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        番茄根際多功能益生芽孢桿菌的篩選與鑒定

        2019-12-11 06:48:58張翠綿賈楠馬佳彭杰麗李書鴻胡棟魏曉燕王春燕王占武
        河北農(nóng)業(yè)科學 2019年4期
        關鍵詞:能力

        張翠綿,賈楠,馬佳,彭杰麗,李書鴻,胡棟,魏曉燕,王春燕,王占武*

        (1.河北省農(nóng)林科學院遺傳生理研究所,河北省植物轉基因中心重點實驗室,河北 石家莊 050051;2.河北三農(nóng)農(nóng)用化工有限公司,河北 石家莊 050051)

        隨著農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)結構的調整,蔬菜產(chǎn)業(yè)正朝著專業(yè)化、集約化方向發(fā)展。然而,連年種植導致蔬菜連作障礙問題日漸突出,尤其是在設施栽培中,蔬菜復種指數(shù)高,農(nóng)藥和化肥的使用頻率和投入量增加現(xiàn)象普遍,加速了連作障礙的產(chǎn)生。連作障礙主要包括土壤次生鹽漬化、病原菌增多、根際毒素積累等,這些問題往往同時存在,交互影響[1~3],因此采用單一防治方法效果往往不理想。

        目前,國內外針對連作障礙的研究雖然較多[4~7],但由于其發(fā)生原因復雜和地域的差異,因此,截至目前仍然尚未發(fā)現(xiàn)防控效果穩(wěn)定的方法。根際微生物是修復退化土壤最活躍的組分,但應用僅具有促生、防病或抗逆等1~2種功能的菌株進行修復效果較差且不穩(wěn)定,因此,亟需篩選具有改善根際營養(yǎng)環(huán)境、拮抗病原菌、促進植物生長和提高植株抗性等多種功能的菌株。

        芽孢桿菌(Bacillus spp.)廣泛存在于植物根際土壤,有些菌株能夠產(chǎn)生拮抗物質、促生物質,具有繁殖快、生長能力強、可產(chǎn)生休眠體、易產(chǎn)業(yè)化等特點[8,9],是微生物肥料等產(chǎn)品開發(fā)的重要微生物類群。以從番茄根際、根表篩選出有促生和抑菌效應的芽孢桿菌為目標,采用根際養(yǎng)分利用、促生、抗病等層級篩選方法,初步篩選同時具有上述功能的芽孢桿菌菌株,并通過盆栽番茄試驗對優(yōu)勢菌株的促生效果進行評價,不僅可為克服番茄連作障礙植物根際促生菌(PGPR)接種劑的研制提供良好的菌種資源,還可為進一步探索PGPR對蔬菜的促長機制提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        1.1.1 根際土壤 從河北省農(nóng)林科學院經(jīng)濟作物研究所蔬菜大棚以及石家莊市藁城區(qū)和無極縣的番茄基地(常年連作),挖出整株帶土的健康番茄幼苗,將根部土壤抖落后裝入無菌紙袋,帶回實驗室備用。

        1.1.2 培養(yǎng)基 菌株分離采用牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(NA)[10];植物病原真菌的培養(yǎng)和對峙試驗采用馬鈴薯葡萄糖培養(yǎng)基(PDA)[11];解(溶)磷功能的測定采用無機、有機磷培養(yǎng)基[12,13];菌株固氮能力的測定采用Ashby液體培養(yǎng)基[14];產(chǎn)鐵載體能力的定性檢測采用CAS培養(yǎng)基[15];產(chǎn)吲哚乙酸(IAA) 功能的定性檢測采用IAA培養(yǎng)基[16]。菌種鑒定用培養(yǎng)基參照宋大新等[17]的方法配制。

        1.1.3 番茄 供試番茄品種為冀番135,由河北省農(nóng)林科學院經(jīng)濟作物研究所提供。

        1.1.4 病原真菌指示菌 供試病原真菌指示菌有番茄灰霉菌(Botrytis cinerea)、茄子早疫病菌(Alternaria solan)i、番茄絲核菌 (Rhizoctonia solan)i、棉花枯萎病菌(Fusarium oxysporum)、辣椒腐霉菌(Pythium aphanidermatum) 和黃瓜鐮刀菌 (Fusarium moniliforme),均由河北省農(nóng)林科學院遺傳生理研究所微生物室保存。

        1.1.5 盆栽基質 盆栽試驗土壤采自大田,用孔徑為5 mm的篩子過篩后與蛭石按照體積比2∶1混合均勻,裝入直徑25 cm、高17 cm的塑料盆中備用,裝入量約 2.0 kg/盆。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 番茄幼苗根際菌種的分離與純化 將番茄幼苗根際土用無菌刷輕輕刷下,連同已用無菌水充分消毒的幼苗根一起放入無菌水中充分振搖,系列稀釋,涂布于牛肉膏蛋白胨平板上。在30℃下培養(yǎng)2 d,選取產(chǎn)芽孢的菌落,純化后得到斜面菌株,保存于4℃冰箱。

        1.2.2 優(yōu)勢菌株的篩選 對經(jīng)分離、純化后得到的產(chǎn)芽孢細菌,進行解(溶)磷、固氮、產(chǎn)鐵載體、產(chǎn)IAA能力的定性檢測,據(jù)此篩選出綜合能力較強的優(yōu)勢菌株。

        1.2.2.1 解(溶) 磷能力的確定。將待測菌株點植于有機磷培養(yǎng)基及無機磷培養(yǎng)基中,點植數(shù)量6個/皿,3次重復,在30℃下培養(yǎng)48 h。測定溶磷圈直徑(HD) 和菌落直徑(CD)。根據(jù)各菌株的HD/CD,確定其溶磷能力的強弱。

        1.2.2.2 固氮能力的確定。將待測菌株接入Ashby液體培養(yǎng)基中,在30℃、120 rpm條件下?lián)u床培養(yǎng)3 d。然后,將能在Ashbg液體培養(yǎng)基中生長的菌株再次轉接到Ashby液體培養(yǎng)基中,重復3次,選出最終生長的細菌即為有固氮能力的細菌。測定波長620 nm處的吸光度值(OD)。根據(jù)各菌株的OD620,確定其固氮能力的強弱。

        1.2.2.3 產(chǎn)鐵載體能力的確定。將待測菌株點植于CAS檢測平板上,30℃恒溫倒置培養(yǎng),點植數(shù)量6個/皿,3次重復,在30℃下培養(yǎng)48 h。觀測經(jīng)過培養(yǎng)的CAS檢測平板,分泌鐵載體的細菌菌落周圍會出現(xiàn)明顯的橙色鐵載體暈圈。通過比較平板上橙色透明圈的大小,來確定各菌株產(chǎn)鐵載體能力的強弱。

        1.2.2.4 產(chǎn)IAA能力的確定。試驗樣品為待測菌株發(fā)酵液;對照樣品有3個,分別為含有100 mg/L色氨酸的KingB空白培養(yǎng)基、50 mg/L IAA溶液、含有50 mg/L IAA的KingB培養(yǎng)基。吸取0.5 mL待測樣品于1.5 mL離心管中,加入等體積的Salkouski試劑,置于暗處反應15 min。根據(jù)測試樣品溶液顯色的深淺,判斷其產(chǎn)IAA能力的強弱。

        1.2.3 最優(yōu)菌株抑菌能力的確定 以番茄灰霉病菌、茄子早疫病菌、番茄絲核病菌、棉花枯萎病菌、黃瓜鐮刀菌、辣椒腐霉6種病原真菌為靶標,采用改良平板對峙法[11],對篩選出的優(yōu)勢菌株進行抑菌效果測定,以篩選出更優(yōu)的菌株。將直徑5 mm的指示病原真菌菌餅接于PDA平板中央,與之相距3 cm兩側接活化的待測菌株,每處理3次重復,以只接種病原真菌的培養(yǎng)基為對照,在30℃下培養(yǎng)3~5 d。待對照病原真菌長滿平板時,測定菌株與各指示菌間拮抗帶的寬度。

        1.2.4 最優(yōu)菌株促長效果的確定 將篩選出的最優(yōu)菌株轉接至NA無菌液體培養(yǎng)基中,在30℃下振蕩培養(yǎng)48 h,4 000 rpm離心10 min,去除上清液,無菌水重懸菌體備用。

        挑選飽滿整齊一致的番茄種子,用溫湯法滅菌,催芽后播種于56孔育苗缽(育苗基質由蛭石和草炭按體積比1∶2混合而成)中,溫室培育,待番茄幼苗長至3葉1心時移栽定植。

        選擇長勢基本一致的健壯番茄苗定植于塑料盆中,待定植苗生長5 d后,采用灌根法接種優(yōu)勢菌株,菌液濃度設稀釋100倍 (G81-100)、稀釋 200倍(G81-200) 和稀釋300倍(G81-300) 3個處理,以無菌水灌根為對照(CK)。每處理10盆,等量(50mL)灌根后于溫室中培育。

        1.3 測定項目與方法

        1.3.1 菌株特征 參照《微生物實驗技術教程》[17]對菌株的形態(tài)和生理生化特征進行鑒定。

        1.3.2 菌株分子學鑒定 將優(yōu)勢菌株用NA液體培養(yǎng)液培養(yǎng)至對數(shù)生長期,離心收集菌體。細菌總DNA提取采用SDS-CTAB法。用27F(AGAGTTTGATC CTGGCTCAG) 和 1492R (GGTTACCTTGTTACGACTT)為引物PCR擴增菌株的16S rDNA基因序列。PCR反應條件:94℃預變性5 min,94℃變性40 s,56℃退火40 s,72℃延伸90 s,30個循環(huán);72℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后送上海英濰捷基貿(mào)易有限公司測序,將測得的16SrDNA序列在NCBI核酸數(shù)據(jù)庫上采用Blast程序進行同源性比較分析。

        1.3.3 番茄生物學特征 待番茄幼苗長至4葉1心時,測定量試驗組和對照組番茄植株的株高、鮮重、葉面積、主根長、毛細根數(shù)量。然后,于烘箱中105℃殺青15 min,75℃烘干至恒重,稱量地上部干重和根系干重。

        1.3.4 番茄葉片葉綠素含量 待番茄幼苗長至4葉1心時,每盆均選取頂部第2片葉子,采用浸提法[18]測定葉片的葉綠素含量。

        1.4 數(shù)據(jù)處理

        應用SPSS 13.0統(tǒng)計分析軟件進行數(shù)據(jù)的差異顯著性分析。

        2 結果與分析

        2.1 番茄幼苗根際細菌的分離

        采用平板稀釋法,經(jīng)分離、純化后共得到產(chǎn)芽孢細菌11株。進行解磷、固氮、產(chǎn)鐵載體、產(chǎn)IAA能力的定性檢測后,篩選出優(yōu)勢菌3株,編號為G81、G92和G99(表1)。

        表1 優(yōu)勢菌株功能檢測結果Table 1 Functional test results of dominant strains

        2.2 優(yōu)勢菌株抑菌能力的比較

        采用對峙試驗對3株優(yōu)勢菌株的抑菌能力進行鑒定。結果(表2) 顯示,G81、G92和G99菌株對供試的6種病原真菌都具有明顯的抑制作用,抑菌帶寬度為5.9~9.3 mm,其中G81菌株的整體抑菌效果最佳。G81菌株對茄子早疫病菌的抑制作用最強,抑菌帶寬為9.3 mm,指標值>其他2個菌株,且與G99菌株差異達到了顯著水平;對番茄灰霉病菌的抑制作用次之,抑菌帶寬為8.6 mm,指標值與其他2個菌株差異不顯著;對辣椒腐霉的抑制作用也較強,抑菌帶寬為8.1 mm,指標值顯著>其他2個菌株;對番茄絲核病菌、棉花枯萎病菌和黃瓜鐮刀菌的抑菌帶寬均為7.0 mm左右,除對番茄絲核病菌的抑菌帶寬與G92菌株差異不顯著外,其他指標值均顯著>其他2個菌株。綜上分析,篩選出G81為最優(yōu)菌株。

        表2 優(yōu)勢菌株對病原真菌的抑菌帶寬Table 2 Antimicrobial bandwidth of dominant strains to pathogenic bacteria (mm)

        2.3 最優(yōu)菌株G81的鑒定

        2.3.1 形態(tài)及生理生化特征 經(jīng)平板劃線觀察G81的形態(tài)特征,結果(表3) 顯示,G81菌落表面粗糙,中央隆起、有褶皺,灰白色,無光澤,不透明。生理生化測試結果顯示,G81能利用葡萄糖、木糖醇、淀粉和明膠等多種碳源。根據(jù)以上特征,可初步確定G81為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)。

        表3 G81菌株的形態(tài)和生理生化特征Table 3 Morphological,physiological and biochemical characteristics of strain G81

        2.3.2 16S rDNA的序列比對與分析 為進一步確定G81菌株的分類學地位,以G81菌株的總DNA為模板,27F/1492R為引物,擴增出了長約1.5 kb的16S rDNA,測序結果通過NCBI-Blast比對分析,與枯草芽孢桿菌的16S rDNA序列同源性達到100%。同時結合其表型特征,最終確定G81菌株為枯草芽孢桿菌。

        2.4 優(yōu)勢菌株G81的盆栽促長效果

        2.4.1 對番茄幼苗生物量的影響 G81對番茄根系和莖葉具有協(xié)同促長作用,以稀釋200倍處理促生效果最佳,各項指標值均較CK提高30%以上,毛細根數(shù)量增加2倍以上,差異均達到了極顯著水平(表4)。即G81菌株稀釋200倍處理可極顯著促進番茄地下部和地上部的生長,改善根系結構,提高植株對養(yǎng)分的吸收能力,為植株系統(tǒng)抗性的提高奠定了基礎。

        2.4.2 對葉片葉綠素含量的影響 G81可顯著提高番茄葉片的葉綠素含量,以稀釋200倍處理效果最佳,各指標值均顯著高于其他處理,其中葉綠素a、b含量分別較CK提高了2.68倍和2.43倍(表5)。稀釋100倍與稀釋300倍處理的番茄葉片葉綠素含量差異不顯著,但均顯著>CK,其中葉綠素a含量分別較CK提高了1.83倍和1.81倍,葉綠素b含量分別提高了1.09倍和1.36倍。番茄植株葉片葉綠素含量的提高可能與G81菌株的促生長作用有關。

        表4 不同處理對苗期番茄生物學特征的影響Table 4 Effects of different treatments on biological characteristics of tomato at seedling stage

        表5 不同處理對番茄葉綠素含量的影響Table 5 Effects of different treatments on chlorophyll content of tomato

        3 結論與討論

        根際微生物在植物根際代謝旺盛,可分泌出促進植物生長的多種酶類等物質。根際微生物通過分泌鐵載體,可為寄主植物提供鐵元素,進而抑制有害微生物的生長和繁殖;通過分泌IAA,直接參與植物的生長,有利于植物地上部和根部的生長;通過改變植物根際微環(huán)境,活化土壤中的難溶性磷,改善植物的磷營養(yǎng)狀況[19]。榮良燕等[20]分離出的產(chǎn)鐵載體PGPR菌LHS11對黃瓜枯萎病菌(Fusarium oxysporum f.sp.cucumerinum)抑制率達80%以上。李引等[21]分離篩選出的花生根際益生菌既產(chǎn)IAA又具有解磷能力??蒂O軍等[22]從小麥、油菜等根際土壤中分離的菌株RBP1,在培養(yǎng)基中利用鉬銻抗比色法測定該菌的最高含磷量為106.75 mg/L。

        PGPR的促生長效應一般是通過其產(chǎn)IAA、產(chǎn)嗜鐵素、溶磷等多種功能共同作用實現(xiàn)的[23~26],尤其是在植物幼苗期。劉秀花等[25]對小麥根際促生菌進行了研究,結果發(fā)現(xiàn)接種促生菌株B5后,小麥幼苗的株高、鮮重、根長分別較CK增加了17.2%、21.0%和20.5%;段秀梅等[26]對玉米、樹莓等的根際土壤促生菌進行了研究,結果發(fā)現(xiàn)在玉米上混接菌株P9和P28,玉米苗期的株高和干重分別較CK增加了35.5%和28.9%。

        目前對生產(chǎn)實踐具有重要作用的根際促生菌株,不僅要具有促生長作用,還要具有抑制病原菌的能力[27]。孫廣正等[28]發(fā)現(xiàn),根際促生菌不僅能夠促進油菜生長,而且對菌核病菌和立枯絲核菌具有良好的抑制效果;王靜等[29]發(fā)現(xiàn),短小芽胞桿菌AR03菌株的菌懸液對煙草炭疽病的防治效果為83.03%,可顯著抑制煙草炭疽病的發(fā)生。

        本研究條件下,從番茄根際土壤中分離出了11株同時具有溶磷和產(chǎn)IAA等能力的功能菌,其中G81、G92和G99具有解磷、固氮、產(chǎn)鐵、產(chǎn)IAA的功能;采用平板對峙法測定了3個菌株對番茄灰霉病菌、茄子早疫病菌、番茄絲核病菌、棉花枯萎病菌、黃瓜鐮刀菌和辣椒腐霉的抑制效果,結果顯示,3個菌株的抑菌作用均較為明顯,抑菌帶寬度為5.9~9.3 mm,其中G81對6種病原真菌的抑菌效果最佳。采用盆栽方法對篩選出的優(yōu)勢菌株G81進行番茄促生長效應測定,結果顯示,接種G81的番茄幼苗各項生理指標均明顯高于對照??蛇M一步對G81菌株進行研發(fā),以制備促生菌劑。

        植物根際細菌對植物的作用,與植物種類和菌種代謝產(chǎn)物的濃度有關[30]。G81稀釋200倍處理的番茄幼苗株高、主根長、整株鮮重、地上部干重、根系干重和葉綠素a+b含量分別較CK增加了55.6%、30.4%、39.4%、38.7%、33.3%和2.61倍,效果顯著優(yōu)于稀釋100倍和300倍處理,但其田間應用效果還有待進一步驗證。此外,為了后期更好地應用和推廣根際促生菌株,采用熒光顯微鏡定期觀測優(yōu)勢菌株在土壤中的定殖能力及變化動態(tài)試驗正在進行中。

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