鐘 敏 陶俊杰 黃春輝 黃 清 鄒梁峰 廖光聯(lián) 陳 璐 徐小彪1,,*
(1 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)院,江西 南昌 330045;2 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)獼猴桃研究所,江西 南昌 330045)
毛花獼猴桃(ActinidiaerianthaBenth.)為獼猴桃科(Actinidiaceae)獼猴桃屬(Actinidia)雌雄異株的多年生藤本果樹,是我國特有的獼猴桃種質(zhì)資源,主要分布于長江以南海拔200~1 000 m的山區(qū)[1]。目前世界獼猴桃的主栽品種比較單一,培育新的栽培品種具有重要意義[2]。毛花獼猴桃具有抗逆性強、果實維生素C含量高且含有豐富的礦物質(zhì)等優(yōu)勢,已成為獼猴桃新品種選育的重要潛在物種[3]。目前已報道的毛花獼猴桃雌性品種有大果型沙農(nóng)18號[4]、華特[5]和易剝皮型品種贛獼6號[6]。
目前,獼猴桃雌株的研究主要集中在果實發(fā)育特性[7]、果實品質(zhì)[8]、果實采后特性[9]等方面,其中針對雄花花粉活力[12-13]、花粉形態(tài)[14]等的研究報道較多,但有關(guān)雄性種質(zhì)資源的報道較少。獼猴桃具有花粉直感效應(yīng)[10-11],雄株所產(chǎn)花粉對果實的外觀和內(nèi)在品質(zhì)影響較大。當(dāng)前,我國獼猴桃授粉雄株的選育工作嚴(yán)重滯后,綜合性狀優(yōu)良并與雌株相配套的雄性品種較缺乏[15]。研究表明,從野生資源中選擇優(yōu)異品種較雜交育種耗時短且見效快,因此對野生資源的調(diào)查、評價和保存具有重要意義[16]。
SSR(simple sequence repeat)分子標(biāo)記因其共顯性遺傳、分布廣、穩(wěn)定性和重復(fù)性好[17]等優(yōu)點,已成為理想的遺傳標(biāo)記技術(shù),在藜麥[18]、綠豆[19]、蘋果[20]、杜梨[21]、牛心柿[22]、毛櫻桃[23]上均有報道。在分子水平上分析遺傳多樣性,可為種質(zhì)資源鑒定和品種鑒定提供依據(jù),有利于獼猴桃種質(zhì)資源的開發(fā)利用。SSR技術(shù)在獼猴桃上的應(yīng)用集中于遺傳多樣性[2]、親緣關(guān)系鑒定[24]、關(guān)聯(lián)分析[25]及指紋圖譜鑒定[26]等方面,對野生獼猴桃雄性種質(zhì)資源群體的遺傳多樣性研究尚未見報道。江西是毛花獼猴桃的主產(chǎn)地之一,江西農(nóng)業(yè)大學(xué)獼猴桃研究團隊從2009年開始對江西省境內(nèi)的毛花獼猴桃進行種質(zhì)資源調(diào)查、收集,發(fā)現(xiàn)多個野生毛花獼猴桃雄性群體,并從中挖掘出觀賞和授粉兼用型優(yōu)株MG-15[27]。本研究通過對江西麻姑山、廬山、武功山、井岡山和南源山等地區(qū)的野生毛花獼猴桃雄株進行實地考察和樣品采集,利用15對SSR引物對其遺傳多樣性進行分析,以期為毛花獼猴桃雄性品種選育,挖掘優(yōu)異等位基因提供一定的理論基礎(chǔ)。
在江西農(nóng)業(yè)大學(xué)獼猴桃研究團隊2009-2015年調(diào)查江西省境內(nèi)野生毛花獼猴桃資源的基礎(chǔ)上,于2016年4-6月對集中分布區(qū)于麻姑山、廬山、武功山、井岡山和南源山5個野生毛花獼猴桃雄性群體共72個樣品進行取樣(表1)。按照均勻分布、隨機采樣的原則,選擇成齡毛花獼猴桃雄性單株,樣本間距離大于50 m,對規(guī)模較少的群體(如廬山)采集所發(fā)現(xiàn)的全部樣本。采集野生毛花獼猴桃個體的新鮮嫩葉,用有色硅膠迅速脫水干燥,常溫保存,用于DNA提取。
表1 野生毛花獼猴桃群體采樣信息Table 1 Sample information for each population of wild Actinidia eriantha
1.2.1 DNA提取 選用改良的CTAB法[28]提取野生毛花獼猴桃葉片基因組DNA;采用1%瓊脂糖凝膠對DNA質(zhì)量進行檢測,將提取的DNA樣品于 -20℃ 保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 SSR-PCR擴增 從80對SSR引物篩選出15對多態(tài)性較好的SSR引物(表2)進行擴增。擴增體系為10 μL,包含2×Taq PCR Mix[天根生化科技(北京)有限公司]5 μL,上下游引物各0.8 μL,模板DNA 1 μL,ddH2O 2.4 μL。PCR擴增程序:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s,52~62℃退火30 s,72℃延伸30 s,28~34個循環(huán);72℃終延伸10 min,12℃保存。PCR擴增產(chǎn)物采用8%的非變性PAGE電泳,快速銀染法檢測并拍照記錄[17]。
以 DNA marker 作對照,拍照記錄并統(tǒng)計清晰的SSR條帶,從小到大依次記為A、B、C…,應(yīng)用POPGENE Ⅴ. 1.32 軟件計算各居群等位基因數(shù)(number of alleles,Na)、Shannon信息指數(shù)(Shannon′s information index,Ⅰ)、有效等位基因數(shù)(effective number of alleles,Ne)、Nei′s基因多樣性指數(shù)(Nei′s gene diversity)、觀察雜合度(observed heterozygosity,Ho)、預(yù)期雜合度(expected heterozygosity,He)、多態(tài)位點比率(proportion of polymorphic loci,PPL)等遺傳多樣性指標(biāo)?;贜ei′s遺傳距離,利用NTSYS-pc2.10軟件對各毛花獼猴桃群體進行聚類分析,使用SPSS軟件對群體間的地理距離與遺傳距離進行相關(guān)性分析。
從80對SSR引物中篩選出15對引物(表2),能擴增出條帶清晰、穩(wěn)定性和多態(tài)性較好的條帶(圖1)。由表2、3可知,15對SSR引物在72份樣品的擴增位點上,共檢出86個等位基因,平均每對引物擴增出等位基因數(shù)為5.733,擴增產(chǎn)物片段介于100~300 bp之間。每對引物擴增有效等位基因數(shù)介于1.043~8.062之間,均值為3.002,多態(tài)性位點百分率為100%。Nei′s遺傳多樣性指數(shù)為0.507,Shannon信息指數(shù)為1.046,表觀雜合度介于0.042~0.819之間,預(yù)期雜合度介于0.041~0.882之間,表明江西地區(qū)的毛花獼猴桃群體在分子水平具有豐富的多態(tài)性。除5號與61號引物外,其他引物表觀雜合度均小于預(yù)期雜合度,表明在野生毛花獼猴桃雄性群體中存在雜合子不足的現(xiàn)象。
表2 15對引物基本信息Table 2 Information of 15 pairs of primers
表3 15個SSR位點的遺傳多樣性參數(shù)Table 3 15 primers used for SSR amplification and genetic parameters for each loci
5個毛花獼猴桃群體中多態(tài)性位點百分率最高的為廬山群體(100%),Nei′s遺傳多樣性指數(shù)(0.500)也最高,15對引物共檢測到55個位點,所有位點均具多態(tài)性(100%);南源山群體中檢測到的位點數(shù)最多,為62個位點,多態(tài)性位點百分率達到93.3%;麻姑山群體的多態(tài)性位點百分率最低,為80.0%,Nei′s遺傳多樣性指數(shù)也最低(0.324)。群體平均多態(tài)性百分率達89.3%,群體的Nei′s遺傳多樣性指數(shù)的范圍介于0.324~0.500,平均為0.421,Shannon信息指數(shù)介于0.649~0.954,平均為0.811(表4)。
表4 野生毛花獼猴桃群體的遺傳多樣性Table 4 Genetic diversity of wild Actinidiaeriantha Benth populations
由表5可知,5個毛花獼猴桃群體Nei′s遺傳距離范圍介于0.102~0.409之間,均值為0.253;遺傳一致度范圍為0.665~0.903,其均值為0.731。其中,武功山群體和井岡山群體之間的遺傳距離最小,麻姑山群體和武功山群體的遺傳距離最大。為分析距離對不同群體遺傳的影響,對各群體間的地理距離(表6)和遺傳距離進行相關(guān)性分析,結(jié)果表明,群體間的遺傳距離與地理距離之間無顯著相關(guān)性(r=0.334,P=0.345>0.05)
表5 毛花獼猴桃群體間的Nei′s遺傳距離和遺傳一致度Table 5 Genetic distance and genetic identity different populations
注:上三角:Nei′s遺傳一致度;下三角:遺傳距離。
Note:Above diagonal: Genetic identity. Below diagonal: Genetic distance.
表6 毛花獼猴桃雄株群體間地理距離Table 6 Geographic distance between male Actinidia eriantha populations
利用Nei′s遺傳距離對5個群體進行UPMGA聚類分析。由圖2可知,井岡山群體與武功山群體的遺傳距離最近,聚為一類,麻姑山與南源山群體聚在一起,廬山群體與其他群體的遺傳距離較大,單獨聚為一類。
圖2 5個毛花獼猴桃雄株不同群體的UPGMA聚類圖Fig.2 UPGMA dendrogram of different groups of five male Actinidia eriantha populations
本研究中毛花獼猴桃雄株的遺傳參數(shù)(Ne=3.002、Ⅰ=1.046)表明,野生毛花獼猴桃具有豐富的遺傳多樣性,這與湯佳樂等[30]的研究結(jié)果一致。此外,毛花獼猴桃雄株群體大部分位點表現(xiàn)出一定程度的多態(tài)性,各群體多態(tài)性位點百分率介于80%~100%之間。毛花獼猴桃群體的遺傳參數(shù)(Ne=2.3485、Ⅰ=0.8107、Nei′s=0.4205)表明群體水平上的遺傳多樣性較高,與楊妙賢等[16]的結(jié)果一致。5個毛花獼猴桃群體中遺傳多樣性最高的為廬山群體(Nei′s=0.500),最低的為麻姑山群體(Nei′s=0.324),進一步分析表明,廬山群體采自自然保護區(qū),人為干擾少,從而保留了較高的遺傳多樣性,其他樣本均來自于路旁,人為干擾較大。麻姑山地區(qū)樣本量雖然較大,但毛花獼猴桃雄株在山北面潮濕地區(qū)分布較為集中,親緣關(guān)系較近,這可能是麻姑山群體Nei′s遺傳多樣性水平低于其他群體的原因。江西獼猴桃野生資源豐富,在野生條件下毛花獼猴桃與中華獼猴桃、京梨獼猴桃等不同種獼猴桃群居一起[31],異花授粉增加了基因重組和變異的概率[32],因此遺傳多樣性較高。此外,種子繁殖是一種重要的繁殖方式,毛花獼猴桃果實成熟后被動物取食,分散,從而提高了居群的遺傳多樣性[33]。
研究認為,孤立的居群中有親緣關(guān)系的個體發(fā)生雜交,可能會出現(xiàn)明顯的雜合子缺失現(xiàn)象[33]。本研究中,大多數(shù)位點的表觀雜合度小于預(yù)期雜合度,出現(xiàn)輕微的雜合子缺失現(xiàn)象,在很多種群中也有相似的情況[33-34]。一般認為,遺傳分化系數(shù)Fst值大于0.15,群體間的遺傳分化較大[35]。本研究中毛花獼猴桃遺傳分化系數(shù)的平均值為0.201,同時群體遺傳多樣性水平均低于總體水平,表明群體間基因交流有限,在毛花獼猴桃群體間存在較大的遺傳分化,這與劉亞令等[36]的研究結(jié)果一致。自然條件下毛花獼猴桃花粉主要通過風(fēng)媒傳播,花期在每年5-6月,此時江西地區(qū)雨水偏多,極大地影響了毛花獼猴桃花粉形式的基因交流。同時,群體間有山脈的阻擋,動物活動受限,導(dǎo)致群體間的基因交流較少,這可能是野生毛花獼猴桃群體間的地理距離和遺傳距離間無相關(guān)性的主要原因[33]。
本研究對江西地區(qū)野生毛花獼猴桃遺傳多樣性進行分析,表明毛花獼猴桃雄株在物種水平和群體水平遺傳多樣性較高,5個毛花獼猴桃雄性群體的遺傳多樣性豐富度依次為廬山>井岡山>南源山>武功山>麻姑山。本試驗結(jié)果為闡明毛花獼猴桃的種質(zhì)遺傳多樣性,毛花獼猴桃種質(zhì)的保存及利用提供了一定的理論依據(jù)。在本研究種質(zhì)收集和保存的基礎(chǔ)上,開發(fā)出大量的SSR分子標(biāo)記,再利用生物信息學(xué)方法,能迅速尋找到大量的遺傳差異,結(jié)合獼猴桃雄株的重要性狀,如花粉量、花期、花色等,可以挖掘出影響獼猴桃性狀的基因,更好地開發(fā)和利用獼猴桃雄性資源。