姚啟倫 李玉潔 陳發(fā)波 高健 李文博 方平 李紅艷
摘要:探討優(yōu)化玉米染色體滴片關(guān)鍵因子處理效果,尋求一種操作簡單、染色體分散度和完整性好,并且適于玉米染色體分離操作的制片方法。本研究以玉米自交系B73根尖為材料,在單因素試驗(yàn)的基礎(chǔ)上采用四因素二次回歸正交組合設(shè)計(jì),分析玉米滴片技術(shù)中4個(gè)關(guān)鍵因子的處理效果。結(jié)果表明,NO處理時(shí)間、冰乙酸固定時(shí)間、酶解時(shí)間和滴片距離對(duì)染色體滴片效果均存在最佳處理效應(yīng)?;诙位貧w方程的統(tǒng)計(jì)方法得到了符合實(shí)際的優(yōu)化的染色體滴片技術(shù)方案,即采用NO處理時(shí)間2.0h、冰乙酸固定時(shí)間2.0h、酶解時(shí)間6.0h和滴片距離35.0cm。由此方案制作了高質(zhì)量的玉米染色體制片,保證了細(xì)胞中染色體的分散性和完整性。
關(guān)鍵詞:玉米;染色體;滴片;優(yōu)化
中圖分類號(hào):S513
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
文章編號(hào):1000-4440(2019)02-0255-07
染色體作為基因的載體,一直是細(xì)胞遺傳學(xué)和分子生物學(xué)研究的熱點(diǎn)。染色體制片是觀察、鑒定染色體的基本方法,它是進(jìn)行生物染色體組型分析、染色體顯帶、染色體畸變分析、染色體特殊成分鑒定、DNA原位雜交和單染色體分離研究的重要技術(shù)手段。傳統(tǒng)的染色體制片技術(shù)是壓片法和火焰干燥法,眾多學(xué)者就染色體制片過程中的取材時(shí)間、預(yù)處理方式、冰乙酸固定時(shí)間、細(xì)胞解離及染色方法等作了大量卓有成效的研究。潘頎等以新疆紫草為材料,用壓片法研究染色體制片技術(shù),其研究結(jié)果表明,新疆紫草染色體制片效果主要取決于秋水仙素預(yù)處理時(shí)間、處理溫度和細(xì)胞解離時(shí)間3個(gè)關(guān)鍵處理因子。勞世輝等采用火焰干燥法制備菠蘿蜜染色體制片,通過比較不同預(yù)處理試劑和預(yù)處理時(shí)間的作用效果,發(fā)現(xiàn)以1:1(體積比)的8-羥基喹啉(0.002mol/L)與秋水仙素(0.2%)混合液預(yù)處理制片材料,可達(dá)到理想的染色體制片效果。陳雪等通過對(duì)射干染色體壓片技術(shù)研究指出,室溫下用秋水仙素(0.1%)預(yù)處理材料8h和379C下酶解材料60min,用壓片法可制作出染色體分散良好的制片。劉丹等通過比較分析多種植物的染色體壓片技術(shù),認(rèn)為壓片法中制約植物染色體制片效果的關(guān)鍵處理因子是預(yù)處理藥劑和時(shí)間。分子生物技術(shù)的發(fā)展對(duì)染色體制片技術(shù)提出新的更高的要求,一張高質(zhì)量的染色體制片要求處于有絲分裂中期相的細(xì)胞多,染色體交叉重疊少、分散性好,細(xì)胞內(nèi)容物少、清晰度高。染色體滴片法是新興的一種染色體制片方法,目前國內(nèi)鮮見有關(guān)染色體滴片技術(shù)研究的相關(guān)報(bào)道。為此,本試驗(yàn)以遺傳學(xué)研究的模式生物一玉米為染色體制片材料,采用數(shù)理統(tǒng)計(jì)法分析影響染色體滴片效果的4個(gè)關(guān)鍵因子,為規(guī)范玉米染色體滴片技術(shù)提供理論依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
選用典型玉米自交系B73作染色體制片材料,玉米自交系B73種子由長江師范學(xué)院玉米育種課題組提供。
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 染色體滴片制作
1.2.1.1 胚根在培養(yǎng)皿內(nèi)鋪一層無菌紗布,放入預(yù)浸6h的玉米種子,在恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)25C培養(yǎng)1~2d,待胚根長1.0~2.0cm時(shí),剪取1.0~1.5cm根尖置入盛有超純水的EP管中,讓濕潤根尖貼于管壁。1.2.1.2 NO處理將裝有根尖的EP管放入NO處理罐,在0.5Pa的壓強(qiáng)下進(jìn)行NO處理,NO處理罐由解壓閥、NO罐、連接管、處理罐和三通閥組成。
1.2.1.3 冰乙酸固定取出EP管并滴加適量90%冰乙酸對(duì)根尖材料進(jìn)行固定處理。
1.2.1.4 材料漂洗固定后的根尖材料從EP管取出,在盛有超純水的培養(yǎng)皿中漂洗2~3次,然后置于載玻片切取根尖分生區(qū)。
1.2.1.5 制備細(xì)胞懸液根尖分生區(qū)材料在37C溫度下酶解,酶解后的材料用70%乙醇清洗2次,再置入瞬時(shí)離心機(jī)離心2次,每次8s,最后加入冰乙酸,搗碎混勻制成細(xì)胞懸液。
1.2.1.6 細(xì)胞懸液滴片用移液槍吸10μl細(xì)胞懸液,在一定高度依靠其自身重力直接滴加在載玻片上,待滴液干燥后進(jìn)行染色處理。
1.2.1.7 鏡檢在光學(xué)顯微鏡下觀察、鑒定滴片中細(xì)胞有絲分裂中期染色體,并利用照像系統(tǒng)進(jìn)行拍照記錄。
1.2.2 制訂染色體制片評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)以染色體滴片效果為考察指標(biāo),根據(jù)有絲分裂中期相的細(xì)胞數(shù)、染色體重疊率、單細(xì)胞染色體數(shù)和細(xì)胞內(nèi)溶物面積比4個(gè)參數(shù)值,對(duì)染色體滴片效果進(jìn)行評(píng)定等級(jí),其評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)見表1。
1.2.3 試驗(yàn)設(shè)計(jì)基于前期大量的玉米染色體滴片試驗(yàn),單因素試驗(yàn)設(shè)計(jì)參照賈建的方法,按不同的試驗(yàn)設(shè)計(jì),選擇不同的NO處理時(shí)間(1.0h、1.5h、2.0h、2.5h和3.0h)、冰乙酸固定時(shí)間(1.0h、1.5h、2.0h、2.5h和3.0h)、酶解時(shí)間(5.0h、5.5h、6.0h、6.5h和7.0h)和滴片距離(10.0cm、20.0cm、30.0cm、40.0cm和50.0cm)。用二次回歸正交組合設(shè)計(jì)分析染色體滴片效果與各關(guān)鍵因子間的線性關(guān)系。單因素試驗(yàn)設(shè)計(jì)得到的最優(yōu)處理作為二次回歸正交設(shè)計(jì)的零水平,進(jìn)行回歸正交試驗(yàn),建立染色體滴片效果與各關(guān)鍵因子的回歸方程,以探究玉米染色體滴片法的最佳技術(shù)方案。
1.3 數(shù)據(jù)分析
試驗(yàn)數(shù)據(jù)經(jīng)Excel整理后,利用DPS軟件進(jìn)行二次回歸正交組合設(shè)計(jì)統(tǒng)計(jì)分析,建立回歸方程。
2 結(jié)果與分析
2.1 各關(guān)鍵因子對(duì)染色體滴片的處理效果
由表2可知,NO處理時(shí)間分別為1.0h、1.5h、2.0h、2.5h和3.0h時(shí),玉米染色體滴片效果的得分等級(jí)分別為1、2、5、4和3,以2.0hNO處理時(shí)間的評(píng)分等級(jí)最高,染色體滴片效果最好(圖1a3)。冰乙酸固定根尖材料時(shí)間分別為1.0h、1.5h、2.0h、2.5h和3.0h時(shí),其滴片效果的得分等級(jí)分別為1、2.5、4和3,以2.0h固定時(shí)間的染色體滴片效果最好(圖1b3),評(píng)分等級(jí)最高。酶解時(shí)間分別為5.0h、5.5h、6.0h、6.5h和7.0h時(shí),其滴片效果的得分等級(jí)分別為3、4、5、2和1,以酶解時(shí)間為6.0h的染色體滴片效果最好(圖1c4),評(píng)分等級(jí)最高。滴片距離分別為10.0cm、20.0cm、30.0cm、40.0cm和50.0em時(shí),其滴片效果的得分等級(jí)分別為1、3、5、4和2,以30.0cm距離的染色體滴片效果最好(圖1d3),評(píng)分等級(jí)最高。
2.2 二次回歸正交設(shè)計(jì)及回歸分析
據(jù)單因素試驗(yàn)結(jié)果,二次回歸正交組合設(shè)計(jì)零水平分別為2.0h、2.0h、6.0h和30.0cm。關(guān)鍵處理因子NO處理時(shí)間的上下水平分別為1.0h和3.0h,冰乙酸固定時(shí)間的上下水平分別為1.0h和3.0h,酶解時(shí)間的上下水平分別為5.0h和7.0h,滴片距離的上下水平分別為10.0cm和50.0cm。由m=4、m,=3,選用γ=1.547,設(shè)計(jì)4個(gè)因素:NO處理時(shí)間(Z)、冰乙酸固定時(shí)間(Z2)、酶解時(shí)間(Z3)和滴片距離(Z4),相應(yīng)編碼為x、x、x和x,列出因素水平編碼表(表3),將試驗(yàn)設(shè)計(jì)中的編碼水平轉(zhuǎn)換成相應(yīng)的實(shí)際水平,即得試驗(yàn)實(shí)施方案(表4)。
據(jù)四因素二次回歸正交組合設(shè)計(jì)表,整理數(shù)據(jù)后得到四因素二次回歸正交組合設(shè)計(jì)結(jié)構(gòu)矩陣及試驗(yàn)結(jié)果計(jì)算表(表5),由此建立回歸方程:Y=6.18-0.25x+0.12x-0.29x+0.19x-0.30xx+0.10xx+0.06xx+0.29xx-0.03xx-0.13xx-1.47x’-1.41x'-1.45x'-1.20x'。
據(jù)表6顯著性檢驗(yàn)結(jié)果,x、x、x和x,的二次項(xiàng)均達(dá)到極顯著水平,其余各項(xiàng)回歸系數(shù)均不顯著,說明x、x、x和x的二次項(xiàng)對(duì)試驗(yàn)結(jié)果有極顯著影響,回歸關(guān)系極顯著,由此建立的數(shù)學(xué)模型與實(shí)際情況擬合較好。據(jù)平方項(xiàng)中心化公式:x’=x(x0)/n=x0.77,得到回歸方程:Y=10.44-0.25x+0.12x-0.29x+0.19x-0.30x1x+0.10xx+0.06xx+0.29xx-0.03xx-0.13xx-1.47x-1.41x-1.45x-l.20x。以Y值最大為目標(biāo)函數(shù),通過確定參數(shù)x(j=1,2,3,4)的最優(yōu)值。當(dāng)Y值最大時(shí),據(jù)目標(biāo)函數(shù)解得x=-0.078,x=0.040,x=-0.110,x=0.360,將x=(Z-2)/0.65,x2=(Z2)/0.65,x=(Z-6)/0.65,x=(Z-30)/12.93代入得到實(shí)際因素Z=1.95,Z=2.04,Z=5.93,Z=34.65
綜上所述,根據(jù)回歸方程,優(yōu)選出各關(guān)鍵處理因子的最佳方案,基于試驗(yàn)操作的實(shí)際性,采用取整法,即得到本試驗(yàn)玉米染色體滴片法關(guān)鍵處理因子的最佳技術(shù)方案:NO處理時(shí)間2.0h,冰乙酸固定時(shí)間2.0h,酶解時(shí)間6.0h,滴片距離35.0cm。
3 討論
3.1 影響染色體滴片效果的主要因素
滴片法的操作步驟有取材、預(yù)處理、固定、解離和滴片。材料預(yù)處理的目的是改變細(xì)胞內(nèi)染色體形態(tài)及分散狀態(tài),常采用秋水仙素、8-羥基喹啉和a-溴萘等藥劑進(jìn)行化學(xué)處理,本研究對(duì)材料的預(yù)處理則是通過增壓條件下的NO處理達(dá)到改良細(xì)胞內(nèi)染色體狀態(tài)的目的,同時(shí)避免了秋水仙素等化學(xué)試劑帶來的毒害和污染。材料固定的目的是使材料快速失活和蛋白質(zhì)沉淀,使材料保持初始狀態(tài),卡諾氏I固定液和甲醇冰乙酸(1:3,體積比)混合液是常用的固定液,固定液固定時(shí)間是影響染色體壓片技術(shù)的因素之一,本試驗(yàn)選擇冰乙酸固定材料2h,取得了較好的效果。解離是植物染色體制片過程的重要環(huán)節(jié),解離能分解細(xì)胞壁,消除細(xì)胞內(nèi)溶物,增加染色體清晰度,解離方法有酸解法和酶解法,酸解法往往因酸解過度造成染色體損傷,目前多采用酶解法,對(duì)于酶解時(shí)間,回歸分析選優(yōu)結(jié)果表明,采用2%纖維素酶和0.5%果膠酶混合液37C下酶解材料6.0h最適宜滴片法制片。不同于壓片法和火焰干燥法,滴片法的制片質(zhì)量取決于滴片技術(shù),而滴片距離直接決定染色體制片的成敗,滴片距離過小,細(xì)胞內(nèi)染色體交叉重疊、分散性差,滴片距離過大則細(xì)胞內(nèi)染色體過度分散、細(xì)胞間染色體混雜,回歸分析選優(yōu)結(jié)果發(fā)現(xiàn),細(xì)胞懸液以35.0cm的距離滴片可獲得分散性好、細(xì)胞內(nèi)染色體數(shù)目完整的高質(zhì)量制片。滴片法常規(guī)試驗(yàn)中多采用20.0cm左右的滴片距離,35.0em的滴片距離在實(shí)際操作中可能存在滴片不準(zhǔn)、細(xì)胞懸浮液流向邊緣導(dǎo)致浪費(fèi)等問題。因此,在實(shí)際的試驗(yàn)操作中,需綜合考慮,或反復(fù)進(jìn)行滴片技術(shù)的訓(xùn)練,以達(dá)到最佳的制片效果。
3.2 植物染色體制片技術(shù)
染色體制片質(zhì)量是制約細(xì)胞生物學(xué)和分子生物學(xué)發(fā)展的重要因素,一張高質(zhì)量的染色體制片要求細(xì)胞有絲分裂中期相多、染色體分散無重疊及染色體完整性好。目前國內(nèi)外通常采用壓片法和低滲涂片法進(jìn)行染色體制片。染色體壓片技術(shù)作為常用的染色體制片方法,被廣泛應(yīng)用于各類生物,尤其是植物染色體研究。壓片法雖然操作簡單實(shí)用,但需要適宜的取材時(shí)間和嫻熟的壓片技術(shù),對(duì)操作者的操作技術(shù)要求較高。染色體低滲涂片技術(shù)的核心是將試驗(yàn)材料均勻涂布在載玻片,上,從而有效降低壓片法所造成的染色體重疊。低滲涂片法盡管對(duì)操作技術(shù)要求不高,且制片效果較好,但其操作過程涉及火焰干燥和蓋玻片壓片,從而影響染色體完整性。染色體滴片法是將處理后的試驗(yàn)材料搗碎于冰醋酸溶液,然后制成細(xì)胞懸液,細(xì)胞懸液利用自身重力滴落在玻片上,保證了細(xì)胞中染色體的分散性和完整性。滴片法是一種新的染色體制片方法,目前國內(nèi)尚未見有關(guān)滴片技術(shù)研究的相關(guān)報(bào)道,鑒于滴片法的技術(shù)優(yōu)勢(shì),它將廣泛應(yīng)用于染色體研究,進(jìn)而促進(jìn)細(xì)胞遺傳學(xué)和分子生物學(xué)的發(fā)展。為規(guī)范染色體滴片技術(shù),本研究基于前期的染色體滴片技術(shù)經(jīng)驗(yàn),通過設(shè)置染色體滴片技術(shù)關(guān)鍵處理因子,采用回歸分析模型,確立了最佳玉米染色體滴片技術(shù)方案。由此制作了高質(zhì)量的染色體制片,制片中細(xì)胞有絲分裂中期相多、細(xì)胞內(nèi)溶物和雜質(zhì)少、染色體著色均勻、染色體交叉重疊少、具有完整染色體組(2n=20)的細(xì)胞較多。
參考文獻(xiàn):
[1]李懋學(xué),張贊平.作物染色體研究技術(shù)[M].北京:中國農(nóng)業(yè)出版社,1996:58-92.
[2] 馬婷玉,李明,吳燕燕,等.穿心蓮染色體制片優(yōu)化及核型分析[J].江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2017 ,45(7):33-36.
[3] MCFEE A F,SAYER A M,SAOMAA S I,et al. Methods for im-proving the yield and quality of metaphase preparations for FISHprobing of human lymphocyte chromosomes[J]. Environ Mol Mu-tagen,1997,29 :98-104.
[4] PENG R H,LIU F,HU X,et al. Microdissection and microcloning of chromosome 5 in Gossypium arboreum[J]. Plant Mol Biol Rep,2012 ,30(5):1218-1228.
[5] JONES N,HOUBEN A. B chromosomes in plants:escapees from the A chromosome genome[J]. Trends in Plant Science ,2003 ,8:417-423.
[6] HU Z M,CUI L H,WANG L L,et al. Isolation of single chromo-somes and chromosomal fragments of Lilium regale[J]. Acta Ge-netica Sinica,1997,24(3):278-281.
[7] 楊大翔.遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)[M].3版.北京:科學(xué)出版社,2016:3-98.[8] 潘頎,王芳,郝愛花,等.新疆紫草不同材料染色體制片技術(shù)研究[J].新疆農(nóng)業(yè)科學(xué),2013 ,50(9):1642- 1650.
[9] 勞世輝,魏岳榮,盛鷗,等.菠蘿蜜的染色體制片優(yōu)化及核型分析[J].中國農(nóng)學(xué)通報(bào),2011 ,27(16):215-219.
[10]陳雪,商超,張曉瑩,等.射干染色體制片技術(shù)的探索[J].中國園藝文摘,2016(1):9-12.
[11]劉丹,夏雪,吳益梅,等.植物染色體制片效果影響因素的解析[J].浙江農(nóng)業(yè)科學(xué),2015,56 (10):1654-1657.
[ 12] BARCH M J,KNUTSEN T,SPERBUCK T L. AGT cytogenetics laboratory manual [ M ].3rd. Philadelphia:Lippincott Raven Pub-lishers,1991 :39-46.
[ 13] JONES R N,GONZALEZ-SANCHEZ M ,GONZALEZ-CARCIA M,et al. Chromosomes with a life of their own[ J]. Cytogenet GenomeRes ,2008,120(3/4):265-280.
[14] DENG W T S,LUCAS J N,LEUNG C S,et al. A new method for improving metaphase chromosome spreading[ J]. Cytometry Part Athe Journal of the International Society for Analytical Cytology,2003,51(1):46-51.
[15]賈建.沙果果醋醋酸發(fā)酵工藝條件的優(yōu)化[J].中國調(diào)味品,2015,40(4):42-45.
[16]葉雙峰,葉書有,張影.回歸最優(yōu)設(shè)計(jì)進(jìn)行無花果施肥的研究[J].江蘇林業(yè)科技,2001 ,28(2):25-27.
[17] HENEGARIU O,HEEREMA N A,WRIGHT L L,et al. Improve-ments in cytogenetic slide preparation:controlled chromosomespreading ,chemical aging and gradual denaturing[J]. Cytometry,2001 ,43(2):101-109.
[18] MASONBRINK R E,BIRCHLER J A. Sporophytic nondisjunction of the maize B chromosome at high copy numbers[ J]. J Genet Ge-nomics ,2010,37(1):79-84.
[19] LAMB J C,MEYER J M,CORCORAN B,et al. Distinct chromo-somal distributions of highly repetitive sequences in maize [ J ].Chromosome Research ,2007,15(1):33-49.
[20] WANG H,WAN Y. A modifed method for improving the quality of metaphase preparations[ J]. Chinese Journal of Birth Health & He-redity ,2013 ,21(7):64-65.
[21]徐道娜,薛志強(qiáng),李世棟,等.西瓜染色體壓片技術(shù)改進(jìn)研究[J].西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2007 ,16(6):301-304.
[22]姚啟倫.玉米染色體制片技術(shù)中關(guān)鍵因子處理效應(yīng)及優(yōu)化[J].湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2007 ,33(4):419-422.
[23] KATO A,LAMB J C,BIRCHLER J A. Chromosome painting in maize using repetitive DNA sequences as probes for somatic chro-mosome identification[J]. Proc Natl Acad Sci USA,2004,101 (37):13554-13559.
[24] KATO A. Air drying method using nitrous oxide for chromosome counting in maize[ J]. Biotech Histochem,1999 ,74(3):160-166.
[25] AHLADA M R,RAO I,VICTOR R ,et al. Slide making and proto-type of a dropper device for chromosomal preparations[J]. Int JHum Genet ,2005 ,5(3):213-216.