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        基于多元非線性回歸和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的長(zhǎng)春花形態(tài)指標(biāo)生長(zhǎng)模型的比較

        2020-01-02 06:49:08盈,趙
        關(guān)鍵詞:長(zhǎng)春花冠幅花苞

        劉 盈,趙 方

        (北京林業(yè)大學(xué)信息學(xué)院,北京100083)

        園林苗圃是繁育和培育苗木的基地,苗木作為城市綠地系統(tǒng)的支撐,對(duì)于調(diào)節(jié)氣候、保持水土起到了不可替代的作用,也有利于人們的身心健康[1]。長(zhǎng)春花綠化和觀賞效果極佳,醫(yī)學(xué)上具有抗腫瘤、降血壓、降血糖、利尿等作用,常作為城市綠化和家庭觀賞的花卉[2-3],構(gòu)建長(zhǎng)春花生長(zhǎng)模型,對(duì)長(zhǎng)春花的科學(xué)培育和精細(xì)化管理具有重要意義。

        國(guó)內(nèi)近年來(lái)主要利用Logistic曲線方程對(duì)林木苗期和果實(shí)生長(zhǎng)量動(dòng)態(tài)進(jìn)行模擬[4]。于志民等[5]通過(guò)對(duì)圓齒野鴉椿一年生苗的生長(zhǎng)狀況進(jìn)行持續(xù)觀測(cè),利用Logistic模型對(duì)幼苗苗高、地徑年生長(zhǎng)規(guī)律進(jìn)行擬合與分析。朱鑫[6]利用Logistic模型對(duì)小白菜株高、葉片數(shù)、葉長(zhǎng)、葉寬等進(jìn)行了模擬。在利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)植物長(zhǎng)勢(shì)的領(lǐng)域,張瑜等[7]提出根據(jù)環(huán)境因子預(yù)測(cè)線椒株高的方法,相關(guān)系數(shù)可達(dá)0.996。王軼夫等[8]探索BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型在立木生物量估測(cè)上的適用性,發(fā)現(xiàn)該模型能夠一次性地引入多個(gè)解釋變量,同時(shí)估測(cè)多個(gè)量,從而簡(jiǎn)化了生物量建模和估測(cè)工作,對(duì)實(shí)際生產(chǎn)具有一定的意義。

        本研究引入自制的小型植物生長(zhǎng)箱,配置傳感器等物聯(lián)網(wǎng)設(shè)備,對(duì)長(zhǎng)春花的生長(zhǎng)環(huán)境進(jìn)行實(shí)時(shí)的監(jiān)測(cè)、記錄,旨在顛覆傳統(tǒng)試驗(yàn)中大棚栽培的方式,為實(shí)現(xiàn)智慧苗圃的信息化管理提供技術(shù)支撐。此外,本研究在傳統(tǒng)Logistic模型的基礎(chǔ)上加入環(huán)境因子的影響,創(chuàng)造性地引入BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),旨在明確長(zhǎng)春花的外觀品質(zhì)指標(biāo)(株高、單株葉片數(shù)、冠幅、單株花苞數(shù))與發(fā)育時(shí)間和環(huán)境因子(溫度、土壤含水量、光照)的關(guān)系,合理構(gòu)建生長(zhǎng)模型,預(yù)測(cè)長(zhǎng)春花的長(zhǎng)勢(shì),以期為智慧苗圃中其他植物的培育奠定堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)方法

        試驗(yàn)在北京林業(yè)大學(xué)苗圃(北緯116.344°,東經(jīng)40.014°)的溫室內(nèi)進(jìn)行,同期進(jìn)行兩組相同的試驗(yàn),所得數(shù)據(jù)分別作為訓(xùn)練集和測(cè)試集。供試品種為盆栽白長(zhǎng)春花,土壤栽培。苗圃內(nèi)擺放兩個(gè)自制的植物生長(zhǎng)箱,生長(zhǎng)箱整體由透明無(wú)色玻璃制成,長(zhǎng)3 m,寬2 m,高1.5 m,為長(zhǎng)春花的生長(zhǎng)發(fā)育提供一個(gè)相對(duì)密閉的空間;箱內(nèi)配置傳感器等物聯(lián)網(wǎng)設(shè)備,對(duì)箱內(nèi)環(huán)境因子進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控并記錄。箱內(nèi)的環(huán)境受苗圃溫室內(nèi)光照、溫度及人工澆水的影響,目前尚不可控,在后續(xù)的研究中,將引入植物燈、小風(fēng)扇、加熱棒、噴水裝置等設(shè)備實(shí)現(xiàn)箱內(nèi)環(huán)境的自動(dòng)控制。

        試驗(yàn)1于2017年9月底在苗圃開(kāi)始播種,2017年11月1日,選取長(zhǎng)勢(shì)一致、發(fā)育健康的60盆幼苗,移至植物生長(zhǎng)箱內(nèi)培育。行距為15 cm,株距為10 cm,適時(shí)澆水、打頂。每5 d測(cè)量一次,每次測(cè)量箱內(nèi)60株長(zhǎng)春花的株高、單株葉片數(shù)兩個(gè)指標(biāo);在2017年12月中旬,植株開(kāi)始變豐滿時(shí),增加冠幅指標(biāo);在2017年12月底,花苞開(kāi)始冒出時(shí),增加單株花苞數(shù)指標(biāo),直至2018年3月底,試驗(yàn)結(jié)束。試驗(yàn)2做相同的處理。

        為了增強(qiáng)模型擬合效果,剔除植物生長(zhǎng)箱內(nèi)長(zhǎng)勢(shì)過(guò)差的10株,以剩余50株長(zhǎng)春花五個(gè)月以來(lái)的測(cè)量數(shù)據(jù)來(lái)擬合生長(zhǎng)模型。試驗(yàn)1所得數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練集,利用多元非線性回歸分析和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分別擬合生長(zhǎng)模型;試驗(yàn)2所得數(shù)據(jù)作為測(cè)試集,用于檢測(cè)模型的預(yù)測(cè)效果。分析比較兩種模型的性能。

        1.2 試驗(yàn)數(shù)據(jù)采集

        1.2.1 環(huán)境因子的采集

        植物生長(zhǎng)箱內(nèi)的傳感器將采集到的數(shù)據(jù)發(fā)送到匯聚節(jié)點(diǎn),匯聚節(jié)點(diǎn)通過(guò)串口線傳至電腦數(shù)據(jù)庫(kù)完成存儲(chǔ),設(shè)定為每小時(shí)采集并存儲(chǔ)一次。

        光照強(qiáng)度:通過(guò)測(cè)量光敏電阻阻值來(lái)獲取,由公式(1)計(jì)算得出光照強(qiáng)度,設(shè)測(cè)量到的光敏電阻阻值為HM,則:

        溫度:通過(guò)單片機(jī)上DHT11溫濕度傳感器芯片得到溫度值。

        土壤含水量:采用LM393比較器芯片,通過(guò)獲得該芯片的模擬量,轉(zhuǎn)換成數(shù)字量后獲得數(shù)值。設(shè)獲取的土壤含水量值是Humidity,則:

        1.2.2 長(zhǎng)春花外觀品質(zhì)指標(biāo)的采集

        株高、冠幅的測(cè)量值精確到0.01 cm,單株葉片數(shù)、單株花苞數(shù)采用人工計(jì)數(shù)的方法。具體測(cè)量方法為:

        株高:用高度游標(biāo)卡尺測(cè)量植株地上部分的根部到主莖頂部的距離。

        冠幅:用游標(biāo)卡尺測(cè)量植株最大幅度之間的直徑。

        單株葉片數(shù):對(duì)葉面積大于1 cm2的葉片進(jìn)行人工計(jì)數(shù)。

        單株花苞數(shù):對(duì)花苞進(jìn)行人工計(jì)數(shù)。

        1.3 試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理

        環(huán)境因子數(shù)據(jù)做如下處理:

        平均溫度:從發(fā)育開(kāi)始的時(shí)刻到該條記錄產(chǎn)生的時(shí)刻,計(jì)算這段時(shí)間內(nèi)的溫度平均值。

        平均土壤含水量、平均光照強(qiáng)度:處理方式同平均溫度。

        長(zhǎng)春花數(shù)據(jù)集展示如下:

        數(shù)據(jù)記錄50株樣本從發(fā)育35 d至發(fā)育180 d的環(huán)境因子和外觀指標(biāo)的情況(表1)。

        表1 長(zhǎng)春花數(shù)據(jù)集Table 1 Data set of Catharanthus roseus

        2 長(zhǎng)春花生長(zhǎng)模型的建立

        2.1 多元非線性回歸模型

        多元非線性回歸可以研究一個(gè)隨機(jī)變量或因變量Y與一個(gè)或多個(gè)自變量(X1—Xn)之間的非線性關(guān)系,并利用統(tǒng)計(jì)分析方法和函數(shù)對(duì)這種關(guān)系進(jìn)行分析解讀和形式化描述。最常用的參數(shù)估計(jì)方法是非線性的最小二乘法,該方法使用線性函數(shù)來(lái)逼近非線性函數(shù),并且通過(guò)不斷迭代這個(gè)過(guò)程來(lái)得到參數(shù)的最優(yōu)解[9]。

        多元非線性回歸分析模型的形式化描述為:

        其中,β是常數(shù)項(xiàng),表示所有自變量為0時(shí)Y的總體平均值的估計(jì)值,β1—βn表示回歸系數(shù)。

        其殘差平方和函數(shù)為:

        用f(Xi,β)的一階Taylor展開(kāi)近似代替f(Xi,β),得到:

        由于對(duì)于給定的初值β1(β1)是確定可計(jì)算的,于是S(β)所表達(dá)的殘差平方正是線性回歸Yi的殘差平方和。由最小二乘估計(jì)得到遞推關(guān)系:

        不斷迭代,可得序列β1,β2,β3,…,βn,…。

        2.1.1 株高生長(zhǎng)模型的擬合

        圖1散點(diǎn)圖呈現(xiàn)的是每個(gè)時(shí)間點(diǎn)對(duì)應(yīng)的50株長(zhǎng)春花的不同指標(biāo)的值,根據(jù)散點(diǎn)圖和前期的調(diào)研,發(fā)現(xiàn)株高生長(zhǎng)規(guī)律符合“慢-快-慢”的“S”型生長(zhǎng)曲線[10-11],符合Logistic模型的形式。本試驗(yàn)根據(jù)株高與環(huán)境因子的相關(guān)分析,適當(dāng)?shù)丶尤肓谁h(huán)境因子的影響。將株高作為回歸分析的目標(biāo)變量,記為H。將發(fā)育時(shí)間、平均溫度、平均土壤含水量、平均光照強(qiáng)度作為自變量,分別記為Ti、Te、Hu、Li,所采用的曲線方程為:

        式(7)中,k、a、b、e、f、g為待定系數(shù)。

        2.1.2 單株葉片數(shù)生長(zhǎng)模型的擬合

        隨時(shí)間的增長(zhǎng)呈指數(shù)型增加。經(jīng)過(guò)相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn),葉片數(shù)與發(fā)育時(shí)間的相關(guān)性最強(qiáng),相關(guān)系數(shù)為0.85,與其他環(huán)境因子的相關(guān)性較弱,相關(guān)系數(shù)均小于0.5,所以在模型中剔除環(huán)境因子,所采用的曲線方程為:

        式(8)中,a、b、c、d為待定系數(shù)。

        2.1.3 冠幅生長(zhǎng)模型的擬合

        冠幅的增長(zhǎng)表現(xiàn)為開(kāi)始緩慢,隨后迅速加快,近似線性增長(zhǎng),到達(dá)一定的限度后,生長(zhǎng)速度放緩。根據(jù)相關(guān)分析,在模型優(yōu)化過(guò)程中加入環(huán)境因子的影響,所采用的logistic曲線形式為:

        式(9)中,k、a、b、c、d、e為待定參數(shù)。

        2.1.4 單株花苞數(shù)生長(zhǎng)模型的擬合

        隨時(shí)間的呈指數(shù)型增長(zhǎng),根據(jù)相關(guān)分析,花苞數(shù)與發(fā)育時(shí)間的相關(guān)性最強(qiáng),相關(guān)系數(shù)為0.87,與其他環(huán)境因子的相關(guān)系數(shù)均小于0.5,所以在模型中剔除環(huán)境因子。采用的模型形式為:

        式(10)中,a、b、c、d為待定參數(shù)。

        圖1 長(zhǎng)春花株高、單株葉片數(shù)、冠幅、單株花苞數(shù)與發(fā)育時(shí)間的關(guān)系Fig.1 Relationship between p lant height,leaf number,crown w idth,bud number and the grow th time of Catharanthus roseus

        2.2 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型

        BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)是在人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,通過(guò)按誤差反向傳播從而不斷更新神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中各層的權(quán)值的多層前饋網(wǎng)絡(luò)[12]。其核心算法思想是:利用梯度下降法,不斷更新網(wǎng)絡(luò)中的各個(gè)權(quán)值,直至將輸出值與期望值之間的差距減至最小。BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法分為前向傳播和反向傳播兩個(gè)階段[13]。

        2.2.1 前向傳播

        將前一層的神經(jīng)元序號(hào)記為i,當(dāng)前層神經(jīng)元的序號(hào)記為j,每一層神經(jīng)元的輸出如式(11):其中,ylj為第l層的第j個(gè)神經(jīng)元的輸出值,f為激活函數(shù),wij表示前一層(第l-1層)的第i個(gè)神經(jīng)元節(jié)點(diǎn)與當(dāng)前層(第l層)的第j個(gè)神經(jīng)元節(jié)點(diǎn)之間連接線的權(quán)值。bj表示偏置。

        2.2.2 反向傳播

        輸出值與期望值之間距離為:

        反向傳播過(guò)程中權(quán)值的更新過(guò)程和偏置的更新過(guò)程如下:

        其中,η表示學(xué)習(xí)率,代表權(quán)值更新的速率。

        此外,訓(xùn)練集數(shù)據(jù)中的噪聲可能會(huì)造成大量增加模型訓(xùn)練次數(shù)、無(wú)法收斂等問(wèn)題[14]。采用min-max標(biāo)準(zhǔn)化方法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化處理,將輸入輸出數(shù)據(jù)映射到[0,1]區(qū)間內(nèi):

        其實(shí),xmax為輸入數(shù)據(jù)的最大值,xmin為輸入數(shù)據(jù)的最小值。

        預(yù)處理之后,建立BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,確定輸入層為4個(gè)神經(jīng)元,即發(fā)育時(shí)間、平均溫度、平均土壤含水量、平均光照強(qiáng)度,隱含層為8層,輸出層節(jié)點(diǎn)個(gè)數(shù)為1,即外觀品質(zhì)指標(biāo)其中之一[15];激勵(lì)函數(shù)選用Sigmoid函數(shù);最后,將訓(xùn)練集數(shù)據(jù)輸入BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行仿真訓(xùn)練。學(xué)習(xí)速率選為lr=0.035,網(wǎng)絡(luò)閾值和b和初始權(quán)值w利用random()選為隨機(jī)數(shù)。學(xué)習(xí)最大次數(shù)定為20 000。

        本試驗(yàn)利用環(huán)境因子作為神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的輸入樣本,通過(guò)訓(xùn)練來(lái)模擬長(zhǎng)春花生長(zhǎng),同時(shí),訓(xùn)練得到的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)也可用于長(zhǎng)春花生長(zhǎng)的預(yù)測(cè)。

        3 長(zhǎng)春花生長(zhǎng)模型擬合與分析

        通過(guò)決定系數(shù)(R2)、回歸估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)誤差(RMSE)和相對(duì)誤差(RE)對(duì)長(zhǎng)春花苗期的株高生長(zhǎng)模型進(jìn)行擬合效果檢驗(yàn)[16]。

        式(16)、(17)、(18)、(19)中,^yi為預(yù)測(cè)的長(zhǎng)春花的外觀品質(zhì)指標(biāo),y-為該每個(gè)指標(biāo)的平均值,yi為每個(gè)指標(biāo)的實(shí)測(cè)值,n為樣本容量。

        決定系數(shù)R2越大,表明觀察點(diǎn)在回歸直線附近越密集,自變量對(duì)因變量的解釋程度就越高。回歸估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)誤差RMSE越小,表明預(yù)測(cè)值與實(shí)測(cè)值之間的偏差越小,模型的擬合效果越好。相對(duì)誤差RE表示絕對(duì)誤差在真值中所占的百分比,RE越小,模型可信度越高[17]。

        3.1 基于多元非線性回歸的長(zhǎng)春花生長(zhǎng)模型分析

        用試驗(yàn)2所得數(shù)據(jù)集(即測(cè)試集)對(duì)模型進(jìn)行檢驗(yàn)。模型的擬合結(jié)果及檢驗(yàn)結(jié)果如表2所示。其中,株高、冠幅生長(zhǎng)模型標(biāo)準(zhǔn)誤差RMSE分別為1.040 cm、0.456 cm,相對(duì)誤差分別為6.552%、3.813%,預(yù)測(cè)精度可以達(dá)到90%以上;單株葉片數(shù)、單株花苞數(shù)模型標(biāo)準(zhǔn)誤差RMSE分別為3.477、1.860,相對(duì)誤差分別為19.916%、24.084%,預(yù)測(cè)精度達(dá)75%以上,模型比較真實(shí)地反映了發(fā)育時(shí)間和環(huán)境因子對(duì)長(zhǎng)春花植株外觀品質(zhì)的影響,說(shuō)明利用多元非線性回歸的方法來(lái)擬合株高是可行的。

        表2 長(zhǎng)春花外觀品質(zhì)的擬合結(jié)果及誤差分析Table 2 The fitting result and error analysis of Catharanthus roseus’s appearance quality

        比較試驗(yàn)2的實(shí)測(cè)值和預(yù)測(cè)值,畫(huà)出散點(diǎn)圖。圖2的結(jié)果表明,株高、單株葉片數(shù)、冠幅、單株花苞數(shù)的(實(shí)測(cè)值,預(yù)測(cè)值)數(shù)據(jù)點(diǎn)集中分布在1∶1線附近,說(shuō)明實(shí)測(cè)值和預(yù)測(cè)值較接近,模型達(dá)到了較好的預(yù)測(cè)結(jié)果。

        圖2 長(zhǎng)春花株高、單株葉片數(shù)、冠幅、單株花苞數(shù)預(yù)測(cè)值與實(shí)測(cè)值的比較Fig.2 Comparison between the predicted and observed plant height,leaf number,crown width,bud number of Catharanthus roseus

        3.2 基于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的長(zhǎng)春花生長(zhǎng)模型分析

        使用Python在Win10下PyCharm平臺(tái)上分別針對(duì)株高、單株葉片數(shù)、冠幅、單株花苞數(shù),對(duì)訓(xùn)練集進(jìn)行BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練。網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練目標(biāo)為總均方差SSE小于0.025,株高歷史誤差曲線示例如圖3所示。

        對(duì)每一株長(zhǎng)春花的株高、單株葉片數(shù)、冠幅、單株花苞數(shù)建立BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),同時(shí),程序輸出誤差評(píng)價(jià)指標(biāo)R2、MS、RMSE、RE(表3)。

        圖3 株高BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)歷史誤差曲線示例Fig.3 Exam p le diagram of the history error curve of the BP neural network of p lant height

        表3 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法的誤差分析表Table3 The error analysis table of BP neural network method

        對(duì)于外觀品質(zhì)的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)仿真R2均大于0.9,表明BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)株高和冠幅的擬合優(yōu)度很大;MSE為0.0011—1.7868,RMSE為0.0331—1.4857,RE為0.8544%—18.4848%,表明BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的擬合偏差程度很小,模型可靠度很高。綜上所述,利用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)長(zhǎng)春花生長(zhǎng)模型的仿真取得了良好和可靠的成果。

        4 兩種方法的對(duì)比分析

        長(zhǎng)春花的外觀品質(zhì)受到與自身遺傳基因和環(huán)境因子的綜合影響[18-19]。此外,試驗(yàn)采用的環(huán)境因子也是智慧苗圃中容易調(diào)控的量,因此,以本試驗(yàn)具有重大的實(shí)際意義[20]。

        本試驗(yàn)分別采用多元非線性回歸和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的方法,建立了長(zhǎng)春花外觀品質(zhì)生長(zhǎng)模型。模型通過(guò)輸入發(fā)育時(shí)間和環(huán)境因子,可以較好地預(yù)測(cè)長(zhǎng)春花外觀品質(zhì)的各項(xiàng)指標(biāo),有利于對(duì)長(zhǎng)春花的生長(zhǎng)實(shí)現(xiàn)有效的控制。模型效果對(duì)比:(1)多元非線性回歸方法的決定系數(shù)R2為0.824—0.875,已經(jīng)達(dá)到顯著相關(guān);BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的R2為0.9321—0.9987,自變量和因變量的相關(guān)性更顯著,擬合優(yōu)度更高;(2)多元非線性回歸的RMSE為0.456—12.090,BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的RMSE為0.0331—1.4857,后者RMSE更小,表明預(yù)測(cè)值與實(shí)測(cè)值的偏差更??;(3)多元非線性回歸的RE為3.813%—24.084%,BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的RE為0.8544%—18.4848%,后者RE更小,表明絕對(duì)誤差在真值中所占百分比更小,模型可信度更高。綜上所述,兩種方法都有較好的擬合效果和預(yù)測(cè)能力,但BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的擬合效果更為顯著,相對(duì)誤差更小,擬合精度更高,能夠更好展示長(zhǎng)春花生長(zhǎng)周期內(nèi)的生長(zhǎng)規(guī)律。

        本研究所得長(zhǎng)春花生長(zhǎng)模型是在較適宜的環(huán)境中建立的,更適應(yīng)于植物生長(zhǎng)箱內(nèi)的實(shí)際培育。參數(shù)較少而且容易獲取、預(yù)測(cè)精度較高,能為預(yù)測(cè)長(zhǎng)春花的長(zhǎng)勢(shì)提供可靠依據(jù),同時(shí),在植物生長(zhǎng)箱中,可以根據(jù)生長(zhǎng)模型進(jìn)行人工設(shè)置,利用物聯(lián)網(wǎng)設(shè)備自動(dòng)調(diào)控環(huán)境因子的值,這也為長(zhǎng)春花形態(tài)指標(biāo)的提升提供了決策支持,為日后智慧苗圃及智慧大棚植物的生長(zhǎng)培育奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

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