王 鵬,李芳弟,郭天順,竇俊煥,頡煒清,羅照霞,齊小東,楊 晨,趙中梁,宋 怡,呂 汰
(甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,甘肅 天水 741001)
隨著馬鈴薯主糧化發(fā)展和加工業(yè)企業(yè)興起的需要,育成的品種除具備抗病、高產(chǎn)特性外,還需適宜食品加工(炸片、炸條、淀粉、全粉)和鮮薯出口。甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所由于馬鈴薯種質(zhì)資源保存與利用滯后,育種缺乏優(yōu)質(zhì)親本,現(xiàn)已育成品種主要以甘肅省平?jīng)鍪星f浪縣農(nóng)機(jī)推廣中心育成的品種‘莊薯3 號’和甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所自育品系‘天99-5-4’為親本。
種質(zhì)的價(jià)值決定于種質(zhì)自身的遺傳多樣性、可利用性和有效性[1]。在育種實(shí)踐中,環(huán)境及人為因素的影響使得選擇過程操作起來較為困難,而利用DNA指紋差異則可直接提供與目標(biāo)性狀有關(guān)的DNA水平信息,避免了環(huán)境干擾,從而大大提高了雜交育種對親本及后代理想單株的選擇效率[2]。國外分子標(biāo)記技術(shù)用于馬鈴薯遺傳多樣性研究較早[3-6]。近年來,Gavrilenko等[7]利用SSR標(biāo)記技術(shù)對237份具有栽培馬鈴薯特性的種質(zhì)和155份具有野生種特性并接近栽培種種質(zhì)的遺傳多樣性進(jìn)行分析,并分析其與野生種的遺傳關(guān)系,結(jié)果表明,所有的材料聚為A、B 兩大類,A 類包括了具有二倍體、三倍體和四倍體的栽培種和部分具有野生型親本的種質(zhì),B類包括大部分的野生型種質(zhì)和雜交栽培種。國內(nèi)分子標(biāo)記技術(shù)用于馬鈴薯遺傳多樣性研究相比國外較晚[8-14]。Wang Fang 等[15]利用AFLP 分子標(biāo)記技術(shù)對123份引自國際馬鈴薯中心(CIP)及部分國內(nèi)育成馬鈴薯品種進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果表明,CIP引進(jìn)馬鈴薯種質(zhì)遺傳多樣性豐富,中國馬鈴薯品種遺傳相似度較高,遺傳基礎(chǔ)狹窄,可以利用CIP資源來拓寬中國馬鈴薯狹窄的遺傳基礎(chǔ)。
為了擴(kuò)大馬鈴薯種質(zhì)資源基因庫,迎合中國馬鈴薯主食化發(fā)展及對主食化品種的需求,甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所近兩年收集并引進(jìn)不同基因型的馬鈴薯資源。為進(jìn)一步將這些資源材料用于馬鈴薯育種親本的選配中,本研究利用引進(jìn)的國內(nèi)育成馬鈴薯品種以及甘肅省主要育成的部分馬鈴薯品種,用SSR分子標(biāo)記檢測方法對其遺傳關(guān)系進(jìn)行研究,明確甘肅省部分馬鈴薯栽培品種與引進(jìn)馬鈴薯品種的遺傳多樣性,為拓寬甘肅省馬鈴薯育成品種遺傳基礎(chǔ)提供理論依據(jù)。
馬鈴薯品種共計(jì)65個(gè)(表1),包括甘肅省育成品種14個(gè),引進(jìn)馬鈴薯品種47個(gè),甘肅省天水市地方品種4個(gè)。
摘取馬鈴薯田間幼嫩葉片,利用改良的CTAB法[16]提取馬鈴薯基因組DNA。用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA樣品的質(zhì)量和完整性。
采用輪篩法篩選多態(tài)性較好的引物,第1輪隨機(jī)選取‘天薯11號’和‘中薯18號’,SSR引物來自于公開發(fā)表的文獻(xiàn)[6,17,18],從100對引物中篩選出在兩份材料間有條帶的引物;第2輪以5份材料(‘天薯10號’、‘隴薯7號’、‘中薯10號’、‘云薯506’、‘麗薯10號’)進(jìn)一步篩選出多態(tài)性指數(shù)較高的引物,引物多態(tài)性指數(shù)PPB(Percentage of polymorphic bands):PPB(%)=(K/N)×100,(其中K 為擴(kuò)增多態(tài)性條帶數(shù),N為擴(kuò)增條帶總數(shù))。用篩選出的多態(tài)性指數(shù)較高的SSR引物對供試馬鈴薯品種進(jìn)行擴(kuò)增分析。
表1 供試材料名稱及來源Table 1 Names and sources of materials
續(xù)表1Continued Table 1
1.4.1 PCR擴(kuò)增體系
PCR 反 應(yīng)在Eppendorf Master-cycler PCR 擴(kuò)增儀上進(jìn)行。SSR反應(yīng)體系和程序按照Ghislain等[6]的方法,SSR-PCR體系(10 μL):2×Taq PCR Master Mix(中科瑞泰生物科技有限公司)5 L,10 ng/μL上游引物和下游引物各1 μL,100 ng/μL 模板DNA 1 μL,ddH2O 2 μL。反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性1 min,復(fù)性(以引物最適退火溫度而定)50 s,72 ℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。
1.4.2 PAGE凝膠電泳檢測
采用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠對PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳(恒功率70 W 電泳1.5 h)。凝膠染色步驟:ddH2O 漂洗2~3 min,2 g/L 硝酸銀染色15 min,蒸餾水漂洗30 s,20 g/L氫氧化鈉中加入37%甲醛4 mL顯色至條帶清晰可見,蒸餾水漂洗,照相。
對擴(kuò)增后清晰、穩(wěn)定、易讀的條帶采用‘0-1’系統(tǒng)記錄其位置,在相同的遷移位置上有帶記‘1’,無帶記‘0’,構(gòu)建‘0,1’二元數(shù)據(jù)矩陣。利用NTSYS-pc 2.1遺傳多樣性分析軟件計(jì)算供試材料之間的遺傳相似系數(shù),按照UPGMA(Un-weighted pair group method using arithmetic averages)方法進(jìn)行聚類分析,并通過Tree plot模塊生成聚類圖。
篩選出25對多態(tài)性指數(shù)較高的馬鈴薯SSR引物(表2)。
利用篩選出的25 對多態(tài)性指數(shù)較高的SSR 引物,對65 份馬鈴薯品種進(jìn)行SSR 擴(kuò)增分析。擴(kuò)增結(jié)果顯示,25 對引物共檢測出145 個(gè)清晰、穩(wěn)定、易讀的條帶,引物擴(kuò)增條帶數(shù)為3~12 個(gè),平均每對引物擴(kuò)增出5.88 個(gè)條帶,其中,多態(tài)性條帶145 個(gè),平均多態(tài)性比率為100%。引物STI005擴(kuò)增出的條帶數(shù)最多(12個(gè)),擴(kuò)增條帶數(shù)最少的為引 物STM1104、STGBSS、SSR594、STM1106 和STI052,條帶總數(shù)均為3 個(gè)(表2)。圖1 為引物STI052對部分馬鈴薯基因型的擴(kuò)增結(jié)果。
表2 馬鈴薯品種SSR分析的多態(tài)性引物序列Table 2 Polymorphic primer sequences of potato variety SSR analysis
圖1 引物STI052對部分馬鈴薯品種的SSR擴(kuò)增Figure 1 SSR amplification of some potato varieties by Primer STI052
用NTSYS-pc 2.1數(shù)據(jù)分析軟件計(jì)算了65份供試馬鈴薯品種兩兩之間的遺傳相似系數(shù)(Genetic similarity,GS)在0.60~0.93,平均遺傳相似系數(shù)為0.76?;谶z傳相似系數(shù)用類平均法(UPGMA)對供試材料進(jìn)行聚類,結(jié)果表明(圖2),在GS 為0.60時(shí),供試材料分為兩大類,‘華恩1 號’單獨(dú)聚為一類,該品種為華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、湖北恩施中國南方馬鈴薯研究中心從雜交組合‘395049’的子代實(shí)生系中選擇優(yōu)良單株經(jīng)無性繁殖而成的品種。其余64 份材料聚為第二類;在GS 為0.61 時(shí),第二類又分為兩個(gè)亞類,‘農(nóng)天1 號’、‘甘谷紫’、‘天薯9 號’、‘五龍洋芋’、‘天薯10 號’聚為第一亞類;其余59份材料聚為第二亞類;‘農(nóng)天1號’、‘天薯9號’和‘天薯10號’為甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所先后選育的品種,‘農(nóng)天1號’和‘天薯10號’共同親本是‘莊薯3號’,其中,‘甘谷紫’和‘五龍洋芋’均為天水地方品種。在GS為0.64時(shí),第二亞類又分為2個(gè)亞亞類:第1亞亞類為‘天薯11號’、‘青薯10號’、‘青薯6號’、‘甘谷紅’和‘秦州紅’,其中,青海省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所育成的‘青薯10號’和‘青薯6 號’相似系數(shù)最高,達(dá)0.93,搜集于甘肅省天水市不同的兩個(gè)縣區(qū)的地方品種‘甘谷紅’和‘秦州紅’相似系數(shù)較高,達(dá)0.88,其外觀(薯型、薯皮、芽眼等)有一定的相似性,其余54 份材料聚為第2 亞亞類:在GS為0.65時(shí),‘延薯系列(延薯4、7、8、9、10)’、‘鄂馬鈴薯11號’和‘米拉’7份材料被聚為一組,在GS為0.66時(shí),‘隴薯13號’和‘夏波蒂’,‘紅玫瑰’、‘希森6號’、‘克新22號’和‘蘇蘭1號’分別聚在一起,其余41 份材料(占供試材料的63.08%):在GS 為0.67 時(shí),‘中薯7 號’、‘虎頭’、‘中薯18號’、‘大西洋’、‘早大白’、‘鄂薯5號’、‘麗薯6號’、‘云薯605’、‘宣薯5號’、‘中薯19號’、‘川涼薯7號’、‘畢薯2號’和‘克新6號’13份材料聚在一起,在GS為0.68時(shí),‘青薯2號’、‘冀張薯14號’、‘冀張薯8號’、‘云薯201’、‘蒙薯17號’、‘蒙薯10號’、‘中薯3號’、‘鄭薯7號’、‘農(nóng)天2號’、‘中薯10號’、‘中薯11號’、‘天薯13號’、‘青薯9號’、‘希森5號’、‘希森3號’、‘隴薯12號’、‘費(fèi)烏瑞它’、‘冀張薯12號’和‘隴薯6號’19份材料聚為一組,在GS為0.70時(shí),‘隴薯8號’、‘隴薯7號’、‘莊薯4號’、‘肯德’、‘天薯12號’、‘中薯8號’、‘隴薯10號’、‘青薯7號’和‘訥薯16號’9份材料聚在一起。來自于美國的薯片加工型品種‘大西洋’、來自于德國的中晚熟品種‘米拉’、來自于加拿大的薯?xiàng)l加工型品種‘夏波蒂’與國內(nèi)育成品種的遺傳差異并不十分明顯,這可能是由于這些品種被引進(jìn)國內(nèi)后,將其作為親本反復(fù)利用,與國內(nèi)育成品種做過很多雜交,因此,育成品種中有其血緣,遺傳關(guān)系較近,遺傳差異較小。
圖2 供試馬鈴薯品種的聚類Figure 2 Cluster analysis of tested potato varieties
就供試馬鈴薯品種的遺傳距離(Genetic distance,GD)來看,樂陵希森馬鈴薯產(chǎn)業(yè)集團(tuán)有限公司育成的早熟馬鈴薯品種‘希森3號’與甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所育成的晚熟淀粉加工型品種(淀粉含量達(dá)19.44%)‘天薯10 號’、甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)與天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所合作育成的鮮食菜用型馬鈴薯品種‘農(nóng)天1號’遺傳距離最大(GD=1.000 0),‘希森3號’與‘天薯9號’差異也較大;‘天薯10 號’與‘紅玫瑰’、‘希森3 號’與‘五龍洋芋’親緣關(guān)系最遠(yuǎn),遺傳距離最大,均為0.922 4,‘農(nóng)天1號’與早熟品種‘費(fèi)烏瑞它’(GD=0.862 5)、‘紅玫瑰’、‘延薯4號’、‘云薯605’遺傳差異均較大,親緣關(guān)系較遠(yuǎn);‘天薯10 號’與‘延薯10 號’(GD=0.853 7)、‘肯德’、‘夏波蒂’的親緣關(guān)系均較遠(yuǎn),遺傳距離均大于0.800 0,其次,‘天薯10號’與‘米拉’、‘延薯9號’、‘蒙薯10號’、‘隴薯12號’、‘中薯7號’、‘中薯19號’、‘蘇蘭1號’、‘希森5號’、‘中薯3號’、‘云薯605’遺傳差異也較大,‘天薯10號’和‘農(nóng)天1號’是當(dāng)?shù)赜N單位重要的育種親本,在馬鈴薯雜交育種中,可以利用‘天薯10號’、‘農(nóng)天1號’與上述遺傳差異較大的品種進(jìn)行雜交選配工作,進(jìn)而為選育出綜合性狀優(yōu)異的馬鈴薯新品種奠定基礎(chǔ)。部分供試馬鈴薯品種的遺傳距離見表3。
馬鈴薯品種來源、遺傳距離和遺傳背景差異較大的在聚類圖(圖2)中被分離出聚為一類,如‘華恩1號’、‘天薯11號’、‘鄂馬鈴薯11號’等。來源相同或同一育種單位的育成品種,遺傳差異較小、距離較近,如甘肅天水地方品種和育成品種‘農(nóng)天1號’、‘天薯9號’、‘天薯10號’、‘甘谷紫’和‘五龍洋芋’聚在一起,‘延薯4號’、‘延薯7號’、‘延薯8號’、‘延薯9號’和‘延薯10號’聚在一起,‘青薯10號’和‘青薯6 號’、‘青薯7 號’和‘訥薯16 號’、‘中薯10號’和‘中薯11 號’、‘蒙薯10 號’和‘蒙薯17 號’、‘冀張薯8號’和‘冀張薯12號’分別聚在一起。這可能由于相同栽培區(qū)域和各育種單位集中化利用親本,所以同一個(gè)育種單位培育的品種大多聚在相同類群中,該結(jié)果與時(shí)啟冬等[19]和段艷鳳等[20]的研究結(jié)果一致。比如,‘延薯9號’是吉林省延邊朝鮮族自治州農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院以‘延薯8 號’為母本、‘早大白’為父本育成的中晚熟品種,‘延薯7號’是以‘延薯4號’為母本、‘早大白’為父本,有性雜交獲得實(shí)生籽,經(jīng)過各世代鑒定篩選而育成。所以都聚在一起,由此也證明了SSR分子標(biāo)記方法在作物品種血緣關(guān)系分析中的準(zhǔn)確性與可靠性。
在本研究中有些聚類分析結(jié)果與實(shí)際的親緣關(guān)系不太符合,如‘青薯10號’和‘青薯6號’在本研究中相似系數(shù)較高,兩個(gè)品種均為青海省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所先后選育而成,‘青薯10號’是從國際馬鈴 薯 中 心(CIP)引 進(jìn) 雜 交 組 合(‘387521.3’בAphrodite’)材料‘C92.140-05’中選出優(yōu)良單株ZT,后經(jīng)系統(tǒng)選育而成,而‘青薯6號’親本為‘固33-1’和‘92-9-44’(‘73-21-1’בDesiree’),兩個(gè)品種沒有共同的親本,此結(jié)果的產(chǎn)生可能與研究中所選的SSR引物及其數(shù)量有關(guān),擴(kuò)增獲得的多態(tài)性條帶有限,不能充分表現(xiàn)出材料之間真實(shí)的遺傳關(guān)系。
也有不同來源的品種相似性較高,如‘大西洋’和‘中薯18號’、‘費(fèi)烏瑞它’和‘冀張薯12號’、‘中薯3號’和‘鄭薯7號’、‘隴薯7號’和‘莊薯4號’等,‘中薯18 號’是中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所用‘C91.628’בC93.154’選育的品種,‘大西洋’親本為‘B5141-6’(Lenape)בWauseon’,是1978 年由農(nóng)業(yè)部和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院引入中國,這很可能是不同育種單位間相互引種,共用親本,使得這些品種具有共同的血緣,遺傳差異較小。但是,部分血緣關(guān)系較近的品種相似性卻不高,比如,早熟品種‘鄭薯7 號’為河南省鄭州市蔬菜研究所利用‘費(fèi)烏瑞它’為母本、‘豫馬鈴薯1號’為父本育成,炸片加工型品種‘大西洋’為‘冀張薯12號’的母本,可是,
在本研究中,‘鄭薯7號’與其母本早熟品種‘費(fèi)烏瑞它’、‘冀張薯12號’與‘大西洋’卻相聚較遠(yuǎn),這可能是雜交后代中群體分離比較大,使其與親本間發(fā)生了較大的遺傳差異。
表3 部分供試馬鈴薯品種的遺傳距離Table 3 Genetic distance of some potato varieties
馬鈴薯在中國屬于外來作物,因此,馬鈴薯種質(zhì)資源十分有限,本研究通過對甘肅省主要育成馬鈴薯品種和引進(jìn)品種的遺傳多樣性進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)部分引進(jìn)主食化馬鈴薯品種與甘肅省育成品種遺傳差異較大,是較好的親本資源,應(yīng)加大其今后在馬鈴薯育種中的應(yīng)用。