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        EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)基因多態(tài)性與精神分裂癥相關(guān)性研究

        2019-07-02 03:35:08項則文
        關(guān)鍵詞:精神分裂癥研究

        汪 斌 項則文 陳 瑩 蔡 靚

        精神分裂癥是一種慢性、嚴(yán)重和致殘的精神疾病,其臨床特征是幻覺、妄想和認(rèn)知缺陷,其遺傳度高達(dá)80%[1]。EFNB2 基因位于13q33 染色體上,與精神分裂癥有很強(qiáng)的聯(lián)系。研究發(fā)現(xiàn),EFNB2 基因與中國漢族人群中的精神分裂癥有關(guān)[2]。研究表明,microRNA 表達(dá)失調(diào)可能與精神分裂癥相關(guān)[3-5]。microRNA-137(miR-137)的變異是迄今為止鑒定的與精神分裂癥風(fēng)險相關(guān)性最為密切的基因座之一,與較差的認(rèn)知表現(xiàn)有關(guān)。與miR-137 相關(guān)的精神分裂癥風(fēng)險可能與其更廣泛的下游遺傳效應(yīng)有關(guān)[6]。rs550067317 位于EFNB2 基因的3’-UTR,該區(qū)域是miR-137 的結(jié)合位點(diǎn),本研究探討EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與精神分裂癥的相關(guān)性,同時分析miR-137 的作用,報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 隨機(jī)選擇2015 年8 月—2017 年12月期間浙江省紹興市第七人民醫(yī)院精神科收治的85例精神分裂癥患者作為研究對象,選擇同期健康體檢者85 名作為對照,本研究通過醫(yī)院倫理委員會的審核,所有受試者均簽署知情同意書。

        1.2 精神分裂癥診斷標(biāo)準(zhǔn) 參考美國精神障礙診斷與統(tǒng)計手冊第四版(Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disor-ders,DSM-IV)[7]。

        1.3 納入、排除標(biāo)準(zhǔn) 納入標(biāo)準(zhǔn):(1)年齡≥20 歲;(2)有兩名精神科主治醫(yī)生根據(jù)DSM-IV 標(biāo)準(zhǔn)確診為精神分裂癥。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)根據(jù)DSM-IV 診斷為精神發(fā)育遲滯、心境障礙、譫妄、分裂情感障礙、癡呆等精神類疾??;(2)有嚴(yán)重的臟器功能障礙;(3)處于哺乳期或者妊娠期的患者。

        1.4 基因型分析 所有受試者均被抽取約2mL 靜脈血,使用乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝,保存于-20℃冰箱待測。根據(jù)美國國立生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)數(shù)據(jù)庫中EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)信息設(shè)計引物,上游引 物 序 列 為F:5’-TACTGGCACTAAGATACACAG CTCCGAGCT-3’。下游引物序列為R:5’-GTATCTT AGTGCCAGTACCACAACAGTCCT-3’。使用25μL 的PCR 反應(yīng)體系擴(kuò)增,包含50ng 模板DNA,10×PCR緩沖液2.5μL,25mM Mg2+1.5μL,10mM dNTP 0.5μL,5U Taq 酶0.5μL,上下游引物各1μL,補(bǔ)雙蒸水至25μL。PCR 反應(yīng)程序為:95℃,4min;然后進(jìn)入30 個循環(huán)的如下反應(yīng):94℃,30s;60℃,30s;72℃,30s;然后72℃,10min。PCR 反應(yīng)完成后將產(chǎn)物寄送上海生工生物工程有限公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果使用chromas 1.62 進(jìn)行序列分析,結(jié)果見圖1。

        圖1 EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)測序結(jié)果

        1.5 血漿miR-137 表達(dá)檢測 取2mL 受試者EDTA 抗凝血,使用TRIzol(Invitrogen,USA)提取總RNA,使用反轉(zhuǎn)錄PCR 反轉(zhuǎn)錄成cDNA,試劑盒為TaqManmicroRNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒(ThermoFisher,批號4366596),每個樣本重復(fù)測量2 次,以GAPDH 為外參,計算miR-137 的閾值環(huán)(threshold cycle,Ct)的差,并用2-△△Ct 表示miR-137 的相對表達(dá)水平。GAPDH 反轉(zhuǎn)錄qPCR 正向引物序列為5’-CCAAGG TCATCCATGACAACT-3’,反向引物為5’-CAGGGA TGATGTTCTGGAGAG-3’。miR-137 反轉(zhuǎn)錄qPCR 正向引物序列為5’-TTATTGCTTAAGAATACGCGTAG-3’,反向引物為5’-CTCGCTTCGGCAGCACA-3’。

        1.6 統(tǒng)計學(xué)方法 使用SPSS20.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析,計數(shù)資料的表示方法為頻數(shù)[n(%)],組間差異采用χ2檢驗,基因型頻率分布是否符合Hardy-Weinberg 平衡采用χ2檢驗。采用非條件Logistic 回歸模型估計優(yōu)勢比(OR)和95%置信區(qū)間(CI)。計量資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(s) 表示,組間統(tǒng)計分析采用t 檢驗或單因素方差分析。采用非參數(shù)法估計計算受試者工作特征曲線(ROC)曲線下面積(AUC),P<0.05 表示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 精神分裂癥患者與健康對照者一般情況比較研究組85 例中男46 例,女39 例,年齡20~74 歲,平均(36.54±9.56)歲。對照組85 名中男42 名,女43名,年齡20~65 歲,平均(36.15±10.12)歲。研究組與對照組年齡、性別等差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),具有可比性。

        2.2 EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)基因多態(tài)性與精神分裂癥風(fēng)險 EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg 平衡(P>0.05)。研究組患者與對照組EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)基因型頻率之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=6.996,P=0.030),以野生型AA 為參考,雜合子(AC)不是精神分裂癥的危險因素(OR=0.492,95%CI=0.203~1.182,P=0.082),純合子(CC)是精神分裂癥發(fā)生的保護(hù)因子(OR=0.300,95%CI=0.087~0.980,P=0.024),顯性模型下精神分裂癥發(fā)生風(fēng)險降低(OR=0.414,95%CI=0.196~0.870,P=0.011),隱性模型下精神分裂癥風(fēng)險并未顯著降低(OR=0.346,95%CI=0.102-1.112,P=0.081)。研究組患者EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)C 等位基因頻率顯著低于對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=9.833,P=0.002),以A 等位基因為參考,C 等位基因是精神分裂癥發(fā)生的保護(hù)因素(OR=0.413,95%CI=0.226~0.750,P=0.002),見表1。

        2.3 miR-137 表達(dá)情況 RT-PCR 檢測結(jié)果顯示,精神分裂癥患者血漿miR-137 水平顯著高于對照組(P<0.01),見表2。分析比較EFNB2 基因rs550067317位點(diǎn)不同基因型受試者血漿miR-137 水平,結(jié)果顯示,AA 基因型受試者血漿miR-137 水平顯著高于AC 基因型、AC 基因型顯著高于CC 基因型(P<0.01),見表3。

        2.4 miR-137 基因表達(dá)對精神分裂癥診斷價值 使用Graphpad Prism 7.0 作miR-137 水平診斷精神分裂癥的ROC 曲線,結(jié)果顯示,cut-off 值為2.45,即當(dāng)miR-137 相對表達(dá)量為2.45 時診斷精神分裂癥的價值最高,miR-137 診斷精神分裂癥的AUC(曲線下面積)為0.8619,P<0.0001,敏感度為72.94%,特異度為85.88%。當(dāng)僅考慮rs550067317 位點(diǎn)野生型(AA)受試者時,miR-137 診斷精神分裂癥的AUC(曲線下面積)為0.9791,P<0.0001,敏感度為98.53%,特異度為95.59%,cut-off 值為3.75。當(dāng)僅考慮rs550067317 位點(diǎn)突變型(AC+CC)受試者時,miR-137 診斷精神分裂癥的AUC(曲線下面積)為0.8529,P=0.0004,敏感度為76.47%,特異度為76.47%,cut-off 值為2.25。見圖2。

        表1 EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)基因型和等位基因頻率[例(%)]

        表2 研究組和對照組miR-137 相對表達(dá)水平比較(x±s)

        表3 EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)不同基因型受試者血漿miR-137 水平比較(x±s)

        3 討 論

        雖然全基因組關(guān)聯(lián)研究提供了一種系統(tǒng)的、有效的、無偏移的方法來研究復(fù)雜疾病如精神分裂癥的常見變異,然而由于精神分裂癥在不同人群中的遺傳異質(zhì)性,精神分裂癥易感位點(diǎn)的識別在不同的研究中不能被重復(fù)[8-9]。盡管如此,通過病例對照全基因組關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn),歐洲人體內(nèi)miR-137 與精神分裂癥之間的較強(qiáng)關(guān)聯(lián)性在中國漢族人群中被重復(fù)[10]。miR-137 與EFNB2 結(jié)合的序列是保守的[11],通過計算預(yù)測分析和報告基因分析,EFNB2 基因被miR-137 直接靶向調(diào)控。包括EFNB2 在內(nèi)的腎上腺素B 的激活可以彌補(bǔ)Reelin 的缺失,而Reelin 信號是神經(jīng)系統(tǒng)正常運(yùn)作所必需的,這種通路的中斷導(dǎo)致了異腦癥,這是一種與精神分裂癥相關(guān)的嚴(yán)重發(fā)育障礙[12]。既往研究表明,miR-137 調(diào)節(jié)成人神經(jīng)發(fā)生、神經(jīng)元成熟和突觸前可塑性,miR-137 的過度表達(dá)導(dǎo)致突觸小泡運(yùn)輸受損和突觸可塑性改變[13]。Wu等[14]研究顯示,EFNB2 作為miR-137 的直接靶標(biāo),miR-137 是精神分裂癥的危險因素,可能與NMDA受體信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和/或Reelin 信號通路有關(guān)。

        圖2 miR-137 基因表達(dá)對精神分裂癥診斷價值的ROC 曲線分析

        通過本研究結(jié)果可以看出,EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)C 等位基因頻率顯著低于對照組,以A 等位基因為參考進(jìn)行非條件Logistic 回歸模型估計結(jié)果顯示,C 等位基因是精神分裂癥發(fā)生的保護(hù)因素,說明攜帶A 等位基因的群體具有比C 等位基因攜帶者具有更高的精分裂癥風(fēng)險。本研究結(jié)果還顯示,AA 基因型受試者血漿miR-137 水平顯著高于AC 基因型、AC 基因型顯著高于CC 基因型(P<0.01)。根據(jù)Wu 等[14]研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),內(nèi)源性EFNB2表達(dá)在蛋白質(zhì)水平上可以被miR-137 下調(diào),rs550067317 位點(diǎn)位于3’-UTR 與miR-137 的結(jié)合位點(diǎn)上,C 等位基因影響miR-137 與EFNB2 基因3’-UTR 的結(jié)合,進(jìn)而影響miR-137 對EFNB2 表達(dá)的調(diào)控作用,具體表現(xiàn)為A 等位基因EFNB2 低表達(dá),被miR137 抑制,C 等位基因EFNB2 高表達(dá)。

        此外,在使用ROC 曲線分析miR-137 診斷精神分裂癥時發(fā)現(xiàn),以EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)所有基因型為對象,AUC 為0.8619,P<0.0001,敏感度為72.94%,特異度為85.88%,cut-off 值為2.45。當(dāng)僅考慮rs550067317 位點(diǎn)野生型(AA)受試者時,miR-137 診斷精神分裂癥的AUC 為0.9791,P<0.0001,敏感度為98.53%,特異度為95.59%,cut-off 值為3.75。當(dāng)僅考慮rs550067317 位點(diǎn)突變型(AC+CC)受試者時,miR-137 診斷精神分裂癥的AUC 為0.8529,P=0.0004,敏感度為76.47%,特異度為76.47%,cut-off值為2.25。由此結(jié)果可知,野生型型群體中miR-137診斷精神分裂癥的價值高于突變型。

        本研究有以下不足之處。首先,沒有建立EFNB2表達(dá)模型驗證EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與EFNB2 表達(dá)以及與血漿miR-137 水平的相關(guān)性;其次,樣本量較小,可能影響統(tǒng)計結(jié)果的準(zhǔn)確性。

        綜上所述,EFNB2 基因rs550067317 位點(diǎn)基因多態(tài)性與精神分裂癥風(fēng)險相關(guān),血漿miR-137 水平檢測精神分裂癥具有較高的診斷價值,其中野生型群體中診斷價值最高,敏感度高達(dá)98.53%,特異度高達(dá)95.59%。

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