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        基于快速模糊C均值和鄰域空間信息的腦部MR圖像分割

        2019-09-09 07:28:10任彤
        中國醫(yī)療設(shè)備 2019年9期
        關(guān)鍵詞:空間信息腦部鄰域

        任彤

        南京胸科醫(yī)院 放射科,江蘇 南京 210029

        引言

        MR 成像是診斷腦疾病的重要手段。評估腦組織形態(tài)改變需要精確劃分腦部MR 圖像中灰質(zhì)、白質(zhì)和腦脊液等區(qū)域,圖像分割技術(shù)可按臨床診斷需要提取出感興趣區(qū)域[1-3]。目前圖像分割算法層出不窮,但由于人體解剖結(jié)構(gòu)復(fù)雜性、不規(guī)則性、灰度不均等原因,并無統(tǒng)一的算法滿足所有醫(yī)學(xué)圖像分割需求。模糊C 均值聚類(Fuzzy C-Means,F(xiàn)CM)因簡單、高效、精確等特點(diǎn)廣泛應(yīng)用于腦部MR 圖像分割[4-5],但傳統(tǒng)FCM 算法包含多種缺點(diǎn),不能利用像素之間的空間信息,且對圖像噪聲敏感,其次初始聚類中心的選取對收斂速度影響很大。多種改進(jìn)算法被提出,均在一定程度上改善了FCM 算法性能。其中Kistin 等[6]采用核密度估計(jì)選取初始聚類中心,Vivas 等[7]根據(jù)像素特征更新聚類中心,還有學(xué)者將鄰域空間信息加入隸屬度函數(shù)中[8-9]。

        本研究提出一種基于改進(jìn)FCM 的腦部MR 圖像分割算法,其特點(diǎn)在于:采用距離最大測度測定初始聚類中心;采用硬分類方法更新聚類中心;采用鄰域空間信息重構(gòu)隸屬度函數(shù)。

        1 方法

        1.1 FCM算法

        FCM 算法基本思想是:通過優(yōu)化目標(biāo)函數(shù)得到每個(gè)樣本點(diǎn)對所有聚類中心的隸屬度,從而決定樣本點(diǎn)的類屬以達(dá)到自動(dòng)對樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行分類的目的[10]。

        設(shè)圖像像素?cái)?shù)目為n,圖像像素集合為X={x1, x2, ......xn},圖像分為c 個(gè)類別,為各類別聚類中心,uij是第j 個(gè)像素對第i 類的隸屬度函數(shù),則目標(biāo)函數(shù)Jm可寫成公式(1),隸屬度約束條件如公式(2)[11],其中m 為控制聚類結(jié)果的模糊程度常數(shù),一般取2[12-13], 表示歐式距離,當(dāng)目標(biāo)函數(shù)相鄰兩次迭代結(jié)果小于設(shè)定的閾值,則完成聚類過程。

        在公式(2)的約束條件下求公式(1)的極小值,采用拉格朗日乘數(shù)法可得vi和vij的表達(dá)式如(3)和(4)所示,用于更新聚類中心和各像素隸屬度。

        FCM 聚類算法實(shí)現(xiàn)簡單,但存在一定局限性,算法收斂速度取決于初始聚類中心的設(shè)定,選擇不當(dāng)容易陷入局部最優(yōu)解,且增加計(jì)算量。本文提出一種基于空間鄰域信息的快速FCM 算法,并改進(jìn)初始聚類中心選取方法。

        1.2 初始聚類中心設(shè)定

        本研究采用距離最大測度選取FCM 初始聚類中心提高收斂速度和避免盲目性,具體步驟如下:

        (1)將mi按照升序方式排列,其中mk如公式(5)所示[14],且輸入向量X={x1, x2, ......xn}是P 維數(shù)據(jù)。

        (2)重新排列X 向量,記為X'={x'1, x'2, ......x'n},分為c 個(gè)類別,每個(gè)類別包含nck個(gè)數(shù)據(jù)量,如公式(6),表示下取整運(yùn)算,因此第c 類包含剩余的數(shù)據(jù)量。

        (3)計(jì)算各組像素點(diǎn)之間距離,如表1 所示,選取各組距離最大值,如果第k 類的最大距離為,則第k 類初始聚類中心為像素xi和xj的平均值,記為Mk。

        表1 各組像素點(diǎn)之間距離

        1.3 快速FFCM算法

        FCM 算法將c 個(gè)隸屬度分配到所有像素,迭代更新每個(gè)像素的聚類中心和隸屬度,模糊更新c×n 次是一個(gè)耗時(shí)的過程,觀察發(fā)現(xiàn)聚類中心之間存在相似特征向量,可采用硬分類隸屬度更新聚類中心,具體步驟如下:① 對于p維輸入數(shù)據(jù),將uij放入d1×d2矩陣中;② 設(shè)定一個(gè)新的模糊隸屬度和標(biāo)記矩陣L={L1,L2,......Lc},Lk為當(dāng)前迭代中第k 類的標(biāo)簽矩陣;③ 將所有對應(yīng)標(biāo)簽矩陣Lk的數(shù)據(jù)記為nck 為第k 類別的數(shù)據(jù)量;④ 采用公式(7)更新第k 類聚類中心。

        1.4 基于空間鄰域信息的FCM/FFCM算法

        鄰域像素之間包含有很多相似特征,可看成是一些大概率類別的集合[15]。為了在FCM/FFCM 算法中充分利用鄰域空間信息,空間函數(shù)表達(dá)式由公式(8)給出,此處空間函數(shù)hij類似于隸屬度函數(shù)uij,表示像素xj屬于第i 類的概率,表示55 的線性空間函數(shù)點(diǎn)陣窗口,xj是點(diǎn)陣窗口中心像素。

        若窗口中絕大多數(shù)像素屬于同一個(gè)類別,此時(shí)hij表示大概率的像素即是此類別的一員,因此基于空間函數(shù)的隸屬度可由公式(9)表示,式中為新的隸屬度函數(shù),參數(shù)p,q 表示隸屬度函數(shù)uij與空間函數(shù)hij的相互影響,因此基于參數(shù)p,q 調(diào)節(jié)和空間信息的FCM/FFCMF 算法記為SFCMp,q/SFFCMp,q。

        因此,基于SFCMp,q/SFFCMp,q的分類步驟如下:① 選取聚類中心數(shù)目c,初始化聚類中心矩陣V(0)/V*(0);② 采用公式(9)更新隸屬度矩陣U/U*;③ 采用公式(4)/(7)更新SFCM/SFFCM 的聚類中心V/V*;④ 重復(fù)步驟(3)和(4),直到為一個(gè)非常小的正數(shù)。

        1.5 模糊聚類效果評價(jià)

        圖像分類效果采用模糊位置系數(shù)和位置熵兩個(gè)指標(biāo)評估[16-17],分別表示分割的精確性與誤差性,由公式(10)和(11)給出,Vpc越接近1,Vpe越接近0,聚類效果越佳。

        2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析

        為了驗(yàn)證本研究算法的可行性、精確性和實(shí)用性,選用人工合成圖像和臨床實(shí)例MR 腦圖像,人工圖像由高斯白噪聲腐蝕,所有仿真實(shí)驗(yàn)均在Matlab 2013a 平臺上實(shí)現(xiàn)。

        2.1 定性分析

        首先,選用人工合成的MR-T1 圖像進(jìn)行測試,結(jié)果如圖1 所示,4 層灰度分別為50、100、150 和200,每層灰度代表MR 圖像的一種結(jié)構(gòu),可以看出FCM/FFCM 的分割圖像(圖1c 和1d)中躁點(diǎn)顯著,基于空間信息的SFCM1,1/SFFCM1,1分割圖像(圖1e 和1f)中噪聲水平顯著降低,SFCM0,2/SFFCM0,2(圖1g 和1h)分割圖像最佳,且肉感分辨無差別?;诓煌惴ǖ娜斯ず铣赡X部MR-T1 加權(quán)圖像分割結(jié)果如圖2 所示,結(jié)果顯示,基于FCM/FFCM 的不同分割算法均能分割出腦脊液、白質(zhì)和灰質(zhì)區(qū)域,但明顯基于SFCM/SFFCM 算法的圖像質(zhì)量更佳。不同算法的臨床MR 圖像分割結(jié)果見圖3 所示,同樣地,臨床實(shí)例腦部MR-T1 加權(quán)圖像分割結(jié)果再次證明基于SFCM/SFFCM 算法的圖像質(zhì)量優(yōu)于傳統(tǒng)的FCM/FFCM 算法。

        圖1 不同算法的人工合成圖像分割結(jié)果

        圖2 不同算法的人工合成MR圖像分割結(jié)果

        圖3 不同算法的臨床MR圖像分割結(jié)果

        2.2 定量分析

        不同F(xiàn)CM/FFCM 算法所得模糊分類指標(biāo)比較結(jié)果,見表2。對于人工合成的MR 圖像分割,F(xiàn)FCM0,2獲得的Vpc值最接近于1(0.979),SFFCM1,1獲得的Vpe最接近于0(0.024);對于合成的腦部MR-T1 圖像和臨床實(shí)例腦部MR-T1 圖像分割,基于FCM/FFCM 獲得的評價(jià)指標(biāo)均較差,基于SFCM1,1/SFFCM1,1的分類評價(jià)指標(biāo)均較優(yōu),且SFFCM1,1獲得Vpc和Vpe均最優(yōu),Vpc達(dá)0.944,Vpe 達(dá)0.043。

        表2 不同F(xiàn)CM/FFCM算法所得模糊分類指標(biāo)比較

        程序耗時(shí)與迭代次數(shù)可表征分割算法的運(yùn)行速度與收斂性能,其中不同算法所需運(yùn)算時(shí)間比較結(jié)果見圖4 所示,按耗時(shí)高低排序依次為:標(biāo)準(zhǔn)FCM(21.49、47.21、12.46 s),F(xiàn)FCM,SFCM1,1,SFCM0,2,SFFCM0,2,SFFCM1,1(5.87、8.09、7.83 s)。SFFCM1,1較標(biāo)準(zhǔn)FCM 減低4.83~39.12 s,提升37.2%~82.9%。不同算法所需迭代次數(shù)見圖5 所示,基于標(biāo)準(zhǔn)FCM 的迭代次數(shù)均最高(13、28 和13),基于空間信息的SFFCM0,2和SFFCM1,1所需迭代次數(shù)相當(dāng)(4、8 和8),同比下降了5~20 次,且顯著低于其他分割算法。

        圖4 不同F(xiàn)CM/FFCM算法所得仿真時(shí)間對比

        圖5 不同F(xiàn)CM/FFCM算法所得迭代次數(shù)對比

        3 結(jié)論

        本研究設(shè)計(jì)了一種基于FCM 改進(jìn)算法的腦部MR 圖像分割,主要改進(jìn)三處提高算法收斂速度:① 采用快速FCM算法更新聚類中心;② 采用空間鄰域特征信息重構(gòu)隸屬度函數(shù);③ 采用最大距離測度選取初始聚類中心。人工合成和臨床實(shí)例腦部MR 圖像的仿真實(shí)驗(yàn)均表明,基于本研究改進(jìn)算法(SFFCM)所得的分割圖像能完成正確的區(qū)域分類,壓制噪聲獲得高質(zhì)量圖像,且分類精確性、算法性能等指標(biāo)均優(yōu)于其他算法。因此,本研究提出的算法適用于腦部MR 圖像分割,具有較高的可行性、強(qiáng)健性和優(yōu)越性。

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