趙錦燕 尚海霞 曾建偉 蘭煒蘭 洪振豐#
(1 福建中醫(yī)藥大學(xué)中西醫(yī)結(jié)合研究院 福州 350122;2 福建省中西醫(yī)結(jié)合老年性疾病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 福州 350122)
原發(fā)性肝癌是常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,2018 年全球癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)分析顯示原發(fā)性肝癌死亡率居全球癌癥死亡率的第四位。在我國(guó),由于慢性肝炎和黃曲霉素污染的食物攝入使得肝癌的發(fā)病率和致死率均居高不下[1]。目前,肝癌的治療仍以綜合化療為主,然而腫瘤多藥耐藥的發(fā)生導(dǎo)致肝癌治療效果不佳[2]。微小RNA(MicroRNA,miRNA)是一類普遍存在的非編碼小分子RNA,主要作用于靶基因3′非翻譯區(qū)(Untranslated Region,UTR),引起靶mRNA的降解或抑制其翻譯,參與調(diào)控機(jī)體的各項(xiàng)生理病理活動(dòng)(包括腫瘤)[3~5]。為探討miRNA 在肝癌耐藥中的作用,本研究應(yīng)用miRNA 表達(dá)譜芯片篩選肝癌多藥耐藥細(xì)胞異常表達(dá)的miRNA,以尋找能夠逆轉(zhuǎn)肝癌多藥耐藥的治療靶點(diǎn)?,F(xiàn)報(bào)道如下:
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 細(xì)胞株 Bel-7402 細(xì)胞及其5-氟尿嘧啶(5-FU)誘導(dǎo)的耐藥株Bel-7402/5-FU 購(gòu)自南京凱基生物科技發(fā)展有限公司。
1.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑 Agilent 人miRNA 芯片19.0(博奧生物有限公司);胎牛血清(FBS)、0.25%胰酶和RPIM1640 基礎(chǔ)培養(yǎng)基(美國(guó)life technologies 公司);RNAiso for small RNA、Uni-miR qPCR Primer和SYBR PrimeScriptTMmiRNA RT-PCR kit(寶生物工程大連有限公司)。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng) Bel-7402 細(xì)胞和Bel-7402/5-FU細(xì)胞分別培養(yǎng)于RPMI 1640 完全培養(yǎng)基(含10%FBS、100 U/ml 青霉素和100 μg/ml 鏈霉素)和含20 μg/ml 5-FU 的RPMI 1640 完全培養(yǎng)基(含10%FBS、100 U/ml 青霉素和100 μg/ml 鏈霉素),37℃,5%CO2飽和濕度的CO2培養(yǎng)箱內(nèi)。檢測(cè)指標(biāo)前將Bel-7402/5-FU 細(xì)胞更換成正常的RPMI 1640 完全培養(yǎng)基培養(yǎng)。
1.2.2 MTT 法驗(yàn)證Bel-7402/5-FU 的耐藥性 分別取處于指數(shù)生長(zhǎng)期的Bel-7402 細(xì)胞和(或)Bel-7402/5-FU 細(xì)胞,以5 000 個(gè)細(xì)胞/孔接種于96孔板,每孔100 μl,置細(xì)胞培養(yǎng)箱中過(guò)夜,分別用不同濃度的5-氟尿嘧啶(0~25 600 μM)、阿霉素(0~256 μM)、順鉑(0~128 μM)干預(yù)48 h 后用MTT法檢測(cè),每組設(shè)8 個(gè)復(fù)孔。對(duì)照組的細(xì)胞活力按100%計(jì)算。
1.2.3 miRNA 表達(dá)譜分析 取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期Bel-7402 細(xì)胞和(或)Bel-7402/5-FU 細(xì)胞,分別以2.0×105/孔的密度接種于6 孔板中,每組3 個(gè)樣本,常規(guī)培養(yǎng)48 h,棄上清,每孔加Trizol 1 ml 提取總RNA,瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)細(xì)胞樣本RNA 的完整性。然后,每個(gè)樣品單獨(dú)標(biāo)記,進(jìn)行芯片實(shí)驗(yàn),以得到該樣品中miRNA 的表達(dá),按照Agilent miRNA標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)記方法進(jìn)行熒光標(biāo)記后和芯片進(jìn)行雜交、清洗。使用生物芯片掃描儀掃描,獲取每個(gè)陣列熒光染料的掃描圖像和數(shù)據(jù),并以TIFF 的文件格式保存圖像和數(shù)據(jù)。使用基因芯片提數(shù)軟件提取數(shù)據(jù),選擇合適的數(shù)據(jù)歸一化方法,得到各個(gè)RNA 樣品的雜交信號(hào),并選擇出差異性表達(dá)的miRNA 基因,常規(guī)篩選標(biāo)準(zhǔn)為:p-value≤5%,同時(shí)FC(abs)在2.0 倍以上。
1.2.4 RT-qPCR 驗(yàn)證 按上述方法收集細(xì)胞,應(yīng)用RNAiso for small RNA 提取miRNA,應(yīng)用SYBR PrimeScriptTMmiRNA RT-PCR kit 進(jìn)行Poly(A)加尾反應(yīng)和反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),向20 μl 逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中加無(wú)RNA 酶的去離子水補(bǔ)足至100 μl,取2 μl 稀釋液進(jìn)行后續(xù)的real-time PCR 反應(yīng)。反應(yīng)體系(20 μl):SYBR Premix Ex TaqⅡ(2×)10 μl,PCR Forward Primer(10 μm)0.8 μl,Uni-miR qPCR Primer(10 μm)0.8 μl,Rox Reference Dye Ⅱ(50×)0.4 μl,cDNA 溶液2 μl 和dH2O 6 μl。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS18.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,計(jì)量資料用表示,采用t檢驗(yàn)。P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 Bel-7402/5-FU 細(xì)胞具有多藥耐藥性 與Bel-7402 比較,Bel-7402/5-FU 對(duì)5-氟尿嘧啶、阿霉素和順鉑均具有耐藥性,5-氟尿嘧啶對(duì)Bel-7402 和Bel-7402/5-FU 的抑制率分別是(100.00±3.20)%、(31.41±2.34)%、(18.84±0.56)%、(15.25±0.21)%、(14.37±0.22)%、(14.22±0.21)%、(14.70±0.29)%、(13.75±0.11)%、(13.60±0.13)%、(13.93±0.23)%和(100.00±0.96)%、(100.00±0.76)%、(99.76±1.59)%、(91.75±0.88)%、(90.41±1.10)%、(85.18±1.88)%、(79.97±1.30)%、(75.66±0.76)%、(69.18±1.29)%、(67.38±1.31)%,阿霉素對(duì)Bel-7402 和Bel-7402/5-FU 的抑制率分別是(100.00±3.70)%、(82.07±2.11)%、(80.67±1.29)%、(51.34±1.38)%、(20.78±0.21)%、(22.91±0.30)%、(34.08±1.50)%、(24.41±0.24)%、(26.93±0.35)%、(28.66±0.29)%和(100.00±1.64)%、(88.37±1.06)%、(89.10±2.44)%、(87.87±1.25)%、(83.81±1.62)%、(84.39±1.82)%、(87.43±2.42)%、(79.97±1.87)%、(67.15±0.95)%、(59.62±0.43)%,順 鉑 對(duì)Bel-7402 和Bel-7402/5-FU 的抑制率分別是(100.00±4.96)%、(92.46±2.34)%、(90.28±3.75)%、(73.27±4.01)%、(63.13±4.20)%、(41.97±0.18)%、(10.41±0.11)%、(10.89±0.30)%和(100.00±2.41)%、(95.63 ±1.32)%、(96.31±2.51)%、(94.49±2.04)%、(93.30±2.29)%、(91.54±2.32)%、(90.33±1.37)%、(90.18±1.03)%,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)圖1。
圖1 Bel-7402/5-FU 細(xì)胞對(duì)5-氟尿嘧啶、阿霉素和順鉑耐藥性
2.2 miRNA 在耐藥細(xì)胞中的差異表達(dá)譜 選擇P值≤5%,同時(shí)FC(abs)在2.0 倍以上的miRNA 做聚類分析圖和散點(diǎn)圖,發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的miRNA 有29個(gè),其中上調(diào)14 個(gè),下調(diào)15 個(gè)。見(jiàn)圖2、圖3。
圖2 miRNA 芯片檢測(cè)耐藥細(xì)胞中miRNA 的差異表達(dá)
圖3 差異表達(dá)的miRNA 柱形圖
2.3 差異表達(dá)miRNA 的驗(yàn)證 采用qPCR 驗(yàn)證miRNA 芯片中FC(abs)大于2 的miRNA,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與Bel-7402 細(xì)胞比較,有9 個(gè)驗(yàn)證結(jié)果與芯片結(jié)果相符,其中miR-10a-5p、-371a-3p、-371a-5p、-372、-373-3p、-146a-5p、-6723-5p 下 調(diào),miR-3148、-4497上調(diào),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)圖4。
圖4 miRNA 驗(yàn)證結(jié)果
腫瘤的多藥耐藥是指腫瘤細(xì)胞對(duì)一種抗腫瘤藥物產(chǎn)生抗藥性的同時(shí),對(duì)結(jié)構(gòu)和作用機(jī)制不同的其他抗腫瘤藥物也產(chǎn)生耐藥的一種交叉抗藥性,是目前肝癌治療的主要障礙[6],克服腫瘤多藥耐藥是肝癌治療方法未來(lái)研究的重點(diǎn)。然而腫瘤細(xì)胞多藥耐藥產(chǎn)生是一個(gè)十分復(fù)雜的過(guò)程,它可能是初次使用就產(chǎn)生耐藥的原發(fā)性耐藥,也可能是用過(guò)一段時(shí)間之后產(chǎn)生的獲得性耐藥。耐藥基因mdr1/P-gp 高表達(dá)導(dǎo)致細(xì)胞外排功能增加是目前較為公認(rèn)的機(jī)制,研究者針對(duì)P-gp 的作用靶點(diǎn)研發(fā)了很多抑制劑,但由于副作用等諸多原因,很少能真正用于臨床。所以研發(fā)新型的、高效低毒的肝癌多藥耐藥逆轉(zhuǎn)劑任重而道遠(yuǎn)。
非編碼RNA 是表觀遺傳學(xué)的重要組成部分,隨著研究的深入,越來(lái)越多研究發(fā)現(xiàn)miRNA 的表達(dá)能夠影響肝癌多藥耐藥[7~8]。本研究通過(guò)miRNA表達(dá)譜芯片篩選肝癌耐藥細(xì)胞株中差異表達(dá)的miRNA,并通過(guò)熒光定量PCR 驗(yàn)證,探討miRNA在肝癌耐藥中的作用。研究發(fā)現(xiàn)在肝癌耐藥中,有9個(gè)miRNA 表達(dá)發(fā)生改變(miR-10a-5p、-371a-3p、-371a-5p、-372、-373-3p、-146-5p、-6723-5p 下 調(diào),miR-4497、-3148 上調(diào)),表明在肝癌耐藥的發(fā)生中,miRNA 發(fā)揮了重要作用。目前研究發(fā)現(xiàn),上述miRNA 在不同腫瘤中可能發(fā)揮不同的作用(miR-371a-3p、miR-371a-5p 和miR-6723-5p 未見(jiàn)報(bào)道)。miR-10a-5p 在食道鱗癌[9]、乳腺癌[10~12]和腎細(xì)胞癌[13]中具有抑癌作用,而在顆粒癌[14]、非小細(xì)胞肺癌[15]和神經(jīng)膠質(zhì)瘤[16]中促進(jìn)腫瘤的生長(zhǎng)、遷移和侵襲。miR-372 抑制肺癌和腎細(xì)胞癌的遷移、侵襲以及上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化[17~19]。在鼻咽癌中,miR-372 可以通過(guò)激活PBK 依賴的p53 途徑抑制癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移,從而增加放療的敏感性[20];而在胃癌、肝癌和乳腺癌中,miR-372 促進(jìn)腫瘤的發(fā)展進(jìn)程和轉(zhuǎn)移[21~23]。miR-373在膀胱癌、黑色素瘤、骨肉瘤和食道鱗癌中作為促癌miRNA 發(fā)揮作用[24~27],而在對(duì)非小細(xì)胞肺癌和前列腺癌的研究中發(fā)現(xiàn),miR-373 能夠抑制癌細(xì)胞的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移[28~29]。miR-146 在不同的腫瘤中發(fā)揮不同的作用,在肺癌和甲狀腺乳頭狀癌中發(fā)揮促癌作用[30~31],在乳腺癌中則抑制腫瘤轉(zhuǎn)移[32]。有關(guān)miR-3148和miR-4497 的研究較少,目前的研究發(fā)現(xiàn)miR-3148 具有促癌作用,miR-4497 具有抑癌作用[33~34],而這些miRNA 在腫瘤多藥耐藥中的作用尚未明確,有待我們進(jìn)一步研究。miRNA 調(diào)控肝癌多藥耐藥的機(jī)制復(fù)雜,隨著研究的深入,我們希望能夠通過(guò)調(diào)控miRNA 成為低毒有效且不干擾抗腫瘤藥物的耐藥逆轉(zhuǎn)劑。