于水瀾,姜 穎,于英君,宋高臣
(1.黑龍江中醫(yī)藥大學基礎醫(yī)學院,黑龍江 哈爾濱150040;2.牡丹江醫(yī)學院,黑龍江 牡丹江157011)
研究發(fā)現(xiàn),肝癌的發(fā)生是多因素、多基因相互作用的結(jié)果,與腫瘤相關(guān)的癌基因的過度表達或抑癌基因的表達缺失都會導致腫瘤的發(fā)生。目前除了傳統(tǒng)的化療、放療及手術(shù)治療外,靶向基因治療成為研究熱點[1]。腺相關(guān)病毒(AAV)具有感染范圍廣、免疫反應低、定點整合、攜帶的外源基因可持續(xù)穩(wěn)定表達等特點,目前已成為基因轉(zhuǎn)移最為理想的載體之一[2]。CDK2基因是細胞周期蛋白依賴性激酶(CDKs)家族的成員之一,在細胞周期G1/S期的轉(zhuǎn)換過程中起著限速作用[3-5]。本實驗以此作為肝癌基因治療靶點,以AVV作為基因轉(zhuǎn)導載體[6-9],構(gòu)建rAAV-shRNA-CDK2,希望能為肝癌基因治療提供新的理論依據(jù)和實驗基礎。
質(zhì)粒載體pAKD-shRNA、包裝質(zhì)粒 pAAV-RC 和輔助質(zhì)粒pHelper均購自上海艾博思生物科技有限公司(見圖1,圖2,圖3);感受態(tài)細胞株DH5α,購自Takara公司;HEK-293細胞,購自上海艾博思生物科技有限公司。
1.2.1重組質(zhì)粒pAKD-shRNA-CDK2的構(gòu)建
利用KpnⅠ和BgIⅡ酶將質(zhì)粒載體按酶切反應體系進行酶切處理,產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。將前期設計合成的針對靶基因的特異性siRNA序列上添加KpnⅠ(-GTAC-)和BgIⅡ(-GATC-)內(nèi)切酶的酶切位點序列與轉(zhuǎn)錄終止序列,合成完整的shDNA序列。經(jīng)退火反應后,形成兩端帶有KpnⅠ和BgIⅡ酶切位點的雙鏈寡核苷酸片段,標記為CDK2-shRNA。雙鏈DNA連接入酶切載體,取100 μl感受態(tài)細胞加入10 μl 連接產(chǎn)物進行轉(zhuǎn)化,根據(jù)CDK2-shRNA序列設計一對PCR引物:Primer(+):5′-ATTTGCATGTCGCTATGTGTTC-3′;Primer(-):5′-TAAAGGGAACAAAAGCTGGGTA-3′,進行菌落PCR鑒定及DNA測序。
圖1 質(zhì)粒載體pAKD-shRNA 圖2 包裝質(zhì)粒pAAV-RC 圖3 輔助質(zhì)粒pHelper
1.2.2重組腺相關(guān)病毒的包裝、純化
常規(guī)方法培養(yǎng)AAV-293細胞,觀察細胞生長情況,當細胞達到70-80%融合時采用AAV Helper Free系統(tǒng)將三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染AAV-293細胞,進行重組腺相關(guān)病毒的包裝。轉(zhuǎn)染結(jié)束后,更換10 ml 新鮮的培養(yǎng)液放置培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)72 h,熒光倒置顯微鏡下觀察細胞中報告基因 EGFP 的表達情況,以便判斷是否共轉(zhuǎn)染成功。進一步對病毒進行收集、濃縮和純化。
1.2.3病毒載體滴度測定
對重組腺相關(guān)病毒rAAV-shRNA-CDK2采用定量PCR的方法進行滴度測定。將待測病毒樣品用DNase和RNase于37℃消化2-3 h,提取病毒DNA,沸水浴5 min使之變性,立即置于冰上2 min,將病毒樣品與標準品做倍比稀釋成不同濃度,進行定量PCR檢測,所用引物為:forward:5′-CCTTTCCGGGACTTTCGCTTT-3′,reverse:5′-GCAGAATCCAGGTGGCAACA-3′。PCR結(jié)束后,根據(jù)標準品繪制標準曲線,計算病毒樣品滴度,單位用v.g/ml來表示。
將質(zhì)粒載體利用Bgl II和KpnI酶進行酶切處理,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,發(fā)現(xiàn)在大約6 943 bp處出現(xiàn)陽性條帶(見圖4)。
為了證明轉(zhuǎn)化菌質(zhì)粒含有正確序列的shDNA,我們挑取白色陽性克隆菌落進行PCR檢測。對結(jié)果進行2%瓊脂糖凝膠電泳分析,第4、6泳道在大約174 bp處可見陽性條帶,與預期結(jié)果一致,表明此陽性菌落含有目的DNA片段,轉(zhuǎn)化成功(見圖5)。取6號轉(zhuǎn)化子進行DNA測序,測序引物為Primer(+):5′-ATTTGCATGTCGCTATGTGTTC-3′。
采用DNAStar的MegAlign軟件進行序列比對分析,結(jié)果證實所選送測序的堿基為正確序列的shDNA,寡核苷酸片段位于177位至241位(65個堿基)處 (見圖6)。
圖4 載體酶切圖譜
圖5 菌落PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳
注:N,M分別為陰性對照組和Marker DL2000,第1-10泳道為轉(zhuǎn)化子樣本。
圖6 DNA測序報告
于三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染AAV-293細胞后48 h光鏡下觀察,細胞呈現(xiàn)不規(guī)則的多角形,貼壁狀態(tài)良好,胞漿透亮,胞核隱約可見(圖7),在熒光顯微鏡下可以看到綠色熒光布滿整個細胞,分布較均勻(圖8),提示轉(zhuǎn)染效率符合實驗要求。
圖7 自然光源下觀察 rAAV轉(zhuǎn)染48 h(200×) 圖8 熒光觀察rAAV轉(zhuǎn)染48 h(200×)
采用定量PCR方法進行滴度檢測,繪制標準曲線,,表明線性關(guān)系非常好(R2=0.999 4),通過比對標準曲線計算病毒基因組拷貝數(shù),其平均滴度為3.56×1012v.g/ml(見圖9)。
圖9 標準曲線
近年來AAV由于其宿主細胞廣、能夠長期穩(wěn)定表達以及免疫原性低等優(yōu)勢已被廣泛應用于基因治療領域。本實驗利用AAV Helper Free系統(tǒng)進行病毒包裝,消除了活的輔助病毒及產(chǎn)生野生型AAV的危險,該系統(tǒng)是一個更安全、更方便,并且可以替代逆轉(zhuǎn)錄病毒和腺病毒的基因送遞系統(tǒng),提高了我們實驗的生物安全級別[10,11]。
本研究采用Helper-Free系統(tǒng)三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293細胞的方法成功構(gòu)建rAAV載體[12,13],獲得了能有效沉默人肝癌細胞CDK2基因表達的重組病毒rAAV-shRNA-CDK2。接下來我們將通過動物體內(nèi)注射將該病毒載體導入肝癌皮下移植瘤模型裸鼠,進一步研究與明確CDK2在肝癌細胞中的變化情況,并希望通過該研究能為肝癌的基因治療提供新的有效方法。