伍玲麗,楊玉蓉,張 麗,劉小紅,司友斌
(安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)資源與環(huán)境學(xué)院,農(nóng)田生態(tài)保育與污染防控安徽省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,合肥230036)
納米銀(AgNP)與傳統(tǒng)的銀顆粒相比具有耐高溫、電導(dǎo)率高和電阻率相對(duì)較低等理化性質(zhì)以及抗菌特性,因此在食品包裝、個(gè)人護(hù)理品和其他產(chǎn)品中得到了廣泛的應(yīng)用[1-2]。據(jù)統(tǒng)計(jì),目前全球?qū)gNP 的消費(fèi)高達(dá)5.5~550 t·a-1[3]。然而,AgNP 的廣泛使用增加了其釋放到環(huán)境中的風(fēng)險(xiǎn),環(huán)境中的AgNP 顆粒通過大氣沉降、污水灌溉、垃圾填埋等方式最終匯集于土壤,預(yù)測AgNP在土壤中每年可增加1.2~2.3 ng·kg-1[4]。美國EPA 調(diào)查推測,10 年后農(nóng)田土壤中AgNP 可累積到10 mg·kg-1[5]。從2013 年開始,AgNP 的環(huán)境毒性引起了廣泛的關(guān)注[6]。研究表明AgNP 對(duì)土壤微生物具有毒害作用[7-9]。
氮循環(huán)是影響陸地生態(tài)系統(tǒng)生產(chǎn)力可持續(xù)性發(fā)展的重要物質(zhì)循環(huán)[10]。其中,固氮微生物在調(diào)節(jié)土壤氮素轉(zhuǎn)化中起著關(guān)鍵作用。生物固氮是陸地及其他環(huán)境中氮素最主要的天然來源[11],生態(tài)系統(tǒng)中絕大多數(shù)生物可利用形式的氮主要來源于土壤固氮微生物群落(如藍(lán)細(xì)菌、假單胞菌、固氮螺菌和固氮菌)的生物固氮作用[12]。它們通過固氮酶將大氣N2轉(zhuǎn)化為植物有效氮,從而為生態(tài)系統(tǒng)提供額外的氮源[13]。其中nifH基因編碼的固氮酶普遍存在于固氮微生物中[14]。編碼這種酶的nifH基因在細(xì)菌和古細(xì)菌結(jié)構(gòu)域中高度保守,可為研究固氮菌群落提供依據(jù),因此已被廣泛用作研究固氮微生物多樣性和豐度的遺傳標(biāo)記物[15]。
AgNP的毒性機(jī)制主要有:與細(xì)胞膜相互作用,損傷細(xì)胞結(jié)構(gòu);造成細(xì)胞內(nèi)活性氧(ROS)累積,導(dǎo)致細(xì)胞氧化損傷;AgNP或釋放的Ag+穿透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部,破壞DNA復(fù)制等[16-19]。但關(guān)于AgNP釋放的Ag+的毒性大小一直存在爭議。前期研究發(fā)現(xiàn),AgNP 和Ag+對(duì)土壤中硝化微生物及其氨氧化速率都有負(fù)面影響,但Ag+的影響程度比AgNP 低[20]。有研究表明Ag+的毒性具有即時(shí)性,而AgNP 的毒性具有長期性[21]。目前,關(guān)于AgNP 對(duì)土壤固氮微生物的影響研究較少,尤其是自生固氮作用。自生固氮菌容易受到溫度、水分和養(yǎng)分等環(huán)境因素的影響。此外,重金屬也會(huì)造成固氮菌群數(shù)量的改變[22]。Kumar等[23]發(fā)現(xiàn)AgNP、納米銅(CuNP)、納米硅(SiNP)對(duì)極地土壤微生物均產(chǎn)生毒害作用,其中AgNP 能顯著抑制固氮菌的活性。Arnaout 等[24]研究也證實(shí)AgNP 可擾亂土壤中的氮循環(huán)。釋放到土壤環(huán)境中的AgNP 可能對(duì)土壤固氮產(chǎn)生負(fù)面作用,因此有必要研究AgNP 對(duì)土壤固氮微生物及固氮作用的影響。
本文針對(duì)AgNP 的環(huán)境暴露,利用高通量測序技術(shù)比較了不同濃度10 nm 的AgNP(10、25、50 mg·kg-1)和50 nm 的AgNP(25、50、100 mg·kg-1)暴露對(duì)土壤固氮微生物多樣性及群落組成的影響,并對(duì)AgNP暴露下土壤自生固氮菌數(shù)量以及固氮酶活性進(jìn)行了測定,以期為AgNP 的土壤微生物效應(yīng)及對(duì)氮循環(huán)影響的研究提供支持。
1.1.1 供試材料
10 nm的AgNP購于南京先豐納米有限公司,平均粒徑為10±5 nm,形態(tài)如圖1A所示。50 nm的AgNP購于南京埃瑞普納米材料有限公司,平均粒徑為50±5 nm,形態(tài)如圖1B所示。
圖1 兩種粒徑納米銀透射電鏡圖Figure 1 Transmission electron microscope(TEM)images of AgNP of two sizes
表1 土壤樣品的基本理化性質(zhì)Table 1 Basic physical and chemical properties of measured soil
1.1.2 土壤樣品采集及培養(yǎng)
供試土壤為黃褐土,采自安徽省合肥市包河區(qū)大圩鎮(zhèn)(31°46′ N,117°22′ E),采樣深度為0~20 cm。土壤采集后取出其中的植物根和殘葉,過20 目篩備用。土壤理化性質(zhì)的測定參見《土壤農(nóng)化分析》[25],測定結(jié)果如表1 所示。將新鮮土壤過20 目篩后放置于30 ℃恒溫箱中預(yù)培育7 d。將兩種粒徑的AgNP 與少量風(fēng)干土混合后再與培育后的約100 g 鮮土混合均勻,土壤中10 nm 的AgNP(nAg10)終濃度為10、25、50 mg·kg-1,50 nm 的AgNP(nAg50)終濃度為25、50、100 mg·kg-1。將混合后的土壤樣品放于30 ℃的恒溫箱中培養(yǎng),調(diào)節(jié)土壤含水量至田間最大持水量的60%,定時(shí)取樣,每組3個(gè)重復(fù)。
1.2.1 土壤樣品前處理
稱取200 mg 兩種粒徑AgNP 最高劑量暴露7 d(nAg10S 和nAg50S)和90 d(nAg10L 和nAg50L)的土壤,將其放入滅菌后的2 mL 離心管中,并加入1 mL 70%的乙醇,混合均勻后高速(10 000 r·min-1)離心3 min,去除上清液。加入磷酸緩沖液(PBS),以相同的轉(zhuǎn)速離心3 min 后再倒去上清液。最后將離心管于55 ℃烘10 min,使殘留乙醇完全揮發(fā)。同時(shí)未添加AgNP的土壤作為對(duì)照組(CK)。
1.2.2 土壤DNA的提取及PCR擴(kuò)增
按照E.Z.N.A Mag-Bind Soil DNA(OMEGA)試劑盒進(jìn)行土壤微生物總DNA 的提取,用nifH基因作為特異性引物[15]。定量PCR 反應(yīng)體系為:2×Taq master Mix 15 μL,上下游引物(10 μmol·L-1)各1 μL,Genomic DNA 10~20 ng,加dd H2O 至30 μL。PCR 擴(kuò)增引物及反應(yīng)條件見表2。
1.2.3 Illumina Miseq測序及生物信息學(xué)分析
DNA 純化回收和定量混合后利用Illumina Miseq測序平臺(tái)進(jìn)行高通量分析,上機(jī)前保證其終濃度為20 pmol·L-1。測序服務(wù)委托生工生物工程(上海)股份有限公司完成。高通量測序得到的雙端序列數(shù)據(jù)使用FastQC 進(jìn)行質(zhì)量控制,去除低質(zhì)量序列和嵌合體序列。OTU(Operational taxonomic units)指人為給每個(gè)分類單元設(shè)置的同一標(biāo)志,通常對(duì)97%相似水平下的OTU 進(jìn)行生物信息統(tǒng)計(jì)分析[26]。使用Usearch進(jìn)行OTU 聚類,然后根據(jù)樣本分析所得OTU 情況使用QIIME(Quantitative insights into microbial ecology)中的alpha_diversity分析模塊進(jìn)行Alpha多樣性分析。
AgNP 處理7、28、60、90 d 后,選擇Ashby 培養(yǎng)基,采用MPN 稀釋法測定土壤自生固氮菌的數(shù)量[27]。培養(yǎng)基成分如下:甘露醇10.0 g,KH2PO40.2 g,NaCl 0.2 g,CaCO35.0 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,CaSO4·2H2O 0.1 g,蒸餾水1000 mL,調(diào)節(jié)pH至6.8~7.0。
根據(jù)固氮微生物體內(nèi)的固氮酶可將C2H2還原為C2H4的能力,采用C2H2還原法測定土壤的固氮作用,固氮酶活性由每克干土每小時(shí)乙稀產(chǎn)生的納摩爾數(shù)(nmol·h-1·g-1)來表示[28]。將兩種粒徑AgNP 暴露后的土壤(20 g)放入無菌氣密玻璃瓶中,用葡萄糖調(diào)節(jié)土壤含碳量使其達(dá)到1 mg·g-1,用純C2H2氣體(99.99%)代替10%的瓶內(nèi)空氣(10 mL)。將所有土壤樣品在28 ℃下溫育48 h,并使用氣相色譜(GC-7890B,安捷倫,美國)測定C2H4濃度。檢測器為FID,色譜柱為Agilent 19095P-Q04 HP-plot,毛細(xì)管柱為30 m×0.350 mm×40 μm,檢測條件為檢測器溫度150 ℃,柱溫40 ℃,進(jìn)樣溫度150 ℃,載氣為N2,燃?xì)鉃镠2,空氣流速為400 mL·min-1。
數(shù)據(jù)采用SPSS 19.0 進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,并對(duì)不同處理間的數(shù)據(jù)采用單因素方差分析(ANOVA)和Duncan多重比較進(jìn)行顯著性差異檢驗(yàn),Origin 9.0和R語言程序包(Venn 圖采用VennDiagram 軟件包,熱圖采用pheatmap軟件包)作圖。
AgNP 暴露下土壤固氮微生物OTU 數(shù)量變化如圖2A 所示,未添加AgNP 的土壤固氮微生物的OTU數(shù)目最多,所含的微生物種類最豐富,兩種粒徑不同濃度AgNP 暴露下土壤固氮微生物數(shù)量均有所下降。圖2B 中CK 組土壤特有OTU 的數(shù)目為2166,nAg10S、nAg10L、nAg50S 和nAg50L 各處理組的土壤獨(dú)有OTU數(shù)目分別為683、768、784 和1144。10 nm 和50 nm 的AgNP 暴露7 d 和90 d 后土壤固氮微生物OTU 數(shù)量差異不顯著。
表2 PCR擴(kuò)增引物及反應(yīng)條件Table 2 PCR amplification primers and reaction conditions
熱圖根據(jù)顏色的深度來定義群落分布豐度,結(jié)果更直觀,更清晰。屬水平上豐度前10 的物種熱圖分析見圖3。橫向是固氮微生物根據(jù)進(jìn)化關(guān)系的聚類分支,其中CK 組獨(dú)為一類,將nAg50S 組和nAg50L 組先歸并,再與nAg10L 組聚合為另一類,繼而又與nAg10S 組歸并。CK 組土壤樣品微生物群落結(jié)構(gòu)與nAg10S、nAg10L、nAg50S 和nAg50L 組差異較大。另外,從圖中可以看到,CK組土壤相對(duì)豐度最高的菌屬依次為慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、流行桿菌屬(Vulgatibacter)和厭氧黏細(xì)菌屬(Anaeromyxobacter)。AgNP 暴露后這些微生物的豐度明顯降低,而固氮弧菌屬(Azoarcus)的豐度卻大幅上升,與CK 組差別較大,說明AgNP 的暴露引起了固氮微生物群落結(jié)構(gòu)的改變。
圖2 納米銀暴露下土壤微生物OTU數(shù)量分布圖及OTU的Venn圖分析Figure 2 Quantitative distribution of soil microbial OTU and Venn diagram representation of the OTU under the exposure of AgNP
圖3 納米銀暴露下土壤固氮微生物物種豐度熱圖Figure 3 Heat map of soil nitrogen fixing microbial species abundance under the exposure of AgNP
納米銀對(duì)土壤固氮微生物多樣性的影響見表3。Chao 指數(shù)和Ace 指數(shù)常用來分析微生物群落的豐富程度。Shannon 指數(shù)和Simpson 指數(shù)用來估算樣品中微生物的多樣性,其中Shannon 值越大,說明這個(gè)群落的多樣性越高,而Simpson值則相反。Coverage指樣本庫的覆蓋水平[12]。從表3中可以發(fā)現(xiàn),CK組的土壤固氮微生物的多樣性最高,其次是nAg50L 組和nAg10L組,nAg10S 組的土壤固氮微生物多樣性最低,這與各處理的OTU 數(shù)目比較分析結(jié)果相似,說明AgNP 改變了土壤固氮微生物群落,造成其多樣性下降。
表3 納米銀對(duì)土壤固氮微生物多樣性的影響Table 3 Effects of AgNP on nitrogen-fixing microbial community diversity
兩種粒徑的AgNP暴露下土壤自生固氮菌數(shù)量變化如圖4 所示。nAg10(10、25、50 mg·kg-1)暴露28 d后,土壤自生固氮菌數(shù)量減少了18.96%~47.28%;nAg50(25、50、100 mg·kg-1)暴露28 d后土壤自生固氮菌數(shù)量減少了17.42%~27.78%;兩種粒徑AgNP 暴露90 d 后,土壤自生固氮菌數(shù)量總體上分別下降了29.51%~51.04%和20.83%~24.47%。隨著暴露時(shí)間的延長,AgNP 對(duì)土壤自生固氮菌數(shù)量影響減輕,且nAg10 對(duì)土壤固氮菌表現(xiàn)出更強(qiáng)的抗菌活性,說明AgNP對(duì)自生固氮菌的影響與其暴露時(shí)間和尺寸有關(guān)。
從圖5 可以看出,CK 組土壤固氮酶活性最高,AgNP 暴露下土壤固氮酶活性均受到不同程度的影響,尤其是培養(yǎng)后期,土壤固氮酶活性明顯降低。nAg10(50 mg·kg-1)和nAg50(100 mg·kg-1)暴露28 d后土壤固氮酶活性分別降低8.54%和6.76%。隨著AgNP 暴露時(shí)間的延長,土壤固氮酶活性繼續(xù)降低。第90 d 時(shí),與CK 組相比,nAg10(10、25、50 mg·kg-1)處理組土壤固氮酶活性下降了14.55%~27.47%,nAg50(25、50、100 mg·kg-1)處理組土壤固氮酶活性降低了17.87%~21.79%。
圖4 兩種粒徑納米銀暴露下土壤自生固氮菌數(shù)量Figure 4 Variation of azotobacter number under two sizes of AgNP exposure
圖5 兩種粒徑納米銀暴露下土壤固氮酶活性變化Figure 5 Variation of soil nitrogenase activites under two sizes of AgNP exposure
土壤微生物在維持土壤功能方面發(fā)揮著重要作用,如分解有機(jī)物和將無機(jī)氮轉(zhuǎn)化為有機(jī)氮等[29]。自然生態(tài)系統(tǒng)和傳統(tǒng)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的氮循環(huán)主要依賴于固氮微生物的生物固氮作用,因此確定AgNP 對(duì)土壤微生物及其功能的影響尤為重要。本研究基于固氮微生物功能基因nifH的高通量測序分析結(jié)果,表明AgNP 暴露導(dǎo)致土壤固氮微生物數(shù)量和OTU 數(shù)量降低,改變固氮微生物的群落結(jié)構(gòu)。沒有添加AgNP 的土壤中Bradyrhizobium為優(yōu)勢菌屬,其相對(duì)豐度也較高。而AgNP 暴露后Azoarcus變?yōu)閮?yōu)勢菌屬,且其相對(duì)豐度明顯高于其他菌群。Chunjaturas 等[30]也發(fā)現(xiàn)AgNP暴露會(huì)改變土壤微生物群落組成。Ge等[31]同樣發(fā)現(xiàn)不同劑量納米二氧化鈦(TiO2NP)和納米氧化鋅(ZnONP)暴露均改變了土壤微生物群落構(gòu)成,且群落多樣性及土壤中微生物數(shù)量均減少。
固氮細(xì)菌對(duì)環(huán)境因素變化極其敏感,在兩種粒徑AgNP 短期暴露下土壤自生固氮菌數(shù)量下降非常明顯。另外,隨著AgNP 暴露時(shí)間的延長,各處理組自生固氮菌數(shù)量下降趨勢變緩。出現(xiàn)這種現(xiàn)象可能是由于AgNP 添加到土壤后,隨著其暴露時(shí)間的延長,激發(fā)了微生物體內(nèi)的自我保護(hù)機(jī)制,如產(chǎn)生細(xì)胞胞外蛋白質(zhì)或多糖等物質(zhì)來緩解AgNP 的毒性;另外也可能是AgNP 進(jìn)入土壤后與有機(jī)物、黏土礦物等物質(zhì)相互作用,使得AgNP 發(fā)生團(tuán)聚現(xiàn)象且釋放的Ag+減少,影響了其毒性[32]。除此之外,由于土壤氧化還原電位等因素還會(huì)促使一部分AgNP 顆粒形成銀的硫化物[33],使其毒性降低。也有研究表明,土壤中AgNP轉(zhuǎn)化的Ag2S 具有生物可利用性,能在不同的生物體中引起毒性效應(yīng)[34]。
乙炔還原試驗(yàn)結(jié)果表明AgNP 抑制土壤固氮酶活性,但主要發(fā)生在AgNP 的暴露后期,這可能是因?yàn)橥寥拦痰饔檬且粋€(gè)緩慢的過程[35]。Grün 等[32]研究發(fā)現(xiàn),0.01~1 mg·kg-1AgNP 暴露一年后對(duì)土壤微生物量、固氮微生物豐度、酶活性和功能基因表達(dá)具有負(fù)面作用,影響土壤氮循壞。孫影等[36]研究了不同劑量TiO2NP 暴露下對(duì)不同類型土壤中氮轉(zhuǎn)化相關(guān)細(xì)菌活性的影響,發(fā)現(xiàn)其抑制了土壤自生固氮菌的活性。本研究發(fā)現(xiàn)AgNP 造成土壤固氮作用下降,這一方面可能由于AgNP 釋放的Ag+的作用,另一方面可能是因?yàn)锳gNP 自身影響了土壤中的固氮微生物活性從而影響固氮作用。AgNP進(jìn)入土壤后會(huì)釋放出一定量的Ag+,Ag+與土壤微生物作用而影響酶的活性[37]。同劑量AgNP 和Ag+處理下,AgNP 對(duì)土壤硝化作用的抑制效果更顯著[23]。另外,Ag+對(duì)土壤微生物及酶活性在短期內(nèi)作用效果明顯,而AgNP 對(duì)土壤微生物的毒性發(fā)生在暴露后期,其毒性更具持久性[38],AgNP 的毒性部分來自釋放的Ag+,部分由于本身的特異抗菌性。前期實(shí)驗(yàn)室模擬培養(yǎng)條件下發(fā)現(xiàn)小粒徑的AgNP 對(duì)固氮菌具有更強(qiáng)的抑制作用[39],但在土壤環(huán)境中兩種粒徑AgNP 對(duì)土壤固氮微生物的毒性無顯著差異,這可能是由于土壤系統(tǒng)比實(shí)驗(yàn)室模擬環(huán)境復(fù)雜,其緩沖作用較強(qiáng)。
雖然本研究發(fā)現(xiàn)AgNP 暴露下土壤固氮微生物的種類減少,多樣性及豐度降低,群落組成發(fā)生明顯變化,土壤自生固氮菌數(shù)量和土壤固氮酶活性在Ag-NP暴露后均受到不同程度的影響,對(duì)AgNP的土壤環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)具有一定的貢獻(xiàn)。但是關(guān)于AgNP 對(duì)土壤固氮微生物代謝途徑的影響以及與固氮酶的結(jié)合方式等尚不清楚,還有待進(jìn)一步的研究。
(1)AgNP 作用下土壤固氮微生物多樣性明顯降低,其群落結(jié)構(gòu)組成也發(fā)生顯著變化。與對(duì)照組相比,50 nm 的AgNP 暴露90 d 土壤固氮微生物群落結(jié)構(gòu)差別最小,10 nm 的AgNP 暴露7 d 土壤固氮微生物群落變化最大。
(2)兩種粒徑AgNP 暴露后土壤自生固氮菌數(shù)量均下降,但隨著AgNP 暴露時(shí)間的延長,下降趨勢變緩。
(3)土壤固氮酶活性隨著AgNP 暴露時(shí)間的延長而降低,AgNP暴露后期對(duì)土壤固氮酶活性影響較大。AgNP的抑制作用與其粒徑、濃度以及暴露時(shí)間有關(guān)。