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        基于二茂鐵標(biāo)記的電化學(xué)DNA生物傳感器研究*

        2019-05-07 11:45:00朱濟(jì)鋒王國東周大明王赟姣梁麗媛ChakerTLILI
        傳感器與微系統(tǒng) 2019年5期
        關(guān)鍵詞:檢測

        朱濟(jì)鋒, 王國東, 周大明, 王赟姣, 梁麗媛, Chaker TLILI

        (1.河南理工大學(xué) 電氣工程與自動化學(xué)院,河南 焦作 454150;2.河南理工大學(xué) 物理與電子信息學(xué)院,河南 焦作 454150;3.中國科學(xué)院 重慶綠色智能技術(shù)研究院精準(zhǔn)醫(yī)療單分子診斷中心,重慶 400700)

        0 引 言

        近年來,發(fā)展檢測特異性脫氧核糖核酸(DNA)的生物傳感裝置引起了廣大科研工作者的興趣[1~3]。在過去的幾十年里,已開發(fā)出多種DNA生物標(biāo)志物的檢測技術(shù),如聚合酶反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)[4]、微陣列熒光技術(shù)[5]和比色測定[6]等。然而,這些技術(shù)由于存在過程耗時(shí)長、標(biāo)記步驟繁瑣、價(jià)格昂貴等缺點(diǎn),很難大規(guī)模推廣應(yīng)用。較之傳統(tǒng)的檢測方法,電化學(xué)生物傳感器不僅靈敏度高、選擇性好、成本低廉,還具有小型化的前景,非常適合規(guī)?;a(chǎn),是公認(rèn)的最有前景的生物標(biāo)志物快速檢測方法[7]。目前,基于電化學(xué)的無指示劑DNA生物傳感器引起了廣泛關(guān)注和研究興趣,這類傳感器通過鍵合在DNA探針上的電活性基團(tuán)電化學(xué)信號的變化,實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)的快速、靈敏檢測。

        幾十年來,基于電化學(xué)的DNA生物傳感器已在疾病診斷、基因測序、食品安全、環(huán)境檢測等領(lǐng)域開展了大量的基礎(chǔ)研究,但在穩(wěn)定性、選擇性和可重復(fù)性方面仍面臨一定的挑戰(zhàn),限制了其在臨床診斷中的大規(guī)模應(yīng)用。

        本文利用二茂鐵及其衍生物可逆性強(qiáng)、再生電位低且氧化還原態(tài)穩(wěn)定的特點(diǎn)[8,9],在金電極上通過Au-S鍵自組裝方式固定巰基和二茂鐵修飾的DNA探針,構(gòu)建了基于二茂鐵為電子介體的具有重復(fù)性強(qiáng)、穩(wěn)定性和選擇性好的電化學(xué)DNA傳感器。

        1 基本原理

        傳感器的基本原理如圖1所示。首先,修飾有巰基和二茂鐵的DNA探針通過Au-S鍵在金電極表面自組裝形成均勻分布的目標(biāo)DNA捕獲區(qū),由于DNA探針上的二茂鐵與金電極表面距離較近從而產(chǎn)生一個(gè)相對較大的峰電流信號,當(dāng)加入目標(biāo)DNA后,DNA探針與目標(biāo)DNA雜化形成剛度較大的DNA雙鏈,從而使DNA探針尾端的二茂鐵遠(yuǎn)離金電極表面,使得方波伏安法中的峰電流減小,構(gòu)建“tun-off”型電化學(xué)傳感器[10~12]。同時(shí),有研究者指出“莖環(huán)形”DNA傳感器和“直線形”DNA傳感器在使用交流伏安(AC voltammetry,ACV)法、循環(huán)伏安(cyclic voltammetry,CV)法和差分脈沖(differential pulse voltammetry,DPV)法檢測時(shí),由于掃描頻率的不同而出現(xiàn)由“tun-off”轉(zhuǎn)變?yōu)椤皌urn-on”型的DNA傳感器[13]。因此,本文重點(diǎn)考查了方波伏安法的掃描頻率對DNA傳感器的檢測靈敏度影響,優(yōu)化基于二茂鐵電子介體的電化學(xué)DNA生物傳感器性能。

        圖1 生物傳感器原理

        2 實(shí) 驗(yàn)

        2.1 儀器與試劑

        本文電化學(xué)實(shí)驗(yàn)均采用三電極系統(tǒng):工作電極為金電極(直徑為2.0 mm),鉑絲為輔助電極,飽和Ag/AgCl作為參比電極。方波伏安法(square wave voltammetry,SWV)測定均使用CHI760E 電化學(xué)分析儀(上海辰華儀器有限公司);實(shí)驗(yàn)中所設(shè)計(jì)的不同序列DNA均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,序列如下:

        探針Fc-DNA(3′-HS-C6-TTT-TTT-TTT-TAT-GGG-ACA-TCT-GGT-TTC-AAA-CAC-Fc-5′)

        完全互補(bǔ) cDNA (5′-TA-CCC-TGT-AGA-ACC-GAA-TTT-GTG-3′)

        完全不互補(bǔ)ncDNA (5′-AT-AAT-CTC-GTG-TAT-ACC-AAA-TGT-3′)

        2.2 金電極預(yù)處理

        首先將金電極用砂紙打磨,然后分別使用1,0.3,0.5 μm的氧化鋁粉末對金電極進(jìn)行拋光,直到電極表面光滑如鏡,并分別使用超純水和乙醇超聲清洗殘留的氧化鋁。然后在食人魚溶液(V(H2SO4)︰V(H2O2) =7︰3)中超聲清洗5 min后再用超純水清洗。將清洗后的電極放入0.1 mol/L硫酸溶液中使用電化學(xué)工作站在-0.2~2 V的電壓范圍內(nèi)以100 mV/s的速率連續(xù)掃描直到曲線穩(wěn)定。最后,使用超純水超聲清洗,并用高純氮?dú)獯蹈蓚溆谩?/p>

        2.3 傳感器的制備

        取二茂鐵和巰基修飾的探針Fc-DNA溶液(20 μmol/L)10 μL,加入20 μL的三(2—羧乙基)磷鹽酸鹽(TCEP,100 mmol/L),和170 μL的Tris緩沖溶液(10 mmol/L Tris-HCl,pH 7.4;1 mol/L NaCl),在 37 ℃條件下反應(yīng)20 min激活DNA探針上的硫醇基團(tuán)(SH)。然后將預(yù)處理過的裸金電極浸沒在上述Fc-DNA探針混合溶液中靜置過夜,使Fc-DNA探針在金電極表面自組裝形成均勻分布的目標(biāo)DNA捕獲區(qū)。待Fc-DNA探針固定后,用超純水沖洗去除不穩(wěn)定的Fc-DNA探針,然后將電極浸沒在1 mmol/L的巰基乙醇(MCH)溶液中4 h以封閉金電極裸露表面,最后用Tris緩沖液沖洗可以得到DNA檢測傳感器。

        2.4 電化學(xué)檢測

        在室溫條件下,將修飾過Fc-DNA探針的傳感器分別與不同濃度的目標(biāo)DNA反應(yīng)1 h。然后在三電極系統(tǒng)中,采用方波伏安法在磷酸緩沖溶液(10 mmol/L PBS,pH 7.4)中進(jìn)行檢測,檢測電壓范圍為0.25~0.6 V,掃描頻率為200 Hz。通過對比DNA傳感器與目標(biāo)DNA雜交前后,峰電流的變化率ΔIP/I0(%)來檢測目標(biāo)DNA的濃度,其中,ΔIP=I0-IP,I0為未加入目標(biāo)DNA前金電極的峰電流,IP為加入目標(biāo)DNA后金電極的峰電流。

        3 結(jié)果與討論

        3.1 金電極電化學(xué)表征

        圖2 金電極電化學(xué)表征

        3.2 頻率分析

        在方波伏安法中當(dāng)掃描頻率遠(yuǎn)低于二茂鐵電子介體傳輸速率時(shí),峰電流與頻率成正比。如圖3(a)所示,當(dāng)掃描頻率在低于200 Hz時(shí),不同掃描頻率的峰電流呈線性關(guān)系,在DNA雜化之前,其線性擬合公式為Is=0.040 7+3.903 4f,Is為DNA雜化前的峰電流,f為掃描頻率,線性相關(guān)系數(shù)為0.989 7。在DNA雜化后,其線性擬合公式為ID=0.040 7+3.903 4f,ID為DNA雜化后的峰電流,f為掃描頻率,線性相關(guān)系數(shù)為0.88。而當(dāng)施加的頻率接近臨界值時(shí),電子轉(zhuǎn)移無法跟上快速振蕩的電位,峰電流相對于背景電流減小。如圖3(b)所示, 當(dāng)掃描頻率高于200 Hz 時(shí),雜化前的峰電流相對于雜化后的峰電流的變化率減小[13]。

        圖3 頻率分析

        所以,在本文中選取最佳的掃描頻率200 Hz進(jìn)行方波伏安法檢測。

        3.3 檢測性能

        為了檢測制備的DNA傳感器性能,使用方波伏安法對不同濃度的目標(biāo)DNA進(jìn)行檢測,可以看出,隨著目標(biāo)DNA濃度從0 nmol/L增加至100 nmol/L,峰電流逐漸降低,由于Fc-DNA探針與目標(biāo)DNA雜化形成了剛度較大的DNA雙鏈,使得Fc-DNA探針末端修飾的二茂鐵遠(yuǎn)離金電極表面,這與設(shè)計(jì)的檢測原理一致。在目標(biāo)DNA雜化前后峰電流變化率ΔIP/I0(%)與目標(biāo)DNA濃度線性關(guān)系中,誤差棒由3個(gè)獨(dú)立重復(fù)的實(shí)驗(yàn)計(jì)算所得。峰電流變化的信號量與加入的目標(biāo)DNA濃度在5.0×10-9~1.0×10-7mol/L范圍內(nèi)呈線性關(guān)系,其線性方程式為ΔIP/I0(%) =0.760 95+0.610 65c,ΔIP/I0(%)為峰電流的相對變化率,c為目標(biāo)DNA的濃度,線性相關(guān)系數(shù)為0.993 54。采用3σ計(jì)算方式,其檢測限為1.7×10-9mol/L。

        3.4 選擇性

        在相同條件下,對100 nmol/L非互補(bǔ)DNA(ncDNA)和互補(bǔ)DNA(cDNA)進(jìn)行了檢測,結(jié)果如圖4所示。從圖4(a)可以看出:當(dāng)ncDNA與DNA探針反應(yīng)后,由于兩個(gè)DNA單鏈無法互補(bǔ),所以雜化后峰電流基本不變,當(dāng)與cDNA序列雜化后,由于符合堿基互補(bǔ)配對原則,形成了剛度較大的雙鏈DNA后將末端的電化學(xué)活性基團(tuán)二茂鐵從金電極表面拉遠(yuǎn),使得峰電流下降,表現(xiàn)出明顯的響應(yīng)電流變化。從圖4(b)的峰電流變化柱狀圖可以看出,加入nc-DNA后其峰電流變化率為0.2 %,而相同濃度下的cDNA所引起的峰電流變化率為59.9 %,說明制備的電化學(xué)DNA生物傳感器擁有良好的選擇性。

        圖4 選擇性測試

        3.5 穩(wěn)定性與重現(xiàn)性

        為了檢測所制備傳感器的穩(wěn)定性,將修飾過探針的DNA傳感器浸沒在Tris緩沖液(10 mmol/L Tris-HCl,pH7.4;150 mmol/L NaCl;20 mmol/L MgCl2)中,在室溫條件下分別放置1,24 h后檢測其方波伏安曲線,其峰電流分別減小0.1 %和1.4 %,說明所構(gòu)建的DNA傳感器具有良好的穩(wěn)定性。

        在相同的條件下,獨(dú)立構(gòu)建3支不同的DNA傳感器,在同等的條件下與100 nmol/L的互補(bǔ)DNA雜化反應(yīng)后,3支DNA傳感器的峰電流變化率依次為54 %,56.3 %,60 %,RSD為4.3 %,表明了良好的重現(xiàn)性。

        4 結(jié) 論

        本文構(gòu)建的傳感器利用Au-S鍵的自組裝作用,通過在DNA兩端分別標(biāo)記二茂鐵和巰基,避免了繁瑣的修飾過程;通過對方波伏安法掃描頻率與峰電流信號之間關(guān)系的優(yōu)化,極大地提高了DNA電化學(xué)生物傳感器的檢測靈敏度和穩(wěn)定性。此外,該傳感器適合用于快速、靈敏的檢測特異性DNA,本文有望為后續(xù)的臨床早期診斷疾病中檢測變異的DNA序列提供理論依據(jù)和參考。

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