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        基于1H-NMR 的不同基因型煙草的差異代謝物分析

        2019-08-17 06:48:30魏克強(qiáng)楊俊仙李娟娟
        山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年8期
        關(guān)鍵詞:曼陀羅核磁代謝物

        魏克強(qiáng),楊俊仙,李娟娟,宋 欣

        (1.山西大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山西太原030006;2.山西大學(xué)經(jīng)濟(jì)與管理學(xué)院,山西太原030006;3.保定幼兒師范高等??茖W(xué)校,河北涿州072750)

        目前,我國煙草種質(zhì)的遺傳多樣性水平較低、遺傳基礎(chǔ)相對狹窄,限制了煙葉品質(zhì)的進(jìn)一步提高。通過遠(yuǎn)緣雜交引進(jìn)外源基因以改良品種、形成新物種和新類型已成為煙草育種的發(fā)展趨勢[1]。煙葉燃燒后釋放的煙氣富含4 800 余種化學(xué)成分,有1/3 直接來源于煙草本身,其余的是通過燃燒、裂解、蒸餾、冷凝等一系列復(fù)雜的物理化學(xué)過程新產(chǎn)生的[2],因此,煙草內(nèi)源性物質(zhì)的含量及性質(zhì)直接影響了卷煙制品的安全性與可用性。

        基因型是影響煙草化學(xué)成分的主要因素之一。代謝產(chǎn)物是基因表達(dá)的終產(chǎn)物,代謝組學(xué)以相對分子質(zhì)量1 000 以下的內(nèi)源性小分子為研究對象,其種類和數(shù)量變化是生物系統(tǒng)對基因或環(huán)境變化的最終響應(yīng),日益成為遺傳育種、環(huán)境毒理、疾病診斷、藥物篩選等研究領(lǐng)域的熱點[3-4]。基于核磁共振(NMR)和質(zhì)譜(MS)的代謝組學(xué)新技術(shù),國內(nèi)外已對植物野生種與栽培種、野生型與轉(zhuǎn)基因植株、品種間雜交后代的基因型差異進(jìn)行了相關(guān)研究,表明這是一個有助于評價基因改造效果、篩選優(yōu)良材料的方法[5-8]。魏克強(qiáng)等[9]利用分子標(biāo)記和靶標(biāo)分析技術(shù)揭示了導(dǎo)入白花曼陀羅(Datura metel L.)基因的煙草遠(yuǎn)緣雜交新品種曼陀羅煙與普通煙草(Nicotiana tobacum L.)的基因型差異,發(fā)現(xiàn)莨菪烷型生物堿(東莨菪堿、阿托品)是其差異性代謝產(chǎn)物之一,但尚未對化學(xué)成分進(jìn)行整體、全面的分析?;诖?,山西大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院環(huán)境污染與健康風(fēng)險實驗室利用1H-NMR 技術(shù)結(jié)合主成分分析法(PCA)、正交偏最小二乘法判別分析(OPLS-DA)的多元統(tǒng)計方法,研究了曼陀羅煙及其親本煙草78-04 的差異代謝物,旨在為指導(dǎo)煙草品質(zhì)的遺傳改良、構(gòu)建煙氣毒理的評價方法提供理論依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 材料與儀器

        供試煙草遠(yuǎn)緣雜交新品種曼陀羅煙及其親本烤煙品種78-04,由山西農(nóng)業(yè)大學(xué)煙草育種研究室提供。MS 固體培養(yǎng)基(北京索來寶),NMR 試劑重水(美國Norell);氘代甲醇、氘代氯仿(德國Merck)等。Bruker 600-MHz Avance ⅢNMR Spectrometer(德國布魯克公司),KDC-140HR 型高速冷凍離心機(jī)(安徽中科中佳),MGC-350HP 智能型人工氣候箱(上海一恒)等。

        1.2 試驗方法

        試驗于2018 年3—8 月在山西大學(xué)進(jìn)行。

        1.2.1 煙草幼苗的培養(yǎng) 挑選顆粒飽滿的種子,于培養(yǎng)皿中先用無菌水浸泡24 h,再用75%乙醇浸泡1 min,10%H2O2浸泡15 min,無菌水沖洗干凈后接種于MS 培養(yǎng)基上,暗培養(yǎng)至種子破皮后,人工氣候箱內(nèi)進(jìn)行光照培養(yǎng)(溫度26 ℃,濕度75%)。

        1.2.21H-NMR 的檢測方法 參考文獻(xiàn)[10]的方法,煙草幼苗培養(yǎng)60 d 后,取新鮮的葉片組織,液氮研磨。真空冷凍干燥后,稱取200 mg,置于10 mL 的玻璃離心管中。加入蒸餾水和甲醇各1.5 mL、氯仿3 mL,室溫下漩渦混勻1 min。將混勻后的樣品置于超聲清洗儀中,超聲提取25 min;室溫下,3 500 r/min 離心25 min。取上清液,減壓濃縮蒸干,對上層甲醇水相濃縮蒸干物進(jìn)行溶解處理:加入氘代甲醇400 μL與緩沖液400 μL 溶解,然后使用移液槍將圓底燒瓶中的溶液轉(zhuǎn)移至離心管,4 ℃,13 000 r/min 離心10 min。取上清液600 μL 于5 mm 核磁管內(nèi)進(jìn)行600-MHz NMR 檢測,參數(shù)為25 ℃,測定頻率為600.13 MHz,掃描次數(shù)為64,譜寬為12 345.679 Hz。

        1.3 數(shù)據(jù)分析

        將核磁圖導(dǎo)入MestReNova 軟件,對核磁圖進(jìn)行定標(biāo)(TSP:δ0.00),相位校準(zhǔn)和基線校準(zhǔn)后進(jìn)行積分處理,以δ0.01 對積分區(qū)間進(jìn)行分段積分,積分區(qū)段為δ0.76~9.34,切除其中甲醇峰δ3.29~3.32。將處理后的數(shù)據(jù)保存。使用SIMCA-P 13.0 軟件對上述處理的積分?jǐn)?shù)據(jù)作PCA 和OPLS-DA 分析,找出樣品中的差異性代謝物。

        2 結(jié)果與分析

        對分離得到的提取物的核磁圖譜進(jìn)行代謝物指認(rèn),根據(jù)文獻(xiàn)[7,11]提供的化合物化學(xué)位移、耦合常數(shù)以及核磁數(shù)據(jù)庫,從煙葉甲醇水相的圖譜中共指認(rèn)出18 個代謝物,主要包括氨基酸類(亮氨酸、纈氨酸、蘇氨酸、丙氨酸、脯氨酸、谷氨酰胺、γ-氨基丁酸、天冬氨酸、色氨酸、酪氨酸、異亮氨酸、甘氨酸)、糖類(β-葡萄糖、α-葡萄糖、蔗糖)、有機(jī)酸類(延胡索酸、甲酸)、膽堿等物質(zhì)。然后采用多元統(tǒng)計分析對數(shù)據(jù)進(jìn)一步挖掘:在PCA 得分散點圖的基礎(chǔ)上建立OPLS-DA得分圖,以消除組內(nèi)及隨機(jī)誤差,使得數(shù)據(jù)的整體特征和變化規(guī)律更加明顯,提高模型的有效性和解析力。篩選組間的差異性代謝物(圖1):由得到的OPLS-DA 得分圖和S-PLOT 圖,同時結(jié)合S-PLOT 圖中VIP 值(>1)尋找不同基因型煙草中的差異性代謝物,可見曼陀羅煙與78-04 能明顯區(qū)分,其化學(xué)成分差異主要涉及γ-氨基丁酸、β-葡萄糖、α-葡萄糖、脯氨酸、蘇氨酸、谷氨酰胺、異亮氨酸、甘氨酸等代謝物,尤以氨基酸類最為明顯。

        3 討論

        在植物代謝組學(xué)研究中,核磁共振波譜技術(shù)(NMR)和色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(GC/MS 或LC/MS)是目前最常用的技術(shù)平臺,主要被應(yīng)用于揭示植物對環(huán)境擾動代謝調(diào)控的生物標(biāo)記物以及植物對遺傳改變的代謝應(yīng)答、鑒別不同基因型材料的差異?;贕C/MS 的分析顯示,蘋果酸和檸檬酸是辨別不同基因型擬南芥(Arabidopsis thaliana)(Col0 和C24)最重要的代謝物,葡萄糖和果糖是辨別其雜交一代F1(C24×Col0 和Col0×C24)最重要的代謝物?;?H-NMR 的代謝輪廓分析發(fā)現(xiàn),色氨酸、甲酸、脯氨酸和蘇氨酸的含量差異與2 個基因型(褐色籽與黃色籽)埃塞俄比亞芥(Brassica carinata)的耐鹽性差異密切相關(guān),為生物乙醇材料的篩選提供了依據(jù)?;?H-NMR 的代謝指紋分析,確定了區(qū)分野生型與表達(dá)水楊酸生物合成基因薩姆遜煙草植株的主要成分是綠原酸、蘋果酸、葡萄糖和蔗糖;野生與栽培胡蘿卜(Daucus carota L.)幼苗的綠原酸、阿魏??崴岷看嬖诓町悾⒈砻髌潆s種后代具有母本遺傳或野生品質(zhì)優(yōu)勢[5-8]。但這2 種方法各具優(yōu)點和局限性,要對所有代謝產(chǎn)物進(jìn)行無偏向性的完整分析,1H-NMR 與GC/MS 相結(jié)合將是比較理想的手段[12]。

        茄科煙草屬(Nicotiana)植物的遺傳背景相對狹窄,栽培煙草品種間的遺傳相似性較高,迫切需要導(dǎo)入有價值的外源基因來拓展其基因池[13]。通常曼陀羅屬(Datura L.)植物被用于提取莨菪烷型生物堿,具有很高的醫(yī)藥價值。煙草的化學(xué)成分極其復(fù)雜,小分子代謝物的結(jié)構(gòu)種類繁多、理化性質(zhì)差異巨大、含量極微且動態(tài)范圍極寬、時空分布的差異明顯、相互作用方式多樣。燃燒后產(chǎn)生的煙氣成分更是復(fù)雜多樣,既有提供香氣、吃味和生理作用的物質(zhì),也有產(chǎn)生雜氣、刺激的物質(zhì),還有苯并芘、亞硝胺、煙堿等有害物質(zhì)。筆者前期研究發(fā)現(xiàn),基于國際煙草科學(xué)研究合作中心(CORESTA)推薦的毒理學(xué)測試方法,即細(xì)菌誘變分析(Ames 試驗)、細(xì)胞遺傳學(xué)分析(微核試驗)、哺乳動物細(xì)胞系細(xì)胞毒性分析(中性紅試驗)及大鼠慢性阻塞性肺疾?。–OPD)模型,發(fā)現(xiàn)煙氣暴露誘發(fā)的體外毒性效應(yīng)、大鼠吸煙相關(guān)性的肺損傷和COPD 的疾病進(jìn)程等方面的差異可能與不同基因型煙草的差異性化學(xué)組成有關(guān)[14-17]。與78-04 比較,曼陀羅煙的總糖、還原糖、總氮和蛋白質(zhì)含量分別降低19.24%,22.04%,6.34%和9.25%[9]。本研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)了18 個小分子的差異性代謝物,尤以氨基酸類最為明顯,但目前還不清楚它們對煙草品質(zhì)、健康風(fēng)險產(chǎn)生了哪些影響。傳統(tǒng)的育種方法預(yù)見性差、工作量大,難以快速獲得理想的類型,如何充分利用代謝組學(xué)信息來評價基因改造的效果、篩選出優(yōu)良材料還有待于進(jìn)一步研究。

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