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        基于增強(qiáng)CT影像組學(xué)模型鑒別腎透明細(xì)胞癌與非透明細(xì)胞癌

        2019-11-21 07:21:44殷小平任嘉梁郭建黨趙珍珍趙瑩佳
        關(guān)鍵詞:勾畫組學(xué)亞型

        王 平,裴 旭,殷小平,任嘉梁,郭建黨,趙珍珍,趙瑩佳

        [1.河北大學(xué)附屬醫(yī)院CT-MRI室,河北 保定 071000;2.河北大學(xué)(醫(yī)學(xué)院),河北 保定 071000;3.河北省腫瘤放化療機(jī)制與研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河北 保定 071000;4.通用電氣藥業(yè)(上海)有限公司,上海 210000]

        腎細(xì)胞癌(renal cell carcinoma, RCC)占成人惡性腫瘤的2%~3%,致死率較高[1],其病理分型包括腎透明細(xì)胞癌(clear cell RCC, ccRCC)和非透明細(xì)胞癌(non-clear cell RCC, non-ccRCC),后者又分為嫌色細(xì)胞癌(chromophobe renal cell carcinoma, chRCC)、乳頭狀細(xì)胞癌(papillary renal cell carcinoma, pRCC)、集合管癌(collecting duct carcinoma, CDC)及未分類癌。RCC的亞型[2-3]及病理分期[4]均會(huì)影響臨床治療及預(yù)后。腎穿刺活檢是診斷RCC亞型的金標(biāo)準(zhǔn),但穿刺可能導(dǎo)致癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移、腫瘤出血等并發(fā)癥,且存在抽樣誤差,故對于RCC活檢一直存在爭議[5-6]。盡管影像學(xué)上ccRCC與non-ccRCC表現(xiàn)出不同的強(qiáng)化方式,但臨床誤判率仍較高[7]。聯(lián)合應(yīng)用不同影像學(xué)檢查可提高診斷RCC亞型的正確率,但增加患者經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān),且耗時(shí)長。影像組學(xué)是從醫(yī)學(xué)圖像中高通量提取定量特征(紋理特征、形狀特征、強(qiáng)度特征及高階特征等信息),轉(zhuǎn)化為可采集的組學(xué)數(shù)據(jù),并對這些數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,從而達(dá)到判斷病變性質(zhì)的目的[8]。本研究探討基于增強(qiáng)CT的影像組學(xué)模型鑒別ccRCC與non-ccRCC的價(jià)值。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 回顧性分析2017年1月—2019年9月河北大學(xué)附屬醫(yī)院收治的179例RCC患者的影像學(xué)資料,男93例,女86例,年齡27~88歲,平均(58.4±10.6)歲;腫瘤最大徑2~11 cm,平均(6.48±3.46)cm;術(shù)后病理診斷ccRCC 147例,non-ccRCC 32例(pRCC 20例、chRCC 9例、CDC 3例)。納入標(biāo)準(zhǔn):①病理檢查明確診斷RCC及其分型;②術(shù)前3周接受增強(qiáng)CT皮質(zhì)期掃描。排除標(biāo)準(zhǔn):①病灶內(nèi)存在直徑超過4~5 cm的壞死、囊變;②腫瘤已發(fā)生轉(zhuǎn)移;③圖像質(zhì)量不佳。將患者隨機(jī)分為訓(xùn)練集和測試集。訓(xùn)練集125例,男64例,女61例,年齡27~87歲,平均(58.4±9.9)歲,64例≤60歲;non-ccRCC 22例(pRCC 15例、chRCC 6例、CDC 1例),ccRCC 103例。測試集54例,男29例,女25例,年齡30~88歲,平均(59.7±9.1)歲;其中non-ccRCC 10例(pRCC 5例、chRCC 3例、CDC 2例),ccRCC 44例。

        1.2 儀器與方法 采用GE Discovery HD750 64排CT掃描儀。囑患者禁食6~8 h后,行腎臟平掃及增強(qiáng)掃描。掃描參數(shù):層厚5 mm,螺距0.984:1,掃描視野36 cm×43 cm,矩陣512×512,管電壓100~120 kV,管電流134~409 mA,窗寬250~450 HU,窗位30~50 HU。對比劑為非離子型碘佛醇,經(jīng)肘靜脈注射,流率3.0~3.5 ml/s,劑量1.0~1.2 ml/kg體質(zhì)量。皮質(zhì)期、髓質(zhì)期、排泄期掃描時(shí)間分別為注射對比劑后30~35 s、50~60 s和180 s。

        1.3 圖像分割、特征提取與建模 將CT增強(qiáng)圖像(皮質(zhì)期)導(dǎo)入ITK-SNAP(www.itk-snap.org)軟件,由2名具有8~10年工作經(jīng)驗(yàn)的影像學(xué)醫(yī)師分別獨(dú)立勾畫ROI(圖1~3)。ROI勾畫原則:①選取PACS系統(tǒng)上DICOM格式的圖像;②距病灶皮質(zhì)期邊緣內(nèi)側(cè)0~1 mm;③逐層勾畫,獲得病灶的ROI容積(volume of interest, VOI);④包含小范圍壞死囊變及強(qiáng)化血管;⑤避開腎靜脈內(nèi)的瘤栓;⑥對于non-ccRCC皮質(zhì)期,參考髓質(zhì)期圖像勾畫ROI。

        將所有原始圖像文件及勾畫好的ROI文件導(dǎo)入A.K軟件(GE Artificial Intelligence Kit)進(jìn)行特征提取,包括直方圖特征、形態(tài)學(xué)特征及二階紋理特征(灰度共生矩陣、游程矩陣等),共生成396個(gè)特征;釆用單因素方差分析及秩和檢驗(yàn)、一般線性模型和前10%互信息(mutual information, MI)3種方法依次進(jìn)行特征降維,最終選取16個(gè)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的特征,即LargeAreaEmphasis、 OneVoxelVolume HaralickCorrelation_angle0_offset7、ClusterProminence_angle135_offset7、ShortRunEmphasis_angle0_offset4、LowGreyLevelRunEmphasis_AllDirection_offset1_SD、HaralickCorrelation_angle135_offset4、LeastAxisLength、LowIntensityLargeAreaEmphasis、最大像素值(MaxIntensity)、直方圖熵(histogramEntropy)、方差(variance)、直方圖能量(histogramEnergy)、平均像素值(MeanValue)、直方圖標(biāo)準(zhǔn)差(stdDeviation)和hara熵(haraEntroy)。分別建立線性邏輯回歸(logistic regression, LR)模型及非線性隨機(jī)森林(random forest,RF)模型,保留AUC最大且特異度較高的模型,釆用測試數(shù)據(jù)進(jìn)行模型評估。

        表1 訓(xùn)練集、測試集中RF、LR模型診斷ccRCC的效能

        圖1 患者男,59歲,pRCC 皮質(zhì)期CT增強(qiáng)圖像(虛線為ROI) 圖2 患者女,62歲,ccRCC 皮質(zhì)期CT增強(qiáng)圖像(虛線為ROI) 圖3 患者男,71歲,chRCC 皮質(zhì)期CT增強(qiáng)圖像(虛線為ROI)

        圖4 RF、LR模型診斷ccRCC的ROC曲線 A. RF模型的訓(xùn)練集和測試集ROC曲線; B. LR模型的訓(xùn)練集和測試集ROC曲線。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 釆用SPSS 24.0統(tǒng)計(jì)分析軟件,以獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)比較訓(xùn)練集和測試集患者年齡,χ2檢驗(yàn)比較性別和ccRCC在的訓(xùn)練集和測試集之間的分布。采用ROC曲線評價(jià)LR、RF模型鑒別ccRCC與non-ccRCC的效能。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        訓(xùn)練集和測試集患者年齡(t=2.13,P=0.05)、性別(χ2=0.41,P=0.05)、ccRCC在的訓(xùn)練集和測試集之間的分布(χ2=0.02,P=0.90)差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        ROC曲線結(jié)果顯示,訓(xùn)練集RF模型診斷ccRCC的AUC為0.96(P<0.05),特異度為1.00,敏感度0.83;LR模型診斷ccRCC的AUC為0.96(P<0.05),特異度為1.00,敏感度為0.83。測試集RF模型診斷ccRCC的AUC為0.96(P<0.05),特異度為1.00,敏感度為0.89;LR診斷ccRCC的AUC為0.88(P<0.05),特異度為0.90,敏感度為0.77。見表1、圖4。

        將RF預(yù)測模型帶入原始數(shù)據(jù)中進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果顯示訓(xùn)練集中ccRCC真陽性85例,non-ccRCC真陰性22例,測試集中ccRCC真陽性39例,non-ccRCC真陰性10例。將LR預(yù)測模型帶入原始數(shù)據(jù)中進(jìn)行預(yù)測,訓(xùn)練集中ccRCC真陽性85例,non-ccRCC真陰性22例;測試集中ccRCC真陽性34例,non-ccRCC真陰性9例。

        3 討論

        RCC是腎臟最常見的惡性腫瘤,約20% RCC患者就診時(shí)已發(fā)生轉(zhuǎn)移,早期診斷RCC對于指導(dǎo)臨床治療意義重大[2-3]。盡管多期增強(qiáng)CT可用于鑒別RCC亞型[3],但在臨床工作中仍有很高的誤診率。目前采用影像組學(xué)特征鑒別RCC亞型的研究[9]較少,且缺乏研究RCC亞型之間潛在的分子基礎(chǔ)。既往有研究[3,5-6]評估增強(qiáng)CT模式、2D紋理和其他定量參數(shù)對RCC亞型的診斷效能,發(fā)現(xiàn)其各有不足[10]。放射組學(xué)具有可重復(fù)性,已逐漸應(yīng)用于臨床。本研究提取RCC皮質(zhì)期CT增強(qiáng)圖像特征建立模型,可更直觀地反映腫瘤的整體特征[10],即使選擇一期進(jìn)行分析,模型對鑒別ccRCC與non-ccRCC的敏感度和特異度仍較高,為傳統(tǒng)CT增強(qiáng)所不及;盡管本組non-ccRCC病例數(shù)較少,但兩種模型的特異度均較高,提示模型未過擬合,泛化能力較好。

        Zhu等[11]認(rèn)為低強(qiáng)化是高級別ccRCC的特征。本研究于腎臟腫瘤CT增強(qiáng)皮質(zhì)期勾畫ROI,利用A.K軟件提取其影像特征(灰度分布、小波特征及紋理特征等),以反映腫瘤內(nèi)部的異質(zhì)性[12]。異質(zhì)性是惡性腫瘤的重要特征,與其惡性生物學(xué)行為關(guān)聯(lián)密切[13],能夠反映相關(guān)生長因子變化及腫瘤生長微環(huán)境的變化,而這些變化可導(dǎo)致腫瘤局部區(qū)域發(fā)生細(xì)胞增殖或凋亡、內(nèi)部代謝活躍或抑制、腫瘤血管增加或減少等[14];腫瘤血管生成的異質(zhì)性可能導(dǎo)致局部有效血流灌注減少,引起該區(qū)域缺氧,導(dǎo)致間質(zhì)靜水壓增高等獨(dú)特的腫瘤微環(huán)境變化,最終增加腫瘤侵襲和轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn)[15-16]。

        由于本組non-ccRCC例數(shù)較少,可能存在建模偏差,故分別采用線性的LR模型和非線性的RF模型進(jìn)行建模并對比;ROC曲線結(jié)果顯示,測試集RF模型診斷ccRCC的AUC達(dá)0.96,LR模型為0.88。LR模型的診斷效能不及RF模型,原因可能在于RCC亞型與特征之間呈非線性關(guān)系,而LR模型為線性模型,故診斷效能相對差;RF為非線性,可更加穩(wěn)定地預(yù)測非線性數(shù)據(jù)。此外,RF模型可處理高維度數(shù)據(jù),且毋須進(jìn)行特征選擇(特征子集隨機(jī)),訓(xùn)練速度快,易采用并行化方法。Li等[17]聯(lián)合von Hippel-Lindau(VHL)基因分別建立影像組學(xué)模型Boruta、mRMRe,結(jié)果顯示測試集在兩種模型中鑒別診斷ccRCC與non-ccRCC的AUC分別為0.969、0.900,與本研究的RF模型(AUC=0.96)相當(dāng)?shù)哂谠摻MLR模型(AUC=0.88)。

        本研究的局限性:樣本量較小,且non-ccRCC樣本量更少;臨床資料中無家族病史,未做組合模型;non-ccRCC樣本僅納入pRCC、chRCC、CDC病例,未涉及其他病理類型non-ccRCC;勾畫ROI時(shí),受部分腫塊邊緣不清晰或部分容積效應(yīng)的影響,導(dǎo)致準(zhǔn)確率降低,且病灶壞死囊變會(huì)在一定程度上影響影像組學(xué)分析結(jié)果。

        總之,基于增強(qiáng)CT的影像組學(xué)模型可用于鑒別ccRCC與non-ccRCC,其中RF模型的診斷價(jià)值更高。

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