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        遺傳計(jì)算中數(shù)學(xué)模型的構(gòu)建

        2019-10-31 08:35:18張玉平馮明董
        生物學(xué)通報(bào) 2019年1期

        張玉平 馮明董

        (1廣東廣雅中學(xué) 廣東廣州 510160)

        關(guān)于基因頻率的考題中,常會(huì)有這樣的情況:已知常染色體隱形基因(a)的頻率,需要據(jù)此求出顯性表現(xiàn)群體(AA 和Aa)中攜帶者(Aa)的頻率。這時(shí)常規(guī)解法往往需要利用遺傳平衡定律,先分別求出AA 和Aa 的頻率,然后再求出其中Aa 的頻率。這樣的算法在計(jì)算過程中數(shù)據(jù)往往比較復(fù)雜,有分?jǐn)?shù)和平方,極易出錯(cuò),許多學(xué)生知道怎么做,卻由于計(jì)算問題,耗費(fèi)了大量時(shí)間,最后得出的卻是錯(cuò)誤答案??荚嚂r(shí),由于時(shí)間緊迫,很大一部分學(xué)生看到此類題會(huì)直接放棄。

        1 規(guī)律的發(fā)現(xiàn)及數(shù)學(xué)模型的歸納

        在教學(xué)過程中,筆者發(fā)現(xiàn)此類題的答案有一定的規(guī)律,并歸納總結(jié)出一定的數(shù)學(xué)模型,再用數(shù)學(xué)方法加以證明。有此模型,在已知常染色體隱形基因(a)的頻率時(shí),不用再去利用遺傳平衡定律進(jìn)行繁瑣的計(jì)算,直接將數(shù)據(jù)套入一個(gè)簡(jiǎn)單的公式,可快速而準(zhǔn)確地算出顯性表現(xiàn)群體中攜帶者的頻率,極大節(jié)約了時(shí)間,提高了準(zhǔn)確率。

        例1,假設(shè)群體中某常染色體隱形基因(a)的頻率是1/10,則顯性表現(xiàn)群體(AA 和Aa)中攜帶者(Aa)的頻率為_______________。

        1.1 常規(guī)解法 運(yùn)用遺傳平衡定律,首先分別求出總?cè)后w中AA 和Aa 的頻率,再求出顯性表現(xiàn)群體中攜帶者的頻率,如下所示:

        2種基因的頻率分別為a:1/10;A:9/10。

        2種顯性表現(xiàn)基因型的頻率分別為AA:(9/10)2=81/100;Aa:2×(1/10)×(9/10)=18/100。

        所以,顯性表現(xiàn)群體中攜帶者的頻率為:

        Aa/(AA+Aa)=(18/100)/(18/100+81/100)=2/11。

        1.2 總結(jié)規(guī)律,歸納模型 這類題做多了會(huì)發(fā)現(xiàn)以下規(guī)律:

        1)若2種基因的頻率分別為a:1/20;A:19/20。

        則2種顯性表現(xiàn)基因型的頻率分別為AA:(19/20)2;Aa:2×(1/20)×(19/20)。

        顯性表現(xiàn)群體中攜帶者的頻率為:Aa/(AA+Aa)=2/21。2)若2種基因的頻率分別為a:1/30;A:29/30。

        則2種顯性表現(xiàn)基因型的頻率分別為AA:(29/30);Aa:2×(1/30)×(29/30)。

        顯性表現(xiàn)群體中攜帶者的頻率為:Aa/(AA+Aa)=2/31。

        按照以上規(guī)律,以此類推,根據(jù)數(shù)學(xué)方法歸納出數(shù)學(xué)通式,設(shè)a 的基因頻率為m,則正常群體中攜帶者的概率=2/(1+1/m)。

        2 數(shù)學(xué)模型的論證

        此通式是否具有普遍性,遺傳計(jì)算中能否大膽放心使用? 筆者用數(shù)學(xué)方法加以論證。

        若2種基因的頻率分別為a:m;A:1-m。

        則2種顯性表現(xiàn)基因型的頻率分別為AA:(1-m)2;Aa:2m(1-m)。

        顯性表現(xiàn)群體中攜帶者的頻率為:Aa/(AA+Aa)=2m(1-m)/[(1-m)2+2m(1-m)]

        =2m/(1+m)

        =2/(1+1/m)。

        3 數(shù)學(xué)模型的應(yīng)用

        例2,(2013年安徽省理綜,第31題)圖1是一個(gè)常染色體遺傳病的家系系譜。致病基因(a)是由正?;颍ˋ)序列中一個(gè)堿基對(duì)的替換而形成的。圖2顯示的是A 和a 基因區(qū)域中某限制酶的酶切位點(diǎn)。分別提取家系中Ⅰ1、Ⅰ2和Ⅱ1的DNA,經(jīng)過酶切、電泳等步驟,再用特異性探針做分子雜交,結(jié)果見圖3。

        圖1

        圖2

        圖3

        1)Ⅱ2的基因型是________。

        2)一個(gè)處于平衡狀態(tài)的群體中a 基因的頻率為q。如果Ⅱ2與一個(gè)正常男性隨機(jī)婚配,他們第1個(gè)孩子患病的概率為______。如果第1個(gè)孩子是患者,他們第2個(gè)孩子正常的概率為_______。

        3)研究表明,世界不同地區(qū)的群體之間,雜合子(Aa)的頻率存在著明顯的差異。請(qǐng)簡(jiǎn)要解釋這種現(xiàn)象。①_____________;②________________。

        4)B 和b 是一對(duì)等位基因。為了研究A、a 與B、b 的位置關(guān)系,遺傳學(xué)家對(duì)若干基因型為AaBb和AABB 個(gè)體婚配的眾多后代的基因型進(jìn)行了分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)這些后代的基因型只有AaBB 和AABb 2種。據(jù)此,可以判斷這2對(duì)基因位于____染色體上,理由是__________________________。

        5)基因工程中限制酶的作用是識(shí)別雙鏈DNA分子的____________,并切割DNA 雙鏈。

        6)根據(jù)圖2和圖3,可以判斷分子雜交所用探針與A 基因結(jié)合的位置位于______________。

        答案:1)aa 2)q/3(q+1) 3/43)①不同地區(qū)基因突變頻率因環(huán)境的差異而不同 ②不同環(huán)境條件下,選擇作用會(huì)有所不同 4)一對(duì)同源個(gè)體AaBb 只能產(chǎn)生aB 和Ab 2種配子 5)核苷酸序列6)酶切位點(diǎn)①與②之間。

        針對(duì)小題2的2種解法比較。

        傳統(tǒng)解法:①根據(jù)圖中信息可推知Ⅰ1、Ⅰ2基因型均為Aa,Ⅱ2基因型情況為1/3AA、2/3Aa;②Ⅱ2的丈夫表現(xiàn)正常,其他信息不知,只能從群體中的頻率計(jì)算其基因型情況,根據(jù)題干首先得出A 頻率為1-q,再推出AA、Aa 的頻率分別為(1-q)2和2q(1-q),Ⅱ2的丈夫表現(xiàn)正常,所以其為攜帶者的概率為2q(1-q)/[(1-q)2+2q(1-q)],化簡(jiǎn)為2/(1+1/q); ③最后再算出Ⅱ2夫婦生出患病孩子的概率為(2/3)×[2/(1+1/q)]×(1/4)=q/3(q+1)。

        應(yīng)用數(shù)學(xué)模型法:①據(jù)題知Ⅱ2基因型情況為1/3AA、2/3Aa;②丈夫表現(xiàn)正常,其他未知,可利用數(shù)學(xué)模型快速得知其為攜帶者的概率為2/(1+1/q);③Ⅱ2夫婦所生孩子患病概率為(2/3)×[2/(1+1/q)]×(1/4)=q/3(q+1)。

        經(jīng)比較可以發(fā)現(xiàn)傳統(tǒng)解法中間步驟較多,計(jì)算繁瑣,容易出錯(cuò)。而利用數(shù)學(xué)模型法,計(jì)算步驟少,更加簡(jiǎn)單直接,準(zhǔn)確率高,還節(jié)約時(shí)間。

        例3,圖4為某家族甲、乙2種遺傳?。ň煌{生命)的系譜圖。甲遺傳病由一對(duì)等位基因(A、a)控制,且甲病在人群中發(fā)病率為1/900;乙遺傳病由另一對(duì)等位基因(B、b)控制,這2對(duì)等位基因獨(dú)立遺傳。已知Ⅲ-4攜帶甲遺傳病的致病基因,但不攜帶乙遺傳病的致病基因?;卮饐栴}:

        圖4

        1)甲病的遺傳方式是________,乙病的遺傳方式是________。

        2)Ⅱ-2的基因型為__________,Ⅲ-3的基因型為_________。

        3)若Ⅲ-3和Ⅲ-4再生一個(gè)孩子,則這個(gè)孩子為同時(shí)患甲、乙2種遺傳病男孩的概率是_______。

        4)若Ⅳ-1與一個(gè)正常男性結(jié)婚,則他們生一個(gè)患甲遺傳病孩子的概率是______。

        答案:1)常染色體隱性遺傳 伴X 染色體隱性遺傳2)AaXBXbAAXBXb或AaXBXb3)1/244)3/310。

        針對(duì)小題4的2種解法比較。

        傳統(tǒng)解法:①根據(jù)題干信息可知Ⅲ-3甲病基因型情況為1/3AA,2/3Aa,Ⅲ-4基因型為Aa,而Ⅳ-1表現(xiàn)正常,其基因型情況為2/5AA,3/5Aa;②Ⅳ-1的丈夫表現(xiàn)正常,其他信息不知,只能從群體中的頻率計(jì)算其基因型情況。根據(jù)發(fā)病率可知aa 頻率為1/900,所以a、A 的頻率分別為1/30和29/30,所以AA、Aa 的頻率分別為841/900和58/900,所以其為攜帶者的概率為(58/900)/[(841/900)+(58/900)]=2/31; ③Ⅳ-1夫婦生出患病孩子的概率為(3/5)×(2/31)×(1/4)=3/310。

        應(yīng)用數(shù)學(xué)模型法:①據(jù)題可推知Ⅳ-1甲病基因型情況為2/5AA,3/5Aa; ②丈夫表現(xiàn)正常,其他未知,而人群中發(fā)病率為1/900,則a 頻率為1/30,可利用數(shù)學(xué)模型快速得知他為攜帶者的2/31;③Ⅳ-1夫婦生出患病孩子的概率為(3/5)×(2/31)×(1/4)=3/310。

        本小題由于其親本Ⅲ-3基因型情況為已經(jīng)不確定,需分情況討論,而Ⅳ-1表現(xiàn)又正常,又要改變范圍求比例,因此算出Ⅳ-1為攜帶者概率有較大難度。根據(jù)筆者多年教學(xué)經(jīng)驗(yàn),學(xué)生較容易在這里出錯(cuò)。如果此時(shí),丈夫的為攜帶者概率還要慢慢計(jì)算,此題難度就更加提高。這時(shí)直接運(yùn)用數(shù)學(xué)模型,難度直接降低了一半。

        綜上所述,當(dāng)已知常染色體隱形基因頻率(m)時(shí),可直接運(yùn)用公式2/(1+1/m),快速而準(zhǔn)確地得知顯性表現(xiàn)人群中攜帶者的概率,化繁為簡(jiǎn),極大節(jié)約遺傳計(jì)算的時(shí)間,更是明顯提高準(zhǔn)確率。

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