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        蛋雞資源群體產(chǎn)蛋性狀遺傳參數(shù)分析

        2019-05-15 07:35:00竇套存胡玉萍沈曼曼王星果王克華

        郭 軍,曲 亮,竇套存,胡玉萍,沈曼曼,王星果,王克華

        (江蘇省家禽科學(xué)研究所,江蘇 揚(yáng)州 225125)

        遺傳參數(shù)是畜禽數(shù)量遺傳研究基本內(nèi)容,最初用于預(yù)測選擇反應(yīng)[1]。隨著BLUP 方法不斷在畜禽育種取得成果,剖分重要經(jīng)濟(jì)性狀的方差組分成為畜禽遺傳學(xué)研究重點(diǎn)。盡管以候選基因分析、QTL定位、RNA-Seq 分析以及全基因組關(guān)聯(lián)分析發(fā)掘的分子標(biāo)記不斷增多,無可否認(rèn)當(dāng)前畜禽育種實(shí)踐仍以混合線性模型理論為主要推動力。

        產(chǎn)蛋總重不僅是決定養(yǎng)雞收益的一項(xiàng)重要指標(biāo),還影響采食量、蛋品質(zhì)、存活率,具有經(jīng)濟(jì)上的重要意義。然而,以往蛋品質(zhì)遺傳評估研究,由于統(tǒng)計(jì)產(chǎn)蛋總重費(fèi)時(shí)費(fèi)力,產(chǎn)蛋總重大多作為次要角色。隨著活禽市場逐步取締,提高產(chǎn)蛋總重在地方特色蛋雞選育上越來越重要。多篇文獻(xiàn)報(bào)道單純提高產(chǎn)蛋率并非提高養(yǎng)殖收益的最佳選擇[2-5]。究其原因,產(chǎn)蛋數(shù)與單個(gè)蛋重存在負(fù)相關(guān),高強(qiáng)度選擇產(chǎn)蛋數(shù)導(dǎo)致蛋重下降,進(jìn)而影響總蛋重。影響產(chǎn)蛋總重的因素較多,包括年齡、營養(yǎng)、遺傳背景以及飼養(yǎng)方式[6-8]。品種比較試驗(yàn)表明產(chǎn)蛋數(shù)、蛋重等產(chǎn)蛋性狀存在群體特異性[9-10]。為評估產(chǎn)蛋總重、產(chǎn)蛋數(shù)以及單個(gè)蛋重性狀之間遺傳關(guān)系,H.Jorjani 等收集白萊航雞群體數(shù)據(jù),結(jié)果表明產(chǎn)蛋數(shù)、蛋重、產(chǎn)蛋總重、對照系產(chǎn)蛋總重遺傳力分別為0.11±0.07、0.27±0.10、0.26±0.10、0.67±0.16,與理論期望基本一致[11]。同樣以白萊航蛋雞為遺傳評估對象,A.Sewalew 等以個(gè)體動物模型剖分產(chǎn)蛋總重方差組分,結(jié)果表明產(chǎn)蛋數(shù)、蛋重、產(chǎn)蛋總重、對照系產(chǎn)蛋總重遺傳力分別為0.69±0.02、0.62±0.02、0.40±0.02、0.62±0.03[12]。針對兩個(gè)褐殼蛋雞品系,T.Savas 等以動物模型產(chǎn)蛋性狀遺傳參數(shù),結(jié)果表明產(chǎn)蛋總重遺傳力分別為0.22±0.06、0.37±0.02[13]。同樣基于動物模型,S.Niknafs 等評估伊朗地方雞種產(chǎn)蛋總重遺傳力為0.16±0.01[14]。國外學(xué)者研究了蛋雞、地方雞種產(chǎn)蛋總重遺傳參數(shù),然而尚未見針對國內(nèi)雞種產(chǎn)蛋總重進(jìn)行遺傳評估。本試驗(yàn)以白萊航雞與東鄉(xiāng)綠殼蛋雞F2 分離群體為素材,采用多性狀動物模型計(jì)算產(chǎn)蛋性狀遺傳力、遺傳相關(guān)系數(shù),旨在厘清蛋重、產(chǎn)蛋數(shù)、開產(chǎn)性狀與產(chǎn)蛋總重之間關(guān)系。

        1 材料和方法

        1.1 試驗(yàn)動物

        依照F2 設(shè)計(jì),以東鄉(xiāng)綠殼蛋雞與白萊航雞雜交組建資源群體。P 代東鄉(xiāng)綠殼蛋雞群體由257 只母雞、244 只公雞組成,白萊航雞群體由86 只母雞、53 只公雞組成。從P 代群體選出6 只東鄉(xiāng)綠殼蛋雞公雞與86 只白萊航雞母雞交配,繁育F1代正交群體,出雛552 只;選出140 只東鄉(xiāng)綠殼蛋雞母雞與6 只白萊航雞公雞組成并繁育反交群體,F(xiàn)1出雛1 029 只。F1代正交群體組成23 個(gè)家系,獲得1 760只F2代雞雛;F1代反交群體組成26 個(gè)家系,獲得1 989 只F2代雞雛。試驗(yàn)雞分3 個(gè)階段飼養(yǎng),第一階段從出雛到7 周齡為育雛期,第二階段從8 周齡到18 周齡為育成期,第三階段從19 周齡到淘汰為產(chǎn)蛋期。試驗(yàn)雞單籠飼養(yǎng),雞籠為3 層階梯式,雞只單獨(dú)戴翅號,飼喂常規(guī)飼料。育成期每日光照8 h,產(chǎn)蛋期每日光照16 h。機(jī)械化喂料、清糞。

        1.2 數(shù)據(jù)測定

        試驗(yàn)雞系譜資料完整。除有蛋重記錄的母雞外,系譜記錄還包括配種公雞及P 代父母信息。從32~60 周每4 周稱量1 次蛋重,每個(gè)測定周每只母雞連續(xù)收集3 枚蛋,用電子天平(JY10001,上海良平儀器儀表有限公司)稱取單個(gè)蛋重,取3 個(gè)蛋重平均值作為測量周蛋重。蛋重原始數(shù)據(jù)來自2 146 只母雞,共有15 825 條記錄。去除數(shù)據(jù)明顯錯(cuò)誤和重復(fù)個(gè)體,整理成Excel 格式;除去3 倍標(biāo)準(zhǔn)差之外數(shù)值,去除少于5 條記錄的個(gè)體。經(jīng)初步篩選,數(shù)據(jù)集剩余15 626 條記錄。

        以內(nèi)插法計(jì)算非測定周的平均蛋重。針對線性內(nèi)插法、三次樣條內(nèi)插法和三次Hermite 多項(xiàng)式內(nèi)插法,以現(xiàn)有的測定周平均蛋重?cái)?shù)據(jù)進(jìn)行交互驗(yàn)證。具體操作過程:①預(yù)先刪除48 周齡數(shù)據(jù),組成新的平均蛋重?cái)?shù)據(jù);②以3 種內(nèi)插法分別48 周齡數(shù)據(jù);③將內(nèi)插法獲得的48 周齡數(shù)據(jù)與原有數(shù)據(jù)比較,誤差最小的即為最適內(nèi)插法。經(jīng)數(shù)據(jù)分析,線性內(nèi)插法為最適方法。

        開產(chǎn)日齡、開產(chǎn)體重、產(chǎn)蛋數(shù)以同樣的程序進(jìn)行數(shù)據(jù)整理。產(chǎn)蛋數(shù)是試驗(yàn)雞從32~60 周齡日產(chǎn)蛋數(shù)累積。產(chǎn)蛋總重是每個(gè)雞32~60 周齡所產(chǎn)蛋重的累加,現(xiàn)實(shí)生產(chǎn)中無法實(shí)現(xiàn)每天測蛋重。本研究以周平均蛋重乘以周產(chǎn)蛋數(shù),然后將周產(chǎn)蛋總重累加即為測定期內(nèi)產(chǎn)蛋總重。缺失的周平均蛋重以線性內(nèi)插法獲得,計(jì)算產(chǎn)蛋總重。然后,用SPSS Statistics 21(IBM 公司,芝加哥,美國)對產(chǎn)蛋性狀表型值進(jìn)行單因素方差分析和T 檢驗(yàn)分析,確定列入固定效應(yīng)因素。

        1.3 統(tǒng)計(jì)分析

        以WOMBAT 軟件的AIREML 方法分析(協(xié))方差組分、個(gè)體近交系數(shù)以及遺傳力[15]。所用多性狀動物模型矩陣表達(dá)式:

        式中:y 是所有個(gè)體性狀表型值向量;a,b,e 分別是加性遺傳效應(yīng)、固定效應(yīng)以及殘差效應(yīng)的向量。X,Za分別是固定效應(yīng)、加性遺傳效應(yīng)的指定矩陣,I 為單位矩陣。

        應(yīng)用單性狀動物模型逐個(gè)分析東鄉(xiāng)綠殼蛋雞-白萊航雞資源群體產(chǎn)蛋性狀,確定加性遺傳方差、殘差初始設(shè)定值。然后,以多性狀動物模型評估資源群體產(chǎn)蛋性狀,當(dāng)對數(shù)似然值變化小于5×10-4、參數(shù)向量變化小于10-8、梯度向量范數(shù)小于10-3時(shí),運(yùn)行達(dá)到收斂標(biāo)準(zhǔn),完成計(jì)算。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 表型值比較

        在計(jì)算產(chǎn)蛋性狀遺傳參數(shù)之前應(yīng)分析環(huán)境因素對表型方差的影響,確定列入固定效應(yīng)的因子。由表1可知,白萊航雞與東鄉(xiāng)綠殼蛋雞開產(chǎn)日齡相近,開產(chǎn)體重、蛋重、產(chǎn)蛋數(shù)、產(chǎn)蛋總重略高于東鄉(xiāng)綠殼蛋雞。F2群體比F1群體晚開產(chǎn),但產(chǎn)蛋總重、產(chǎn)蛋數(shù)好于后者。根據(jù)表1數(shù)據(jù)還可推算,產(chǎn)蛋總重和產(chǎn)蛋數(shù)變異系數(shù)較大。經(jīng)單因素方差分析,東鄉(xiāng)綠殼蛋雞、白萊航雞、F1群體、F2群體產(chǎn)蛋性能平均值存在顯著差異(P<0.01)。綜合考慮,產(chǎn)蛋性狀遺傳參數(shù)分析時(shí)將品種、世代列入固定效應(yīng)。

        表1 資源群體各世代產(chǎn)蛋性狀描述Table 1 Described on reproduction traits in the resource population

        2.2 遺傳力估計(jì)

        結(jié)果表明,產(chǎn)蛋總重、產(chǎn)蛋數(shù)、40 周齡蛋重、開產(chǎn)日齡、開產(chǎn)體重、開產(chǎn)蛋重殘差占比依次為71.99%,67.12%,41.73%,64.98%,35.05%,55.73%。開產(chǎn)體重、40 周齡蛋重屬于高遺傳力性狀,產(chǎn)蛋總重、產(chǎn)蛋數(shù)、開產(chǎn)日齡和開產(chǎn)蛋重屬于中等遺傳力性狀。

        表2 產(chǎn)蛋性狀方差組分及遺傳力Table 2 Variance components and heritability on reproduction traits

        遺傳相關(guān)系數(shù)是制定育種規(guī)劃、實(shí)施多性狀選擇所必需的指標(biāo)。本研究結(jié)果表明產(chǎn)蛋總重與開產(chǎn)日齡存在中等負(fù)遺傳相關(guān),與產(chǎn)蛋數(shù)存在強(qiáng)遺傳相關(guān)(表3);產(chǎn)蛋數(shù)與開產(chǎn)日齡、40 周齡蛋重、開產(chǎn)蛋重存在中等負(fù)遺傳相關(guān);40 周齡蛋重與開產(chǎn)體重、開產(chǎn)蛋重存在強(qiáng)遺傳相關(guān);開產(chǎn)體重與開產(chǎn)蛋重存在中等遺傳相關(guān)。產(chǎn)蛋總重與產(chǎn)蛋數(shù)表型相關(guān)大于遺傳相關(guān),推測產(chǎn)蛋總重與產(chǎn)蛋數(shù)存在較強(qiáng)環(huán)境相關(guān);40 周齡蛋重與開產(chǎn)體重、開產(chǎn)蛋重表型相關(guān)小于遺傳相關(guān),推測產(chǎn)蛋總重與產(chǎn)蛋數(shù)存在中等負(fù)環(huán)境相關(guān)。

        表3 產(chǎn)蛋性狀遺傳相關(guān)系數(shù)(右上)及表型相關(guān)系數(shù)(左下)Table 3 Estimated values of genetic and phenotypic correlations on reproduction traits

        3 討論與結(jié)論

        本研究以個(gè)體動物模型分析了產(chǎn)蛋總重遺傳參數(shù)及其與產(chǎn)蛋數(shù)、蛋重等產(chǎn)蛋性狀之間的遺傳相關(guān)。動物模型通過固定效應(yīng)和協(xié)變量解決批次、場地、遺傳組等引起的群體結(jié)構(gòu)層化問題,近年來廣泛用于畜禽遺傳評估[16-17]。資源群體產(chǎn)蛋總重加性遺傳方差為0.34 kg2,可知其遺傳標(biāo)準(zhǔn)差為0.58 kg。遺傳標(biāo)準(zhǔn)差是重要的群體遺傳參數(shù),與遺傳進(jìn)展有關(guān),用來制定育種規(guī)劃、預(yù)測選擇反應(yīng)。產(chǎn)蛋總重與40 周齡蛋重呈中等遺傳相關(guān),與開產(chǎn)體重存在較弱遺傳相關(guān),與開產(chǎn)蛋重?zé)o關(guān)。S.Niknafs 等針對伊朗地方雞種進(jìn)行遺傳評估,研究結(jié)果與本文相近,產(chǎn)蛋總重與產(chǎn)蛋數(shù)、開產(chǎn)日齡、開產(chǎn)體重、開產(chǎn)蛋重、32 周齡蛋重遺傳相關(guān)系數(shù)依次為0.96、-0.46、-0.02、0.02、0.23[14].H.Jorjani 等以動物模型評估4個(gè)蛋雞品系,得出的遺傳相關(guān)系數(shù)與本研究結(jié)果近似,即產(chǎn)蛋總重與產(chǎn)蛋數(shù)存在較強(qiáng)正相關(guān),與開產(chǎn)日齡呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)[11]。蛋雞產(chǎn)蛋總重遺傳參數(shù)因群體不同而存在差異,這提示我們開展地方雞選育時(shí)應(yīng)專門針對選育群體進(jìn)行遺傳評估,最好選育幾個(gè)世代后再重新評估遺傳參數(shù)。

        開產(chǎn)性狀影響早期產(chǎn)蛋數(shù),還與飼料轉(zhuǎn)化率、體重及存活率有關(guān)。本研究結(jié)果表明資源群體開產(chǎn)日齡遺傳力與伊朗馬贊達(dá)蘭雞的近似[14],在洛島紅雞遺傳力估值區(qū)間內(nèi)[18],高于白萊航雞和新漢普夏雞[19],低于褐殼蛋雞[20]和伊朗法爾斯雞[21-22]。對于開產(chǎn)蛋重,其遺傳力存在品種特異性。馬贊達(dá)蘭雞開產(chǎn)蛋重為0.17±0.01[14],韓國地方雞開產(chǎn)蛋重遺傳力為0.06~0.13[23]。本文估計(jì)值高于國外研究結(jié)果,國外兩個(gè)研究針對的是純系群體,本研究以F2分離群體為素材,相當(dāng)于兩個(gè)純系融合成一個(gè)基因庫,加性遺傳方差相對增多,因而表現(xiàn)為遺傳力較高。對于開產(chǎn)體重,伊朗地方品種Far 雞遺傳力為0.52~0.58[22]、馬贊達(dá)蘭雞為0.47[14],韓國地方雞種遺傳力為0.38~0.57[23]。東鄉(xiāng)綠殼蛋雞-白萊航雞資源群體開產(chǎn)體重高于國外地方雞種,原因與前述近似。

        隨著家禽品種資源普查、認(rèn)定工作不斷推進(jìn),越來越多的地方雞種走向商業(yè)化開發(fā),相應(yīng)的遺傳評估工作亟須跟進(jìn)。本研究針對東鄉(xiāng)綠殼蛋雞-白萊航雞資源群體,應(yīng)用多性狀動物模型估計(jì)產(chǎn)蛋性狀遺傳力、遺傳與表型相關(guān)系數(shù)。結(jié)果表明:批次、品種對產(chǎn)蛋性狀有著重要影響,應(yīng)將其列入固定效應(yīng),如果將這些因素從固定效應(yīng)去除,將導(dǎo)致產(chǎn)蛋性狀遺傳參數(shù)估值過高,影響個(gè)體育種值排序及群體選擇反應(yīng)預(yù)測;產(chǎn)蛋總重屬于中等遺傳力性狀,主要取決于產(chǎn)蛋數(shù)。本研究以多性狀動物模型結(jié)合平均信息約束最大似然算法評估蛋雞資源群體產(chǎn)蛋性狀,所得遺傳力、遺傳相關(guān)系數(shù)等遺傳參數(shù)與相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道基本一致。

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