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        SNaPshot技術(shù)檢測灘羊雙羔群體中與多胎性狀相關(guān)SNP研究

        2019-10-24 09:11:18田得紅劉思嘉丁寧李雪趙凱
        生物技術(shù)通報(bào) 2019年10期
        關(guān)鍵詞:灘羊綿羊遺傳

        田得紅 劉思嘉 丁寧 李雪 趙凱

        (1. 中國科學(xué)院西北高原生物研究所,西寧 810008;2. 中國科學(xué)院大學(xué),北京 100049)

        我國地方綿羊品種與同類羊相比,最典型、最突出的特性是性成熟早、肉質(zhì)嫩美、抗逆性好,而它的短板在于生長速度緩慢、繁殖性能低、轉(zhuǎn)化能力低下等,在傳統(tǒng)畜牧業(yè)向現(xiàn)代畜牧業(yè)轉(zhuǎn)型升級(jí)的過程中,地方品種綿羊沒有現(xiàn)代化批量產(chǎn)出的優(yōu)勢(shì),而繁殖力是制約其發(fā)展的重要因素。挖掘其影響多胎性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,通過雙羔分子標(biāo)記本品種選育是解決繁殖力低下出現(xiàn)數(shù)量減少的本質(zhì)問題。但大多數(shù)地方品種綿羊?qū)偌竟?jié)性發(fā)情一胎單羔的動(dòng)物,為了經(jīng)濟(jì)利益的最大化,多胎一直是人們追求的目標(biāo)。雙羔初生重較單羔低20%以上,但在正常飼養(yǎng)管理情況下,這種差距越來越小,滿16個(gè)月齡時(shí)平均體重、產(chǎn)毛量差異均不顯著,經(jīng)濟(jì)效益非常明顯[1]。目前,對(duì)小尾寒羊及湖羊的多胎性狀相關(guān)的主效候選基因研究的較多,而對(duì)于低繁殖力的地方綿羊品種的多胎性狀相關(guān)的候選基因系統(tǒng)研究的較少。

        BMPRIB基因非同義突變發(fā)生在高度保守的胞內(nèi)激酶信號(hào)域編碼區(qū)746(746A→G)引起氨基酸變 化(249Q → R),Mulsant等[2]、Souza 等[3]研究表明,該突變?cè)斐刹糠质荏w失活,抑制了BMPRIB基因的功能,影響顆粒細(xì)胞分化,加快卵泡成熟速度,導(dǎo)致突變型母羊排卵數(shù)增加,引起的突變與Booroola 母羊的高產(chǎn)表型完全相關(guān)[2,4]。Booroola表型具有孟德爾分離模式,該突變對(duì)綿羊排卵數(shù)具有加性效應(yīng),即每增加一個(gè)拷貝將額外多排1.65枚卵,平均產(chǎn)羔數(shù)増加0.90-1.20只[5],在性成熟母羊中,攜帶FecBB的母羊最一致的特征是卵泡的直徑明顯小于非攜帶母羊,純合非載體型(FecB+/FecB+),排卵率為1-2,排卵卵泡直徑為7 mm,雜合攜帶者(FecBB/FecB+),排卵率為3-4,卵泡大小為4-5 mm直徑[6]。因此 BMPR1B 基因成為目前已知的并應(yīng)用于生產(chǎn)的綿羊高繁殖力標(biāo)記基因之一。除了Booroola Merino 綿羊中FecB已被證實(shí)為影響多胎性狀的主效基因外,印度的Garole綿羊[7],伊朗的 Kalehkoohi綿羊[8]、中國的小尾寒羊[9]、湖羊[10]、多浪羊[11]、策勒黑羊[12]中存在 FecB 突變,BMPR1B為主效候選基因之一。BMP4在綿羊的卵巢中發(fā)現(xiàn),BMP4促進(jìn)了原始卵泡的發(fā)育和原始卵泡向初級(jí)卵泡的轉(zhuǎn)變[13],BMP4對(duì)綿羊顆粒細(xì)胞分泌黃體酮有較強(qiáng)的抑制作用,降低顆粒細(xì)胞黃體酮分泌[14],完全阻斷FSH刺激作用,而促進(jìn)雌激素的分泌,導(dǎo)致顆粒細(xì)胞的早熟分化和濾泡的成熟[15]。BMP4在正常卵泡中高表達(dá),但在閉鎖卵泡中幾乎檢測不到[16],Sharma等[17]研究發(fā)現(xiàn) BMP4基因被認(rèn)為是山羊繁殖能力的候選基因,在小尾寒羊母羊、湖羊、山羊、陶寒F1、陶寒F2中BMP4基因產(chǎn)羔數(shù)相關(guān)[18-20],而BMP4基因?qū)χ袊览颍ㄜ妷ㄐ停└叻敝沉ρ驔]有影響[21]。因此,BMP4可能會(huì)對(duì)哺乳動(dòng)物的生殖功能產(chǎn)生影響。ADAMTS蛋白酶是一種分泌的鋅金屬蛋白酶,ADAMTS蛋白酶參與原膠原蛋白和血管性血友病因子的成熟,以及與形態(tài)發(fā)生、血管生成、排卵、癌癥和關(guān)節(jié)炎相關(guān)的細(xì)胞外基質(zhì)蛋白水解[22]。ADAMTS1的金屬蛋白酶結(jié)構(gòu)域具有催化活性[23]。研究發(fā)現(xiàn)ADAMTS1可能是新近發(fā)現(xiàn)的影響排卵數(shù)的基因[24]。Mittaz等[25]研究發(fā)現(xiàn),ADAMTS1是由導(dǎo)致排卵的激素通路中的孕酮受體調(diào)控的,在敲除 ADAMTS1的雌性小鼠中,雌性生殖器官畸形和繁殖能力下降,ADAMTS1缺失的雌性的生育能力存在于受損的排卵過程中,導(dǎo)致卵子被釋放的數(shù)量減少,ADAMTS1是正常排卵發(fā)生所必需的基因,因此ADAMTS1基因在雌性生育中,在排卵的組織重塑過程中起著重要作用。

        SNaPshot技術(shù)也稱微測序技術(shù),是由美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司(Applied Biosystems,ABI)開發(fā)的一種SNPs多重分析技術(shù),可實(shí)現(xiàn)中通量的SNPs分型[26],它具有檢測速度快,準(zhǔn)確性高,成本相對(duì)低廉等特點(diǎn)。目前,已經(jīng)廣泛地用于人類遺傳疾病相關(guān)性分析[27-30]和法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的SNPs鑒定[31-32]。

        本研究利用SNaPshot分型方法來檢測地方品種灘羊與多胎性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,統(tǒng)計(jì)檢測的灘羊候選基因突變頻率,分析中國地方品種灘羊突變頻率分布情況。旨在為畜牧工作者利用分子標(biāo)記改良繁殖性狀、培育多羔家系提供科學(xué)資料和參考依據(jù),為多胎性狀相關(guān)分子標(biāo)記的篩選構(gòu)建一種快速準(zhǔn)確、機(jī)動(dòng)靈活、經(jīng)濟(jì)實(shí)用的檢測方法,促進(jìn)SNP技術(shù)在分子育種中的應(yīng)用。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 供試羊群和樣品采集 具有產(chǎn)羔記錄的2-5月齡的灘羊雙羔實(shí)驗(yàn)組384只,灘羊單羔對(duì)照組144只。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物來自遺傳系譜清晰,具有產(chǎn)雙羔、單羔記錄的羔羊,用耳號(hào)鉗取耳組織5 g,放入裝1 mL 70%乙醇的取樣管中,帶回實(shí)驗(yàn)室-20℃保存。

        1.2 方法

        1.2.1 引物設(shè)計(jì) 選取BMPR1B、BMP4、ADAMTS1等3個(gè)基因所有外顯子設(shè)計(jì)引物,最終篩選出13個(gè)位點(diǎn),采用 AssayDesigner3.1 軟件對(duì)3個(gè)基因的13個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行引物設(shè)計(jì)PCR反應(yīng)和單堿基擴(kuò)展引物,并交由四川栢暉生物公司合成表1。

        1.2.2 Massarray SNP分型 取1.5 mL EP管中配置PCR master mix,并振蕩低速離心。在384加樣孔中加入4 μL PCR master mix,最后加入1 μL模板DNA(20 ng/μL)混勻,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR,擴(kuò)增程序 :94℃ 5 min ;94℃ 20 s,56℃ 30 s,72℃ 1 min,45個(gè)循環(huán);72℃ 3 min。產(chǎn)物堿性磷酸酶處理:反應(yīng)總體積為7 μL,其中PCR產(chǎn)物5 μL,SAP mix 2 μL。SAP Mix體系為 2 μL:Water(HPLC grade)1.53 μL,10×SAP Buffer 0.17 μL,1 U/μL SAP Enzyme 0.30 μL。單堿基延伸反應(yīng),反應(yīng)體系總體積9 μL:EXTEND Mix 2 μL,SAP+PCR reaction 7 μL。將點(diǎn)樣后的Spectro CHIP芯片使用MALDI-TOF質(zhì)譜儀分析,檢測結(jié)果使用TYPER4.0軟件獲取原始數(shù)據(jù)及基因分型圖,檢查數(shù)據(jù)文件的完整性和正確性,將結(jié)果保存入相應(yīng)存儲(chǔ)媒介并進(jìn)行分析。

        表1 引物序列信息

        1.2.3 數(shù)據(jù)分析 用Plink軟件分析最小等位基因、哈溫平衡、卡方分析、邏輯模型等,通過Pearson卡方檢驗(yàn)或Fisher精確檢驗(yàn),分析實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組在每個(gè)位點(diǎn)上基因型和等位基因的差異,從而分析與多胎基因的相關(guān)性。用卡方適合性檢驗(yàn)法分析Hardy-Weinberg平衡定律,P>0.001表示無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,符合Hardy-Weinberg平衡定律。Hapview軟件分析連鎖不平衡及單體型。

        2 結(jié)果

        2.1 SNaPshot 檢驗(yàn)的前期工作及HWP檢驗(yàn)

        前期選擇7個(gè)經(jīng)典基因(BMPR1B、BMP4、ADAMTS1、BMP15、GDF9、INHA、MTNR1A7),利用混池?cái)U(kuò)增測序進(jìn)行SNP位點(diǎn)初步篩選的基礎(chǔ)上,通過軟件比對(duì)及人工對(duì)峰圖的判斷,選取雜合峰圖的位點(diǎn)作為候選SNP位點(diǎn),共得到33個(gè)位點(diǎn)和8 個(gè) 文 獻(xiàn) 位點(diǎn)[33](FecB、FecXG、FecXH、FecXI、FecXB、FexXO、FecXGR、FecXL)點(diǎn)作為候選點(diǎn),共計(jì)41個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行SNP時(shí)間飛行質(zhì)譜檢測(單次檢測最多30個(gè)位點(diǎn)),進(jìn)行了兩次檢測,通過分型,最終確定了3個(gè)基因13個(gè)位點(diǎn)存在雜合情況,然后進(jìn)行后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。

        Hardy-Weinberg平衡是指群體內(nèi)一個(gè)位點(diǎn)上的基因型頻率和基因頻率世代保持不變,沒有偏離遺傳平衡狀態(tài)。進(jìn)行HWE檢驗(yàn)的主要目的就是為了檢驗(yàn)我們研究的群體是否來源于獨(dú)立樣本和處在一個(gè)穩(wěn)定的狀態(tài),是否存在顯著遺傳漂變。本實(shí)驗(yàn)經(jīng)Hardy-Weinberg平衡定律檢驗(yàn)13個(gè)位點(diǎn)無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,未偏離哈迪-溫伯格平衡(P>0.001),樣本來源于孟德爾遺傳規(guī)律散發(fā)獨(dú)立樣本,該基因是群體中穩(wěn)定存在的基因,13個(gè)SNPs在后續(xù)的檢驗(yàn)中是有意義的,可進(jìn)行下一步關(guān)聯(lián)分析。13個(gè)SNPs位點(diǎn)在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中純合度較高,雜合度則相對(duì)較低,表明這13個(gè)SNPs位點(diǎn)在群體中的變異較小。

        2.2 我國地方品種灘羊SNP多態(tài)性與多胎性狀相關(guān)性分析

        通過測序序列比對(duì)結(jié)果,在3個(gè)基因中共發(fā)現(xiàn)13個(gè)多態(tài)位點(diǎn),這些位點(diǎn)中不存在插入和缺失位點(diǎn),其中轉(zhuǎn)換位點(diǎn)有9個(gè),包括3個(gè)A/G轉(zhuǎn)換位點(diǎn)和6個(gè)T/C轉(zhuǎn)換位點(diǎn);顛換位點(diǎn)有4個(gè),包括A/C顛換位點(diǎn)3個(gè),G/T顛換位點(diǎn)1個(gè)。最小等位基因率MAF>0.05,說明選取實(shí)驗(yàn)群體數(shù)據(jù)與真實(shí)的大范圍群體相比沒有出現(xiàn)偏移,突變頻率較低的位點(diǎn)在實(shí)驗(yàn)組-對(duì)照組間差異較大,可以得出有效結(jié)論。每個(gè)SNP的等位基因頻率在單羔和雙羔組中的分布差異見表3,經(jīng)過檢驗(yàn)后,其中SNP5-C/T位 點(diǎn)、FecB-A/G位 點(diǎn)、rs21-A/C位 點(diǎn)、rs22-A/C位點(diǎn)的等位基因在雙羔組和單羔組中的分布存在極顯著差異(P<0.01),SNP15-C/T分布差異顯著(P<0.05),初步分析認(rèn)為SNP5-C/T位點(diǎn)、FecB-A/G位點(diǎn)、SNP15-C/T位點(diǎn)、rs21-A/C位點(diǎn)、rs22-A/C位點(diǎn)與多胎性狀相關(guān),除了FecB位點(diǎn)是已報(bào)道的影響多胎的主效基因外[3-4],其余4個(gè)位點(diǎn)相關(guān)的研究內(nèi)容目前尚未見報(bào)道,SNP5-T、SNP15-T、FecB-G、rs21-C、rs22-C為優(yōu)勢(shì)等位基因,5個(gè)位點(diǎn)測序結(jié)果與參考序列進(jìn)行比對(duì),做出基因堿基突變位點(diǎn)測序峰圖與MassArray 分型的散點(diǎn)圖進(jìn)行驗(yàn)證,其結(jié)果一致,說明結(jié)果的可靠性(圖1-2)。

        表2 灘羊群體哈溫平衡檢驗(yàn)

        針對(duì)該基因每個(gè)多態(tài)位點(diǎn)的基因型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)位點(diǎn)SNP5-CC/TC/TT、rs21-AA/CA/CC、rs22-CC/AC/AA、FecB-AA/GA/GG基因型在雙羔組和單羔組間的分布極顯著差異(P<0.01),SNP15-CC/TC/TT基因型在單羔組和雙羔組間的分布顯著差異(P<0.05),野生型和突變型對(duì)雙羔性狀影響存在極顯著性差異(P<0.01)。

        表3 BMPR1B、BMP4、ADAMTS1基因外顯子SNP基因頻率分布及單位點(diǎn)分析

        圖1 5個(gè)SNPs測序圖

        2.3 SNP位點(diǎn)遺傳模型構(gòu)建及相關(guān)性

        對(duì)13個(gè)位點(diǎn)分別行3種不同的遺傳模型分析,結(jié)果顯示,SNP15、SNP5、FecB、rs21、rs22位點(diǎn)建立的3種模型均為有意義的模型,SNP15與多胎性狀的發(fā)生有顯著相關(guān)性(P<0.05),SNP5、rs21、rs22、FecB發(fā)生為極顯著相關(guān)性(P<0.01),模型預(yù)測SNP15、SNP5、rs21、rs22、FecB為與雙羔性狀相關(guān)的位點(diǎn)。

        2.4 雙羔組和單羔組SNP的連鎖不平衡分析及單倍型的構(gòu)建

        對(duì)符合Hardy-Weinberg平衡定律的SNPs位點(diǎn),利用SHSsis 在線軟件[34]計(jì)算連鎖不平衡系數(shù)進(jìn)行連鎖不平衡分析,通過D'值,觀察各位點(diǎn)之間的連鎖不平衡程度,判斷是否存在連鎖不平衡。在ADAMTS1的6個(gè)位點(diǎn)中,存在1個(gè)block構(gòu)建3種單倍型,經(jīng)分析發(fā)現(xiàn)3種單倍型都與多胎無關(guān)(P>0.05),表6。在BMPR1B基因中關(guān)聯(lián)兩個(gè)SNPs間的連鎖不平衡很弱或的不存在連鎖不平衡,無法構(gòu)建單倍型。

        圖2 Sequenom MassArray分型的散點(diǎn)圖

        表4 BMPR1B、BMP4、ADAMTS1基因外顯子SNP基因型頻率分布

        表5 SNPs各位點(diǎn)的遺傳模型與多胎性狀相關(guān)性

        圖3 ADAMTS1 6個(gè)位點(diǎn)連鎖不平衡圖譜

        圖4 BMPR1B 4個(gè)位點(diǎn)連鎖不平衡圖譜

        表6 單倍型頻率

        3 討論

        本研究在前期初步篩選的基礎(chǔ)上,確定3個(gè)基因13個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行多態(tài)性分析,最終發(fā)現(xiàn)3個(gè)基因的13個(gè)位點(diǎn)均未偏離哈溫平衡,5個(gè)位點(diǎn)(SNP15、SNP5、FecB、rs21、rs22)在雙羔組和單羔組間差異顯著,表明這5個(gè)位點(diǎn)與雙羔性能有關(guān)聯(lián)。本研究最終篩選的3個(gè)BMPR1B、BMP4、ADAMTS1基因都是生殖軸上己知被前人研究者證明與羊的繁殖性狀相關(guān)[3,35-36]。其中 FecB 位點(diǎn)在 Booroola羊中亦證實(shí)為影響多胎的主效基因,F(xiàn)ecB位點(diǎn)也是影響我國的小尾寒羊多胎性能的主效候選基因[37],F(xiàn)ecB基因在小尾寒羊和湖羊的外顯子8存在FecB突變[38],F(xiàn)ecBB突變?cè)跒┭蛑谐霈F(xiàn)基因分型,發(fā)現(xiàn)FecBB等位基因?qū)┭虍a(chǎn)仔數(shù)有非常顯著的影響[39],BMPR-1B基因外顯子9的雜合度可使所有母羊產(chǎn)仔數(shù)增加[40],周世偉等[41]對(duì)FecB基因編輯后,初生的羔羊單核苷酸交換的觀察效率高達(dá)23.8%。由于收集產(chǎn)仔數(shù)數(shù)據(jù)需要很長時(shí)間,目前還無法收集編輯后的動(dòng)物的表型數(shù)據(jù),但認(rèn)為此項(xiàng)發(fā)現(xiàn)將有助于提高動(dòng)物的繁殖性狀。以上研究證實(shí)FecB突變與產(chǎn)仔數(shù)增加有關(guān)與本實(shí)驗(yàn)的結(jié)果一致,主要原因沉默BMPR1B可促進(jìn)細(xì)胞凋亡,而過表達(dá)BMPR1B可抑制綿羊顆粒細(xì)胞細(xì)胞凋亡[42],F(xiàn)ecB基因突變可能改變了卵母細(xì)胞發(fā)育和卵丘顆粒細(xì)胞的增殖水平,從而提高排卵率[43]。但FecB突變?cè)?Barki和Rahmani地方綿羊品種中未檢測到[44],推測可能是基因結(jié)構(gòu)和品種的不同對(duì)小鼠卵巢的研究證明ADAMTS1在體內(nèi)排卵和受精過程中都起著至關(guān)重要的作用,通過對(duì)貴州半細(xì)羊毛綿羊ADAMTS1基因的混池測序發(fā)現(xiàn)該基因可能影響繁殖性能[45],但也有研究發(fā)現(xiàn)ADAMTS1基因不能作為高產(chǎn)湖羊的候選基因[46]。本研究認(rèn)為ADAMTS1基因可能是影響灘羊繁殖性狀的一個(gè)候選基因,但可否作為綿羊繁殖性狀的候選基因可能存在品種間的差異,還有待進(jìn)一步研究。我們通過3種遺傳模型分析也發(fā)現(xiàn)5個(gè)SNPs與雙羔性能的相關(guān)性。但這5個(gè)SNP 位點(diǎn)能否作為雙羔性狀的遺傳標(biāo)記,還需要對(duì)這些地方品種灘羊個(gè)體進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證以及如何參與綿羊雙羔生產(chǎn)的機(jī)制仍需進(jìn)一步研究探討。

        本研究關(guān)聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn)與雙羔性狀相關(guān)5個(gè)SNPs位 點(diǎn), 即 SNP5、SNP15、rs21、rs22、FecB位點(diǎn),5個(gè)位點(diǎn)的突變可能利于生產(chǎn)雙羔。這5個(gè)SNPs位點(diǎn)在群體中的變異較小,這可能與地方品種綿羊的遺傳背景和本品種選育程度有關(guān)[47];13個(gè)位點(diǎn)均處于哈迪-溫伯格平衡,說明試驗(yàn)群體在選擇中不易受外界干擾,這些位點(diǎn)的基因序列保守性較強(qiáng),在品種的選育、遷徙和遺傳漂變因素作用下而處于動(dòng)態(tài)平衡,他們的遺傳是隨機(jī)的[48],而使這5個(gè)SNPs位點(diǎn)能夠提供較為合理的遺傳信息,這可能是由于該群體在適應(yīng)性方面具有遺傳優(yōu)勢(shì),并經(jīng)過長期進(jìn)化和選擇達(dá)到了平衡狀態(tài),基因型頻率的平衡對(duì)于群體穩(wěn)定性有著直接的保證作用的。哈溫平衡不但受遺傳學(xué)規(guī)律的控制,而且還受外界環(huán)境的影響[49],遺傳學(xué)影響表現(xiàn)在基因頻率自然選擇作用發(fā)生了變化、基因漂變,以及鄰種群的基因由于雜交而正在加入到所研究的區(qū)域或是其基因成分發(fā)生了變化[48]。HWE檢驗(yàn)是有必要的,只有哈溫平衡才能驗(yàn)證所獲得的樣本是否有代表性,只有滿足HWE,才能進(jìn)一步推斷基因與雙羔的關(guān)聯(lián)性。CoxDG等[50]認(rèn)為不符合 HWE可能是基因分型錯(cuò)誤所致,那么在此基礎(chǔ)上繼續(xù)進(jìn)行基因與性狀的關(guān)聯(lián)推斷顯然是沒有意義的。

        單倍型可提供比單個(gè)SNPs 更為豐富的信息量,有助于低頻率變異信息的利用,被稱為人類進(jìn)化歷史的“分子化石”[51]。在復(fù)雜性狀的關(guān)聯(lián)研究中,單倍型比單個(gè)SNPs具有更好的統(tǒng)計(jì)分析效果,不同SNP位點(diǎn)優(yōu)勢(shì)等位基因型與優(yōu)勢(shì)等位基因種類和頻率大小,單倍型均有不同程度的差別。但由于樣本數(shù)量有限會(huì)導(dǎo)致單倍型被漏檢,樣本選擇不全面,并且研究不夠深入[52]。本研究對(duì)符合要求的SNPs位點(diǎn)構(gòu)建了單倍型,得到了3種與雙羔性能相關(guān)的單倍型,但在雙羔組和單羔組間都未達(dá)到差異水平,所以我們繼續(xù)以ADAMTS1和BMPR1B基因?yàn)橹行模瑧?yīng)該進(jìn)一步擴(kuò)大樣本容量,確定我國地方綿羊品種群LDblock的精確結(jié)構(gòu),為優(yōu)勢(shì)選擇進(jìn)一步尋找證據(jù),并為地方品種灘羊基因組多樣性研究增加遺傳數(shù)據(jù),為今后推動(dòng)地方品種綿羊雙羔分子標(biāo)記本品種選育提供參考。

        4 結(jié)論

        本研究利用SNaPshot技術(shù),在前期篩選的基礎(chǔ)上,確定在3個(gè)基因13個(gè)位點(diǎn)上比較分析了地方品種灘羊雙羔和單羔群體與多胎性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,13個(gè)位點(diǎn)均未偏離哈溫平衡,最終分析發(fā)現(xiàn)5個(gè)位點(diǎn)(SNP15、SNP5、FecB、rs21、rs22)在雙羔組和單羔組間差異顯著,這5個(gè)位點(diǎn)與多胎性狀相關(guān),構(gòu)建的遺傳模型也被證實(shí),但在ADAMTS1的6個(gè)位點(diǎn)中的1個(gè)block構(gòu)建3種單倍型都與多胎無關(guān)。在地方品種綿羊雙羔群體中挖掘與多胎性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,有助于雙羔分子標(biāo)記本品種選育,由于外血滲入對(duì)地方品種的巨大沖擊,鑒定并運(yùn)用雙羔分子標(biāo)記技術(shù)也是對(duì)本品種很大的保護(hù)。

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