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        長鏈非編碼RNA調(diào)控肝纖維化信號通路的研究進(jìn)展

        2019-12-22 00:29:42陶科攻
        胃腸病學(xué) 2019年11期
        關(guān)鍵詞:信號

        陶科攻 林 勇

        海軍軍醫(yī)大學(xué)附屬長征醫(yī)院消化內(nèi)科(200003)

        長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉(zhuǎn)錄本長度為200~100 000 nt的不具備編碼蛋白功能的RNA,主要在轉(zhuǎn)錄調(diào)控、遺傳學(xué)、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等各個(gè)層面實(shí)現(xiàn)對基因表達(dá)的調(diào)控,具有諸多復(fù)雜且較為關(guān)鍵的生物學(xué)功能,在細(xì)胞分化、胚胎發(fā)育等病理生理過程以及腫瘤、纖維化等疾病的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用[1]。近年大量研究顯示,lncRNA可通過多條信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路參與肝纖維化的發(fā)生、發(fā)展,有望在肝纖維化早期診斷、預(yù)后判斷和治療方面成為新的研究靶點(diǎn)[2]。隨著研究的持續(xù)深入,lncRNA對肝纖維化的調(diào)控作用已得到普遍認(rèn)可。本文就lncRNA調(diào)控肝纖維化信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的研究進(jìn)展作一綜述。

        一、LncRNA概述

        LncRNA主要位于細(xì)胞核或細(xì)胞質(zhì)內(nèi),先由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄,再經(jīng)多腺苷酸化和RNA前體剪接等共轉(zhuǎn)錄修飾而成。作為一種非編碼RNA,lncRNA與編碼蛋白的信使RNA(mRNA)存在明顯差異,其不具備典型的啟動(dòng)子保守區(qū)、啟動(dòng)密碼子、開放閱讀框、終止密碼子,因此缺乏編碼蛋白質(zhì)的功能。但近年研究發(fā)現(xiàn),lncRNA不僅可與轉(zhuǎn)錄因子、染色質(zhì)組蛋白以及其他轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白相結(jié)合并在轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達(dá)和染色體活性,而且參與DNA中CpG二核苷酸島高甲基化的表觀遺傳調(diào)控;還能對一些短肽鏈進(jìn)行編碼[3]。LncRNA可涉及mRNA翻譯、剪切、蛋白質(zhì)降解和磷酸化修飾、RNA結(jié)合蛋白亞細(xì)胞定位、細(xì)胞骨架構(gòu)成等機(jī)體重要的遺傳、生理過程[4],在多種疾病包括腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮非常重要的調(diào)控作用。

        二、LncRNA對肝纖維化相關(guān)信號通路的調(diào)控作用

        1.轉(zhuǎn)化生長因子-β1(transforming growth factor-β1, TGF-β1)/Smad信號通路:TGF-β1/Smad是調(diào)控肝纖維化的重要信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路[5-6]。TGF-β1屬TGF-β家族,可通過與肝星狀細(xì)胞(HSC)表面受體結(jié)合,活化下游Smad,使Smad發(fā)生磷酸化并進(jìn)入HSC細(xì)胞核,結(jié)合并激活目的基因,從而產(chǎn)生大量膠原。目前已發(fā)現(xiàn),肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1, MALAT1)、被TGF-β活化的lncRNA(lncRNA activated by TGF-β,lncRNA-ATB)、H19、肝纖維化相關(guān)lncRNA1(liver fibrosis-associated lncRNA1, lnc-LFAR1)等多種lncRNA可通過TGF-β1/Smad信號通路調(diào)控肝纖維化。

        MALAT1又稱為核富集常染色體轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物2(nuclear-enriched abundant transcript 2, NEAT2),是位于人11號染色體q13.1的lncRNA,長度8 700 nt。Wu等[7]的研究發(fā)現(xiàn),下調(diào)MALAT1表達(dá)可上調(diào)脫乙酰酶SIRT1表達(dá),導(dǎo)致活化的LX-2細(xì)胞恢復(fù)靜息狀態(tài)或凋亡。而有研究表明SIRT1可誘導(dǎo)Smad3脫乙酰并抑制HSC激活[8],故MALAT1可能通過抑制SIRT1-Smad3途徑促進(jìn)肝纖維化。

        Fu等[9]的研究發(fā)現(xiàn),lncRNA-ATB表達(dá)與肝硬化程度呈正相關(guān)。與健康人群相比,丙型肝炎肝硬化患者肝組織和血漿lncRNA-ATB表達(dá)均上調(diào),經(jīng)TGF-β1刺激活化的LX-2細(xì)胞中,lncRNA-ATB表達(dá)同樣上調(diào);在LX-2細(xì)胞中過表達(dá)lncRNA-ATB可顯著提高α-SMA和Col1A1表達(dá),并促進(jìn)LX-2細(xì)胞增殖;反之,敲除lncRNA-ATB可明顯降低α-SMA和Col1A1基因的表達(dá),并抑制LX-2細(xì)胞增殖。提示lncRNA-ATB可能作為促纖維化因子參與肝纖維化的發(fā)生、發(fā)展。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)lncRNA-ATB調(diào)控肝纖維化的機(jī)制是競爭結(jié)合miR-425-5p,上調(diào)TGF-β Ⅱ型受體(TβRⅡ)和Smad2蛋白表達(dá),從而激活HSC,增加Ⅰ型膠原生成,促進(jìn)肝纖維化。

        H19位于人類染色體11p15.5,長度為2.3 kb,在細(xì)胞增殖和活化過程中發(fā)揮重要作用,參與多種組織器官的炎癥、腫瘤和纖維化疾病的發(fā)生、發(fā)展。研究[10]顯示,H19水平與肝纖維化相關(guān),可通過競爭性結(jié)合miR-148a,上調(diào)miR-148a下游靶基因泛素特異性蛋白酶4(USP4)的表達(dá),增加細(xì)胞膜表面TβRⅠ泛素化水平,促進(jìn)TβRⅠ與TGF-β1信號結(jié)合,從而激活LX-2細(xì)胞,并促進(jìn)肝細(xì)胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化,最終促進(jìn)肝纖維化的發(fā)生。

        Lnc-LFAR1的長度為734 nt,位于染色體4q25,在肝纖維化組織中高表達(dá)。Zhang等[11]發(fā)現(xiàn),下調(diào)lnc-LFAR1不但可在體外抑制TGF-β誘發(fā)的肝細(xì)胞凋亡,還能在體內(nèi)阻斷CCl4和BDL造模小鼠的肝纖維化進(jìn)展。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),lnc-LFAR1可直接結(jié)合Smad2和Smad3,促進(jìn)其磷酸化,對TGF-β1/Smad信號通路發(fā)揮激活作用。

        2.PI3K/Akt信號通路:PI3K是一種具有磷脂酰肌醇激酶和Ser/Thr蛋白激酶雙重活性的異二聚體。PI3K被激活后,可催化細(xì)胞膜表面磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸(PIP2)磷酸化為磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸(PIP3),繼而激活PIP3下游靶蛋白蛋白激酶B(protein kinase B, PKB),即Akt[12]?;罨腁kt可在HSC內(nèi)引發(fā)級聯(lián)反應(yīng),激活HSC并促進(jìn)細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)合成,導(dǎo)致肝纖維化的發(fā)生[13]。

        PTEN基因是一種編碼磷酸酯酶的基因,其編碼蛋白具有使PIP3去磷酸化的功能,是PI3K/Akt信號通路的主要負(fù)向調(diào)節(jié)因子。有多種lncRNA通過與PTEN相互作用調(diào)控PI3K/Akt信號通路,參與肝纖維化的發(fā)生、發(fā)展。長鏈基因間非編碼RNA-p21(long intergenic non-coding RNA-p21, lincRNA-p21)長度約3 kb,位于p21基因上游約15 kb處。Zheng等[14]的體內(nèi)和體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),lincRNA-p21在人和小鼠的活化HSC中表達(dá)均下調(diào);過表達(dá)lincRNA-p21能減輕小鼠肝纖維化程度,抑制HSC體外活化。其機(jī)制可能為競爭性結(jié)合miR-181b,增加PTEN的表達(dá),使PIP3去磷酸化,從而抑制PI3K/Akt信號通路的激活,抑制HSC活化[15]。

        與lincRNA-p21相似,HOX轉(zhuǎn)錄反義RNA(HOTAIR)也通過競爭性結(jié)合miRNA方式間接調(diào)控PI3K/Akt信號通路。HOTAIR長約2 200 nt,從HOX基因簇中反義編碼而來。其表達(dá)在HSC活化過程中上調(diào)。Yu等[16]發(fā)現(xiàn),HOTAIR可競爭性結(jié)合miR-29b,下調(diào)HOTAIR可間接導(dǎo)致miR-29b下游靶基因PTEN表達(dá)升高,促進(jìn)PIP3去磷酸化,對PI3K/Akt信號通路的活性起負(fù)向調(diào)節(jié)的作用。

        H19不僅通過TGF-β1/Smad信號通路參與肝纖維化的發(fā)生、發(fā)展,還可通過PI3K/Akt信號通路參與HSC激活。胰島素樣生長因子結(jié)合蛋白相關(guān)蛋白(IGFBPrP1)是HSC活化的驅(qū)動(dòng)蛋白之一,可通過PI3K/Akt/mTOR信號通路激活HSC自噬,促進(jìn)其活化[17]。Huang等[18]通過體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在轉(zhuǎn)染IGFBPrP1的JS-1細(xì)胞中,細(xì)胞自噬活躍程度與H19表達(dá)呈正相關(guān);H19可通過PI3K/Akt/mTOR信號通路促進(jìn)IGFBPrP1誘發(fā)的HSC自噬,但具體機(jī)制尚未明確。

        3.Wnt/β-catenin信號通路:Wnt是一種配體蛋白,可與膜蛋白受體結(jié)合激發(fā)多個(gè)下游信號靶基因,包括β-catenin。Wnt被激活時(shí),Wnt蛋白與受體結(jié)合,激活細(xì)胞內(nèi)蓬亂蛋白(Dsh)及其同源物(DVL),抑制糖原合成激酶3β(GSK-3β)活性,阻止GSK-3β對β-catenin的磷酸化和降解,使β-catenin在胞質(zhì)中累積。當(dāng)β-catenin積累過多時(shí)即可進(jìn)入細(xì)胞核,與核內(nèi)轉(zhuǎn)錄因子T細(xì)胞因子(Tcf)/淋巴增強(qiáng)因子(Lef)結(jié)合,激活纖維化相關(guān)基因,從而激活HSC,促進(jìn)肝纖維化[19]。LncRNA主要通過競爭性結(jié)合miRNA的方式作用于Wnt/β-catenin信號通路來調(diào)節(jié)肝纖維化。

        LncRNA-SNHG7位于9號染色體,長度為2 157 nt,在人類肝纖維化組織和活化的小鼠原代HSC中均表達(dá)上調(diào)。Yu等[20]的研究發(fā)現(xiàn),在靜息HSC中,miR-378a-3p可通過與DVL2結(jié)合,抑制Wnt/β-catenin通路活性。LncRNA-SNHG7與miR-378a-3p互為內(nèi)源競爭RNA(ceRNA),可通過競爭性結(jié)合miR-378a-3p使細(xì)胞內(nèi)游離DVL2含量增加,β-catenin在細(xì)胞內(nèi)大量積累,促進(jìn)HSC激活,誘發(fā)肝纖維化。

        LincRNA-p21亦可通過Wnt/β-catenin信號通路調(diào)節(jié)HSC活性。LincRNA-p21通過ceRNA方式競爭性結(jié)合miR-17-5p,上調(diào)HSC內(nèi)GSK-3β表達(dá),促進(jìn)細(xì)胞內(nèi)β-catenin降解,抑制Wnt/β-catenin信號通路活性,從而抑制HSC的激活,但其上調(diào)GSK-3β表達(dá)的具體機(jī)制尚未明確[21]。

        除通過TGF-β1/Smad信號通路外,lncRNA-ATB還可通過Wnt/β-catenin信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路對丙型肝炎相關(guān)性肝纖維化進(jìn)行調(diào)節(jié)。LncRNA-ATB能與β-catenin競爭性結(jié)合miR-200a,上調(diào)其下游靶基因β-catenin表達(dá),激活HSC,導(dǎo)致肝纖維化的發(fā)生[22]。

        三、結(jié)語

        盡管lncRNA是近年肝病研究領(lǐng)域中的熱點(diǎn),但多數(shù)lncRNA在肝纖維化中的作用機(jī)制尚未完全闡明,其上游調(diào)節(jié)基因和下游靶基因的作用機(jī)制及其所調(diào)節(jié)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路仍有待于進(jìn)一步研究。相信隨著研究技術(shù)的不斷發(fā)展,將會(huì)發(fā)現(xiàn)lncRNA在肝纖維化中的更多調(diào)控機(jī)制和功能,為肝纖維化治療提供新的理論基礎(chǔ)。

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