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        豬日本乙型腦炎及豬細小病毒復合PCR檢測方法的建立

        2019-12-16 01:42:53呂玉金吳鳳筍劉勝利李文剛
        江蘇農(nóng)業(yè)科學 2019年19期

        呂玉金 吳鳳筍 劉勝利 李文剛

        摘要:根據(jù)GenBank上登錄的日本乙型腦炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)與豬細小病毒(Porcine parvovirus,PPV)參考基因序列,設計合成2對特異性引物,在建立優(yōu)化單項PCR檢測方法的基礎上,建立了PPV-JEV復合PCR檢測方法,可擴增出預期的238 bp和152 bp特異性片段。該方法敏感性高、穩(wěn)定性好、特異性強,臨床樣品檢測結(jié)果與單項PCR檢測結(jié)果符合率100%,該方法適合JEV和PPV的聯(lián)合檢測和鑒別診斷。

        關(guān)鍵詞:豬;日本乙型腦炎病毒;細小病毒;復合PCR

        中圖分類號:S852.65 文獻標志碼: A

        文章編號:1002-1302(2019)19-0176-03

        收稿日期:2018-07-20

        基金項目:河南牧業(yè)經(jīng)濟學院預防獸醫(yī)學重點學科建設項目(編號:MXK2016102)。

        作者簡介:呂玉金(1984—),女,河南商丘人,碩士,講師,主要從事動物傳染病發(fā)病機理及防制研究。E-mail:272166760@qq.com。

        通信作者:李文剛,博士,教授,主要從事動物傳染病防控研究。E-mail:wengang-li@126.com。

        隨著我國養(yǎng)豬業(yè)的發(fā)展,豬病呈現(xiàn)多病原混合感染或繼發(fā)感染的現(xiàn)象[1]。流行性日本乙型腦炎(Japan eseencephalitis,JE)又叫日本乙型腦炎,簡稱乙腦,是由日本乙型腦炎病毒(JEV)引起的一種重要的人獸共患傳染病,豬群最易感,妊娠母豬主要表現(xiàn)為流產(chǎn)、高熱、死胎和木乃伊胎,公豬表現(xiàn)為睪丸炎,被世界衛(wèi)生組織列為需要重點控制的傳染病之一[2-3]。豬細小病毒病是由豬細小病毒(Porcine parvovirus,PPV)引起的豬繁殖障礙性疾病,該病主要感染初產(chǎn)母豬,臨床表現(xiàn)為胎兒和胚胎的感染和死亡。血清學陰性的母豬主要在懷孕前半期通過口鼻感染病毒,病毒大量繁殖后可引發(fā)母豬的病毒血癥并且隨血液循環(huán)到達胎盤傳染給胎兒,形成垂直傳播[4]。該病在我國多發(fā)生于4—10月,豬感染后可終生帶毒,全場豬在短時間內(nèi)即可感染本病。豬在感染PPV后的1~6 d內(nèi)會出現(xiàn)病毒血癥現(xiàn)象,3~7 d內(nèi)即可經(jīng)糞便排毒,1周后可以檢測到相應抗體[5]。母豬感染PPV后,病毒主要分布于機體內(nèi)一些快速增生的組織(例如淋巴結(jié)生發(fā)中心、結(jié)腸固有層、腎間質(zhì)等)[6]。研究表明,PPV僅會在活的豬胚胎中復制,感染胚胎一旦死亡就會被母體重吸收,病毒則無法在母體子宮內(nèi)傳播擴散,若感染胚胎存活,則會在子宮內(nèi)傳播病毒,致使同窩的其他胎兒也發(fā)生感染[7]。

        JEV、PPV感染都可造成母豬繁殖障礙性疾病,檢測這2種病毒有多種方法,包括病毒的分離鑒定、酶聯(lián)免疫吸附試驗和免疫熒光試驗等,但都存在敏感性低、特異性差等缺陷[8]。近年來,聚合酶鏈式反應(PCR)因其特異性好,靈敏度高,被廣泛應用于各種病原的檢測,尤其是多重PCR,比常規(guī)PCR更高效,目前研究較多[9]。為快速鑒別診斷這2種病毒病,本研究旨在建立JEV-PPV復合PCR方法,并將該方法初步應用于臨床樣品檢測。

        1 材料與方法

        1.1 病毒

        JEV疫苗株、PPV疫苗株及實驗室保存的疑似感染JEV、PPV的病料。病料采取自河南某養(yǎng)豬場的疑似感染JEV、PPV病死豬的肝臟、脾臟、肺臟和淋巴結(jié)等9份病料,每頭豬的各種組織混合為1份病毒。

        1.2 主要試劑

        Ezup柱式病毒DNA抽提試劑盒、Taq DNA聚合酶,購自上海生物工程公司;HipureViralRNASpinKit試劑盒、M-MLV H-First Sand Sythesis Kit試劑盒,購自Magen公司;DL500 DNA Marker,購自寶生物工程(大連)有限公司等。

        1.3 方法

        1.3.1 病毒DNA的提取及檢測

        應用Sangon Biotech的Ezup柱式病毒DNA抽提試劑盒提取PPV病毒DNA,按照試劑盒標準抽提步驟進行,其中溶液A在65 ℃預熱后沉淀溶解完全后使用,最后用100 μL經(jīng)65 ℃預熱的ddH2O洗脫。用超微量紫外分光光度計對所提取DNA的濃度進行檢測。

        1.3.2 病毒RNA的提取、檢測及反轉(zhuǎn)錄

        采用Magen公司的HipureViralRNASpinKit試劑盒提取JEV的RNA,嚴格按照試劑盒的操作步驟進行。Carrier RNA固體在使用前須用DEPC水溶解完全,濃度為1 μg/μL,注意分裝保存。另外,Buffer VHB、Buffer RW2用前必須用無水乙醇稀釋。最后采用100 μL DEPC水洗脫,并使用超微量紫外分光光度計進行RNA濃度的測定。

        然后利用Magen公司的M-MLV H-First Sand Sythesis Kit試劑盒將提取的RNA進行反轉(zhuǎn)錄。取適量RNA溶液,依次加入適量RNA溶液、0ligo (dT)1 μL,dNTPs 1 μL,DEPC水補足至13 μL,經(jīng)過孵育冰上冷卻后,再加入5×First Stand Buffer 4 μL,0.1 M DTT 1 μL,M-MLV RNase HRT 1 μL,RNase Ihibior(40 U/μL)1 μL,離心,反應45 ℃ 30 min,85 ℃ 10 s后瞬離,將產(chǎn)物立即放置-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3.3 引物的設計和合成

        根據(jù)GenBank公布的PPV和JEV的全基因序列,按照引物設計原則設計、選擇引物,并對其特異性進行鑒定,均具有良好的特異性。引物由寶生物工程(大連)有限公司合成,引物設計見表1。

        1.3.4 單項PCR反應體系的建立 單項PCR反應體系見表2。

        94 ℃預變性5 min;94 ℃變性1 min,梯度退火溫度(49.5、507、52.9、54.1、55.4、57.8、587、59.9 ℃)下30 s,72 ℃ 延伸1 min,35個循環(huán);72 ℃延伸10 min。經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測,確定最佳退火溫度。

        1.3.5 復合PCR反應體系的建立

        在單項PCR的基礎上,建立多重PCR反應體系(表3)。

        94 ℃預變性5 min;94 ℃變性1 min,梯度退火溫度(49.5、50.7、52.9、54.1、55.4、57.8、58.7、59.9 ℃)下30 s,72 ℃延伸1 min,35個循環(huán);72 ℃延伸10 min。經(jīng)1.5%瓊糖凝膠電泳檢測,確定最佳退火溫度。

        1.3.6 敏感性試驗

        將病毒模板進行10倍系列稀釋,以ddH2O為模板作為為陰性對照,進行單項和多重PCR擴增,以其模板最高稀釋倍數(shù)擴增呈陽性為其PCR的敏感度。

        1.3.7 特異性試驗

        分別以PPV、JEV、豬瘟病毒(CSFV)和豬偽狂犬病毒(PRV)基因組為模板,以ddH2O為模板作為陰性對照,應用復合PCR方法進行擴增,電泳,驗證其特異性。

        1.3.8 穩(wěn)定性試驗

        對PPV和JEV重復檢測5次,以驗證該方法的穩(wěn)定性。

        1.3.9 臨床樣品檢測

        應用建立的單項PCR與多重PCR方法,檢測實驗室保存的9份疑似感染PPV和JEV的病料,比較兩者檢測結(jié)果的符合率。

        2 結(jié)果

        2.1 DNA的檢測結(jié)果

        提取的PPV的DNA濃度為141.9 ng/μL,D260 nm/D280 nm為1.91,比值在1.8~2.0 之間,表明提取的基因組DNA質(zhì)量非常好。

        2.2 RNA的檢測結(jié)果

        提取的JEV的RNA濃度為1 325.6 ng/μL,D260 nm/D280 nm為1.94,表明提取的RNA質(zhì)量非常好。

        2.3 PPV和JEV的單項PCR擴增結(jié)果

        電泳結(jié)果顯示,PPV和JEV分別擴增出152、238 bp的片段。PPV單項PCR的最佳退火是57.8 ℃,JEV單項PCR的最佳退火溫度是58.7 ℃,見圖1和圖2。

        2.4 復合PCR擴增結(jié)果

        電泳結(jié)果(圖3)顯示,PPV和JEV的最佳退火溫度是54.1 ℃。

        2.5 敏感性試驗

        電泳結(jié)果(圖4)顯示,可檢測到PPV和JEV的稀釋濃度分別為10-7、10-5。

        2.6 特異性試驗

        由圖5可知,電泳結(jié)果顯示,PPV和JEV可擴增出目的條帶,而CSFV和PRV則沒有產(chǎn)生,說明該方法特異性良好。

        2.7 穩(wěn)定性試驗

        以建立的多重PCR方法對PPV和JEV重復檢測5次。由圖6可知,5次的檢測結(jié)果一致,說明該方法穩(wěn)定性較好。

        2.8 臨床樣品檢測

        利用建立的復合PCR方法對9份臨床樣品進行檢測,然后使用同樣的特異性引物進行單項PCR檢測,結(jié)果顯示兩者結(jié)果符合率100%(表4)。

        3 討論與分析

        目前,國內(nèi)外發(fā)生的動物病毒病或一個征候群的疫病多同時涉及DNA和RNA兩類病毒[10]。本研究從感染PPV和JEV[CM(24*8]的病死豬組織中提取了DNA和RNA,且在紫外線波長260 nm和280 nm處的比值均在1.8和2.0之間,符合純的DNA D260 nm/D280 nm的值為2.0、純的RNA D260 nm/D280 nm的值為1.8的要求[11]。

        在多重PCR反應過程中,引物的設計至關(guān)重要,它關(guān)系到多重PCR反應的成功與否。本試驗針對PPV和JEV這2種常見病毒的保守基因分別設計2對特異性引物,應用DNAstar軟件進行綜合分析,結(jié)果顯示,2對特異性引物較好且同源性較低,各擴增片段相差不大,可在同一種濃度的電泳膠下進行。本試驗設計的2對引物經(jīng)試驗驗證,均是擴增效果較好的引物。

        本研究在大量前期試驗的基礎上,首先確定了PPV和JEV單項PCR反應的最佳反應條件和反應程序,在此基礎上摸索出了多重PCR的最佳反應條件,彌補了多重PCR因引物之間交叉干擾而導致敏感性降低的缺點。敏感性試驗結(jié)果表明,該雙重PCR具有較強的敏感性。本研究建立的PPV和JEV雙重PCR檢測方法,實現(xiàn)了這2種病毒的同步檢測,為JEV和PPV感染的快速檢測和流行病學調(diào)查奠定了基礎。

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