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        谷子種子線蟲(chóng)檢測(cè)及分析

        2019-09-02 12:27:08宋振君李志勇王永芳全建章馬繼芳董志平
        華北農(nóng)學(xué)報(bào) 2019年4期
        關(guān)鍵詞:貝西谷子線蟲(chóng)

        宋振君,李志勇,王永芳,全建章,馬繼芳,白 輝,董志平

        (1.河北省農(nóng)林科學(xué)院 谷子研究所,河北省雜糧重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,國(guó)家谷子改良中心,河北 石家莊 050035;2.河北師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,河北 石家莊 050024)

        谷子(Setariaitalica)起源于中國(guó),具有悠久的種植歷史。谷子是一種抗旱耐瘠、糧草兼用、富含營(yíng)養(yǎng)的特色雜糧作物,可用于提升干旱地區(qū)糧食產(chǎn)量、發(fā)展畜牧業(yè)和改善人們膳食結(jié)構(gòu)[1-2]。谷子線蟲(chóng)病是華北谷子產(chǎn)區(qū)的重要病害,在河北中南部、山東、河南等夏谷區(qū)普遍發(fā)生,嚴(yán)重地塊可減產(chǎn)50%~80%,是當(dāng)前谷子高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的主要障礙之一[3]。由于谷子種子調(diào)運(yùn)頻繁、抗病品種培育困難、主要栽培品種均為感病品種等因素影響,在我國(guó)谷子產(chǎn)區(qū)谷子線蟲(chóng)病蔓延的趨勢(shì)日益加劇[4]。谷子線蟲(chóng)病又稱(chēng)紫穗病或者倒青,病原菌為貝西滑刃線蟲(chóng)(AphelenchoidesbesseyiChristie, 1942),是一種遷移性植物寄生線蟲(chóng)[5]。谷子線蟲(chóng)病的傳播主要依賴(lài)于帶病種子,線蟲(chóng)會(huì)伴隨著植株的生長(zhǎng)逐漸由植株的地下部分轉(zhuǎn)移到地上部分,主要為害花器、子房,影響穗的發(fā)育,造成谷子大量減產(chǎn)[3, 6]。

        谷子線蟲(chóng)為種傳病害,應(yīng)從選種初期進(jìn)行篩選與防控,切斷傳播病害的源頭,因此對(duì)種子進(jìn)行帶線蟲(chóng)檢測(cè)尤為重要。崔麗麗等[7]采用馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA)平板法和紙培養(yǎng)法,檢測(cè)到吉林省北五味子種子攜帶有青霉屬、曲霉屬和根霉屬病菌;趙芝等[8]對(duì)采自云南省的15份三七種子樣品,采用PDA平板法檢測(cè)到種子表面和內(nèi)部攜帶多種真菌;胡曉芬等[9]采用盆栽幼苗癥狀觀察法和PDA培養(yǎng)基法,對(duì)7個(gè)玉米品種進(jìn)行了種子表面帶菌檢測(cè),結(jié)果檢測(cè)到供試種子表面攜帶有4種真菌;高葦?shù)萚10]用洗滌法和PDA平板法,對(duì)12個(gè)黃瓜栽培品種進(jìn)行種子外部和內(nèi)部帶菌檢測(cè),結(jié)果顯示供試種子外部帶菌量高于種子內(nèi)部寄藏真菌;金柳艷等[11]對(duì)黃淮海夏玉米區(qū)720個(gè)玉米籽粒樣品帶菌量進(jìn)行檢測(cè),采用洗滌檢測(cè)法和PDA平板檢測(cè)法,發(fā)現(xiàn)表面無(wú)癥狀的玉米籽粒在成熟期均攜帶大量病原菌。目前,關(guān)于種子帶菌檢測(cè)的報(bào)道中很多試驗(yàn)者都采用PDA平板法[12]對(duì)籽粒的帶菌率與分離到菌屬的分離頻率進(jìn)行統(tǒng)計(jì),且對(duì)分離得到的菌屬進(jìn)行分類(lèi)鑒定。此檢測(cè)方法在平板培養(yǎng)過(guò)程中易受雜菌的干擾,且鑒定結(jié)果還需要進(jìn)行再接種的生物學(xué)試驗(yàn)進(jìn)一步確定,如有大量的樣品需要檢測(cè)時(shí),耗時(shí)費(fèi)力[13]。

        由于滑刃屬線蟲(chóng)種類(lèi)繁多,形態(tài)特征復(fù)雜多變,且與其近似種十分相似,利用傳統(tǒng)方法對(duì)貝西滑刃線蟲(chóng)進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定,需要扎實(shí)的分類(lèi)鑒定功底,因此,傳統(tǒng)檢測(cè)方法有一定的局限性。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的快速的發(fā)展,基于PCR技術(shù)的分子檢測(cè)技術(shù)以其特異性強(qiáng)、靈敏度高、檢測(cè)快速、簡(jiǎn)捷且鑒定結(jié)果準(zhǔn)確等優(yōu)勢(shì),已被用于種子中植物病原菌的檢測(cè)[13-21]。宋順華等[13]通過(guò)優(yōu)化PCR模板的方法,利用傳統(tǒng)的PCR技術(shù),檢測(cè)出西瓜種子帶有細(xì)菌性果腐病菌;任毓忠等[22]采用特異性引物PCR技術(shù)檢測(cè)出8個(gè)市售哈密瓜品種的種子攜帶有瓜類(lèi)果斑病菌;曾丹丹等[23]采用環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)對(duì)黃淮地區(qū)29個(gè)大豆主栽品種種子進(jìn)行帶菌檢測(cè),檢測(cè)出多種病原菌;張貴等[24]利用巢氏聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),檢測(cè)出向日葵種皮中攜帶有黃萎病菌。在種子帶菌檢測(cè)中PCR的方法呈現(xiàn)出快速、簡(jiǎn)捷且鑒定結(jié)果可靠的優(yōu)點(diǎn),因此可用于谷子種子帶菌的檢測(cè)。在谷子中利用PCR技術(shù)檢測(cè)種子攜帶線蟲(chóng)的報(bào)道還極少。因此,本研究以來(lái)自黑龍江、吉林、遼寧、內(nèi)蒙古、河北、山東、山西和陜西等谷子主產(chǎn)區(qū)的99份谷子種子DNA為模板,使用已報(bào)道的1對(duì)貝西滑刃線蟲(chóng)PCR特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增[21],快速檢測(cè)谷子種子是否帶有貝西滑刃線蟲(chóng),并分析線蟲(chóng)種群的單倍型數(shù)目和變異位點(diǎn),旨在為谷子種子攜帶線蟲(chóng)進(jìn)行快速鑒定提供技術(shù)支持,為谷子線蟲(chóng)病的早期診斷與防控奠定理論基礎(chǔ)。

        1 材料和方法

        試驗(yàn)于2018年4-8月在河北省農(nóng)林科學(xué)院谷子研究所河北省雜糧重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室完成。

        1.1 試驗(yàn)材料

        供試的谷子線蟲(chóng)病穗,由河北省農(nóng)林科學(xué)院谷子研究所植保室保存;99份谷子種子來(lái)自黑龍江、吉林、遼寧、內(nèi)蒙古、河北、山東、山西和陜西等國(guó)家谷子高粱產(chǎn)業(yè)體系育種崗位、試驗(yàn)站和種子公司,具體信息詳見(jiàn)表1。

        表1 99份供試谷子品種編號(hào)及來(lái)源Tab.1 Numbers and origins of the 99 tested foxtail millet varieties

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 谷子種子基因組DNA的提取 使用植物基因組DNA提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司,DP321-03)提取谷子種子基因組DNA,試驗(yàn)步驟參照試劑盒說(shuō)明書(shū)。分別采用瓊脂糖凝膠電泳、Nanodrop方法檢測(cè)DNA樣品的完整性、純度和濃度,選擇合格的DNA樣品進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

        1.2.2 引物的特異性檢測(cè) 采用已報(bào)道的根據(jù)貝西滑刃線蟲(chóng)核糖體28S rRNA-D2/D3片段設(shè)計(jì)的特異性引物[21]:GU-F(GACACTGCAATCGCTTCGAC)/GU-R(ATCCGCAACCACAACTCACA),以谷子貝西滑刃線蟲(chóng)和其他4種谷子籽粒上常見(jiàn)的病原菌:谷子銹菌(Uromycessetariae-italicae)、谷瘟病菌(Pyriculariasetariae)、白發(fā)病菌(Sclerosporagraminicola)和粟粒黑穗病菌(Ustilagocrameri)DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,檢測(cè)引物的特異性。PCR反應(yīng)體系為25 μL,2 × Es Taq Master Mix 12.5 μL(北京康為世紀(jì)生物科技有限公司,CW0690)、模板DNA 2.0 μL、上下游引物各1 μL(濃度10 μmol/L)、超純水補(bǔ)足。PCR擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性 2 min;35個(gè)循環(huán)反應(yīng)(94 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s),72 ℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物用1.2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè)。電泳緩沖液為1×TAE,恒定電壓160 V,電泳20 min,用EB染色并在紫外凝膠成像儀上觀察電泳條帶并且拍照。

        1.2.3 引物的靈敏度檢測(cè) 將谷子線蟲(chóng)DNA用滅菌超純水稀釋為初始質(zhì)量濃度10 ng/μL,按(1,1/10,1/20, 1/40,1/80,1/160)共6個(gè)濃度梯度,分別稀釋成10.0,1.0,0.5,0.25,0.125,0.062 5 ng/μL。以不同濃度的DNA為模板,采用PCR檢測(cè)體系進(jìn)行擴(kuò)增,檢測(cè)特異性引物的靈敏度。

        1.2.4 28S核糖體RNA序列PCR擴(kuò)增和測(cè)序 利用貝西滑刃線蟲(chóng)特異性引物GU-F/GU-R對(duì)谷子種子基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,總反應(yīng)體系為25 μL,反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性 2 min;35個(gè)循環(huán)反應(yīng)(94 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸20 s),72 ℃延伸5 min。用1.2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),并回收目的條帶。按照凝膠DNA小量回收試劑盒(美基生物科技有限公司,D2111-03)的步驟將切膠回收的目的片段與pMD19-T載體連接,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞(DH5α),把經(jīng)菌落PCR篩選的陽(yáng)性克隆菌液送至上海生工測(cè)序。每個(gè)樣品測(cè)序3次,3次測(cè)序結(jié)果吻合的樣品進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。利用Sequencher_v4.1.4 軟件讀取測(cè)序的序列,觀察峰值進(jìn)行反復(fù)校對(duì),利用DNAMAN_v6、ClustalX1.81[25]軟件對(duì)測(cè)得的序列進(jìn)行分析,并與從GenBank上下載貝西滑刃線蟲(chóng)28S核糖體RNA序列進(jìn)行多序列同源比對(duì),分析單倍型數(shù)目和變異位點(diǎn)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 引物的特異性檢測(cè)

        利用谷子貝西滑刃線蟲(chóng)的特異性引物GU-F/GU-R,以谷子貝西滑刃線蟲(chóng)和4種谷子籽粒上常見(jiàn)的病原菌(谷銹菌、谷瘟病菌、白發(fā)病菌和粟粒黑穗病菌)DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以驗(yàn)證引物的特異性。結(jié)果如圖1所示,該引物僅能對(duì)谷子貝西滑刃線蟲(chóng)DNA擴(kuò)增出約245 bp的特異性片段,其他病原菌DNA與陰性對(duì)照(ddH2O)則無(wú)條帶出現(xiàn)。將特異性片段進(jìn)行回收純化和測(cè)序,與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中貝西滑刃線蟲(chóng)的28S核糖體RNA序列(登錄號(hào):KX622689.1)進(jìn)行比對(duì)分析,可知245 bp特異性片段的序列與貝西滑刃線蟲(chóng)序列完全匹配,說(shuō)明引物GU-F/GU-R能夠特異的檢測(cè)出谷子貝西滑刃線蟲(chóng)。

        M.Marker;AB.谷子貝西滑刃線蟲(chóng);US.谷銹菌;PS.谷瘟病菌;SG.白發(fā)病菌;UC.粟粒黑穗病菌;CK.陰性對(duì)照(ddH2O)。

        M.Marker;AB.Aphelenchoidesbesseyi;US.Uromycessetariae-italicae;PS.Pyriculariasetariae;SG.Sclerosporagraminicola;UC.Ustilagocrameri;CK.Negative control(ddH2O).

        圖1 貝西滑刃線蟲(chóng)特異性引物GU-F/R的檢測(cè)結(jié)果
        Fig.1 Detection results ofAphelenchoidesbesseyispecific primerGU-F/R

        2.2 引物的靈敏度檢測(cè)

        利用谷子貝西滑刃線蟲(chóng)的特異性引物,以谷子線蟲(chóng)DNA稀釋后不同質(zhì)量濃度的DNA(10.0, 1.0, 0.5, 0.25, 0.125, 0.0625ng/μL)為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以檢測(cè)特異性引物的靈敏度。結(jié)果如圖2,模板濃度為10 ng/μL時(shí),擴(kuò)增條帶清晰且明亮。質(zhì)量濃度為1 ng/μL(1/10×)和0.5 ng/μL(1/20×)時(shí),擴(kuò)增條帶依然清晰可見(jiàn)。稀釋至0.125 ng/μL(1/80×)時(shí),條帶亮度下降,但仍可判別。質(zhì)量濃度為0.062 5 ng/μL(1/160×)時(shí),特異性條帶基本消失。表明貝西滑刃線蟲(chóng)特異性引物對(duì)線蟲(chóng)DNA檢測(cè)靈敏度較高,即使DNA濃度較低時(shí),仍保持較高的檢測(cè)效率。線蟲(chóng)DNA模板量為0.125 ng/μL是引物的最低檢測(cè)濃度。

        M.Marker;1-6.(1×,1/10×,1/20×,1/40×,1/80×,1/160×);CK.陰性對(duì)照(ddH2O)。M.Marker;1-6.(1×,1/10×,1/20×,1/40×,1/80×,1/160×);CK. Negative control(ddH2O).

        M.Marker;CK+.貝西滑刃線蟲(chóng);CK-.ddH2O;C1~C99.品種編號(hào)。M.Marker;CK+. Aphelenchoides besseyi;CK-.ddH2O;C1-C99.Cultivar numbers.

        2.3 谷子種子攜帶貝西滑刃線蟲(chóng)及其頻率的檢測(cè)

        將采自黑龍江、吉林、遼寧、內(nèi)蒙古、河北、山東、山西和陜西等地的99份谷子種子樣本進(jìn)行基因組DNA提取,利用PCR技術(shù),對(duì)籽粒上的貝西滑刃線蟲(chóng)進(jìn)行擴(kuò)增檢測(cè)。結(jié)果如圖3所示,99份種子樣品中有33份擴(kuò)增出特異性條帶,陰性對(duì)照(ddH2O)無(wú)條帶。對(duì)擴(kuò)增條帶進(jìn)行TA克隆并選擇陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果與貝西滑刃線蟲(chóng)28S核糖體RNA序列(KX622689.1)進(jìn)行比對(duì),除C40樣品的序列為97%以外,其他所有序列與其相似性為99%及以上。結(jié)果表明,本研究建立的PCR體系具有良好的準(zhǔn)確性與穩(wěn)定性,可用于谷子種子中貝西滑刃線蟲(chóng)的檢測(cè)。

        表2 不同地區(qū)谷子品種種子帶病頻率的檢測(cè)結(jié)果Tab.2 Contamination rate of different foxtail millet cultivars detected

        為了確定谷子不同品種籽粒攜帶貝西滑刃線蟲(chóng)的頻率,對(duì)99份谷子種子的帶病率進(jìn)行了重復(fù)檢測(cè)。結(jié)果顯示,33份谷子種子帶有貝西滑刃線蟲(chóng),與之前檢測(cè)結(jié)果一致,陽(yáng)性重復(fù)率100%。將33份陽(yáng)性谷子帶貝西滑刃線蟲(chóng)頻率進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),其中,C93帶病率最高,為100%;C65、C66、C67和C77共4份谷子品種帶病率最低,僅為33.3%;其余供試的谷子種子帶病率介于二者之間(表2)。33份帶貝西滑刃線蟲(chóng)的谷子品種大部分來(lái)自春谷區(qū)(圖4),在黑龍江、吉林、遼寧、內(nèi)蒙古、陜西、山西、河北張家口這些地區(qū)均檢測(cè)到,而來(lái)自海南的5份種子中檢測(cè)到2份帶貝西滑刃線蟲(chóng)。

        三角形和圓形表示樣本所在地區(qū),圓形表示具有陽(yáng)性樣本的地區(qū);分?jǐn)?shù)表示該地區(qū)陽(yáng)性樣本數(shù)占樣本數(shù)的比值。

        The triangle and round indicate the location of the sample, and the round indicates positive samples;The score represents the ratio of positive samples to the total samples in the area.

        圖4 帶貝西滑刃線蟲(chóng)的谷子品種地理分布圖
        Fig.4 Geographical distribution map of foxtail milletvarieties withAphelenchoidesbesseyi

        2.4 貝西滑刃線蟲(chóng)28S核糖體RNA序列的分析

        對(duì)33份陽(yáng)性種子攜帶的貝西滑刃線蟲(chóng)28S核糖體RNA序列進(jìn)行多態(tài)性分析,結(jié)果如表3所示。貝西滑刃線蟲(chóng)基因種內(nèi)多態(tài)性位點(diǎn)有29個(gè),其中多變異位點(diǎn)3個(gè),這些突變以A-G/T-C之間的轉(zhuǎn)換為主。貝西滑刃線蟲(chóng)種內(nèi)變異率為11.8%,基因中的GC含量為56.3%~57.1%,平均為56.7%,無(wú)明顯的堿基偏向性。

        對(duì)33份貝西滑刃線蟲(chóng)樣本序列進(jìn)行分析,共檢測(cè)出22種單倍型,分別命名為AB1-AB22,并進(jìn)行單倍型的多樣性分析,結(jié)果如表4。其中單倍型AB1出現(xiàn)的頻率最高,在具有陽(yáng)性樣品的各省份中均可檢測(cè)到該單倍型。其余的單倍型僅出現(xiàn)過(guò)一次,屬于稀有單倍型。河北張家口和內(nèi)蒙古松山區(qū)兩地的遺傳多樣性最為豐富。

        表3 貝西滑刃線蟲(chóng)樣本單倍型的變異位點(diǎn)Tab.3 Variation sites in haplotypes of Aphelenchoides besseyi

        注:AB1-AB22.貝西滑刃線蟲(chóng)單倍型(AB1 GenBank 登錄號(hào):KX622689.1;AB2-AB22 GenBank 登錄號(hào):MK204592-MK204612)。

        Note: AB1-AB22.Haplotypes ofAphelenchoidesbesseyi(GenBank accession number of AB1: KX622689.1; GenBank accession number of AB2 to AB22: MK204592-MK204612).

        表4 貝西滑刃線蟲(chóng)各地理種群?jiǎn)伪缎徒y(tǒng)計(jì)Tab.4 Phenotypic statistics in different geographical populations of Aphelenchoides besseyi

        3 結(jié)論與討論

        本研究利用PCR技術(shù)對(duì)谷子種子是否攜帶貝西滑刃線蟲(chóng)進(jìn)行了檢測(cè),這種快速檢測(cè)方法來(lái)自貝西滑刃線蟲(chóng)雙重PCR檢測(cè)體系[21],該方法共設(shè)計(jì)2對(duì)引物:內(nèi)標(biāo)引物F194/AB28以及特異性引物GU-F/GU-R,同時(shí)進(jìn)行擴(kuò)增,能快速準(zhǔn)確鑒定出貝西滑刃線蟲(chóng)。本研究中,選擇其特異性引物GU-F/GU-R對(duì)谷子種子DNA進(jìn)行檢測(cè),可準(zhǔn)確擴(kuò)增出陽(yáng)性條帶,經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證與貝西滑刃線蟲(chóng)序列完全匹配;同時(shí)也選擇內(nèi)標(biāo)引物F194/AB28對(duì)種子DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增結(jié)果有2條大小不同的條帶:其中750 bp條帶匹配谷子序列,780 bp條帶匹配假單胞菌屬序列,測(cè)序比對(duì)結(jié)果均不匹配線蟲(chóng)序列,這一結(jié)果與雙重PCR檢測(cè)體系結(jié)果并不一致。

        傳統(tǒng)的PCR技術(shù)所使用的PCR模板,是采用CTAB方法從帶菌種子上分離的病菌DNA,此方法比較繁瑣, 也降低了PCR的靈敏度[13]。本試驗(yàn)初期,曾使用試劑盒和CTAB 2種方法提取種子DNA,經(jīng)PCR擴(kuò)增結(jié)果比對(duì)發(fā)現(xiàn),使用CTAB法提取的種子DNA擴(kuò)增出的陽(yáng)性條帶數(shù)量低于使用試劑盒提取的種子DNA擴(kuò)增出的陽(yáng)性條帶數(shù)量,且結(jié)果重復(fù)性不穩(wěn)定,因此,選擇使用試劑盒來(lái)提取種子DNA。但種子中線蟲(chóng)DNA提取與檢測(cè)效率容易受到線蟲(chóng)蟲(chóng)口數(shù)量和種子中雜質(zhì)的影響,還需要對(duì)帶病種子中線蟲(chóng)DNA的提取方法進(jìn)行優(yōu)化和改進(jìn)。

        董立等[4]對(duì)64份涵蓋東北春谷區(qū)、西北春谷區(qū)和華北夏谷區(qū)的谷子品種進(jìn)行線蟲(chóng)病抗性鑒定,發(fā)現(xiàn)大部分品種為感病品種。本試驗(yàn)利用PCR方法檢測(cè)了99份谷子種子,33份種子檢測(cè)到攜帶谷子貝西滑刃線蟲(chóng),該樣品主要來(lái)自春谷區(qū),這與其研究結(jié)果是一致的;此外,董立等[4]研究中的晉谷21號(hào)是高感品種。在本研究中有來(lái)自4個(gè)不同地區(qū)的晉谷21號(hào)(C59、C60、C61、C62),除了C61未檢測(cè)到貝西滑刃線蟲(chóng)外,其余3個(gè)地區(qū)的晉谷21檢測(cè)結(jié)果呈陽(yáng)性;對(duì)于晉谷21號(hào)的2種檢測(cè)結(jié)果基本一致。

        一些研究表明,谷子線蟲(chóng)病是夏谷區(qū)重要的病害[4,26-28],本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)除來(lái)自海南的C85(66.7%)和C86(55.6%)2個(gè)品種檢測(cè)到貝西滑刃線蟲(chóng)外,在夏谷區(qū)(河北中南部和山東)并未檢測(cè)到貝西滑刃線蟲(chóng)的存在。分析原因可能是,夏谷區(qū)線蟲(chóng)病發(fā)生嚴(yán)重的谷穗會(huì)呈現(xiàn)紫色,肉眼容易分辨,在收獲時(shí)會(huì)舍棄病穗、留存健康穗的籽粒。這樣會(huì)導(dǎo)致本試驗(yàn)來(lái)自夏谷區(qū)的樣品大部分是健康籽粒,樣品不攜帶線蟲(chóng)或攜帶的線蟲(chóng)蟲(chóng)口數(shù)量極少,線蟲(chóng)DNA相對(duì)于種子DNA濃度太低未檢測(cè)到。今后要繼續(xù)對(duì)夏谷區(qū)主推谷子品種種子進(jìn)行線蟲(chóng)的檢測(cè),以了解夏谷區(qū)線蟲(chóng)初侵染來(lái)源及發(fā)生規(guī)律。

        本研究初步分析了33份陽(yáng)性樣本的遺傳多樣性,從試驗(yàn)結(jié)果可以看出28S rRNA片段適合用于研究貝西滑刃線蟲(chóng)種群的遺傳多樣性。從研究結(jié)果可以看出,貝西滑刃線蟲(chóng)AB1出現(xiàn)頻率最高,是優(yōu)勢(shì)單倍型。其他單倍型僅出現(xiàn)過(guò)一次,屬于稀有單倍型。河北張家口和內(nèi)蒙古松山區(qū)分別具有7,4種單倍型,說(shuō)明兩地貝西滑刃線蟲(chóng)的遺傳多樣性最為豐富。

        種傳病害是一類(lèi)以種子帶菌進(jìn)行傳播和擴(kuò)散的病害,號(hào)稱(chēng)作物的“癌癥”,均為系統(tǒng)性侵染病害。被侵染植株攜帶大量的病原菌,使種子帶病為其遠(yuǎn)距離傳播病害提供條件[4]。因此,種子帶線蟲(chóng)的檢測(cè)是防止該病害擴(kuò)散的重要環(huán)節(jié)。本試驗(yàn)采用的PCR檢測(cè)技術(shù)方法簡(jiǎn)單、快捷,只需要簡(jiǎn)單的PCR儀器即可完成;使用特異性引物GU-F/GU-R對(duì)貝西滑刃線蟲(chóng)的檢測(cè)具有較高的特異性和準(zhǔn)確性。該方法的推廣可以加快線蟲(chóng)檢測(cè)的進(jìn)度,為種子線蟲(chóng)檢測(cè)提供技術(shù)支持,有利于對(duì)谷子線蟲(chóng)病害的發(fā)生與傳播進(jìn)行防控,促進(jìn)谷子產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展。

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