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        應(yīng)用基因芯片技術(shù)研究硫酸氨基葡萄糖對骨性關(guān)節(jié)炎相關(guān)炎性基因表達(dá)譜的影響

        2019-06-27 02:36:58李高峰李雪鵬張季鎧
        中國實驗診斷學(xué) 2019年6期

        桑 平,李高峰,李雪鵬,張季鎧

        (吉林省人民醫(yī)院 骨科,吉林 長春130021)

        關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎是最常見的骨骼肌肉疾病,是一種危害成人健康的慢性漸進性疾病,是與年齡相關(guān)的、關(guān)節(jié)軟骨細(xì)胞合成與分解代謝失衡造成的骨關(guān)節(jié)疾病[1]。其病理特點是關(guān)節(jié)軟骨的破壞,細(xì)胞外基質(zhì)的減少,軟骨下骨的改變及關(guān)節(jié)的炎癥改變。關(guān)節(jié)的炎癥影響和參與已被廣泛認(rèn)可,這種自身炎癥反應(yīng)引起分解代謝旺盛及軟骨細(xì)胞凋亡,最終引起關(guān)節(jié)軟骨的降解,引起一系列的臨床癥狀,其中前列腺素E2在骨關(guān)節(jié)炎的發(fā)病中具有重要作用[2],參與前列腺素E2的三種酶分別為:磷脂酶A2、膠原酶及前列腺素合酶,雖然病因已經(jīng)明確,但是仍沒有有效率的預(yù)防和治療手段[3,4]?;蛐酒夹g(shù)作為高通量、高敏感基因組學(xué)的研究技術(shù),目前已被廣泛應(yīng)用于臨床醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,它通過成千上萬個探針點結(jié)構(gòu),攝取細(xì)胞或組織標(biāo)本的mRNA表達(dá)水平,然后通過對不同生理病理條件下提取的mRNA的表達(dá)進行平行比較,可在更深層次上認(rèn)識器官的病理或生理現(xiàn)象。Affymetrix的體系及系統(tǒng)是國際上應(yīng)用最多和技術(shù)成熟的平臺,它提出了基因標(biāo)準(zhǔn)化的概念,實現(xiàn)了數(shù)據(jù)的共享性、客觀性和可比性[5]。基因芯片技術(shù)對于軟骨代謝失衡的分子機制的進一步明確,將能使關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎的預(yù)防及治療得到改善。致病的相關(guān)的基因其中大量基因為細(xì)胞因子所介導(dǎo)或者炎性介質(zhì)基因,基因芯片技術(shù)為該病的分子遺傳學(xué)研究提供了新的思路[6]。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        標(biāo)本來源及分組:收集9例關(guān)節(jié)軟骨組織樣本,其中正常膝關(guān)節(jié)軟骨樣本3例來自我院創(chuàng)傷骨科因暴力碾挫傷而行截肢手術(shù)的患者股骨髁軟骨組織,6例來源于髖關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎關(guān)節(jié)置換手術(shù)患者軟骨樣本,患者均參照ACR髖關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎診斷標(biāo)準(zhǔn)選擇,患者平均年齡為54歲。

        1.2 方法

        將采集的軟骨細(xì)胞進行體外培養(yǎng)、刺激及鑒定,-75℃冰箱凍存。然后行基因表達(dá)譜芯片檢測程序,首先Trizol法行總RNA提取、質(zhì)量檢測及純化,體外轉(zhuǎn)錄(IVT)cRNA合成及隨機引物反轉(zhuǎn)錄,樣品標(biāo)記和雜交Realtime-PCR反應(yīng)及ELISA檢測,流程結(jié)束后,離心并將芯片洗滌和準(zhǔn)備掃描。

        1.3 數(shù)據(jù)分析及統(tǒng)計學(xué)方法

        采用Affymetrix Gene Human Genome U133 Plus 2.0 Array軟件及Affymetrix miRNA v2.0芯片技術(shù)聯(lián)合應(yīng)用進行RMA分析,對炎癥狀態(tài)下?lián)p傷細(xì)胞和正常軟骨細(xì)胞的組基因及miRNA表達(dá)譜進行構(gòu)建并進行信息學(xué)分析,包括背景校正,將探針信號過濾整合為probeset信號等,取得分析報告數(shù)據(jù)。使用信號比值方法進行Ratiocompare比較分析,計算兩組間基因譜表達(dá)差異的顯著性水平(P值)和誤判率,從而得到差異基因,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 體外軟骨細(xì)胞培養(yǎng)及總RNA質(zhì)檢結(jié)果

        體外分離培養(yǎng)活躍的軟骨細(xì)胞(圖1),所有正常對照組、炎性對照組、藥物干預(yù)組的軟骨細(xì)胞經(jīng)裂解后行RNA質(zhì)檢。使用SMA3000分光光度計和瓊脂糖凝膠電泳質(zhì)檢實驗,檢測RNA的濃度、純度及完整性,質(zhì)控證實已經(jīng)提取到高純度的總RNA。

        圖1 正常狀態(tài)下活躍的軟骨細(xì)胞

        2.2 炎癥介質(zhì)白細(xì)胞介素18刺激可引起軟骨細(xì)胞炎癥合成通路的基因表達(dá)譜異常表達(dá)

        白細(xì)胞介素包括促炎性和抑制炎性的白細(xì)胞介素,其中促進炎癥白細(xì)胞介素18在骨性關(guān)節(jié)炎病理生理過程中是關(guān)鍵因素,為了驗證白細(xì)胞介素18對關(guān)節(jié)軟骨細(xì)胞炎癥合成通路基因表達(dá)譜的影響,我們分別將培養(yǎng)板設(shè)為正常對照組、炎性對照組(白細(xì)胞介素18刺激組)并對之行芯片檢測。炎性對照組與正常對照組相比,基因表達(dá)及細(xì)胞信號合成通路存在明顯表達(dá)異常(圖2)。其中與前列腺素E2及磷脂酶A2、膠原酶代謝有關(guān)的基因為:ACAN、COL2A1、PTGES、PTGS2、IL1a、IL6、IL17等基因均上調(diào); MMP、MEZ及IFN等基質(zhì)降解酶類基因上調(diào)。本組實驗表明白細(xì)胞介素18能夠增加前列腺素E2信號合成通路關(guān)鍵酶基因表達(dá),同時激活絲裂原活化蛋白激酶信號通路,有效的促進炎癥的發(fā)生及軟骨組織的降解。

        2.3 硫酸氨基葡萄糖對骨性關(guān)節(jié)炎關(guān)節(jié)軟骨細(xì)胞反應(yīng)通路基因表達(dá)譜的影響

        圖2 表達(dá)上調(diào)的基因,橫軸為炎性對照組/正常對照組基因表達(dá)的比值

        為了驗證硫酸氨基葡萄糖對骨性關(guān)節(jié)炎關(guān)節(jié)軟骨細(xì)胞炎癥合成通路基因表達(dá)譜的影響,我們將培養(yǎng)板分別設(shè)為炎性對照組(白細(xì)胞介素18刺激組)、藥物干預(yù)組(硫酸氨基葡萄糖+白細(xì)胞介素18),分別提取軟骨細(xì)胞進行基因芯片檢測。與炎性對照組相比,藥物干預(yù)組基因表達(dá)及細(xì)胞信號合成通路存在明顯表達(dá)異常。其中ACAN、COL2A1、PTGES、PTGS2、IL1a、IL6、IL17等與前列腺素E2、磷脂酶A2及膠原酶炎癥有關(guān)的基因基因下調(diào);IL4、 IL10、 IL24、PTGS1抑制炎性基因上調(diào);CXCL13、TNFRSF9、TNFSF10、VEGFA等誘導(dǎo)軟骨細(xì)胞凋亡相關(guān)的基因下調(diào);抑制凋亡基因ADATm-4、BCL2、FGF18、TRAF1等基因上調(diào)。本實驗證明硫酸氨基葡萄糖能夠抑制骨關(guān)節(jié)炎關(guān)節(jié)軟骨細(xì)胞前列腺素E2合成通路關(guān)鍵酶膠原酶和磷脂酶A2基因的表達(dá),減少前列腺素E2生成,同時抑制絲裂原活化蛋白激酶信號通路,從而控制炎癥的發(fā)生及軟骨細(xì)胞的降解。

        3 討論

        骨性關(guān)節(jié)炎是一種逐漸喪失關(guān)節(jié)功能和肢體活動能力從而降低生活質(zhì)量的退行性疾病,其發(fā)生、發(fā)展是一個多階段過程,其病理特點是關(guān)節(jié)軟骨的破壞,細(xì)胞外基質(zhì)的減少,軟骨下骨的退變及關(guān)節(jié)的炎癥改變。但是還沒有有效的預(yù)防及治療手段,許多易感因素會造成膝關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎的發(fā)生及進展,它是一個與年齡相關(guān)的、軟骨基質(zhì)降解與修復(fù)失衡而產(chǎn)生的疾病[7],并由炎癥及應(yīng)壓力加速病變的發(fā)展[8],關(guān)節(jié)的炎癥影響和參與已被廣泛認(rèn)可,這種自身炎癥反應(yīng)引起分解代謝旺盛及軟骨細(xì)胞凋亡,最終引起關(guān)節(jié)軟骨的降解,引起一系列的臨床癥狀,前列腺素E2是巨噬細(xì)胞產(chǎn)生的一種脂肪酸代謝產(chǎn)物,在骨關(guān)節(jié)炎的發(fā)病中具有重要作用[9],參與前列腺素E2生成的主要二種酶分別為:磷脂酶A2及膠原酶。關(guān)節(jié)炎癥狀態(tài)下,白細(xì)胞介素18能夠增加前列腺素E2信號合成通路關(guān)鍵酶基因表達(dá),同時激活絲裂原活化蛋白激酶信號通路,有效的促進炎癥的發(fā)生及軟骨組織的降解。膠原酶和磷脂酶A2由各種細(xì)胞因子、介質(zhì)誘導(dǎo)產(chǎn)生于炎癥反應(yīng)具有重要作用。使用硫酸氨基葡萄糖治療膝關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎,作用機制是能夠調(diào)控減輕炎性反應(yīng)、減少細(xì)胞外基質(zhì)降解、降低關(guān)節(jié)軟骨細(xì)胞的凋亡及改善穩(wěn)定軟骨細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的作用。實驗表明硫酸氨基葡萄糖不僅可以抑制膠原酶和磷脂酶A2的活性,同時也可以減少膠原酶和磷脂酶A2基因的表達(dá),從而達(dá)到控制前列腺素E2炎癥信號合成通路關(guān)鍵酶類表達(dá)的作用,有效的控制炎癥的發(fā)生及關(guān)節(jié)軟骨的降解。

        基因芯片技術(shù)又稱DNA集微芯片、DNA微陣列技術(shù),其主要原理是分子生物學(xué)中的核酸分子原位雜交技術(shù),通過技術(shù)手段將DNA片段固定到介質(zhì)上,隨后將熒光標(biāo)記樣本與其雜交,從而對樣本基因進行規(guī)模檢驗,隨著DNA重組技術(shù)和分子生物學(xué)的發(fā)展,特別是在2005年人類基因組DNA全序列繪制完成,基因芯片技術(shù)已成為基因功能分析研究的最重要技術(shù)之一,診斷疾病是基因芯片最具有價值的應(yīng)用,通過對炎癥狀態(tài)下致病基因表達(dá)譜的研究可為關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎的發(fā)病機制提供新的研究思路和更有效的治療方法?;蛐酒夹g(shù)是以精度、準(zhǔn)度及整體的系統(tǒng)的方法進行研究,宏觀的研究生物基因的表達(dá)和功能。其將核苷酸分子固定于介質(zhì)上,然后與基因芯片上探針列陣雜交,由于列陣中特定位置上的核苷酸序列是已知的,所以利用Affymetrix系統(tǒng)對芯片上每一探針位點熒光信號的強度進行檢測和比較,即可對樣本的信息進行定量定性分析,基因芯片技術(shù)克服了傳統(tǒng)核苷酸雜交技術(shù)復(fù)雜性、自動化程度低及檢測分子數(shù)量少等缺點,可以將克隆到的大規(guī)?;蛱禺愋蕴结樆駾NA片段固定在一塊芯片上,制成表達(dá)譜芯片,對基因表達(dá)個體特異性、組織特異性及病變特異性進行科學(xué)的比較分析,通過研究基因正常表達(dá)與異常擴增、基因與基因之間相互協(xié)同作用關(guān)系、不同的生理病理狀態(tài)下篩選出在疾病各個環(huán)節(jié)及階段起關(guān)鍵性調(diào)控作用的基因,進而將這些關(guān)鍵基因與疾病聯(lián)系起來,對疾病發(fā)病機制提供新的研究思路和更有效的治療方法。基因芯片技術(shù)具有高靈敏度、高通量、高速度、高研究效率、高集成等優(yōu)越性,可以對疾病多因素、基因多樣性進行全面、綜合、系統(tǒng)的分析,因此未來基因芯片技術(shù)在骨科疾病的基礎(chǔ)和臨床研究領(lǐng)域必將得到更廣泛的應(yīng)用。

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