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        田螺MT基因的克隆與鑒定

        2019-07-18 08:42:58劉靜郭章李景沈宋利
        生物化工 2019年3期
        關鍵詞:冰浴田螺離心管

        劉靜,郭章,李景,沈宋利

        (1.紹興文理學院,浙江紹興 312000;2.杭州伊美源檢測科技有限公司,浙江杭州 310030;3.浙江鼎清環(huán)境檢測技術有限公司,浙江杭州 310030;4.浙江聚光檢測技術服務有限公司,浙江杭州 310053)

        MT(金屬硫蛋白基因,Metallothionein)是一種天然生物活性的物質(zhì),廣泛存在于生物體內(nèi),能被金屬離子、氧化損傷及免疫刺激等多種因素誘導產(chǎn)生,具有參與細胞內(nèi)金屬水平的穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)、清除重金屬解毒自由基等重要生物學功能。

        近年來,國內(nèi)外學者對金屬蛋白進行了廣泛的研究,并已深入到基因水平。分子生物學技術的快速發(fā)展,使MT克隆技術、RNA印跡技術和PCR技術應用于MT的定量檢測成為現(xiàn)實。MT克隆檢測是通過MT多克隆和單克隆抗體,運用免疫擴散、免疫電泳等方法來對組織中的MT-mRNA含量進行定量分析,這在生物學研究中有重要的意義。然而目前還缺乏一種簡便、靈敏、快捷適宜產(chǎn)業(yè)化的分離純化和檢測技術,這也成為MT研究的熱點。

        金屬硫蛋白一個顯著的特點就是能在轉錄水平上被環(huán)境中的金屬所誘導,外界環(huán)境穩(wěn)定時,MT在動物體內(nèi)的表達是穩(wěn)定的,當外界或者體內(nèi)金屬元素的含量超過一定濃度時,將誘導MT的表達,表達水平的高低與環(huán)境中的金屬濃度有直接的關系[1]。目前普遍認為,金屬硫蛋白主要的生理功能是穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)細胞內(nèi)金屬水平,即參與生物體內(nèi)必需金屬元素的調(diào)節(jié)和非必需金屬元素的解毒[2]。

        1 材料

        1.1 實驗動物

        田螺,取自紹興文理學院實驗基地。

        1.2 主要儀器設備

        上海鼎科SW-CJ-1D垂直潔凈工作臺、美國賽洛捷克高速微量冷凍離心機D3024R、MASTER LOCK微型離心機Mini-6K、尚儀電熱恒溫鼓風干燥箱XGQ2000、icers藥品冷藏箱、上海博訊立式自動電熱壓力蒸汽滅菌鍋BXM-30R、常州國華數(shù)顯恒溫水浴箱HH-8、上海嘉鵬全自動凝膠成像分析系統(tǒng)ZF-288、馳唐暗箱紫外分析儀WFH-203C、Eppendorf基因擴增儀 Mastercycler X50、上海天能穩(wěn)壓穩(wěn)流型電泳儀EPS200。

        1.3 主要試劑及藥品

        無水乙醇,糖原,1.5 mL Eppendorf管(RNase-free),Tips(RNase-free)[α-32P]dCTP(> 400 Ci/mmol),50 mmol/L、200 mmol/L EDTA,TE- 飽和酚∶氯仿(1 ∶ 1),7.5 mol/L NH4Ac,100%、70% 乙醇,TE緩沖液、蛋白胨、NaCl、氯仿、瓊脂、異戊醇等為國產(chǎn)分析純;pMD19T載體、DNA Marker購自Takara公司;dNTPs、rizol試劑盒、Taq DNA聚合酶、DNA抽提試劑盒購自碧云天公司;DH5α、氨芐、X-Gal、青霉素、IPTG、EB等。

        2 實驗方法

        2.1 準備工作

        (1)塑料制品的處理。將DEPC加入裝有離子水的玻璃燒杯中,制備為濃度0.1%的DEPC溶液。將待處理的塑料制品放入高溫滅菌的容器中,注入DEPC水溶液至塑料制品全部浸泡。通風室溫處理過夜?;厥諒U液,用錫箔紙封口或包裹塑料制品,滅菌,烘干備用。

        (2)玻璃和金屬物品。用錫箔紙封口或包裹,250 ℃烘烤 3 h 以上。

        (3)采取0.002 μmol/L氯化鑭刺激田螺,取經(jīng)鑭刺激的鰓組織。

        2.2 田螺RNA的提取

        采用Trizol法提取田螺RNA。

        (1)液氮研磨,將田螺鰓組織塊直接放入研缽中,加入少量液氮,迅速研磨,待組織變軟,再加少量液氮,再研磨,如此3次,每50~100mg組織加入1ml Trizol,轉入離心管進行第(2)步操作;

        (2)勻漿:組織體積不能超過Trizol體積的10%,否則勻漿效果會不好,用電動勻漿器充分勻漿需 1 ~ 2 min;

        (3)細胞或組織加Trizol后,室溫放置5 min,使其充分裂解??煞湃?70 ℃長期保存;

        (4)12 000 g 離心 5 min,棄沉淀;

        (5)根據(jù) Trizol的體積,每 1 mL Trizol中加入200 μL氯仿,振蕩混勻后室溫放置15 min。注:禁用漩渦振蕩器,以免基因組DNA斷裂;

        (6)4℃ 12 000 g 離心 15 min;

        (7)吸取上層水相,至另一離心管中。棄下層酚相;

        (8)按每1 mL Trizol中加入0.5 mL異丙醇混勻,室溫放置 5~ 10 min;

        (9)4℃ 12 000g離心 10 min,棄上清,RNA 沉于管底;

        (10)按75%乙醇∶Trizol=1∶1比例加入75%乙醇,溫和振蕩離心管,懸浮沉淀;

        (11)4 ℃ 8 000 g 離心 5min,盡量棄上清;(12)室溫晾干或真空干燥5~10 min;

        (13)可 用 50 μL H2O、TE buffer或 0.5%SDS溶解 RNA樣品,55~ 60 ℃,5~ 10 min。注:H2O、TE或0.5%SDS均須用DEPC處理并高壓;

        (14)測O.D值定量RNA濃度。

        2.3 MT基因克隆與鑒定

        2.3.1 總RNA的檢測

        取3 μL的RNA樣品和1 μL溴酚藍Buffer混合,用1.0%普通瓊脂糖凝膠電泳在100 V電壓下電泳10 min,電泳結果用凝膠成像系統(tǒng)觀察照相。

        2.3.2 反轉錄

        (1)滅菌離心管冰浴備用;

        (2)將目的RNA和對照RNA冰浴融化;

        (3)按順序依次加入RNA 2.0 μL、引物dT17 1.0 μL、DEPC 水 2.0 μL;

        (4)混勻后,分別將離心管于70 ℃水浴中保溫5 min,再冰浴 5 min;

        (5)在另一個離心管中依次加入DEPC 水 8.5 μL、5×RT Buffer 4.0 μL、dNTPs 1.0 μL、RNase inhibitor 0.5 μL、M-MLV RTase H 1.0 μL 試劑混勻并冰?。?/p>

        (6)將上述按每個反應15 μL準備的反應混合液,加入含5 μL先前配制的RNA模板和引物混合物的離心管中;

        (7)模板和引物退火:將反應管置于25 ℃保溫5 min;

        (8)cDNA鏈合成:將反應管置于42 ℃保溫1 h;(9)直接取用或冷凍保存。

        2.3.3 PCR反應

        將反轉錄得到的cDNA作為模板進行PCR擴增反應,基因的特異性引物為MTf:5’-ATGGCATCTCAAGTGTGTGC-3’;MTr:5’-CTATCACTCGAGGTCAGTGT-3’。

        PCR 結束后 4 ℃保存,再取出近 8 μL PCR 擴增液擴增產(chǎn)物用2.0%普通瓊脂糖凝膠電泳在90 V電壓下電泳10 min,EB溶液染色15~20 min,電泳結果用凝膠成像系統(tǒng)觀察照相。

        2.3.4 PCR產(chǎn)物的回收與克隆鑒定

        (1)挑取大腸桿菌 DH5α 單菌落,接于 5 ml LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃振蕩培養(yǎng)過夜;

        (2)以1∶50比例將1 mL菌液轉移到新鮮LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃振蕩培養(yǎng)1.5~2 h;

        (3)將4 mL培養(yǎng)液轉移到5 mL離心管中,4 ℃下,5000 rmp 離心 3 min;

        (4)棄上清,加 0.5 mL 預冷的 0.1 mol/L CaCl2溶液,輕輕吹打或搖動以混勻細胞(勿劇烈振蕩);

        (5)冰浴15~20min,4℃,5000 rmp離心2min;

        (6)棄上清,加 0.1 mL 預冷的 0.1 mol/L CaCl2溶液,輕輕吹打或搖動混勻細胞,即得感受態(tài)細胞;

        (7)取0.1 mL感受態(tài)細胞轉移到1.5 mL離心管中,加 1 μL 質(zhì)粒,混勻,冰上放置 30 min;

        (8)42 ℃水浴 60 s,冰浴 2 min;加入 0.8 mL 新鮮 LB 培養(yǎng)基,37 ℃,180 r/min 振蕩約 1 h;

        (9)取200 μL涂布到含有氨芐青霉素的平板上,37 ℃倒置培養(yǎng) 12 h。

        2.3.5 測序鑒定

        挑取陽性克隆,擴大培養(yǎng)后測序。所得測序結果提交GenBank比對,辨別是否為所需的田螺MT基因片段。

        3 結果與分析

        3.1 田螺的RNA提取

        總RNA提取如圖1所示,說明RNA的完整性較好。

        3.2 田螺MT的PCR擴增

        對總RNA反轉錄所得到的cDNA進行PCR擴增,擴增出的條帶在250 bp左右,即目的基因所在條帶。結果見圖2。

        圖2 MT的PCR擴增產(chǎn)物

        3.3 MT基因的測序比對

        經(jīng)測序和提交Genbank比對,上述PCR擴增產(chǎn)物的序列均為MT序列,并且100%相同,表明分別從cDNA和DNA中擴增出了田螺的MT序列,兩者序列完成一致,證明田螺MT基因不含有內(nèi)含子,因此鑭處理不影響MT基因的轉錄。

        4 討論

        MT是一類富含半胱氨酸和金屬離子的、具有基因多態(tài)性的小分子蛋白質(zhì),廣泛表達于所有真核細胞和部分原核細胞的胞漿中。在應激等條件下,MT也可以被釋放到細胞外來發(fā)揮作用[3],具有廣泛的生物學功能,是科技界在動物體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的一種生理功能很多的活性物質(zhì)。,由于MT分子中含有20個游離的巰基(-SH)基因以及由它們組成的多個巰基簇,因此在提高生物體的健康生長、增強抵抗力、增強免疫力等方面具有十分重要的作用。金屬硫蛋白具有很強的金屬結合能力和氧化還原能力,在生物體內(nèi)參與細胞內(nèi)金屬水平的穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)、自由基清除、重金屬解毒等,具有重要的生物學功能[4].因此MT基因的結構及表達的調(diào)控是目前生物醫(yī)學領域的一個研究熱點。

        MT具有很大的開發(fā)潛力和無法估量的應用價值,隨著人們對MT研究的不斷深入,對MT作用機理的不斷探明,MT的應用也將越來越廣泛。MT功能獨特,近年來對MT的研究日益受到重視。不僅對MT的分子結構、性質(zhì)、參與體內(nèi)微量元素代謝、解除重金屬的毒性、清除體內(nèi)自由基、抗氧化損傷、防止機體衰老、應激能力等生物學功能進行了闡述,并對MT與腫瘤和其他疾病的關系等方面的研究進行了綜述,并提出了MT研究中存在的問題及展望。MT作為模型系統(tǒng),還可在基因工程和基因表達調(diào)控方面發(fā)揮巨大的效益,可從MT的代謝方面、生理機能上、結構上和在養(yǎng)殖業(yè)中的應用,挖掘出金屬硫蛋白在養(yǎng)殖方向上的應用前景。

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