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        環(huán)介導等溫擴增技術在快速病原菌檢測中的價值

        2019-11-01 04:21:44陳艷玲
        實用檢驗醫(yī)師雜志 2019年3期
        關鍵詞:檢測

        陳艷玲

        作者單位:253200 山東德州,夏津縣人民醫(yī)院檢驗科

        下呼吸道感染為臨床常見感染性疾病,現(xiàn)已成為導致人類死亡的四大原因之一。世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)2013 年統(tǒng)計報告顯示,世界病死率最高的十大疾病死因中,下呼吸道感染位列冠心病和中風之后的第3 位(5.9%),而位于第4 位的慢性阻塞性肺疾病(5.4%)死亡也與感染有一定相關性,呼吸道致病菌感染居各類致病菌感染之首[1-2]。傳統(tǒng)細菌培養(yǎng)和細菌學檢驗技術不能為臨床提供快速準確的診斷結果,導致下呼吸道感染患者未得到及時準確的治療,病死率常年居高不下,而此時繼聚合酶鏈反應(polymerase chain reaction,PCR)技術發(fā)展之后的環(huán)介導等溫擴增技術(loop mediated isothermal amplification,LAMP)在一定程度上彌補了傳統(tǒng)細菌培養(yǎng)的不足,其中晶芯呼吸道病原菌核酸檢測試劑盒采用LAMP 技術,可定性檢測痰液標本中13 種臨床常見下呼吸道病原菌。截至目前,LAMP 技術已廣泛應用于諸多領域,成為許多地區(qū)臨床檢測的常用方法[3]。本研究對下呼吸道感染患者的痰液標本進行LAMP 檢測和傳統(tǒng)細菌培養(yǎng),檢測呼吸道致病菌菌種,比較兩種方法的差異,分析評價LAMP 檢測下呼吸道病原菌的效果。

        1 材料與方法

        1.1 標本來源 收集本院2017 年2 月—2018 年10 月366 例下呼吸道感染患者的痰液標本。

        1.2 儀器與試劑 采用晶芯呼吸道病原菌核酸檢測試劑盒(LAMP 技術)和RtisochipTM-A 等溫擴增微流控芯片核酸分析儀(博奧生物集團有限公司);采用VITEK 2 Compact 細菌鑒定儀、血平板、麥康凱平板(法國生物梅里埃公司)和加萬古霉素的巧克力平板(安圖生物公司);革蘭染色試劑(珠海貝索生物技術有限公司)。

        1.3 檢測方法

        1.3.1 合格痰標本初篩 用無菌接種鉤挑取送檢痰液黏液、膿性部分,革蘭染色后低倍鏡視野(low power lens,LP)下鏡檢,多形核白細胞>25/LP、鱗狀上皮細胞<10/LP 的合格痰液標本納入研究。

        1.3.2 痰培養(yǎng) 選適量膿性或無血部位合格痰標本接種于血平板、加萬古霉素巧克力平板和麥康凱平板,5%~10%二氧化碳(CO2)培養(yǎng)箱35 ℃培養(yǎng)24 h或48 h,觀察培養(yǎng)情況,篩選可疑致病菌進行鑒定。

        1.3.3 LAMP 病原菌檢測 利用晶芯呼吸道病原菌核酸檢測試劑盒檢測,采用LAMP 技術在微流控蝶式芯片上進行反應,DNA 在一定溫度下(60 ℃~65 ℃)處于動態(tài)平衡狀態(tài),利用DNA 聚合酶的鏈置換功能,使DNA 在等溫下不斷復制擴增,完成模板DNA 的合成、循環(huán)擴增、伸長和再循環(huán),根據擴增曲線判讀結果。

        1.3.4 結果判定 呼吸道病原菌核酸檢測完成后,軟件采用最大二階導數(shù)法結合其他算法找出“S 型”擴增曲線進入快速擴增期的第1 個拐點,將拐點對應時刻與原點時刻的差值作為時刻差值(Tp 值),本試劑盒采用ROC 法計算得到每種病原菌的陽性判斷值,根據Tp 值并結合陽性判斷值進行結果判讀。當病原菌Tp 值≤陽性判斷值時結果判定為陽性,當病原菌Tp 值>陽性判斷值時結果判定為陰性。歸一化曲線在“熒光曲線區(qū)域”顯示,質控結果和各指標檢測結果在“檢測結果區(qū)域”顯示。

        1.3.5 統(tǒng)計學方法 應用SPSS 17.0 統(tǒng)計軟件進行數(shù)據分析,計數(shù)資料以率或構成比表示,兩兩比較采用χ2檢驗。P<0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結果

        2.1 痰培養(yǎng)結果 366 份痰液標本中,痰培養(yǎng)檢出陽性標本72 份(陽性率為19.7%)。共檢出108 株致病菌株,其中革蘭陰性(G-)桿菌為86 株(占79.6%),革蘭陽性(G+)球菌22 株(占20.4%),未檢出嗜麥芽窄食單胞菌和肺炎支原體。見表1。

        表1 72 份痰培養(yǎng)陽性標本的病原菌檢出情況

        2.2 LAMP 檢測結果 366 份痰液標本中,LAMP 檢出陽性標本175 份(陽性率為47.8%),其中單一致病菌感染149 份,2 種及以上致病菌混合感染26 份。共檢出236 株致病菌株,其中G-桿菌168 株(占71.2%),G+球菌68 株(占28.8%),未檢出嗜麥芽窄食單胞菌和肺炎支原體。見表2。

        表2 175 份LAMP 陽性標本的病原菌檢出情況

        2.3 兩種方法結果比較 LAMP 陽性檢出率明顯高于痰培養(yǎng)(47.8%比19.7%;χ2=64.826,P<0.01)。

        3 討論

        WHO 2013 年統(tǒng)計報告顯示,各種感染性疾病仍嚴重危害人類健康,占全球死亡人數(shù)的1/3,其中呼吸道感染居各類感染性疾病之首。下呼吸道感染主要包括社區(qū)獲得性肺炎(community acquired pneumonia,CAP)、慢性阻塞性肺疾病急性加重(acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease aecopd,AECOPD)、支氣管擴張合并感染等[4]。由于抗菌藥物在臨床的使用頻率越來越高,菌株耐藥性也逐漸增加,導致院內感染情況愈加嚴重,尤以銅綠假單胞菌、腸球菌和不動桿菌感染為甚[5]。傳統(tǒng)細菌培養(yǎng)在檢測敏感性和檢測周期等方面難以滿足下呼吸道感染的治療要求。本研究采用等溫擴增芯片法,基于LAMP 原理檢測常見下呼吸道病原體(包括肺炎鏈球菌、金黃色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、銅綠假單胞菌、耐甲氧西林葡萄球菌、鮑曼不動桿菌、嗜麥芽窄食單胞菌、流感嗜血桿菌、大腸埃希菌、嗜肺軍團菌、結核分枝桿菌復合群、肺炎支原體和肺炎衣原體)。LAMP 從痰液標本的最初處理至報告發(fā)放全程僅需2~3 h,檢測時間較傳統(tǒng)痰培養(yǎng)明顯縮短。吳曉睛等[6]研究顯示,LAMP 技術具有較高的靈敏度,檢測結果與痰培養(yǎng)有較高的一致性。

        結核病是結核分枝桿菌侵入人體后引起的消耗性疾病,有強烈傳染性,主要經空氣-呼吸道、食物和垂直傳染,目前以肺結核最為多見,90%肺結核通過呼吸道傳染。近幾年結核病的發(fā)病率有所增長,據WHO 報道,每年約有800 萬新病例產生,至少有300 萬人死于結核病。本研究顯示,LAMP 共檢出結核分枝桿菌19 株,檢測時間僅需2~3 h,眾所周知,傳統(tǒng)結核分枝桿菌培養(yǎng)需2~3 周,二者相比,前者從很大程度上縮短了檢測時間,本研究未涉及痰結核分枝桿菌的培養(yǎng)。但郗志華[7]研究表明,LAMP 對結核分枝桿菌檢測有重要的臨床價值,LAMP 陽性率(77.8%)較涂片抗酸染色法(52.78%)明顯升高(P<0.05),其中涂陽培養(yǎng)的LAMP 陽性率為99.73%,涂陰培養(yǎng)的LAMP 陽性率為58.82%。劉毅等[8]研究顯示,LAMP 檢測結核分枝桿菌的敏感性和特異性較高,操作簡便易行,結果快速準確,且不需要昂貴的檢驗設備,值得基層醫(yī)院推廣應用。

        本研究未檢出肺炎支原體和嗜麥芽窄食單胞菌,林牧等[9]研究顯示,LAMP 具有特異性強、穩(wěn)定性高、檢測快速的特點,能快速準確地檢出肺炎支原體,具有較好的推廣應用前景。郭旭光等[10]研究顯示,采用實時熒光LAMP 檢測嗜麥芽窄食單胞菌的穩(wěn)定性高、特異性強、反應速度快,臨床應用價值較高。根據呼吸道感染病原菌檢測結果指導臨床合理應用抗菌藥物,可準確及時地治療呼吸道感染患者[11-12]。本研究痰培養(yǎng)共檢出2株腸球菌,林牧等[9]痰培養(yǎng)共檢出7 例陰溝腸桿菌,而LAMP 由于試劑盒的局限性不能檢出上述兩種細菌。但LAMP 對肺炎衣原體、結核分枝桿菌及嗜肺軍團菌的檢出率較高,這是痰培養(yǎng)無法比擬的,與文獻[12]一致。

        綜上所述,LAMP 會進一步向更快速、簡便、特異、可現(xiàn)場檢測、檢出病原菌種類更多的方向發(fā)展,不僅能快速準確地檢出傳統(tǒng)呼吸道病原菌,還能檢出肺炎支原體、肺炎衣原體和嗜肺軍團菌等細菌培養(yǎng)難以檢出的病原菌,可廣泛應用于基層醫(yī)院。當然,由于試劑盒的局限性,LAMP 還無法檢出某些不常見的下呼吸道感染病原菌。兩種檢測方法聯(lián)合應用能為臨床提供準確、可靠、及時的診斷依據。

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