張廣成,尹文娟,劉 芳,何孟宇,孟凡娟,王麗燕
(1.天津師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,天津 300387;2.天津師范大學(xué)天津市動(dòng)植物抗性重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津 300387)
圍食膜(peritrophic membrane,PM)是在無脊椎動(dòng)物腸道內(nèi)攝入食物的一層半通透性膜狀結(jié)構(gòu)[1],主要由蛋白質(zhì)和幾丁質(zhì)構(gòu)成[2-4].其功能類似于脊椎動(dòng)物消化道的黏液層,具有保護(hù)中腸上皮細(xì)胞免受食物顆粒機(jī)械損傷、阻擋病原菌接觸上皮細(xì)胞造成感染、促進(jìn)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)消化吸收等作用[5-7].圍食膜蛋白(peritrophin)是構(gòu)成圍食膜結(jié)構(gòu)的主要蛋白成分,具有一個(gè)或多個(gè)保守的幾丁質(zhì)Ⅱ型結(jié)合結(jié)構(gòu)域(chitin-bindingdomain2,ChtBD2),也稱為Peritrophin-A 結(jié)構(gòu)域.圍食膜蛋白最先是從昆蟲的PM 中解離得到,研究發(fā)現(xiàn)圍食膜蛋白在輔助消化食物和防控外源微生物對(duì)昆蟲侵染中都發(fā)揮了巨大作用[4,8].近年來研究發(fā)現(xiàn),蝦類也具有同昆蟲類似的圍食膜結(jié)構(gòu)[9-10],它在免疫防病中的功能有待深入研究.
對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)是世界性海洋生物資源的重要支柱產(chǎn)業(yè),近年來病害頻發(fā),嚴(yán)重制約了我國(guó)對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展.在眾多細(xì)菌與病毒引起的病害中,由對(duì)蝦白斑綜合癥病毒(white spot syndrome virus,WSSV)引起的病毒病較為嚴(yán)重.自然養(yǎng)殖條件下,WSSV 病毒病的傳播主要是由對(duì)蝦殘食染病對(duì)蝦或尸體引起,因此,消化道是病毒感染的主要位點(diǎn).WSSV 病毒分子檢測(cè)結(jié)果同樣證實(shí),腸道是感染W(wǎng)SSV 過程中最早可檢測(cè)到其核酸的組織之一[11-13].
本文通過基因克隆技術(shù)獲得了中國(guó)明對(duì)蝦(Fenneropenaeus chinensis)的類圍食膜蛋白基因FcPT2,研究其在不同組織中的表達(dá)及其應(yīng)對(duì)WSSV 感染的表達(dá)變化,進(jìn)而探究類圍食膜蛋白FcPT2 在對(duì)蝦抗WSSV 感染中發(fā)揮的作用.研究結(jié)果將為深入開展對(duì)蝦WSSV 病毒性疾病的防控提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù).
實(shí)驗(yàn)所用中國(guó)明對(duì)蝦由中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所提供.對(duì)蝦體長(zhǎng)8 cm 左右,在23 ℃條件下,養(yǎng)殖于充氣自然海水中,每天喂食3 次,每次喂食5 g 蝦飼料.
Unizol 試劑,上海博星基因芯片責(zé)任有限公司;MMLV 反轉(zhuǎn)錄酶、RQ1 RNase-free DNase 和 nuclease-free water,美國(guó) Promega 公司;DNA 回收試劑盒,生工生物工程(上海)股份有限公司;PMD-19-T 和 DH5α,天根生化科技(北京)有限公司;SYBR Green Master Mix,美國(guó)Applied Biosystems 公司.
1.2.1 組織樣品制備及WSSV 感染
對(duì)實(shí)驗(yàn)用中國(guó)明對(duì)蝦進(jìn)行隨機(jī)WSSV 檢測(cè).取對(duì)蝦部分鰓組織搗碎,加入90 μL 濃度為50 mmol/L 的NaOH 溶液,煮10 min 后離心取上清液.根據(jù)WSSV囊膜蛋白VP28 基因序列設(shè)計(jì)引物VP28F 和VP28R,如表1 所示,進(jìn)行一步法PCR 檢測(cè).用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),將結(jié)果為陰性的樣本作為無WSSV 感染的對(duì)照組.分別取5 只無WSSV 感染的對(duì)蝦各個(gè)組織,包括肝胰臟、神經(jīng)、心臟、鰓、中腸、精巢、卵巢、血細(xì)胞、眼柄、胃、淋巴Oka、肌肉,分別保存于液氮中,進(jìn)行后續(xù)RNA 提取、基因克隆和定量PCR 實(shí)驗(yàn).
表1 實(shí)驗(yàn)所用引物序列信息Tab.1 Primer sequences used in this study
參照文獻(xiàn)[10,14]中的方法準(zhǔn)備和提取WSSV.提取的WSSV 拷貝數(shù)用PBS 稀釋為80 copies/μL,每只蝦注射10 μL.注射感染病毒36 h 后,分離提取對(duì)蝦的消化道組織作為WSSV 感染組,進(jìn)行RNA 提取和Real-time PCR 實(shí)驗(yàn).
1.2.2 總RNA 提取和cDNA 合成
利用Unizol 試劑提取中國(guó)明對(duì)蝦各組織的總RNA,方法參照使用說明書.提取的總RNA 進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,確認(rèn)RNA 完整性后,用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行定量.反轉(zhuǎn)錄前利用RQ1 RNase-free DNase 降解總RNA 中污染的DNA.第一鏈cDNA 的合成按照M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶說明書進(jìn)行,以隨機(jī)引物合成第一鏈cDNA,用于實(shí)時(shí)定量PCR,-80 ℃冰箱保存其余的RNA.
1.2.3 序列分析
根據(jù)本課題組所建立的中國(guó)明對(duì)蝦腸道轉(zhuǎn)錄組信息和中國(guó)明對(duì)蝦WSSV 感染前后頭胸甲轉(zhuǎn)錄組信息,發(fā)現(xiàn)一條腸道類圍食膜蛋白FcPT2 在WSSV 感染前后存在表達(dá)差異,利用序列在線比對(duì)軟件BLASTX(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/blast)分析比對(duì) FcPT2,利用在線SMART 軟件(http://smart.embl-heidelberg.de/)分析FcPT2 基因編碼氨基酸的結(jié)構(gòu)域特征,利用Clustal W軟件進(jìn)行多序列分析比對(duì).
1.2.4 實(shí)時(shí)定量PCR(real-time PCR)
以FcPT2 序列設(shè)計(jì)實(shí)時(shí)定量PCR 引物RT-FcPT2-F和RT-FcPT2-R.中國(guó)明對(duì)蝦18S rRNA 作為對(duì)照基因,設(shè)計(jì)引物18S-F 和18S-R,如表1 所示.以合成的各組織cDNA 作為模板,不含RNase 的水代替cDNA模板作為陰性對(duì)照.
實(shí)時(shí)定量 PCR 反應(yīng)物為 25 μL 體系,包含:1UTakara Ex taq hot start、1× Ex taq buffer(plus Mg2+)、0.2 mmol/L的 dNTP、1× SYBR Green Master Mix、0.2 mmol/L 的正向引物、0.2 mmol/L 的反向引物、1 μL cDNA 模板.反應(yīng)程序設(shè)置為:94 ℃預(yù)變性 2 min,1 個(gè)循環(huán);94 ℃變性 15 s,55 ℃退火 20 s,72 ℃延伸 20 s,40 個(gè)循環(huán).反應(yīng)完成后進(jìn)行溶解曲線分析,確定只有一條特異性的PCR 產(chǎn)物被擴(kuò)增.每個(gè)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行3 次重復(fù),每個(gè)樣品取自5 只對(duì)蝦.
利用SPSS 11.0 軟件對(duì)所得數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,P<0.05 時(shí)差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義.
本課題組根據(jù)所得中國(guó)明對(duì)蝦腸道的轉(zhuǎn)錄組信息,獲得了FcPT2 的部分cDNA 序列,如圖1 所示.通過Smart 軟件在線分析得知,中國(guó)明對(duì)蝦FcPT2 編碼的蛋白含有3 個(gè)典型的ChtBD2 結(jié)構(gòu)域.通過NCBI Blast 軟件對(duì)所得基因編碼的氨基酸序列進(jìn)行在線搜索,結(jié)果如圖2 所示.由圖2 可以看出,F(xiàn)cPT2 與昆蟲的圍食膜蛋白 TcCPAP3-D2、ApCPAP3-D2 和 NvCPAP3-D2 具有較高相似性,分別為74%、74%和71%.
圖1 中國(guó)明對(duì)蝦FcPT2 部分cDNA 及其編碼的氨基酸序列和FcPT2 幾丁質(zhì)Ⅱ型結(jié)合結(jié)構(gòu)域Fig.1 Partial cDNA sequence and deduced amino acid sequence of FcPT2 gene and chitin-binding domain Ⅱof FcPT2 in F.chinensis
圖2 FCPT2 與其他昆蟲的CPAP3 氨基酸序列比對(duì)Fig.2 Amino acid sequence comparison of FcPT2 in F.chinensis with CPAP3 of other insects
對(duì)中國(guó)明對(duì)蝦類圍食膜蛋白(FcPT2)與其他蝦和昆蟲類圍食膜蛋白的氨基酸序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹分析,結(jié)果如圖3 所示.由圖3 可以看出,對(duì)蝦類的圍食膜蛋白(PT)首先聚在一起,然后與昆蟲圍食膜蛋白CPAP3 聚類.FcPT2 與CPAP3 圍食膜蛋白聚在一起,進(jìn)一步說明了FcPT2 與昆蟲CPAP3 圍食膜蛋白具有相對(duì)較高的序列相似性.
圖3 FcPT2 與其他圍食膜蛋白氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析Fig.3 Phylogenetic tree of FcPT2 with other peritrophins
對(duì)中國(guó)明對(duì)蝦不同部位的定量PCR 檢測(cè)結(jié)果表明,F(xiàn)cPT2 主要在眼柄(eyestalk)和胃(stomach)組織中進(jìn)行表達(dá),鰓(gill)、精巢(testis)、卵巢(ovary)和血細(xì)胞(hemocyte)中也有少量表達(dá),肝胰臟(hepatopancreas)、神經(jīng)(nerve)、心臟(heart)、淋巴 Oka 和肌肉(muscle)中較少甚至無表達(dá),如圖4 所示.中國(guó)明對(duì)蝦感染W(wǎng)SSV 后,F(xiàn)cPT2 在胃組織中出現(xiàn)明顯的表達(dá)上調(diào),如圖5 所示,實(shí)驗(yàn)組表達(dá)量為對(duì)照組表達(dá)量的3.64 倍(P<0.05),這說明FcPT2 可能在中國(guó)明對(duì)蝦抗WSSV的侵染中發(fā)揮一定的作用.
圖4 FcPT2 在中國(guó)明對(duì)蝦不同組織中的表達(dá)Fig.4 Expression of FcPT2 in different tissues in F.chinensis
圖5 WSSV 感染前后FcPT2 在中國(guó)明對(duì)蝦胃組織中的表達(dá)Fig.5 Expression of FcPT2 in stomach of F.chinensis before and after WSSV infection
圍食膜蛋白最早是用強(qiáng)變性劑從昆蟲圍食膜中解離出來的,其典型特征是含有ChtBD2 結(jié)構(gòu)域[8,15].Jasrapuria 等[16]根據(jù)系統(tǒng)樹、表達(dá)和功能分析,將赤擬谷盜中含有ChtBD2 結(jié)構(gòu)域的蛋白分成3 個(gè)家族:PMP(peritrophic matrix proteins)、CPAP3(cuticular proteins analogous to peritophins 3)和 CPAP1(cuticular proteins analogous to peritophins 1).PMP 家族屬于腸道特異性蛋白,又稱為圍食膜因子(peritrophin),是圍食膜結(jié)構(gòu)形成的主要蛋白成分,而CPAP3 和CPAP1 家族蛋白則只是表達(dá)于表皮形成相關(guān)組織中,其功能還未知.近年來研究發(fā)現(xiàn),蝦類具有同昆蟲類似的圍食膜結(jié)構(gòu),其圍食膜成分同樣是由幾丁質(zhì)和蛋白構(gòu)成[10].本文對(duì)中國(guó)明對(duì)蝦類圍食膜蛋白FcPT2 的研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)cPT2 與昆蟲CPAP3 圍食膜蛋白有較高的相似性,其氨基酸序列中也具有典型的ChtBD2 結(jié)構(gòu)域,但是蛋白序列差異較大.在昆蟲中圍食膜蛋白的種類也不同,從幾種到幾十種[17-18].同種昆蟲中,發(fā)育時(shí)期、餌料營(yíng)養(yǎng)等也會(huì)影響圍食膜蛋白的種類.
FcPT2 的組織表達(dá)結(jié)果顯示,類圍食膜蛋白基因除了表達(dá)于腸道組織外,還廣泛存在于其他組織中.在短鉤對(duì)蝦(P.semisulcatus)[19]和日本對(duì)蝦(Marsupenaeus japonicus)[20]卵巢中幾種類圍食膜蛋白基因呈組成型高表達(dá),由此稱之為蝦卵巢圍食膜蛋白(shrimp ovarian peritrophins,SOPs).在昆蟲圍食膜蛋白研究中,Barry等[21]和 Behr 等[22]從果蠅(Drosophila melanogaster)的表皮形成相關(guān)組織中鑒定到編碼ChtBD2 的基因;Nisole等[23]從云杉卷葉蛾(Choristoneura fumiferana)中克隆到一條cDNA,能夠編碼具有ChtBD2 結(jié)構(gòu)的存在于表皮中的蛋白.本研究結(jié)果顯示,F(xiàn)cPT2 主要表達(dá)于中國(guó)明對(duì)蝦的眼柄和胃中,這2 個(gè)器官中都含有上皮,是與表皮形成相關(guān)的組織,該蛋白在鰓、精巢、卵巢和血細(xì)胞中也有少量表達(dá).由此可知,具有ChtBD2 結(jié)構(gòu)域的類圍食膜蛋白不僅存在于圍食膜中,在其他組織中也發(fā)揮了重要作用.
蝦類圍食膜蛋白呈現(xiàn)了多樣的生物學(xué)功能:如短鉤對(duì)蝦中存在2 條SOP,具有在受精卵表面形成保護(hù)層的功能[19];墨吉對(duì)蝦的SOP 具有抗菌肽活性[24-25];中國(guó)明對(duì)蝦類圍食膜蛋白PTPH 具有結(jié)合細(xì)菌和幾丁質(zhì)的活性[26];凡納濱對(duì)蝦類圍食膜蛋白能夠與WSSV 的多種囊膜蛋白相互作用[27].Hui 等[28]發(fā)現(xiàn)日本對(duì)蝦的3種腸道類圍食膜蛋白基因在WSSV 感染后出現(xiàn)明顯的表達(dá)上調(diào),據(jù)此提出這類圍食膜蛋白在腸道免疫反應(yīng)中發(fā)揮了重要作用.本研究結(jié)果顯示,WSSV 感染中國(guó)明對(duì)蝦后,F(xiàn)cPT2 在對(duì)蝦胃中的表達(dá)量出現(xiàn)明顯上調(diào),提示該靶基因可能也在中國(guó)明對(duì)蝦應(yīng)答WSSV 感染過程中發(fā)揮作用.
綜上所述,本研究鑒定了中國(guó)明對(duì)蝦的類圍食膜蛋白基因FcPT2,F(xiàn)cPT2 蛋白主要表達(dá)于眼柄和胃中,其編碼的氨基酸序列不同于其他已報(bào)道的蝦類圍食膜蛋白,但與昆蟲CPAP3 圍食膜蛋白具有較高的同源性,因此推測(cè)FcPT2 是這類圍食膜蛋白,在不同組織中發(fā)揮著不同的作用.WSSV 感染實(shí)驗(yàn)證明FcPT2 可能在中國(guó)明對(duì)蝦應(yīng)答WSSV 侵染中發(fā)揮了重要作用,具體機(jī)制有待于進(jìn)一步深入研究.