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        大麥白粉病抗性的遺傳分析與QTL定位

        2019-06-04 02:01:00費(fèi)新茹郭寶健許如根
        核農(nóng)學(xué)報(bào) 2019年5期

        費(fèi)新茹 朱 娟 郭 暉 郭 紅 呂 超 郭寶健 許如根,*

        (1 揚(yáng)州大學(xué)大麥研究所/江蘇省作物遺傳生理國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/糧食作物現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心/教育部植物功能基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 揚(yáng)州 225009;2 鹽都區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,江蘇 鹽城 224011;3 江蘇省農(nóng)墾農(nóng)業(yè)發(fā)展股份有限公司,江蘇 南京 210008)

        大麥(HordeumvulgareL.)為禾本科大麥屬一年生草本植物,是世界第四大禾谷類作物,總產(chǎn)量和種植面積僅次于小麥、水稻和玉米[1]。大麥因具有豐富的膳食纖維、高β-葡聚糖含量等營(yíng)養(yǎng)成分,可作為飼料、糧食、啤酒工業(yè)原料和保健用品等,受到了人們廣泛的關(guān)注[2]。然而近年來,大麥白粉病(barley powdery mildew)的發(fā)生和傳播嚴(yán)重影響了大麥的產(chǎn)量和品質(zhì)。大麥白粉病是由大麥?;突铙w寄生菌布氏白粉菌(Blumeriagraminisf. sp.hordei,Bgh)引起的真菌病害,可造成20%~30%的產(chǎn)量損失[3],是世界大麥主產(chǎn)區(qū)的主要病害之一[4]。因此,培育并推廣抗白粉病品種是防治大麥白粉病最經(jīng)濟(jì)有效的手段。

        目前已有關(guān)于大麥白粉病抗性遺傳[5-6]、基因定位[7-8]的研究報(bào)道。如嚴(yán)雋析[9]研究發(fā)現(xiàn)大麥白粉病抗性由單個(gè)顯性基因或2對(duì)基因控制;俞志隆等[10]研究認(rèn)為大麥白粉病田間抗性受多基因控制;黃金堂[11]研究認(rèn)為大麥白粉病抗性遺傳符合加性-顯性遺傳模型,且加性效應(yīng)作用更明顯。大麥對(duì)白粉菌的抗性主要受?;钥共』虻目刂?,目前已鑒定到100多個(gè)抗性基因,其中22個(gè)專化性抗病基因分布于不同的染色體上[12]。研究表明,某些抗病基因存在多個(gè)不同的復(fù)等位基因,如Weibull 等[[13]在Mla基因座共鑒定出32個(gè)抗性復(fù)等位基因。大麥野生型Mlo基因位點(diǎn)通過突變可以產(chǎn)生一系列不同的mlo隱性等位基因,mlo基因介導(dǎo)大麥幾乎對(duì)目前已知的所有Bgh生理小種都有抗性[14]。

        隨著大麥白粉病病原菌生理小種的不斷分化,新菌株可能導(dǎo)致原有抗病品種的抗性下降甚至喪失。為確保大麥生產(chǎn)上應(yīng)用品種的大麥白粉病抗性,必須不斷鑒定發(fā)掘新的大麥白粉病抗性基因并在育種中加以利用[15]。本研究以1個(gè)大麥白粉病抗感DH群體及其親本為試驗(yàn)材料,對(duì)其大麥白粉病抗性進(jìn)行遺傳分析與QTL定位,以期為大麥白粉病抗性基因的精細(xì)定位及分子標(biāo)記輔助選擇育種奠定理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 供試材料 以含173個(gè)DH系的DH群體及其親本為試驗(yàn)材料,該DH群體是以揚(yáng)飼麥1號(hào)×Gairdner雜交F1的花藥經(jīng)組織培養(yǎng)、染色體加倍等技術(shù)構(gòu)建的,其中母本為感大麥白粉病六棱飼料大麥揚(yáng)飼麥1號(hào),父本為抗大麥白粉病二棱啤酒大麥Gairdner,均由澳大利亞塔斯馬尼亞大學(xué)周美學(xué)教授惠贈(zèng)。

        1.1.2 田間種植 于2014年秋季將試驗(yàn)材料播種于揚(yáng)州大學(xué)大麥試驗(yàn)田。每材料人工點(diǎn)播兩行,行長(zhǎng)1.2 m,株距0.03 m, 行距0.2 m,每行點(diǎn)播40粒,并設(shè)3次生物學(xué)重復(fù)。田間管理同大田常規(guī)栽培方法。

        1.2 方法

        1.2.1 抗性鑒定方法 大麥白粉病病級(jí)調(diào)查參照Li等[16]的方法,在大麥白粉病發(fā)病始期(抽穗期)開始調(diào)查,每隔7 d調(diào)查1次,連續(xù)調(diào)查3期。每個(gè)株系連續(xù)調(diào)查10株。根據(jù)葉片病斑的有無、大小及發(fā)病部位,將大麥白粉病病級(jí)分為6級(jí)(詳見表1)。2015年4月上旬和中旬,揚(yáng)州為多雨天氣,隨著氣溫逐漸上升(>15℃),田間溫度和相對(duì)濕度較適宜大麥白粉病的發(fā)生,大麥白粉病的發(fā)病程度隨著調(diào)查時(shí)期延長(zhǎng)而加重。按照公式計(jì)算大麥白粉病病情指數(shù)(disease index, DI)[11]:

        式中,x代表每個(gè)調(diào)查植株抗性級(jí)別(0、1、2、3、4、5級(jí));n代表各病級(jí)的植株數(shù)量;N代表所調(diào)查的總植株數(shù)。

        1.2.2 DH群體遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建方法 篩選親本間多態(tài)性好的SSR標(biāo)記,利用這些多態(tài)性標(biāo)記對(duì)親本及173個(gè)DH系進(jìn)行基因型鑒定,與揚(yáng)飼麥1號(hào)相同的帶型記為0,與Gairdner相同的帶型記為2,雜合或缺失記為1。利用JoinMap 4.0 軟件構(gòu)建DH群體的分子標(biāo)記遺傳連鎖圖譜。

        1.2.3 QTL定位方法 利用1年3個(gè)時(shí)期的數(shù)據(jù),采用Windows QTL IciMapping 4.0軟件[17]中的完備區(qū)間-加性模型(inclusive composite interval-additive mapping,ICIM-ADD)定位方法,掃描步長(zhǎng)為1 cM,以LOD值2.5作為閾值[18],QTL的命名遵循McCouch[19]的原則。

        表1 大麥白粉病病級(jí)劃分Table 1 The resistance level of barley powdery mildew

        1.3 數(shù)據(jù)分析

        利用Microsoft Excel 2016對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,利用 SPSS 16.0 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)雙親及DH群體進(jìn)行抗性差異的統(tǒng)計(jì)分析。親本大麥白粉病抗性差異采用t測(cè)驗(yàn)分析,DH群體大麥白粉病抗性差異采用方差分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 DH群體及其親本大麥白粉病病情指數(shù)的差異性分析

        2.1.1 DH群體及其親本病情指數(shù)的表現(xiàn) 由表2可知,3個(gè)調(diào)查時(shí)期大麥白粉病病情指數(shù)在親本間均存在極顯著差異,其中親本及DH群體大麥白粉病病情指數(shù)平均值均以第三期最高。從DH群體變異系數(shù)和變幅來看,3個(gè)調(diào)查時(shí)期白粉病病情指數(shù)在DH群體內(nèi)存在廣泛的變異,且存在不同程度的超高親或超低親遺傳現(xiàn)象。

        由圖1可知,3個(gè)時(shí)期DH群體的大麥白粉病病情指數(shù)均呈連續(xù)性分布,表明可進(jìn)一步對(duì)大麥白粉病抗性進(jìn)行QTL定位。

        2.1.2 DH群體病情指數(shù)的方差分析 由表3可知,白粉病病情指數(shù)在調(diào)查時(shí)期間、DH系間及基因型與調(diào)查時(shí)期互作間的差異均達(dá)到極顯著水平,表明白粉病病情指數(shù)在DH群體各系間存在豐富的遺傳變異。同時(shí),DH群體發(fā)病程度還受不同調(diào)查時(shí)期氣候條件的影響。

        表2 親本及DH群體的病情指數(shù)Table 2 DI of DH population and its parents

        注:**表示在0.01水平差異顯著。下同。

        Note:**indicates significant difference at 0.01 level. The same as following.

        注:A:第一期病情指數(shù);B:第二期病情指數(shù);C:第三期病情指數(shù)。紅色箭頭代表揚(yáng)飼麥1號(hào);藍(lán)色箭頭代表Gairdner。Note:A:DI of stage Ⅰ.B:DI of stageⅡ. C:DI of stage Ⅲ. The red arrow represents Yangsimai 1. The blue arrow represents Gairdner.圖1 DH群體白粉病病情指數(shù)頻數(shù)分布Fig.1 Frequency distribution of the DI in DH population

        2.2 DH群體遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建與大麥白粉病抗性QTL定位

        2.2.1 DH群體遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建 由表4可知,對(duì)揚(yáng)州大學(xué)農(nóng)學(xué)院大麥研究所保存的1 008個(gè)SSR標(biāo)記在親本間進(jìn)行多態(tài)性篩選,獲得91對(duì)多態(tài)性好的SSR標(biāo)記。利用這些多態(tài)性標(biāo)記對(duì)親本及173個(gè)DH系進(jìn)行基因型鑒定,構(gòu)建了覆蓋大麥全基因組 1 161.99 cM的遺傳連鎖圖譜,圖譜包含91對(duì)SSR標(biāo)記,較均勻分布于大麥7條染色體上,標(biāo)記間平均遺傳距離為12.77 cM,平均每條染色體上標(biāo)記個(gè)數(shù)為13個(gè)。

        表4 大麥DH群體遺傳圖譜各染色體的長(zhǎng)度及標(biāo)記數(shù)Table 4 The length of chromosome and number of marks in barley DH population

        2.2.2 大麥白粉病抗性QTL定位 由表5可知,3個(gè)調(diào)查時(shí)期共檢測(cè)到5個(gè)與大麥白粉病抗性相關(guān)的QTLs,分布于第2、第3和第4號(hào)染色體上,分別為qPM-2Ha、qPM-2Hb、qPM-3Ha、qPM-4Ha和qPM-4Hb。第2號(hào)染色體上的qPM-2Ha在3個(gè)調(diào)查時(shí)期均被檢測(cè)到,位于Bmag0711-AWBMS56標(biāo)記區(qū)間內(nèi),可解釋7.48%~12.50%的表型變異;qPM-2Hb在第一期和第二期檢測(cè)到,位于Bmag0749-GBM1475標(biāo)記區(qū)間內(nèi),可解釋6.22%~8.13%的表型變異。第3號(hào)染色體上的qPM-3Ha僅在第三期檢測(cè)到,位于EBmac0705-HVLTPPB.2標(biāo)記區(qū)間內(nèi),可解釋3.97%的表型變異。第4號(hào)染色體上的qPM-4Ha在3個(gè)調(diào)查時(shí)期均被檢測(cè)到,位于EBmac0906-HVM68標(biāo)記區(qū)間內(nèi),可解釋23.07%~32.09%的表型變異;qPM-4Hb僅在第三期檢測(cè)到,位于GBM1388-HDAMYB標(biāo)記區(qū)間內(nèi),可解釋13.34%的表型變異。qPM-2Ha、qPM-4Ha及qPM-2Hb的加性效應(yīng)均為負(fù)值,說明其白粉病抗性基因均來源于抗病親本Gairdner;qPM-3Ha和qPM-4Hb的加性效應(yīng)均為正值,說明其白粉病抗性基因來源于感病親本揚(yáng)飼麥1號(hào)。

        表5 大麥白粉病抗性QTLs在染色體上的位置及效應(yīng)分析Table 5 The chromosome positions and effects analysis of barley powdery mildew resistance QTLs

        3 討論

        大麥白粉病是由布氏白粉菌屬大麥?;突铙w寄生菌引起的真菌病害,其流行程度主要與寄主抗病性、氣候條件、栽培措施等密切相關(guān)[5,15]。寄主抗病性一方面取決于是否具有抗病基因,另一方面也受株型和群體結(jié)構(gòu)的影響,如抗病品種病菌形成緩慢,且發(fā)病輕;葉片直立生長(zhǎng)、長(zhǎng)且窄的品種通常發(fā)病也較輕[20]。此外,白粉病發(fā)病程度受溫度、濕度、光照等氣候條件影響較大[20]。白粉病發(fā)生適溫為15~20℃,低于10℃時(shí)發(fā)病緩慢,低于0℃或高于28℃不發(fā)?。桓邼駰l件有利于發(fā)病,相對(duì)濕度大于70%有可能引起病害流行;白粉病病菌的分生孢子對(duì)直射陽光較敏感,散射光有利于病害發(fā)生[20-21]。播種量大,田間植株密度大會(huì)加重白粉病[22]。若施用氮肥過多,會(huì)造成植株貪青、徒長(zhǎng)等利于白粉病的發(fā)生[22];而水肥不足、土壤干旱、植株生長(zhǎng)衰弱、抵抗力低也利于該病發(fā)生[20]。本研究中親本和DH群體在3個(gè)調(diào)查時(shí)期白粉病發(fā)病程度呈逐漸加重的趨勢(shì),這與發(fā)病期間氣溫逐漸上升、雨水勻和利于白粉菌侵染大麥相關(guān)。

        大麥白粉病一般表現(xiàn)為多基因控制的數(shù)量性狀,同時(shí)受環(huán)境及基因與環(huán)境互作的影響[10]。目前,已有部分大麥白粉病抗性QTLs被定位[23-24]、克隆[25-26]并應(yīng)用于大麥品種改良[27-28]。本研究檢測(cè)到的部分QTLs與已報(bào)道的基因可能是等位基因或同一基因,如qPM-2Ha在染色體上的位置與Hilbers等[29]利用Ris03S×Sultan 和Alf ×Vogelsanger Gold 2構(gòu)建的2套DH群體定位到的位于RFLP分子標(biāo)記cMWG660與MWG97之間的抗白粉病基因MlLa位置相近,表明其可能是MlLa的等位基因。qPM-4Ha的位置與G?rg等[30]利用大麥近等基因系定位到與RFLP分子標(biāo)記MWG032共分離的抗白粉病基因Mlg位置相近,即其可能是Mlg的等位基因。Hinze等[31]利用6個(gè)不同基因型的大麥品種構(gòu)建的回交群體定位到第4號(hào)染色體上,與RFLP分子標(biāo)記bAL88/2共分離的抗白粉病基因mlo,qPM-4Hb與mlo位置相近,可能是其等位基因。第2號(hào)染色體上qPM-2Hb和第3號(hào)染色體上qPM-3Ha所在區(qū)域至今沒有相關(guān)的白粉病QTL報(bào)道,可能是新的抗大麥白粉病QTL位點(diǎn),但尚需進(jìn)一步驗(yàn)證。

        4 結(jié)論

        本研究共檢測(cè)到5個(gè)與大麥白粉病抗性相關(guān)的QTLs,其中qPM-2Ha、qPM-4Ha和qPM-4Hb與已報(bào)道的基因可能是等位基因或同一基因,位于第2號(hào)染色體上qPM-2Hb和位于第3號(hào)染色體上qPM-3Ha所在區(qū)域目前尚沒有相關(guān)的白粉病抗性位點(diǎn)報(bào)道,可能是新的抗大麥白粉病QTL位點(diǎn)。本研究結(jié)果為大麥白粉病抗性QTL的發(fā)掘、基因精細(xì)定位、基因克隆和分子標(biāo)記輔助選擇育種奠定了一定的理論基礎(chǔ)。

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