偶健,王瑋,倪夢(mèng)霞,鄭愛燕,丁潔,蒲艷,鄒琴燕,孟慶霞,許詠樂,李紅
(南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州醫(yī)院,蘇州市立醫(yī)院生殖與遺傳中心,蘇州 215002)
染色體易位是常見的染色體結(jié)構(gòu)異常。人群中相互易位的發(fā)生率約為1/1 000~1/500,羅氏易位的發(fā)生率約為1/1 000~1/900,而在不育及反復(fù)自然流產(chǎn)患者中,易位的發(fā)生率達(dá)1%~10%[1]。染色體易位攜帶者在減數(shù)分裂過程中,易位的染色體和正常的染色體之間按照不同的分離重組產(chǎn)生高比例的不平衡配子[2-4],羅氏易位攜帶者異常的胚胎占2/3,而相互易位攜帶者異常比例高達(dá)80%[2],這是導(dǎo)致其反復(fù)流產(chǎn)、胚胎停止發(fā)育、生育智力低下或畸形胎兒的主要原因。
羅氏易位攜帶者在形成配子的過程中,除了影響與易位相關(guān)的染色體的分離外,還會(huì)影響其它非相關(guān)的染色體的分離,其形成原因被認(rèn)為是染色體相互效應(yīng)(interchromosomal effects,ICE)所導(dǎo)致[3]。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)在相互易位攜帶者中同樣也會(huì)發(fā)生新發(fā)染色體異常[4]。本研究的目的在于分析植入前遺傳學(xué)診斷(preimplantation genetic diagnosis,PGD)中這種可能源自ICE的新發(fā)染色體異常對(duì)易位攜帶者胚胎診斷結(jié)果和臨床結(jié)局的影響。
選取27對(duì)羅氏易位攜帶者夫婦(共27個(gè)周期)(表1)和53對(duì)相互易位攜帶者夫婦(共64個(gè)周期)(表2)采用二代測(cè)序(next generation sequencing,NGS)行PGD。納入標(biāo)準(zhǔn):夫婦一方為染色體相互易位或者羅氏易位的患者。排除標(biāo)準(zhǔn):同源染色體易位患者;女方BMI>28 kg/m2。所有患者的染色體易位均由外周血染色體常規(guī)G顯帶確認(rèn)。女方年齡21~43歲,平均年齡29.8歲。所有夫婦均簽署了體外受精(IVF)和PGD知情同意書,醫(yī)院生殖倫理委員會(huì)對(duì)此研究項(xiàng)目通過倫理審查。所用胚胎均由患者簽訂知情同意用于科研。
表1 羅氏易位攜帶者信息
1.胚胎培養(yǎng)及活檢:采用本中心常規(guī)方案[5]進(jìn)行。
2.胚胎活檢細(xì)胞全基因組擴(kuò)增(WGA):采用英國(guó)BlueGnome公司針對(duì)單細(xì)胞的SurePlex WGA Kit。包括細(xì)胞裂解DNA片段化、擴(kuò)增前處理和擴(kuò)增三個(gè)步驟。為避免污染,此過程需全部在專用超凈臺(tái)內(nèi)進(jìn)行。WGA的DNA質(zhì)量檢測(cè)采用Life Qubit 3.0 Fluorometer檢測(cè)。
3.二代測(cè)序(NGS):采用美國(guó)Life Tech公司的ION XPRESS LIBRARY試劑盒構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)。取100 ng WGA產(chǎn)物加入buffer和Enzyme MIX Ⅱ 37℃ 35 min進(jìn)行片段化處理,之后純化采用美國(guó)Beckman公司的Agencourt?AMPure?XP beads,洗脫后加連接頭Ion XpressTMBarcode 1,后再純化,使用E-Gel?SizeSelectTM2% 瓊脂糖凝膠電泳后回收200 bp的片段,PCR擴(kuò)增后再純化,使用Ion PGMTM Template OT 2 200 Kit試劑盒對(duì)文庫(kù)DNA進(jìn)行擴(kuò)增,后開始測(cè)序,程序設(shè)定中測(cè)序Flow數(shù)量選擇260 Flows,參考基因組選擇hg 19,Ion Xpress選擇barcode1。
表2 相互易位攜帶者信息
4.測(cè)序數(shù)據(jù)分析:使用E&S-胚胎染色體異倍性分析系統(tǒng)分析數(shù)據(jù)。E&S系統(tǒng)以正常樣本為標(biāo)準(zhǔn)判定染色體拷貝數(shù),在>4 Mb染色體區(qū)域范圍內(nèi),高于標(biāo)準(zhǔn)1.25倍,則認(rèn)為該區(qū)域重復(fù),低于標(biāo)準(zhǔn)0.75倍,則認(rèn)為該區(qū)域缺失[6]。
采用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行卡方檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
本研究共對(duì)來自易位攜帶者91個(gè)PGD周期的408個(gè)囊胚進(jìn)行了分析,平均每個(gè)囊胚活檢了5~6個(gè)外滋養(yǎng)層細(xì)胞進(jìn)行全基因組擴(kuò)增再進(jìn)行NGS檢測(cè)。結(jié)果顯示,34.1%(139/408)的胚胎存在其它染色體的異常,其中既有易位相關(guān)又有新發(fā)染色體異常囊胚(圖1),比例為11.5%(47/408),而完全新發(fā)染色體異常的囊胚(圖2)比例為22.5%(92/408)。
羅氏易位和相互易位各自的數(shù)據(jù)顯示,羅氏易位攜帶者相關(guān)/新發(fā)染色體異常率為2.4%(3/126),而相互易位攜帶者的相關(guān)/新發(fā)染色體異常率為15.6%(44/282),兩者有顯著性差異(P<0.05)。羅氏易位攜帶者的完全新發(fā)染色體異常率為31.7%(40/126),高于相互易位攜帶者的18.4%(52/282),但兩者差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)(表3)。
紅色箭頭分別提示1號(hào)染色體三體、8號(hào)染色體單體、15號(hào)染色體單體圖1 相互易位攜帶者46,XX,t(1;8)(p34.3;q24.3)的既有易位相關(guān)又有新發(fā)染色體異常囊胚的NGS結(jié)果
紅色箭頭提示6號(hào)染色體單體圖2 相互易位攜帶者46,XY,t(4;13)(p14;q12)的完全新發(fā)染色體異常的囊胚的NGS結(jié)果
組 別PGD周期數(shù)檢測(cè)胚胎數(shù)正?;蛞孜粩y帶胚胎數(shù)相關(guān)染色體異常胚胎數(shù)相關(guān)/新發(fā)染色體異常胚胎數(shù)完全新發(fā)染色體異常胚胎數(shù)羅氏易位2712661(48.4)22(17.5)3(2.4)40(31.7)相互易位6428271(25.2)115(40.8)44(15.6)?52(18.4)合計(jì) 91408132(32.4)137(33.6)47(11.5)92(22.5)
注:與羅氏易位組比較,*P<0.05
羅氏易位攜帶者胚胎新發(fā)染色體異常涉及除13、14、15和21以外的染色體,而相互易位的新發(fā)染色體異常涉及除14以外的染色體。羅氏易位攜帶者新發(fā)染色體異常主要集中于16和22號(hào)染色體非整倍體和8號(hào)染色體的結(jié)構(gòu)異常。相互易位攜帶者新發(fā)染色體異常多見于22、15、21、13、16、18號(hào)染色體非整倍體和9、11號(hào)染色體結(jié)構(gòu)異常(圖3)。
羅氏易位和相互易位攜帶者分別有70.4%(19/27)和54.7%(35/64)的PGD周期檢出完全新發(fā)染色體異常的囊胚。臨床結(jié)局顯示分別有7.4%(2/27)的羅氏易位和18.8%(12/64)的相互易位PGD周期由于新發(fā)染色體異常導(dǎo)致無正常結(jié)果的胚胎可供移植(表4)。
A:羅氏易位和相互易位攜帶者新發(fā)染色體異常在不同染色體上的表現(xiàn);B:相互易位攜帶者新發(fā)染色體異常之不同染色體數(shù)目異常;C:相互易位攜帶者新發(fā)染色體異常之不同染色體結(jié)構(gòu)異常;D:羅氏易位攜帶者新發(fā)染色體異常之不同染色體數(shù)目異常;E:羅氏易位攜帶者新發(fā)染色體異常之不同染色體結(jié)構(gòu)異常 圖3 易位攜帶者胚胎新發(fā)染色體異常
表4 新發(fā)染色體異常對(duì)PGD臨床結(jié)局的影響[n(%)]
ICE是否存在一直有爭(zhēng)議。若干研究顯示ICE存在于相互易位攜帶者[7-8]和羅氏易位攜帶者[9-10]的精子和卵裂期胚胎中。但另外一些報(bào)道則認(rèn)為ICE是不存在的[11],或者認(rèn)為即使有其它染色體異常增加也不能說明是ICE導(dǎo)致的[12]。還有報(bào)道認(rèn)為ICE的發(fā)生取決于易位的區(qū)域以及斷裂的位點(diǎn)[13]。我們認(rèn)為ICE的機(jī)理盡管暫時(shí)還不明確,但胚胎中新發(fā)染色體異常的現(xiàn)象是存在的,可能會(huì)一定程度上影響PGD檢測(cè)結(jié)果及臨床結(jié)局,因此我們對(duì)此異常進(jìn)行了相關(guān)的統(tǒng)計(jì)。
羅氏易位和相互易位攜帶者的囊胚分別顯示存在34.1%和34.0%的新發(fā)染色體異常。其中羅氏易位攜帶者相關(guān)/新發(fā)染色體異常率僅為2.4%(3/126),顯著低于相互易位攜帶者的15.6%(44/282);另外羅氏易位攜帶者的完全新發(fā)染色體異常率為31.7%(40/126),數(shù)值上高于相互易位攜帶者的18.4%(52/282),但無顯著性差異(P>0.05)。可能由于羅氏易位和相互易位各自易位相關(guān)染色體的異常分裂方式不同,相互易位的相關(guān)染色體異常率遠(yuǎn)高于羅氏易位,導(dǎo)致兩種不同易位的相關(guān)/新發(fā)染色體異常率和完全新發(fā)染色體異常率存在一定的差別。
本實(shí)驗(yàn)室的PGD數(shù)據(jù)還顯示母體高齡相比低齡面臨正常胚胎率大幅下降的問題(從31.2%下降至16.7%)。但本研究中的新發(fā)染色體異常的發(fā)生卻不受母體年齡的影響,所有年齡段都保持著相似的水平,與Munné等[11]報(bào)道的一致。相互易位攜帶者PGD中,無新發(fā)染色體異常的人群平均年齡為28.73歲(24~43歲),而有新發(fā)染色體異常的人群平均年齡為29.57歲(21~40歲),無顯著性差異(P>0.05),其中有3例攜帶者所有胚胎均有新發(fā)染色體異常,其年齡分別為25歲、27歲、29歲,均不是母體高齡。由此可見易位攜帶人群中新發(fā)染色體異??赡塥?dú)立于年齡因素。
遺傳不穩(wěn)定在人類早期胚胎中非常普遍[14],雖然沒有明確證據(jù)證明ICE是如何干擾分離過程的,但它可能進(jìn)一步提供了遺傳不穩(wěn)定,容易發(fā)生分離錯(cuò)誤的環(huán)境。一種可能的解釋是易位相關(guān)的染色體分裂時(shí)的重組干擾了其它染色體在紡錘體上的有序排列,進(jìn)一步影響其它染色體的配對(duì)和分離[15]。這種影響是否存在特定染色體的針對(duì)性,為此我們統(tǒng)計(jì)了羅氏易位和相互易位攜帶者新發(fā)染色體異常在不同染色體上的表現(xiàn):一方面我們發(fā)現(xiàn)絕大多數(shù)染色體均存在異常,羅氏易位新發(fā)染色體異常涉及除13、14、15和21號(hào)以外的染色體,而相互易位新發(fā)染色體異常涉及除14號(hào)以外的染色體,羅氏易位的13、14、15和21號(hào)是由于其作為相關(guān)染色體出現(xiàn)概率較高,而相互易位的14號(hào)可能存在染色體特異性;另一方面發(fā)現(xiàn)羅氏易位攜帶者新發(fā)染色體異常主要集中于16和22號(hào)染色體非整倍體和8號(hào)染色體的結(jié)構(gòu)異常。相互易位攜帶者新發(fā)染色體異常多見于22、15、21、13、16、18號(hào)染色體非整倍體和9、11號(hào)染色體結(jié)構(gòu)異常。Wang等[16]對(duì)流產(chǎn)組織染色體異常的統(tǒng)計(jì)顯示不同常染色體異常前六位分別為16、22、21、15、18、13號(hào)染色體異常,與相互易位攜帶者新發(fā)染色體異常涉及常染色體基本一致。這些特定的高發(fā)的染色體非整倍體其發(fā)生概率較高可能與其染色體特異性有關(guān)。此外相互易位攜帶者新發(fā)染色體異常中9號(hào)染色體的結(jié)構(gòu)異常高發(fā)于q21.11(長(zhǎng)臂2區(qū)1帶1亞帶1次亞帶),為9號(hào)臂間倒位的斷裂熱點(diǎn)區(qū)域,此處可能也是容易受到ICE干擾的區(qū)域,而8號(hào)和11號(hào)染色體的結(jié)構(gòu)異常均未發(fā)現(xiàn)熱點(diǎn)區(qū)域。此外,在新發(fā)染色體異常中有18例為嵌合結(jié)果,無特定染色體針對(duì)性,可能代表了一種在不穩(wěn)定環(huán)境下自我修復(fù)的過程。
我們對(duì)存在完全新發(fā)染色體異常囊胚的周期發(fā)生率的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)顯示,最常見的羅氏易位der(13;14)攜帶者為85.7%(12/14),der(14;21)攜帶者為71.4%(5/7),而相互易位攜帶者為54.7%(35/64),其中近端著絲粒染色體易位攜帶者為61.9%(13/21),染色體末端斷裂(易位的片段占染色體臂的比例<0.2)易位攜帶者為57.1%(16/28)。羅氏易位存在完全新發(fā)染色體異常囊胚的周期發(fā)生率在數(shù)值上要高于相互易位,可能原因是近端著絲粒染色體(D組和G組,羅氏易位相關(guān))的短臂由核糖體RNA串聯(lián)拷貝組成,在間期定位在核仁,當(dāng)形成羅氏易位染色體后,短臂消失,導(dǎo)致其間期無法與核仁結(jié)合,核仁結(jié)構(gòu)的改變可能會(huì)影響其它染色體,因?yàn)榇蠖鄶?shù)染色體都有和核仁相互作用的特定序列[17]。
我們進(jìn)一步分析新發(fā)染色體異常對(duì)妊娠結(jié)局的影響。數(shù)據(jù)顯示羅氏易位和相互易位攜帶者分別有70.4%(19/27)和54.7%(35/64)的PGD周期檢出完全新發(fā)染色體異常的囊胚。其臨床結(jié)局為7.4%(2/27)的羅氏易位PGD周期和18.8%(12/64)的相互易位PGD周期,由于新發(fā)染色體異常導(dǎo)致無正常結(jié)果的胚胎可供移植。由此可見,羅氏易位和相互易位攜帶者的囊胚PGD均不同程度的面臨新發(fā)染色體異常的影響。相比于相互易位,羅氏易位囊胚的完全新發(fā)染色體異常的囊胚檢出率更高,但由于羅氏易位可用的正?;蛞孜粩y帶胚胎率更高,實(shí)際其PGD周期受影響要小于相互易位。
總之,ICE還存在爭(zhēng)議,由于實(shí)驗(yàn)對(duì)象數(shù)量有限以及無法設(shè)置常規(guī)人群對(duì)照(即使PGS人群選擇的也都是來尋求輔助生殖的患者,可能本身也存在其它導(dǎo)致染色體異常的影響因素),我們的統(tǒng)計(jì)結(jié)果還無法給這一爭(zhēng)議提供明確的答案,但易位攜帶者胚胎中新發(fā)染色體異常還是必須要面對(duì)的問題,其可能獨(dú)立于年齡因素,會(huì)一定程度上影響PGD檢測(cè)結(jié)果及臨床結(jié)局。由于新發(fā)染色體異常的存在,針對(duì)易位攜帶者的PGD有必要采用全基因組檢測(cè)方法(如芯片和二代測(cè)序)代替?zhèn)鹘y(tǒng)的只能檢測(cè)有限染色體的熒光原位雜交方法。