yīng)更加迅速,群落演替變化更加明顯。因此,探明凍融期高寒區(qū)土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和功能作用的變化以及微生物的耐冷機(jī)制顯得極為重要。鑒于此,本研究以巴音布魯克高寒濕地沼澤土壤為研究對(duì)象,在野外條件下探究凍融期土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能作用的變化,同時(shí)分析微生物不同影響因子的貢獻(xiàn)率。研究結(jié)果可為高寒濕地生態(tài)系統(tǒng)功能過程提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),豐富高寒濕地土壤微生物生態(tài)學(xué)研究,也可為凍融期土壤微生物代謝潛能對(duì)環(huán)境變化響應(yīng)機(jī)制的解析提供新思路。
巴音布魯克天鵝湖高寒濕地(83°40′~84°40′E,42°35′~43°00′N)位于新疆維吾爾自治區(qū)和靜縣境內(nèi),海拔2300~3042 m,面積約為770 km2,年平均氣溫約4.6℃,年最低氣溫達(dá)-48.1℃[22]。凍融期6~7個(gè)月,歷史最大凍土深度為4.39 m,是我國氣象站記錄中的最高值[23]。濕地水分主要來源于高山冰雪融水和自然降水,被譽(yù)為中亞干旱區(qū)的空中濕島[2]。濕地沼澤區(qū)主要植被為細(xì)果苔草(Carex microglochn)、黑花苔草(Carex melanantha)、海韭菜(Triglochin maritimum)和線葉嵩草(Kobresia capillifolia),總蓋度大于80%[24]。
2018年9月,在沼澤區(qū)苔草群落內(nèi)完全隨機(jī)設(shè)置24塊重復(fù)小區(qū)(2 m×2 m),相互間隔大于3 m,去除小區(qū)內(nèi)土壤表面0~2 cm的新鮮凋落物[21],并用1 m高的鋼質(zhì)柵欄圍護(hù),盡量保證試驗(yàn)一致性。依據(jù)土壤溫度和土壤濕度的變化,將凍融期分為3個(gè)階段,分別為初凍期(2018年10月)、凍結(jié)期(2018年11月—2019年2月)、融凍期(2019年3月—4月)。于3個(gè)時(shí)期的典型天氣采集小區(qū)圍欄內(nèi)0~5 cm表層土壤樣品:t0(初凍期),t1=140 d(凍結(jié)期),t2=185 d(融凍期)。每次隨機(jī)選擇8個(gè)小區(qū),小區(qū)內(nèi)采用5點(diǎn)法采集,混合均勻后裝入同一根冷存管,編號(hào)并儲(chǔ)存于液氮罐中,用于提取微生物總DNA進(jìn)行高通量測序。同位置、同方法另采集2份土壤帶回實(shí)驗(yàn)室,自然風(fēng)干后用于土壤理化性質(zhì)測定。
1.2.1 土壤理化性質(zhì)測定
試驗(yàn)區(qū)內(nèi),設(shè)置兩臺(tái)15通道的自動(dòng)氣象站(U30-NRC,HOBO,USA)收集0~5 cm土壤溫度(ST)、土壤濕度(SM)。積雪厚度(SD)為每日12:00人工測量。土壤樣品研磨過篩后,采用元素分析儀(Vario El III,Elementar,Germany)測定土壤全碳(TC)和土壤全氮(TN),TC和TN的比值作為土壤碳氮比(C/N)。
1.2.2 細(xì)菌16SrDNA測序
采用微生物Marker基因高通量測序評(píng)估細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性,使用MN NucleoSpin 96 Soil試劑盒/強(qiáng)力土壤DNA提取試劑盒(PowerMag?Soil DNA iso?lation Kit,MOBIO)從樣品中提取細(xì)菌總DNA。細(xì)菌16SrRNA基因的V3~V4區(qū)用普通引物對(duì)(正向引物338F,5′-ACTCCTAGGGAGGAGCA-3′擴(kuò)增;反向引物806R,5′-GGACTCHVGGGTWTTAT-3′)結(jié)合適配器序列和條形碼序列進(jìn)行擴(kuò)增。本研究所有樣品的測序和生物信息服務(wù)均在北京百邁客生物科技有限公司Illumina Hiseq 2500平臺(tái)完成。
1.3.1 數(shù)據(jù)分析
基于R(v3.3.2)的agricolae軟件包進(jìn)行正態(tài)分布和方差齊性檢驗(yàn)(Normal distribution and homogeneity of variance Test)及單因素方差分析(One-way ANO?VA),并在5%顯著性水平下做LSD(Least significant difference)多重比較。
1.3.2 生物信息學(xué)分析
使用FLASH(v1.2.11)對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接,通過Trimmomatic(v0.33)將拼接得到的序列進(jìn)行質(zhì)量過濾,借助UCHIME(v8.1)去除嵌合體,獲得高質(zhì)量Tags序列。使用USEARCH(v10.0)對(duì)OTU進(jìn)行相似度為97%的聚類,以測序所有序列數(shù)的0.005%作為閾值過濾OTU。使用RDPClassifier(v2.2)對(duì)分類群進(jìn)行分類,最小可信度估計(jì)為80%。
借助Mothur(v1.30)分析細(xì)菌群落α多樣性,通過ggpubr軟件包中Kruskal-Wallis檢驗(yàn)比較組間差異,并使用ggplot軟件包完成繪圖。使用ggalluvial等軟件包繪制細(xì)菌群落豐度變化沖擊圖。冗余分析(Reundancy analysis,RDA)環(huán)境因子對(duì)細(xì)菌群落組成的影響,蒙特卡羅置換檢驗(yàn)(Monte Carlo permutation,n=999)測試分析結(jié)果的顯著性?;贙EGG數(shù)據(jù)庫,使用STAMP(v2.1.3)進(jìn)行細(xì)菌功能差異顯著性分析及繪圖。
依據(jù)土壤溫度、土壤濕度的變化,將凍融期分為初凍期、凍結(jié)期和融凍期(圖1)。在t0(初凍期)采樣7 d后,試驗(yàn)階段內(nèi)首次降雪。一個(gè)月后進(jìn)入凍結(jié)期,土壤濕度迅速降低至25%左右。t0(初凍期)至t1(凍結(jié)期)的大部分時(shí)間里,樣地內(nèi)土壤溫度在0℃以下,積雪厚度超過25 cm。t1(凍結(jié)期)采樣后,積雪融化,土壤溫度和土壤濕度均開始升高。最終取樣t2(融凍期),在研究區(qū)域內(nèi)所有積雪融化后一周進(jìn)行。凍融期內(nèi),土壤TC和TN均呈先顯著下降后顯著升高的趨勢,而C/N則相反(表1)。
所有測序文庫的覆蓋度均在99.5%以上,絕大部分細(xì)菌的序列可以被測出。3個(gè)時(shí)期土壤細(xì)菌群落α多樣性差異顯著(圖2)。OTU數(shù)量(OTUs)在t1(凍結(jié)期)細(xì)菌群落中顯著減少,并在t2(融凍期)細(xì)菌群落中顯著增加(圖2a);可觀察到的物種數(shù)目也具有相似趨勢(圖2d),且t0(初凍期)細(xì)菌群落中物種數(shù)量顯著高于t2(融凍期)。從香農(nóng)指數(shù)和辛普森指數(shù)來看(圖2b和圖2c),t2(融凍期)細(xì)菌群落的物種多樣性略優(yōu)于t0(初凍期),遠(yuǎn)高于t1(凍結(jié)期)。而比較ACE指數(shù)和Chao1指數(shù)可以看出,t0(初凍期)細(xì)菌群落豐富度優(yōu)于t2(融凍期),遠(yuǎn)高于t1(凍結(jié)期)(圖2e和圖2f)。
圖1 凍融期巴音布魯克高寒濕地土壤溫度、土壤濕度、積雪厚度日變化Figure 1 Daily changes of soil temperature,soil moisture and snow depth in Bayinbuluk alpine wetland during freeze-thaw period
表1 凍融期巴音布魯克高寒濕地土壤(0~5 cm)基本特征Table 1 Basic characteristics of soil(0~5 cm)in Bayinbuluk alpine wetland during freeze-thaw period
雖然細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在生物復(fù)制中具有很大差異,但總體變化趨勢顯而易見。在各個(gè)水平上,隨時(shí)間推移,優(yōu)勢菌類群演替明顯。在門水平上(圖3a),t0(初凍期)和t1(凍結(jié)期)樣品細(xì)菌群落更相似,均以Pro?teobacteria(變形菌門)為主(12.8%~45.7%),而t2(融凍期)樣品中可以看到Chloroflexi(綠彎菌門)豐度的增加。在綱一級(jí)(圖3b),3個(gè)時(shí)期均以嗜酸性變形桿菌為主。t0(初凍期)樣品中以Alphaproteobacteria(α-變形桿菌綱)豐度較高;t1(凍結(jié)期)和t2(融凍期)樣品中Gammaproteobacteria(γ-變形桿菌綱)豐度較高,同時(shí),Betaproteobacteria(β-變形桿菌綱)僅存在于t0(初凍期)細(xì)菌群落中。更多的變化在目水平中可見(圖3c),例如,Anaerolineales(厭氧繩菌目)和Rhodospirillales(紅螺菌目)在t0(初凍期)細(xì)菌群落中豐度最高,而在t1(凍結(jié)期)和t2(融凍期)細(xì)菌群落中驟減;t1(凍結(jié)期)細(xì)菌群落中含有更多的Bacteroida?les(擬桿菌目)。在屬一級(jí)也發(fā)現(xiàn)了相同的模式(圖3d),同時(shí)各時(shí)期稀有分類群水平升高。Brevundimonas(短波單胞菌屬)是t0(初凍期)的代表,Ilumatobacter屬、Luteolibacter屬和Tabrizicola屬在t2(融凍期)中豐度較高。然而,由于檢測出更多的稀有類群,超過70%的reads不能夠被準(zhǔn)確分類到該水平。
冗余分析表明,兩個(gè)維度共同解釋了凍融期土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化(門水平)的87.29%(圖4),揭示了土壤環(huán)境對(duì)細(xì)菌群落β多樣性的影響。其中,環(huán)境因子解釋的變量為84.74%,土壤養(yǎng)分因子解釋量為73.91%,兩組變量的共同解釋量為71.36%。蒙特卡羅置換檢驗(yàn)結(jié)果顯示,該排序模型在P=0.001時(shí)顯著,所有影響因子均與細(xì)菌群落分布極顯著相關(guān)。凍融期土壤環(huán)境的劇烈變化,對(duì)土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成產(chǎn)生顯著影響。t0(初凍期)細(xì)菌群落主要受土壤濕度的影響較大;t1(凍結(jié)期)細(xì)菌群落受控于積雪厚度,經(jīng)受t0(初凍期)~t1(凍結(jié)期)階段土壤環(huán)境的選擇作用,Bacteroidetes(擬桿菌門)成為t1(凍結(jié)期)細(xì)菌群落的優(yōu)勢菌群;而Tenericutes(軟壁菌門)是t2(融凍期)細(xì)菌群落的特征物種。同時(shí),土壤溫度和C、N含量在t0(初凍期)和t2(融凍期)采樣時(shí)期較為相似,與t1(凍結(jié)期)具有很大差異。
圖2 凍融期巴音布魯克高寒濕地土壤細(xì)菌群落α多樣性Figure 2 Alpha diversity of soil bacterial communities in Bayinbuluk alpine wetland during freeze-thaw period
圖3 細(xì)菌群落中門(a)、綱(b)、目(c)和屬(d)成員的結(jié)構(gòu)和相對(duì)豐度Figure 3 Structure and relative abundance of members of phylum(a),class(b),order(c)and genus(d)in bacterial community
圖4 凍融期土壤環(huán)境和養(yǎng)分對(duì)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化影響的冗余分析Figure 4 RDA analysis of effects of soil environment and nutrientson changes of bacterial community structure during freeze-thaw period
通過PICRUSt功能注釋軟件將測序所得細(xì)菌群落組成“映射”到Greengenes數(shù)據(jù)庫中,基于基因功能譜預(yù)測細(xì)菌基因組的潛在功能。3個(gè)時(shí)期,細(xì)菌群落包含的功能基因組成不同,通路類型差異顯著,表現(xiàn)出群落功能作用的多樣性和階段性。
“代謝”是最主要的通路類型(圖5a)。t0(初凍期)和t2(融凍期)細(xì)菌群落中包含更多氨基酸、脂類、能量和與異生素代謝相關(guān)的功能基因。而相比于t2(融凍期)細(xì)菌群落,萜類化合物和聚酮化合物的代謝功能在t0(初凍期)和t1(凍結(jié)期)細(xì)菌群落中更多的被表達(dá)。同時(shí),聚糖合成與代謝相關(guān)的功能作用在t1(凍結(jié)期)和t2(融凍期)細(xì)菌群落中得到了加強(qiáng)?!胺肿有盘?hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)”是另一組通路類型,在細(xì)菌群落的功能預(yù)測中具有重要意義。相比于t0(初凍期)細(xì)菌群落,“轉(zhuǎn)錄”“翻譯”和“信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)”功能基因在t1(凍結(jié)期)和t2(融凍期)細(xì)菌群落中的表達(dá)更顯著(圖5b)。同時(shí),細(xì)菌群落的“環(huán)境適應(yīng)性”“細(xì)胞活性”和“細(xì)胞生長和死亡”也是3個(gè)時(shí)期細(xì)菌群落功能顯著差異的一類通路類型(圖5c)。t1(凍結(jié)期)和t2(融凍期)時(shí)期,細(xì)菌群落需要更高的細(xì)胞活性來適應(yīng)凍融期的環(huán)境變化,但是仍然無法避免部分細(xì)菌類群在凍結(jié)期的消亡。
凍融期內(nèi),高寒濕地土壤細(xì)菌群落的α多樣性指數(shù)變化趨勢明顯。t1(凍結(jié)期)細(xì)菌群落的多樣性、豐富度及均勻度遠(yuǎn)低于t0(初凍期)和t2(融凍期)。t0(初凍期)土壤細(xì)菌群落復(fù)雜而穩(wěn)定,生存環(huán)境適宜,物種數(shù)量最高。t1(凍結(jié)期)土壤溫度和土壤濕度對(duì)細(xì)菌群落具有較為強(qiáng)烈的選擇作用,大量細(xì)菌死亡,導(dǎo)致群落物種多樣性驟降。隨著t2(融凍期)的到來,土壤環(huán)境轉(zhuǎn)良,群落中優(yōu)勢菌種加速繁殖。但由于凍融期環(huán)境因子的影響貢獻(xiàn)率較大,以致于細(xì)菌群落從冰凍中恢復(fù)后,大部分細(xì)菌類群活動(dòng)表達(dá)存在潛在的時(shí)間延遲,這與我國東北沼澤土壤細(xì)菌凍融前后群落變化趨勢基本一致,差別主要表現(xiàn)在細(xì)菌類群豐度上的差異[25],后者細(xì)菌類群中Acidobacteria(酸桿菌門)、Firmicutes(厚壁菌門)豐度較高。這些差異可能是由地域氣候、土壤養(yǎng)分及地上植被組成的不同造成的。
細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)對(duì)凍融期土壤環(huán)境變化響應(yīng)敏感。高寒濕地土壤細(xì)菌群落進(jìn)化出一系列復(fù)雜的適應(yīng)能力,以抵消低動(dòng)能環(huán)境和冰水轉(zhuǎn)化的潛在不利影響。凍融期土壤溫度、土壤濕度及積雪厚度的變化是影響細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化的主要因素。生長活躍的細(xì)菌類群,通常受凍融的影響更為嚴(yán)重。本試驗(yàn)中,Chloro?flexi(綠彎菌門)在t1(凍結(jié)期)階段豐度驟降,Acido?bacteria(酸桿菌綱)和Betaproteobacteria(β-變形菌綱)甚至出現(xiàn)了消亡殆盡的現(xiàn)象。土壤碳氮養(yǎng)分的利用也被證明與異養(yǎng)細(xì)菌數(shù)量呈線性關(guān)系,而溫度和水分的有效性同樣也是影響異養(yǎng)細(xì)菌活性的重要因素[7]。短期凍融過程,C/N較低的細(xì)菌群落占比更大,部分類群仍保持較高活性,增強(qiáng)了土壤中無機(jī)氮的固持。具體的研究結(jié)果更依賴于凍融對(duì)微生物群落的影響強(qiáng)度以及微生物群落的恢復(fù)能力[26]。冗余分析結(jié)果顯示,凍融期t0(初凍期)和t2(融凍期)細(xì)菌群落中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與土壤TC、土壤TN關(guān)系更密切,而t1(凍結(jié)期)細(xì)菌群落則相反。同時(shí),土壤TC和土壤TN在t1(凍結(jié)期)土壤細(xì)菌群落中含量最低,這可能是在t0(初凍期)~t1(凍結(jié)期)的前期階段,細(xì)菌群落活性較高,消耗了更多的土壤氮素的結(jié)果。對(duì)凍融期東北沼澤濕地土壤細(xì)菌群落的研究,通過主坐標(biāo)分析(PCoA)同樣證實(shí)了細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在凍融前后發(fā)生了明顯變化[25],并通過冗余分析說明溫度和溶解性碳是濕地土壤細(xì)菌群落短期凍融前后發(fā)生變化的主要影響因子,綜合分析與本研究整體保持一致。總體來說,凍融期內(nèi)土壤細(xì)菌群落中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異明顯,演替頻繁,證明了細(xì)菌群落對(duì)環(huán)境變化的響應(yīng)是迅速的。凍融期后,細(xì)菌群落多樣性和豐富度、均勻度均有所增加,也體現(xiàn)出不同的細(xì)菌類群在應(yīng)對(duì)凍融期環(huán)境變化時(shí)具有不同的生存策略。
為更好地理解高寒濕地土壤微生物生態(tài)學(xué),應(yīng)將微生物群落功能與環(huán)境因子結(jié)合分析。細(xì)菌類群進(jìn)化多種生理適應(yīng)機(jī)制應(yīng)對(duì)凍融環(huán)境變化,這使得它們可以在環(huán)境脅迫下生存甚至保持活躍。細(xì)菌群落的抗寒機(jī)制主要體現(xiàn)在膜流動(dòng)性的調(diào)控、應(yīng)答因子的產(chǎn)生、冷適應(yīng)性基因的響應(yīng)等方面。細(xì)菌群落礦化分解生態(tài)系統(tǒng)中的碳氮養(yǎng)分以支持自身面對(duì)壓力的生理反應(yīng)及抗逆能力[27]。
圖5 凍融期巴音布魯克高寒濕地土壤細(xì)菌功能作用差異顯著性分析Figure 5 Significant difference analysis of soil bacterial functions in Bayinbuluk alpine wetland during freeze-thaw period
在t0(初凍期)和t2(融凍期)的土壤細(xì)菌群落中,“代謝”組功能基因通路被顯著表達(dá)。氨基酸代謝是涉及大量代謝產(chǎn)物的復(fù)雜過程,也是脂類、碳水化合物、核酸和信號(hào)分子合成的前體,在能量的生產(chǎn)中被用作底物。而細(xì)菌進(jìn)行能量代謝,完成三羧酸循環(huán)和氧化磷酸化過程與土壤中碳氮養(yǎng)分保持緊密關(guān)系。脂類作為生物體維持正常生命活動(dòng)不可缺少的四大基本物質(zhì)之一,其合成代謝在能量存儲(chǔ)中起直接作用,同時(shí)因其影響細(xì)胞膜構(gòu)成而對(duì)物質(zhì)運(yùn)輸起到一定的間接作用。通過初級(jí)代謝,細(xì)菌群落可以將營養(yǎng)物質(zhì)轉(zhuǎn)化為結(jié)構(gòu)物質(zhì)、具有生理活性的物質(zhì)或?yàn)樯L提供能量。初級(jí)代謝的產(chǎn)物,都是機(jī)體生存的必備基礎(chǔ),因此極為重要。初級(jí)代謝紊亂,可以導(dǎo)致細(xì)菌的生長障礙甚至突變或死亡。同時(shí),在一定的生長階段會(huì)出現(xiàn)次級(jí)代謝類型,其對(duì)環(huán)境條件極為敏感。如萜類化合物、聚酮類化合物代謝等,在抗生素、激素的產(chǎn)生及抗逆性的增強(qiáng)方面具有重要意義[28]。t0(初凍期)和t2(融凍期)細(xì)菌群落中,Proteobacteria(變形菌門)和Chloroflexi(綠彎菌門)占比較大,遺傳多樣性極為豐富,生理代謝類型更為廣泛,且具有纖維素的降解作用。Cyanobacteria(藍(lán)藻門)作為t0(初凍期)細(xì)菌群落的代表類群,可直接固氮提高土壤肥力。Acido?bacteria(酸桿菌門)作為t0(初凍期)細(xì)菌群落的又一代表類群,在降解植物殘?bào)w多聚物方面具有重要作用。t0(初凍期)土壤環(huán)境溫和穩(wěn)定,新鮮的凋落物對(duì)細(xì)菌群落可能具有一定的刺激作用。
在t0(初凍期)~t1(凍結(jié)期)階段的后期,土壤環(huán)境的劇烈變化對(duì)細(xì)菌群落具有脅迫作用。當(dāng)細(xì)菌群落受到如碳氮養(yǎng)分匱乏、冷激或熱激過程以及滲透壓失常等脅迫時(shí),RNA聚合酶依靠大量Rpos識(shí)別啟動(dòng)子,調(diào)節(jié)基因表達(dá),促進(jìn)生存所必需基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),這一系列的復(fù)雜過程可以發(fā)生在轉(zhuǎn)錄和翻譯階段或者降解過程中,以及活性調(diào)節(jié)方面[29]。t1(凍結(jié)期)土壤細(xì)菌群落中含有更多的“分子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)”功能基因,同時(shí),對(duì)應(yīng)著典型常見嗜冷菌類Bacteroidetes(擬桿菌門)、Firmicutes(厚壁菌門)豐度的增加。嗜冷菌tRNA轉(zhuǎn)錄后被修飾的程度較低,從而降低結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性,細(xì)胞膜含有大量不飽和脂肪酸,防止細(xì)胞膜從液晶態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)槟z態(tài),保證膜具有良好柔性和流動(dòng)性[30],這也是長時(shí)間低溫環(huán)境馴化的結(jié)果。土壤環(huán)境溫度的驟降,促使細(xì)菌相應(yīng)誘導(dǎo)表達(dá)多種冷激蛋白,從而協(xié)助低溫脅迫條件下RNA的轉(zhuǎn)錄以及DNA的復(fù)制,維持DNA和RNA二次結(jié)構(gòu)低溫下的可變性,如轉(zhuǎn)錄、翻譯、蛋白質(zhì)折疊以及細(xì)胞膜透性調(diào)控等。
環(huán)境因子的強(qiáng)烈篩選作用,導(dǎo)致t1(凍結(jié)期)土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的變化,部分嗜冷菌類群成為優(yōu)勢菌群。與此同時(shí),“生存”是微生物所有功能作用的基本,在t0(初凍期)群落中表達(dá)最頻繁的是“細(xì)胞的生長和死亡”功能基因,演替是細(xì)菌群落的常態(tài)。而在t1(凍結(jié)期)和t2(融凍期)細(xì)菌群落中,更多被表達(dá)的功能基因是“環(huán)境適應(yīng)性”和“細(xì)胞活性”,以增加自身的抗寒性,適應(yīng)高寒濕地的低溫環(huán)境。
高寒濕地土壤微生物生態(tài)學(xué)一直是濕地科學(xué)研究的薄弱環(huán)節(jié),亟需更多關(guān)注。人類對(duì)微生物活動(dòng)的了解遠(yuǎn)滯后于環(huán)境變化,更多的科學(xué)問題不斷涌現(xiàn)。微生物群落的功能組成對(duì)氣候變化的適應(yīng)機(jī)制如何?凍土區(qū)或凍融區(qū)土壤養(yǎng)分的有效性及其對(duì)微生物功能群落及酶活性的影響如何?未來應(yīng)開展增加系統(tǒng)研究,綜合運(yùn)用多種技術(shù)方法來度量微生物生理活動(dòng),為厘清和預(yù)測未來氣候變化條件下微生物在地球化學(xué)循環(huán)過程中的功能作用提供科學(xué)信息。
(1)凍融期對(duì)巴音布魯克高寒濕地土壤細(xì)菌群落物種多樣性產(chǎn)生較大影響。凍結(jié)期,細(xì)菌群落物種多樣性、豐富度以及均勻度均顯著降低。
(2)凍融期內(nèi),細(xì)菌群落受土壤環(huán)境和養(yǎng)分的顯著影響,群落結(jié)構(gòu)對(duì)微生境變化響應(yīng)迅速,優(yōu)勢菌群演替過程明顯。
(3)細(xì)菌群落功能發(fā)生顯著變化,整體趨勢表現(xiàn)為:凍融期前期,通過“代謝”供能和“信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)”調(diào)控來增強(qiáng)群落的“環(huán)境適應(yīng)性”(抗寒性),從而維持凍結(jié)期和融凍期的“生存”及“細(xì)胞活性”。