張建芬,林 璟,徐好儀,張夢(mèng)捷
(浙江樹人大學(xué)生物與環(huán)境工程學(xué)院,浙江 杭州 310015)
華澤蘭Eupatorium chinenseL.為菊科澤蘭屬一年生或多年生草本植物,在我國(guó)主要分布于東南部至西南部。傳統(tǒng)藥理研究表明,華澤蘭具有清熱解毒、涼血利咽、抗炎鎮(zhèn)痛等功效;現(xiàn)代研究表明,華澤蘭富含結(jié)構(gòu)新穎的萜類及黃酮類化合物,具有顯著的抑菌和抑制腫瘤細(xì)胞活性[1-3]。劉夢(mèng)元等[4]從華澤蘭根中分離得到苯并呋喃類化合物,具有較強(qiáng)抑菌活性;尉小琴等[5]從華澤蘭中分離得到澤蘭苦內(nèi)酯類化合物,對(duì)人胃癌HGC-27 細(xì)胞及小鼠黑色素瘤B16 細(xì)胞有顯著的細(xì)胞毒活性。
Stierle 等[6]從短葉紅豆杉Taxus brevifolia中分離到一株能夠產(chǎn)生與宿主相同的抗腫瘤代謝產(chǎn)物紫杉醇的內(nèi)生真菌Taxomyces andreanae,而且從藥用植物內(nèi)生真菌中尋找活性成分成為研究的熱點(diǎn),大量的抑菌抗腫瘤活性成分從中分離出來(lái),如紫杉醇、喜樹堿、長(zhǎng)春新堿、鬼臼毒素等[7]。從澤蘭屬中藥內(nèi)生真菌中篩選結(jié)構(gòu)新穎、效價(jià)高、成藥性良好的抑菌、抗腫瘤先導(dǎo)物頗具研究前景,但目前有關(guān)華澤蘭內(nèi)生菌產(chǎn)生抑菌、抗腫瘤活性代謝產(chǎn)物的研究尚未見報(bào)道。
植物內(nèi)生真菌能夠產(chǎn)生萜類、生物堿類、芳香類、肽類等活性次生代謝產(chǎn)物,可分為聚酮類和非核糖體多肽類化合物,生物合成過(guò)程分別是在聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)和非核糖體肽合成酶(non-ribosomal peptide synthetase,NRPS)的催化下完成[8]?;赑KS 和NRPS 功能基因定向篩選的方法,可以預(yù)測(cè)菌株可能產(chǎn)生的化合物類型,發(fā)現(xiàn)新的聚酮類和非核糖體肽類[9]。
本研究以傳統(tǒng)藥用植物華澤蘭為材料,從植物各部位分離內(nèi)生真菌,并利用形態(tài)學(xué)特征結(jié)合ITS序列分析進(jìn)行內(nèi)生真菌的鑒定;篩選含有PKS 和NRPS 基因的功能菌株,預(yù)測(cè)其產(chǎn)生次生代謝產(chǎn)物的能力。在此基礎(chǔ)上,通過(guò)活性篩選的方法從中挖掘出具有抑菌、抗腫瘤活性菌株。
1.1 材料
1.1.1 供試植物 華澤蘭于2016 年9 月至2016年11 月采自杭州西山國(guó)家森林公園,采用隨機(jī)取樣法收集健康植株的根、莖、葉、花,裝入無(wú)菌袋內(nèi)帶回實(shí)驗(yàn)室,用于內(nèi)生真菌的分離。
1.1.2 培養(yǎng)基 采用PDA 培養(yǎng)基進(jìn)行內(nèi)生真菌的分離和純化,采用PDB 培養(yǎng)基進(jìn)行內(nèi)生真菌的發(fā)酵培養(yǎng),采用康乃馨葉片培養(yǎng)基(CLA)進(jìn)行內(nèi)生真菌的產(chǎn)孢培養(yǎng)。
1.1.3 試劑 真菌基因組DNA 提取試劑盒購(gòu)于生工生物工程(上海)有限公司;DNA marker 和2×Taq PCR Master mix 均購(gòu)于寶生物工程(大連)有限公司;PCR 擴(kuò)增引物合成和PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序均由生工生物工程(上海)有限公司完成。
1.2 內(nèi)生真菌分離 采用組織分離法,參照汪瀅等[10]報(bào)道。將健康華澤蘭的根、莖、葉、花用自來(lái)水洗凈,切為小段或小片。分別用75% 乙醇和3%次氯酸鈉溶液消毒2 min,其間分別無(wú)菌水沖洗多次。樣品晾干后,切成約1 cm×1 cm 大小,接到PDA 培養(yǎng)基上,28 ℃培養(yǎng)。將最后1 次清洗樣品所用無(wú)菌水涂布于PDA 平板上作為對(duì)照,同樣條件下培養(yǎng)、觀察,以確保表面消毒徹底。挑取樣品切口處長(zhǎng)出的菌絲尖端部分,轉(zhuǎn)接至新鮮PDA 培養(yǎng)基上,多次純化培養(yǎng),直至獲得純菌株。
1.3 內(nèi)生真菌鑒定 觀察內(nèi)生真菌的平板菌落形態(tài)、菌絲形態(tài)和孢子形態(tài),結(jié)合《真菌鑒定手冊(cè)》對(duì)分離到的真菌進(jìn)行表型鑒定[11],分子生物學(xué)鑒定參照相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道的方法[10]。采用CTAB 法提取內(nèi)生真菌的基因組DNA,以此為模板,ITS1、ITS4 為引物,對(duì)內(nèi)生真菌進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,在Gen-Bank 數(shù)據(jù)庫(kù)中用BLAST 進(jìn)行比對(duì)分析。采用MEGA5 軟件的Neighbor-Joining(鄰接)法構(gòu)建內(nèi)生真菌的系統(tǒng)發(fā)育樹,Bootstrap 1 000 次進(jìn)行穩(wěn)定性檢驗(yàn)。
1.4 內(nèi)生真菌PKS 和NRPS 基因檢測(cè)和分析 以內(nèi)生真菌菌株基因組DNA 為模板,按照文獻(xiàn)的方法,采用兼并引物KAF1(5′-GARKSICAYGGIACIGGIAC-3′)、KAR1(5′-CCAYTGIGCICCRTGICCIGARAA-3′)和 AUG003(5′-CCGGCACCACCGGNAARCCHAA-3′)、AUG007(5′-CCGGACCATGTCGCCNGTBYKRTA-3′)進(jìn)行PKS、NRPS 功能基因的PCR 擴(kuò)增[9-10]。PCR 產(chǎn)物經(jīng)純化后測(cè)序。利用BLASTx 軟件將獲得的PKS 和NRPS 基因序列轉(zhuǎn)化為氨基酸序列,在線進(jìn)行序列的同源性比對(duì)。
1.5 內(nèi)生菌發(fā)酵培養(yǎng)和活性成分提取 將篩選出的內(nèi)生真菌接種PDB 發(fā)酵培養(yǎng)基(100 mL/500 mL),25 ℃培養(yǎng)7~10 d?;钚猿煞值奶崛⒄瘴墨I(xiàn)[10]報(bào)道的方法,發(fā)酵液用布氏漏斗過(guò)濾。發(fā)酵濾液用等體積乙酸乙酯萃取3 次,收集萃取液45 ℃下減壓濃縮至干,用抑菌、抗腫瘤實(shí)驗(yàn)。
1.6 抑菌活性測(cè)定 采用濾紙片法。以革蘭氏陽(yáng)性菌金黃色葡萄球菌Staphylococcus aureus、枯草芽胞桿菌Bacillus subtilis、革蘭氏陰性菌大腸桿菌Escherichia coli、真菌面包酵母Saccharomyces cerevisiae為指示菌,分別吸取測(cè)試樣品溶液(以乙酸乙酯稀釋至10 mg/mL)15 μL 滴加于空白藥敏紙片(直徑6 mm)上,將紙片貼到涂布有0.2 mL指示菌菌液(約1×106CFU/mL)的LB 平板上,以乙酸乙酯為空白對(duì)照,100 μg/mL 氨芐青霉素為陽(yáng)性對(duì)照,37 ℃培養(yǎng)24 h,測(cè)定各樣品抑菌圈直徑。
1.7 抗腫瘤活性檢測(cè) 采用MTT 法[5]。以人乳腺癌細(xì)胞株MDA-MB-231 和MCF-7 為檢測(cè)瘤株,完全培養(yǎng)基為陰性對(duì)照,阿霉素為陽(yáng)性對(duì)照。細(xì)胞在96 孔板中培養(yǎng)后,于490 nm 波長(zhǎng)處檢測(cè)各孔吸光度(A),計(jì)算IC50。
2.1 內(nèi)生真菌的分離與鑒定 采用平板分離法,從華澤蘭中分離得到內(nèi)生真菌43 株。根據(jù)內(nèi)生真菌菌株的平板菌落形態(tài)特征和顯微鏡下的形態(tài)特征,去重后共得到內(nèi)生真菌8 株。
在PDA 培養(yǎng)基上,部分菌株的菌落形態(tài)見圖1、表1。各菌株的菌落形態(tài)豐富,有絨毛狀、絮狀、花瓣?duì)?,顏色有白色、粉紅色、紅色、黑色、綠色等;有的菌株生長(zhǎng)較快,菌絲發(fā)達(dá),有的生長(zhǎng)較慢。圖1 表明,EC2、EC7、EC8 菌株生長(zhǎng)較快,菌絲發(fā)達(dá),迅速長(zhǎng)滿整個(gè)平板,而EC4、EC9 生長(zhǎng)較慢。
圖1 部分內(nèi)生真菌形態(tài)特征Fig.1 Morphological characteristics on some entophytic fungi
以華澤蘭內(nèi)生真菌的基因組DNA 為模板,以ITS1 和ITS4 為引物,成功擴(kuò)增了其ITS 區(qū)序列,測(cè)序結(jié)果提交GeneBank 經(jīng)Blast 比對(duì)分析和進(jìn)化樹分析,基于ITS 區(qū)序列的系統(tǒng)發(fā)育分析見圖2。由此可知,8 株菌株分別與Fusarium graminearum、Diaporthesp、Alternaria alternata、Fusarium prolif-eratum、Neofusicoccumparvum、Alternaria tenuissima、Phyllosticta capitalensis的親緣關(guān)系最近(序列相似度98% 以上),將其ITS 區(qū)序列提交Genbank,獲得登錄 號(hào)。結(jié)合形態(tài)學(xué)特征和5.8SrDNA/ITS 區(qū)序列分析結(jié)果,菌株EC102、EC103 鑒定為禾谷鐮刀菌Fusarium graminearum(GeneBank 登陸號(hào)MK243482 和MK243483);菌株EC104 鑒定為間座殼屬Diaporthesp(GeneBank 登陸號(hào)MK243484);菌株EC105 鑒定為鏈格孢屬Alternaria alternata(GeneBank 登陸號(hào)MK243485);菌株 EC107 鑒定為層生鐮刀菌Fusarium proliferatum(GeneBank 登陸號(hào)MK243486);菌株EC108 鑒定為葡萄座腔菌屬小新殼梭孢Neofusicoccum parvum(GeneBank 登陸號(hào)MK243487);菌株EC109 鑒定為細(xì)極鏈格孢Alternaria tenuissima(GeneBank 登陸號(hào)MK243488);菌株 EC111 鑒定為首都葉點(diǎn)霉屬Phyllosticta capitalensis(GeneBank 登陸號(hào)MK243489)。
表1 內(nèi)生真菌表型鑒定Tab.1 Phenotype identification of entophytic fungi
圖2 內(nèi)生真菌18S rRNA 序列系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.2 Phylognetic tree of entophytic fungi 18s rRNA sequence
2.2 NRPS 和PKS 基因分析 華澤蘭內(nèi)生菌株的NRPS 和PKS 基因擴(kuò)增電泳圖見圖3,可見產(chǎn)物條帶在600~700 bp 左右。本研究共得到了3 個(gè)NRPS 基因片段,占總量的37.5%;1 個(gè)PKS 基因片段,占總量的12.5%。將測(cè)序得到的NRPS 和PKS 基因片段用BLAST 比對(duì),結(jié)果見表2,可知NRPS 片段與GenBank 中已知NRPS 序列的相似度并不高,僅為70%~83%,表明對(duì)分離到8 株菌株的NRPS 和PKS 基因研究較少。因此,對(duì)其深入探討將有可能發(fā)現(xiàn)新型聚酮類和非核糖體多肽類化合物。
圖3 部分菌株的PKS 和NRPS 基因擴(kuò)增電泳圖Fig.3 Electrophoretogram of PKS and NRPS gene amplication of some strains
2.3 內(nèi)生真菌代謝產(chǎn)物的抑菌活性 對(duì)分離純化得到的內(nèi)生真菌進(jìn)行液體培養(yǎng),發(fā)酵液經(jīng)乙酸乙酯提取后,分別得到華澤蘭內(nèi)生真菌乙酸乙酯提取物,以金黃色葡萄球菌、大腸桿菌、枯草芽孢桿菌和面包酵母作為指示菌,進(jìn)行抑菌活性測(cè)定,結(jié)果見表3,表明菌株EC102、EC103、EC107、EC108、EC111 對(duì)供試的4 株菌株都有較好的抑菌效果,占總分離菌株的50%;EC104 和EC109 只對(duì)金黃色葡萄球菌有抑菌作用;EC108 和EC109 對(duì)金黃色葡萄球菌的抑菌圈直徑達(dá)到22 mm。
表2 NRPS 和PKS 基因的相似菌株及相似度Tab.2 Similar strains and similarities of NRPS and PKS genes
表3 內(nèi)生真菌發(fā)酵產(chǎn)物的抑菌活性(±s)Tab.3 Antimicrobial activities of fermentation broth of endophytic fungi(±s)
表3 內(nèi)生真菌發(fā)酵產(chǎn)物的抑菌活性(±s)Tab.3 Antimicrobial activities of fermentation broth of endophytic fungi(±s)
2.4 內(nèi)生真菌代謝產(chǎn)物的抗腫瘤活性 將內(nèi)生真菌發(fā)酵液的乙酸乙酯提取物作用對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的人乳腺癌細(xì)胞株MDA-MB-231 進(jìn)行抗腫瘤試驗(yàn),結(jié)果見表4。顯微鏡下發(fā)現(xiàn),在96 孔板培養(yǎng)物中具有抑制效果的細(xì)胞不同程度脫落、變形甚至凋亡;8株菌株的乙酸乙酯提取物對(duì)人乳腺癌細(xì)胞株MDAMB-231 均有不同程度的抗腫瘤活性,其中效果最明顯的是EC102、EC108,其次是EC107、EC109。然后,將EC102、EC107、EC108、EC109 乙酸乙酯提取物作用對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的人乳腺癌細(xì)胞株MCF-7進(jìn)行抗腫瘤實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)它們均有不同程度的抗腫瘤活性,其中效果最好的是EC109。綜合抑菌實(shí)驗(yàn)和抗腫瘤實(shí)驗(yàn)結(jié)果,菌株EC102、EC107、EC108、EC109 的代謝產(chǎn)物同時(shí)具有抑菌和抗腫瘤活性。
表4 內(nèi)生菌發(fā)酵產(chǎn)物對(duì)MDA-MB-231 和MCF-7 的抑制活性(±s)Tab.4 Inhibitory activities of fermentation broth of endophytic fungi to MDA-MB-231 and MCF-7(±s)
表4 內(nèi)生菌發(fā)酵產(chǎn)物對(duì)MDA-MB-231 和MCF-7 的抑制活性(±s)Tab.4 Inhibitory activities of fermentation broth of endophytic fungi to MDA-MB-231 and MCF-7(±s)
藥用植物具有非常豐富的內(nèi)生真菌資源,而澤蘭屬植物內(nèi)生真菌的研究主要集中在入侵植物紫莖澤蘭Eupatorium adenophorum上。本研究首次從華澤蘭中分離得到8 株植物內(nèi)生菌,分析了華澤蘭內(nèi)生真菌的NRPS 和PKS 基因,發(fā)現(xiàn)4 個(gè)NRPS 基因片段和1 個(gè)PKS 基因片段。目前對(duì)藥用植物內(nèi)生真菌PKS 和NRPS 的研究相對(duì)較少,研究華澤蘭中兩者有助于發(fā)現(xiàn)新的聚酮類和非核糖體肽類化合物。
抑菌活性實(shí)驗(yàn)表明,菌株EC102、EC103、EC107、EC108、EC111 對(duì)金黃色葡萄球菌、枯草芽孢桿菌、大腸桿菌、面包酵母都具有很好的抑菌活性;抗腫瘤活性實(shí)驗(yàn)表明,它們對(duì)2 種腫瘤細(xì)胞株均有不同程度的抗腫瘤活性,其中效果最好的是EC102、EC108 乙酸乙酯提取物,兩者代謝產(chǎn)物同時(shí)具有較強(qiáng)的抑菌、體外抗腫瘤作用。研究表明,鐮刀菌屬的次級(jí)代謝產(chǎn)物通常會(huì)具有較好的抑菌活性和抗腫瘤活性[12-15],盧圍等[13]從小花棘豆中分離到鐮刀菌Fusarium proliferatum,能產(chǎn)抗腫瘤活性物質(zhì)苦馬豆 素;鄭里翔等[14]發(fā)現(xiàn),鐮刀菌Fusariumsp.JN 158 所產(chǎn)色素對(duì)MCF-7 乳腺癌細(xì)胞有明顯抑制作用;劉雷等[15]從川麥冬中分離得到鐮刀菌屬內(nèi)生真菌,對(duì)金黃色葡萄球菌、大腸埃希菌等有抑制作用;Ratnaweera 等[16]從仙人掌中分離得到內(nèi)生真菌Fusariumsp 的代謝產(chǎn)物,具有抑菌作用。但有關(guān)葡萄座腔菌屬代謝產(chǎn)物抗菌抗腫瘤的研究報(bào)道較少,故可進(jìn)一步研究菌株EC102、EC108 代謝產(chǎn)物中抗菌、抗腫瘤活性成分的組成及其結(jié)構(gòu),探明這些內(nèi)生真菌是否產(chǎn)生與宿主華澤蘭相同或相似的萜類及黃酮類次級(jí)代謝產(chǎn)物,或是新的活性物質(zhì),以期為抗腫瘤、抗菌藥物的開發(fā)提供參考。