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        一例牙鲆淋巴囊腫病例的診斷及病毒MCP 基因遺傳進(jìn)化分析

        2019-10-12 01:23:48孟凡亮曹龍龍焦秋林王宏宇劉照虎馬梓承劉思當(dāng)
        中國(guó)動(dòng)物檢疫 2019年10期
        關(guān)鍵詞:牙鲆核苷酸淋巴

        孟凡亮,曹龍龍,焦秋林,李 焱,王宏宇,劉照虎,馬梓承,劉思當(dāng)

        (山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,山東省動(dòng)物生物工程與疾病防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東省畜禽疫病防制工程技術(shù)研究中心,山東泰安 271018)

        淋巴囊腫病毒(lymphocystis disease virus,LCDV)屬于虹彩病毒科淋巴囊腫病毒屬,是淋巴囊腫病的病原體,可引起全球140 種以上的魚(yú)類患病。淋巴囊腫?。╨ymphocystis disease,LCD)在養(yǎng)殖的海水魚(yú)和淡水魚(yú)中均有發(fā)生,通常與養(yǎng)殖相關(guān)的應(yīng)激條件有關(guān),但在自由生活的魚(yú)類中也有報(bào)道[1]。LCDV 感染可導(dǎo)致魚(yú)皮膚、鰭和尾鰭上長(zhǎng)有單個(gè)或聚集的菜花樣腫瘤樣結(jié)節(jié)[2]。有研究[3-4]證實(shí):在魚(yú)類心臟、脾臟等內(nèi)臟器官和眼睛中也存在病毒感染;囊腫除發(fā)生在魚(yú)體表外,在鰓、咽喉、腸壁、腸系膜、肝、脾、卵巢等器官上也可能出現(xiàn),嚴(yán)重者可密布于全身。

        LCDV 是 雙 鏈DNA 病 毒, 目 前 已 獲 知LCDV-1(歐洲株)和LCDV-C(中國(guó)株)全基因組序列,但二者基因組差異很大。基因組比較顯示,兩種LCDV 基因組在大小、組織和遺傳同一性方面具有高度的多樣性。此外,根據(jù)主要衣殼蛋白基因(MCP)序列,LCDV 至少可分為9 個(gè)基因型。MCP 基因是虹彩病毒科病毒系統(tǒng)發(fā)育研究的主要靶基因[5-6]。

        LCDV作為危害魚(yú)類養(yǎng)殖業(yè)的重要疫病病原,越來(lái)越受到人們的關(guān)注。本研究對(duì)山東省某牙鲆魚(yú)場(chǎng)疑似LCDV 感染病例進(jìn)行了綜合診斷,對(duì)病毒MCP 基因進(jìn)行了測(cè)序和遺傳進(jìn)化分析,以期為該病的綜合診斷及流行病學(xué)調(diào)查以及病原的相關(guān)分子生物學(xué)研究和疫苗制備等提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 病料來(lái)源

        2019 年1 月,山東省某牙鲆魚(yú)場(chǎng)出現(xiàn)疑似LCD 病例?;疾◆~(yú)體表出現(xiàn)菜花樣瘤狀物,死亡率超過(guò)30%。剖檢病死魚(yú),并采集魚(yú)體表的瘤狀物及其脾臟、腎臟、腸等病料樣品各兩份。一份用10%的福爾馬林溶液固定,經(jīng)常規(guī)制作,石蠟切片、HE 染色,進(jìn)行病理組織學(xué)檢查;另一份冰凍保存,進(jìn)行病毒DNA 提取與鑒定。

        1.2 主要試劑

        瓊脂糖凝膠DNA 回收試劑盒:購(gòu)自北京天根生化科技有限公司;EasyPure Viral DNA/RNA Kit、pEASY-T1 simple cloning vector 及T1 感 受態(tài)細(xì)胞:購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司;DL 2 000 bp DNA Marker:購(gòu)自寶生物工程大連有限公司。

        1.3 引物設(shè)計(jì)與合成

        根據(jù)GenBank 中登錄的LCDV-1(L63545)、LCDV-C(AY380826)MCP 序列,分別設(shè)計(jì)2 對(duì)引物[7]。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

        表1 引物序列

        1.4 病毒核酸提取與擴(kuò)增

        參照EasyPure Viral DNA/RNA Kit 說(shuō)明書(shū),對(duì)收集的病料研磨液進(jìn)行核酸提取。以提取的核酸為模板,用兩對(duì)LCDV 引物分別對(duì)模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。擴(kuò)增體系為25 μL,擴(kuò)增程序?yàn)椋?5 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s、55 ℃ 30 s、72 ℃ 90 s,35 個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

        1.5 病毒MCP 基因序列測(cè)定分析

        將上述核酸提取物,用LCDV LCC 引物進(jìn)行50 μL 體系擴(kuò)增,將擴(kuò)增后的PCR 產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。將目的條帶所在的凝膠部分分離,使用膠回收試劑盒,回收目的片段;將膠回收的目的片段連接pEASY-T1 simple cloning 載體,然后轉(zhuǎn)入感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行增菌培養(yǎng)。先用PCR 對(duì)菌液進(jìn)行鑒定,將鑒定為L(zhǎng)CDV-MCP 的陽(yáng)性菌液送至生工生物工程(上海)有限公司進(jìn)行測(cè)序鑒定,并對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行遺傳進(jìn)化特點(diǎn)分析。

        2 結(jié)果

        2.1 眼觀病變

        經(jīng)外觀及剖檢病變觀察,發(fā)現(xiàn)病變主要表現(xiàn)為魚(yú)體表長(zhǎng)有灰白色、菜花樣瘤狀物,魚(yú)鰓及魚(yú)鰭上也有多個(gè)瘤狀物(圖1),而內(nèi)臟器官未見(jiàn)明顯的眼觀病變。

        圖1 病魚(yú)剖檢病變

        表2 參考毒株信息

        2.2 病理組織學(xué)變化

        魚(yú)體表腫瘤樣組織中,可見(jiàn)成纖維細(xì)胞增生、變圓、膨大和聚集,形成淋巴囊腫細(xì)胞,在胞漿內(nèi)可見(jiàn)大量的包涵體(圖2-A),肝細(xì)胞普遍發(fā)生空泡變性(圖2-B),脾臟充血、出血(圖2-C),鰓小片上皮細(xì)胞變性、壞死、脫落(圖2-D),腎小管上皮細(xì)胞變性、壞死、脫落,間質(zhì)出血(圖2-E),腸絨毛黏膜上皮細(xì)胞壞死脫落(圖2-F)。

        圖2 感染魚(yú)的組織病理變化(HE,200×)

        2.3 病毒PCR 鑒定

        分別用設(shè)計(jì)的兩對(duì)LCDV 引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。擴(kuò)增結(jié)果顯示,以LCDV-C 毒株為參考序列設(shè)計(jì)的LCC引物擴(kuò)增為陽(yáng)性,說(shuō)明該病例存在LCDV感染。

        圖3 MCP 基因擴(kuò)增瓊脂糖凝膠圖

        2.4 核苷酸和氨基酸序列分析

        利用DNAstar 中的MegAlign,將本試驗(yàn)所得毒株(190103LCDVSD)和參考毒株的核苷酸和推導(dǎo)氨基酸進(jìn)行同源性比較分析。通過(guò)分析可知,本試驗(yàn)所得毒株的核苷酸和推導(dǎo)氨基酸序列與參考毒株序列相比,與基因I 型LCDV-1 毒株的同源性最低,核苷酸和氨基酸序列同源性分別為78.7%和86.8%;而與以LCDV-C 毒株為代表的基因II 型序列同源性較高,核苷酸和氨基酸序列同源性分別介于99.6%~99.9%和99.3%~100%。具體比對(duì)結(jié)果見(jiàn)表3、表4。

        2.5 MCP 基因遺傳演化分析

        選取35 株不同基因型LCDV 的MCP 基因參考序列與本次序列,利用MEGA6 的Maximum-Likelihood 方法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果(圖4)顯示:根據(jù)MCP 基因分型,本試驗(yàn)所得毒株序列與LCDV-C、JF00Kuma、JF03Yoshi、JF03GunNeA、JF、LCDV-K1 等同屬于基因II 型,且與我國(guó)牙鲆分離株LCDV-C 有較高的同源性,說(shuō)明本試驗(yàn)所得毒株在牙鲆魚(yú)中未發(fā)生較大變異。

        表3 本試驗(yàn)毒株MCP 基因與不同基因型參考毒株同源性比對(duì)結(jié)果

        表4 本試驗(yàn)毒株MCP 基因與基因II 型參考毒株同源性比對(duì)結(jié)果

        3 討論

        我國(guó)重要的海水經(jīng)濟(jì)魚(yú)類一般都對(duì)LCDV 易感,包括真鯛、大菱鲆、花鱸和牙鲆等[8]。LCD一年四季均可發(fā)病,其中水溫在10~20 ℃時(shí)發(fā)病達(dá)到高峰[9]。研究發(fā)現(xiàn),該病具有自愈現(xiàn)象,且受溫度影響較大,當(dāng)溫度高于25 ℃時(shí),病魚(yú)體表瘤狀物會(huì)自動(dòng)掉落,魚(yú)體逐漸恢復(fù)健康;但水溫低于15 ℃時(shí),未見(jiàn)自愈現(xiàn)象[10-11]。

        虹彩病毒MCP 蛋白是其病毒粒子中表達(dá)豐度最高的蛋白,占整個(gè)病毒粒子多肽的40%~45%,并且在虹彩病毒科中高度保守,因此可以利用MCP 基因的同源性差異進(jìn)行虹彩病毒分子進(jìn)化方面的研究[12-13]。

        圖4 新分離株與參考毒株的遺傳進(jìn)化樹(shù)

        4 結(jié)論

        病理學(xué)檢查發(fā)現(xiàn),該病例病變符合LCD 的病理學(xué)特征;分子生物學(xué)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),所檢測(cè)毒株與選定的LCDV 參考毒株核苷酸和氨基酸同源性均較高;MCP 基因遺傳進(jìn)化分析表明,所檢測(cè)毒株屬于基因II 型,與我國(guó)分離株LCDV-C 同源性較高,未發(fā)生較大變異。綜合判定該病例為L(zhǎng)CDV 感染。該研究為L(zhǎng)CD 診斷及其流行病學(xué)調(diào)查提供了新資料,為下一步進(jìn)行LCDV 相關(guān)分子生物學(xué)研究以及疫苗制備等提供了理論依據(jù)。

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