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        貴紫麥1號籽粒形成中花青素合成相關(guān)基因的表達(dá)分析

        2020-01-07 06:13:08李魯華任明見徐如宏
        種子 2019年12期
        關(guān)鍵詞:研究

        李魯華 任明見 徐如宏

        (1.貴州大學(xué)農(nóng)學(xué)院, 貴陽 550025; 2.國家小麥改良中心貴州分中心, 貴陽 550025)

        紫粒小麥(TriticumaestivumL)是一類果皮中富含花青素而使籽粒呈現(xiàn)紫色的小麥品種[1-2],具有很高的營養(yǎng)價值,是育種家非常關(guān)注的種質(zhì)資源之一。研究發(fā)現(xiàn),與紅粒和白粒小麥相比,紫粒小麥具有更高的總酚含量和抗氧化活性[3];而與普通小麥相比,紫粒小麥富含對人體有益的各種微量元素鈣、鐵、鋅、硒等[4]。此外,許多紫粒小麥品種除籽??梢苑e累花青素,其他器官如胚芽鞘、莖、葉鞘、葉耳、葉片、花藥等也含有花青素而呈現(xiàn)紫色或紅色[5-6],可以保護植物免受病原體、食草動物和環(huán)境脅迫的侵害[7]。紫粒小麥中參與花青素生物合成過程的基因可以分為兩大類:調(diào)控基因和結(jié)構(gòu)基因。調(diào)控基因主要調(diào)節(jié)花青素合成基因的活性,編碼轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控花青素的合成,主要包括MYB、bHLH(MYC)和WD 40三類轉(zhuǎn)錄因子[8];結(jié)構(gòu)基因主要編碼直接參與花青素合成的酶,包括PAL(苯丙氨酸解氨酶基因)、CHS(查爾酮合成酶基因)、CHI(查爾酮-黃烷酮異構(gòu)酶基因)、F3’H(黃烷酮-3’-羥化酶基因)、F3H(黃烷酮-3-羥化酶)、DFR(二氫黃酮醇-4-還原酶基因)、ANS(花青素苷合成酶基因)和UF3GT(類黃酮3-O-糖基轉(zhuǎn)移酶)等[9-10]。

        針對紫粒小麥中調(diào)控基因的表達(dá),一些學(xué)者進行了探索。Wang等認(rèn)為,紫粒小麥中調(diào)控花青素生物合成的調(diào)控基因是編碼 MYB 和 bHLH 的轉(zhuǎn)錄因子[11];Shoeva等研究發(fā)現(xiàn),TaPpm1(7 D)(紫色果皮-MYB 1)和TaPpb1(2 AL)(紫色果皮-bHLH 1)能夠調(diào)控紫色籽粒的花青素生物合成[12];劉澤厚等的研究也表明,TaMYB和TabHLH在所有小麥種子發(fā)育過程中呈現(xiàn)相同的表達(dá)模式,在深色小麥中的表達(dá)水平要高于淺色小麥[13]。而對于紫粒小麥中結(jié)構(gòu)基因的表達(dá),Shen等指出,CHS和ANS是公認(rèn)的在花青素合成過程中的重要酶類[14];Trojan等研究也表明,花青素合成結(jié)構(gòu)基因CHS在花青素積累之前就開始表達(dá),其能夠影響花青素的沉積[15];Tereshchenko等發(fā)現(xiàn),ANS在普通小麥有色組織中轉(zhuǎn)錄水平表達(dá)量較高[16]。國內(nèi)的一些學(xué)者對紫粒小麥中結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)也開展了一些研究。李海芬等認(rèn)為,CHS和ANS與花青素的合成密切相關(guān),它們在前期表達(dá)量較低,在種子充實期(R 3時期)表達(dá)量達(dá)到最高,而且在種皮顏色較深的花生品種中高表達(dá)[17];劉澤厚等以紫色小麥PI 534284為材料開展研究,發(fā)現(xiàn)CHS和ANS在不同材料中呈現(xiàn)不同的表達(dá)模式,總體隨著種子發(fā)育時間而表達(dá)量逐步增加[13];董玉秀研究表明,TaCHS和TaANS在授粉后25 d左右表達(dá)量達(dá)到最高,隨后表達(dá)量下降[18];徐熙等研究表明,變紫后小麥籽粒中花青素合成基因CHS和ANS的表達(dá)水平顯著高于變紫前,推測CHS和ANS可能是貴紫麥1號中籽粒變紫的關(guān)鍵基因[19]。

        雖然目前已有不少學(xué)者針對小麥籽粒發(fā)育過程中花青素合成相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控進行了一些探索,但對這些調(diào)控基因和結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)模式還缺乏全面和系統(tǒng)的研究。本研究以穎果含有大量花青素的紫粒小麥品種貴紫麥1號材料,利用qRT-PCR(實時熒光定量PCR)技術(shù)分析GzANS、GzCHS、GzMYB-7D1和GzMYC-2A1在籽粒形成過程中的表達(dá)情況,旨在為進一步研究紫粒小麥花青素合成及其分子機制提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 實驗材料

        實驗材料貴紫麥1號系國家小麥改良中心貴州分中心選育的紫粒小麥品種(審定編號:黔審麥 2015003),其不僅整粒為紫色,而且在產(chǎn)量、品質(zhì)、抗病性(白粉病、條銹病、赤霉病等)、抗旱耐寒、耐瘠薄等方面均表現(xiàn)出較強的優(yōu)勢[22]。將貴紫麥1號種植于貴州大學(xué)教學(xué)實驗場國家小麥改良中心貴州分中心科研基地。田間管理澆水、除草和施肥等按統(tǒng)一方式進行。

        貴紫麥1號于2017年3月25日開花,在開花期選取開花一致的麥穗進行掛牌標(biāo)記并連續(xù)觀察記載。花后第9天開始進行取樣,本次試驗分別采取花后第9、13、22、31天和第39天的籽粒作為不同時期的樣品(圖1),每日各取不同植株的3個麥穗籽粒進行樣品混合,液氮速凍后置于-80 ℃超低溫冰箱保存,用于總RNA提取和花青素的測定。

        1.2 總RNA的提取及cDNA鏈的合成

        將凍存的新鮮小麥籽粒取出,參照EASYspin Plus Complex Plant RNA Kit(艾德萊)試劑盒的說明書提取不同時期籽粒的總RNA, 提取完成后用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測總RNA的完整性;用NanoDrop 2000 spectrophotometer測定其在260/280 nm的吸光值確定其濃度及純度,并測定OD260/230的值。再根據(jù)TUREscript 1st Strand cDNA Synthesis Kit gDNA Eraser(艾德萊)試劑盒合成cDNA第一鏈。

        1.3 花青素的提取和含量測定

        籽??偦ㄇ嗨靥崛〖昂繙y定采用Abdel-Aal等[20]的方法并作一定修改。提取方法中酸化乙醇配比采用酸化乙醇溶液(V無水乙醇∶VHCl(1 mol·L-1)= 13∶5),料液比為1∶8。稱取每個時期的新鮮籽粒0.5 g,用液氮冷凍后研磨成粉末,加入4 mL的75%酸化乙醇與樣品混合均勻, 將裝有料液的EP管平放于振蕩儀中,計算不同時期的花青素含量。式中,ρ為樣品中花青素的質(zhì)量濃度,單位:mg·L-1;v為定容體積,單位:mL;m為測試用樣品質(zhì)量,單位:g。

        圖1 不同時期的貴紫麥1號籽粒顏色的變化

        振動幅數(shù)≤5 mm,轉(zhuǎn)速1 420 r·min-1,常溫振蕩20 min后,6 000 r·min-1離心6 min,取上清液1 mL稀釋至10 mL,用紫外分光光度計在527 nm處測定吸光度值,每個樣品做3次重復(fù)。將矢車菊3-葡糖苷(Cyanidin 3-glucoside)配置成0,1.0,5.0,10.0,20.0,40.0 mg·L-1和60.0 mg·L-1的標(biāo)準(zhǔn)液,測定吸光值后得出標(biāo)準(zhǔn)曲線方程y=0.017 844 5x-0.013 460 4(y為吸光度值;x為濃度,單位 mg·L-1,系數(shù)r2=0.999)。根據(jù)公式

        花青素含量(mg·kg-1)=(ρ×v)/m

        1.4 實時熒光定量PCR分析

        把1.2中反轉(zhuǎn)錄的cDNA稀釋成統(tǒng)一質(zhì)量濃度后作為熒光定量PCR的模板,根據(jù)本實驗室貴紫麥1號轉(zhuǎn)錄組測序得到的基因序列,在其高度保守的區(qū)域利用Primer Premier 6.0設(shè)計熒光定量PCR的引物(表1),引物由上海生物工程股份有限公司合成。采用相對定量方法,以小麥18sRNA為內(nèi)參基因(AY 049040.1),參照TB GreenTMPremix Ex TaqTMⅡ(TAKARA,Japan)試劑盒的說明書,反應(yīng)體系為;TB Green Premix Ex TaqⅡ 12.5μL,上下游引物各1μL,cDNA模板2μL,加水至終體積25μL。采用2步法反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性 30 s;95 ℃變性5 s,53~62.5 ℃退火30 s,40個循環(huán);3次技術(shù)性重復(fù),采用2-ΔΔCt分析方法計算基因的相對表達(dá)量。

        1.5 數(shù)據(jù)分析

        利用Excel 2007軟件進行數(shù)據(jù)整理,采用SPSS Statistics 22.0軟件中(IBM,USA)的單因素方差分析數(shù)學(xué)模型中的 Duncan方法(p<0.05)進行數(shù)據(jù)分析。利用 Photoshop CS 6軟件和 Excel 2007軟件進行數(shù)據(jù)作圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 RNA及cDNA的純度鑒定結(jié)果

        采用1%的瓊脂糖電泳檢測RNA的完整性,電泳結(jié)果表明28 s和18 s條帶清晰,說明RNA無降解,完整性較好(圖2);測量OD260/280、OD260/230的值均在1.8~2.0之間,說明RNA無污染,濃度均在1 000 μg·mL-1左右;反轉(zhuǎn)錄的cDNA用內(nèi)參引物檢測,條帶清晰,可用作熒光定量PCR的模板。

        表1 熒光定量PCR引物序列

        基因名稱引物序列(5′-3′)退火溫度/℃GzMYB-7D1_F5′-ACGAGCAAGGAGGACGAGA-3′56GzMYB-7D1_R5′-GTGGAGCCTGACGATGAGC-3′56GzMYC-2A1_F5′-GTGCCTATCCGACGACAAC-3′53GzMYC-2A1_R5′-ATCTCAAAACACCCACCCA-3′53GzANS-F5′-GATCAACAGGAGGAGGAG-3′56GzANS-R5′-CCTTCTTCACCACCTTGT-3′56GzCHS-F5′-CAACCGAGCTTTTACAG-3′58GzCHS-R5′-ATCACCATTTGCTTTCC-3′5818S-F5′-TCGGGATCGGAGTAATGA-3′50~62.518S-R5′-TTCGCAGTTGTTCGTCTT-3′50~62.5

        圖2 不同時期的總RNA電泳結(jié)果

        2.2 籽粒發(fā)育不同時期的花青素含量變化

        貴紫麥1號不同發(fā)育時期的籽粒表型變化見圖1,其果皮最初為白色,隨著籽粒的生長發(fā)育而逐漸變綠后變紫。觀察發(fā)現(xiàn)籽粒在花后第22天時變綠且飽滿,在花后第31天時籽粒有一半變紫且在花后第39天時全部變紫。對貴紫麥1號不同時期的籽?;ㄇ嗨剡M行了測定,結(jié)果見圖3?;ㄇ嗨氐暮繌淖蚜_€沒變紫就有少量積累,說明籽粒一旦灌漿就不斷開始合成花青素,隨著籽粒顏色不斷變紫而遞增,在花后第31天時花青素的含量迅速上升并在花后第39天時達(dá)到最高,這時的花青素含量顯著高于前期的積累量,由此可以看出花青素在籽粒變紫之前的積累是很緩慢的,一旦籽粒變紫花青素的含量則迅速上升。

        注:小寫字母代表差異顯著,相同的字母表示差異不顯著,不同的字母表示差異顯著(p<0.05)。下同。圖3 貴紫麥1號在不同時期的花青素含量變化

        2.3 不同時期花青素合成相關(guān)基因的表達(dá)分析

        2.3.1GzANS和GzCHS基因的表達(dá)分析

        通過對貴紫麥1號中GzANS和GzCHS在不同時期籽粒的qRT-PCR檢測分析,結(jié)果見圖4。GzANS和GzCHS的相對表達(dá)量在不同發(fā)育時期均基本呈現(xiàn)出相同的先升高后降低的變化趨勢,均在花后第22天達(dá)到最大值。與花后第9天的相對表達(dá)量相比,GzANS在花后第13天提高了0.8倍,花后第22天時提高8倍,花后第31天提高5倍,花后第39天提高1.5倍,說明GzANS在不同時期的相對表達(dá)量都有提高,而在花后第22天和第31天的相對表達(dá)量顯著高于其他時期。而GzCHS的相對表達(dá)量在花后第39天最低,在花后第22天最高;與花后第9天相比,GzCHS在花后第13天的相對表達(dá)量提高了0.7倍,第22天提高2.1倍,第31天提高1.2倍,但花后第39天下降了0.1倍。

        結(jié)果表明,GzANS和GzCHS的相對表達(dá)量變化趨勢一致,但GzCHS的相對表達(dá)量比GzANS要低3倍。

        2.3.2GzMYB-7D1和GzMYC-2A1的表達(dá)分析

        通過對貴紫麥1號中GzMYB-7D1和GzMYC-2A1在不同時期的qRT-PCR檢測分析,結(jié)果見圖5。GzMYB-7D1和GzMYC-2A1的相對表達(dá)量在不同發(fā)育時期均基本呈現(xiàn)出相同的“上升—下降—再上升—再下降”的變化趨勢。

        圖4 GzANS和GzCHS在不同時期的相對表達(dá)量

        圖5 GzMYB-7D1和GzMYC-2A1在不同時期的相對表達(dá)量

        GzMYB-7D1的相對表達(dá)量在花后第39天時最低,在第31天時最高;與花后第9天的相比,GzMYB-7D1在花后第13天的相對表達(dá)量下降了0.6倍,第22天提高0.7倍,第31天提高1倍,而到第39天下降0.8倍,GzMYB-7D1的相對表達(dá)量在花后第22天和第31天時顯著高于其他時期。GzMYC-2A1的相對表達(dá)量在花后第22天時最低,在第31天時最高;與花后第9天的相比,只在第31天表達(dá)量有所提高,在第13、22天和第39天時的表達(dá)量都分別下降了0.2、0.4倍和0.3倍。

        結(jié)果表明,GzMYB-7D1和GzMYC-2A1的相對表達(dá)量雖然呈現(xiàn)出相同的上升-下降-再上升-再下降變化趨勢,但GzMYB-7D1的相對表達(dá)量比GzMYC-2A1要高出1倍,二者在花后第22天時期的變化趨勢不同,GzMYB-7D1是上升趨勢,而GzMYC-2A1還是呈下降的趨勢。

        3 討 論

        在本研究中,GzANS和GzCHS的相對表達(dá)量均在發(fā)育中后期較早期表達(dá)量髙,到花后第22天時達(dá)到最大值,這與李海芬[17]、劉澤厚[13]和董玉秀[18]等的研究結(jié)果基本一致。另外,從GzANS和GzCHS的相對表達(dá)量水平來看,GzANS在貴紫麥1號籽粒形成中后期的表達(dá)水平比GzCHS高許多。由于ANS能催化無色花青素轉(zhuǎn)化為有色花青素,其相對表達(dá)量的大量增加很可能促進了有色花青素產(chǎn)物的積累,有利于花青素的合成。

        研究表明,不同組織中花青素的產(chǎn)生往往受bHLH(MYC)或MYB蛋白的組織特異性表達(dá)調(diào)控[21-22]。Jiang Wenhui 等研究發(fā)現(xiàn),TaPpb1的表達(dá)水平逐漸升高,在花后第22天達(dá)到最高值,隨后略有下降,TaPpm1的表達(dá)水平也逐漸升高,在花后第28天達(dá)到最高值[23]。本研究中,GzMYB-7D1的相對表達(dá)量在花后第22天開始上升,在第31天達(dá)到最高值,與Jiang Wenhui等[23]的研究結(jié)果基本一致。但GzMYC-2A1的相對表達(dá)量在花后第22天時下降,到第31天又升高并達(dá)到最高值,這與Jiang Wenhui等[23]的研究結(jié)果不同。這可能是研究材料不同的原因,也有可能是品種在不同環(huán)境下基因表達(dá)差異所致。從本研究結(jié)果看,GzMYC-2A1在籽粒形成早期和后期有較高表達(dá),中期表達(dá)水平相對較低,推測其在種子發(fā)育早期的表達(dá)水平高可能是由于參與調(diào)節(jié)類黃酮合成途徑上游基因的表達(dá),利用底物進行生物合成,而后期的表達(dá)高可能有利于色素物質(zhì)的合成及種子顏色的形成。

        對比不同發(fā)育時期貴紫麥1號籽?;ㄇ嗨睾康淖兓虶zANS、GzCHS、GzMYB-7D1和GzMYC-2A1四個基因表達(dá)量的變化發(fā)現(xiàn),GzANS和GzCHS的表達(dá)高峰是早于花青素含量的,這與Trojan等[15]的研究結(jié)果相同,表明這二個結(jié)構(gòu)基因提前表達(dá)并轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的活性酶,為花青素的積累作準(zhǔn)備,進一步證明GzCHS和GzANS可能是促使籽粒著色的最重要結(jié)構(gòu)基因之一。同樣,GzMYB-7D1和GzMYC-2A1的表達(dá)高峰也是略早于花青素含量的,特別是GzMYB-7D1的相對表達(dá)量在花后第22天和第31天時顯著高于其他時期,說明其對籽粒形成過程中花青素的合成起著重要的調(diào)控作用,在以后的研究中應(yīng)重點關(guān)注和開展研究。

        植物花青素的合成代謝具有復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機制,許多調(diào)控基因和結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)模式和相關(guān)轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制還需要進一步探索,且不同的物種也可能會存在部分甚至較大差異,需要進一步開展研究,以深入了解紫粒小麥花青素合成及其分子機制。

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