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        一個遺傳性蛋白C缺陷癥家系表型與基因突變分析

        2019-04-28 05:10:48劉媚娜蘇看看張海月金艷慧楊麗紅李小龍王明山
        關(guān)鍵詞:證者遺傳性雜合

        劉媚娜,蘇看看,張海月,金艷慧,楊麗紅,李小龍,王明山

        (溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院 醫(yī)學(xué)檢驗中心,浙江 溫州 325015)

        蛋白C(protein C,PC)是由肝臟合成的一種維生素K依賴性糖蛋白,為機(jī)體PC抗凝系統(tǒng)中的中心成分,其本身是無活性的酶原,在體內(nèi)被水解成活化蛋白C(activated protein C,APC)。APC具有抗凝、促纖溶和維持血管內(nèi)皮屏障穩(wěn)定等功能[1]。PC缺乏可使機(jī)體處于高凝狀態(tài),易導(dǎo)致血栓形成。遺傳性PC缺陷癥通常為常染色體顯性遺傳,與蛋白C基因(PROC)的突變有關(guān)[2]。本研究對1例遺傳性PC缺陷癥家系進(jìn)行實驗室表型檢測和基因突變分析,發(fā)現(xiàn)了導(dǎo)致該家系致病的PROC基因突變位點,并采用生物信息學(xué)軟件對突變位點進(jìn)行分析,初步探討其分子致病機(jī)制。

        1 對象和方法

        1.1 對象 先證者,女,39歲,5年前患有“下肢深靜脈血栓形成”,之后長期不規(guī)則口服華法林進(jìn)行抗凝治療。2周前,由于自行停用華法林5 d,后因下肢疼痛而入院。輔助檢查顯示,左腿深靜脈血栓形成,抗核抗體(antinuclear antibody,ANA)陽性,血漿PC活性(PC∶A)為39%(70%~130%),其他凝血相關(guān)指標(biāo)均在參考范圍內(nèi),被診斷為“PC缺乏、系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)、下肢深靜脈血栓形成和疑似鼻竇血栓形成”。住院后期,頭顱MRI顯示靜脈竇血栓形成和腦梗死,尿激酶溶栓治療后死于顱內(nèi)出血。共調(diào)查先證者及家系其他成員3代6人,肝、腎功能均無異常。先證者的父親在47歲時死于腦靜脈竇血栓形成,哥哥在44歲時因肺靜脈栓塞而死亡。家系遺傳圖譜見圖1。選擇100名健康體檢者建立本次實驗室凝血表型指標(biāo)正常參考值和用于突變多態(tài)性的篩查。年齡22~56歲,男53名、女47名,無肝、腎功能異常且無其他基礎(chǔ)性疾病。本通過本院倫理委員會審查,實驗前所有受檢者均簽署知情同意書。

        圖1 遺傳性PC缺陷癥家系圖

        1.2 方法

        1.2.1 樣本采集及處理:采集受檢者外周靜脈血2.7 mL,以109 mmol/L枸櫞酸鈉1∶9抗凝,3 000 r/min離心10 min,上層血漿用于凝血指標(biāo)檢測,2 h內(nèi)檢測完畢;下層血細(xì)胞用于提取基因組DNA,并進(jìn)行PCR擴(kuò)增及測序。

        1.2.2 血漿表型指標(biāo)檢測:在Stago STA-R全自動血凝儀(法國Stag公司)上用發(fā)色底物法檢測血漿PC∶A、蛋白S活性(PS∶A)和抗凝血酶活性(AT∶A),免疫比濁法檢測D-二聚體(D-D)。采用ELISA法檢測蛋白C抗原(PC∶Ag)(試劑盒均購自溫州長風(fēng)公司)。

        1.2.3 PROC基因檢測:基因組DNA提取試劑盒提取先證者及家系成員外周血基因組DNA。參照文獻(xiàn)[3]設(shè)計合成PCR引物(由上海桑尼生物科技有限公司合成)。在ABI Thermalcycler 2720上PCR擴(kuò)增PROC基因所有外顯子及側(cè)翼序列。PCR體系為25 μL。PCR反應(yīng)程序為:①在95 ℃變性5 min;②變性(95 ℃)、退火和延伸(72 ℃)各30 s,共30個循環(huán);③72 ℃再延伸10 min?;蚪MDNA提取及PCR擴(kuò)增試劑盒均購自北京天根生化科技有限公司。純化后的PCR產(chǎn)物送上海桑尼生物科技有限公司進(jìn)行正、反向測序。在Blast上比對測序結(jié)果與美國NCBI基因文庫的PROC基因序列,找尋突變位點。選擇100個個體以排除多態(tài)性。家系成員基因檢測僅限先證者基因突變區(qū)域。

        1.2.4 FV Leiden突變和凝血酶原20210G>A突變檢測:對先證者的F5基因第10外顯子和F2基因第14外顯子進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物直接測序分析。

        1.2.5 蛋白質(zhì)生物學(xué)特性分析:用ClustalX-2.1-win判斷突變氨基酸在物種進(jìn)化過程中的保守性。用PolyPhen-2評估突變氨基酸對PC功能和/或結(jié)構(gòu)的可能影響。通過Swiss-PdbViewer軟件和PIC程序分析突變引起蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的改變。

        2 結(jié)果

        2.1 凝血指標(biāo)檢測結(jié)果 先證者、其兒子和二姐的血漿PC∶A與PC∶Ag均平行下降,為39%~58%。先證者的D-D為20.0 mg/L。先證者的母親、大姐和丈夫的PC和D-D均在正常范圍內(nèi)。所有家庭成員的PS∶A和AT∶A都正常。見表1。

        2.2 基因突變檢測結(jié)果 先證者、其兒子和二姐均在PROC基因的9號外顯子攜帶c.997G>A雜合錯義突變,導(dǎo)致p.Ala291Thr,家系其他成員均為野生型(見圖2及表1)。該基因型結(jié)果與血漿PC表型結(jié)果一致。在100個對照個體中未檢測到此突變,初步排除基因多態(tài)性可能,經(jīng)查閱文獻(xiàn)和人類基因突變數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)其為新的突變。

        表1 遺傳性PC缺陷癥家系成員表型及基因型檢測結(jié)果

        圖2 PROC基因第9外顯子測序結(jié)果

        2.3 蛋白質(zhì)生物學(xué)特性分析 同源序列比對結(jié)果表明Ala291在9種同源物種中不是高度保守。Poly-Phen-2軟件評分為0.850,提示“可能有害的”。蛋白質(zhì)模型分析顯示:在野生型PC中,非極性疏水的Ala291不與其他氨基酸連接。突變?yōu)闃O性親水的Thr291后,Thr291與Pro327之間新增一氫鍵,導(dǎo)致蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)改變(見圖3)。

        圖3 PC蛋白質(zhì)模型圖

        3 討論

        PC系統(tǒng)是體內(nèi)重要的生理性抗凝系統(tǒng),PC活化后與輔助因子蛋白S結(jié)合,滅活活化的凝血因子V(FVa)和活化的凝血因子V III(FV IIIa),限制凝血酶的產(chǎn)生,從而發(fā)揮抗凝作用。PC缺陷癥常導(dǎo)致血栓形成,通常表現(xiàn)為靜脈血栓,而且PC水平越低,血栓形成的趨勢越高[4]。國外研究表明雜合子PC缺陷癥在有遺傳性血栓形成傾向的家庭和健康人口中的發(fā)生率分別為6%和0.2%[5-6]。在中國,PC缺陷癥在靜脈血栓患者的患病率約為8%[7]。本研究中,先證者因左腿深靜脈血栓入院,輔助檢查發(fā)現(xiàn)血漿PC∶A為39%,PC∶Ag為45%?;蚍治鲲@示PROC基因第9號外顯子存在c.997G>A雜合突變,導(dǎo)致p.Ala291Thr突變。其兒子和二姐亦存在該雜合突變。排除FV Leiden突變和凝血酶原20210G>A突變等其他因素,診斷為I型遺傳性PC缺陷癥。根據(jù)家系圖的顯示,推測此突變遺傳自其父親,由于先證者父親已故未能采集到樣本。家系成員中,先證者、其兒子和二姐均攜帶p.Ala291Thr雜合突變,兒子和二姐無靜脈血栓形成臨床表現(xiàn),而先證者具有嚴(yán)重的復(fù)發(fā)性靜脈血栓栓塞,可能原因是先證者同時患有SLE,APC抵抗加劇了血栓形成[8]。PROC基因缺陷患者是否出現(xiàn)血栓形成臨床癥狀可能是多種環(huán)境因素(如妊娠、外傷、服用避孕藥、吸煙、長期制動等)與基因突變共同作用的結(jié)果[9]。

        PC缺陷癥按照產(chǎn)生的原因不同可分為遺傳性PC缺陷癥和獲得性PC缺陷癥。遺傳性PC缺陷癥通常由PROC基因突變所致。PROC基因位于2號染色體2q13-q14,包括9個外顯子和8個內(nèi)含子。外顯子9區(qū)由886個堿基組成,前590個堿基編碼PC第224至第419位氨基酸,均在重鏈區(qū),主要為C端絲氨酸蛋白酶區(qū)域,是PC的活性區(qū)域[10]。該家系攜帶的p.Ala291Thr雜合錯義突變位正發(fā)生于此區(qū),可能影響PC活性。進(jìn)一步研究表明,Ala291位于PROC基因的催化結(jié)構(gòu)域(催化三聯(lián)體:H211-D257-S360),其主要包括Ca2+結(jié)合環(huán)(殘基225-235)和自溶環(huán)(殘基302-317)[11]。自溶環(huán)有助于穩(wěn)定蛋白質(zhì)的活化肽,在APC的抗凝血功能中起關(guān)鍵作用,在Ca2+結(jié)合環(huán)的共同作用下水解滅活FVa[12]。蛋白質(zhì)模型分析顯示Ala291位于自溶環(huán)附近的催化區(qū)域。Ala291被Thr291取代后,Thr291與Pro327形成額外的氫鍵,形成的超強(qiáng)分子間力可能會擾亂催化活性,導(dǎo)致PC活性的降低。

        綜上所述,本研究中我們對1個遺傳性PC缺陷癥家系進(jìn)行實驗室表型和基因型進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)了p.Ala291Thr雜合錯義突變,并通過生物學(xué)分析軟件初步探討了其可能的分子致病機(jī)制,認(rèn)為該家系PC水平減低與p.Ala291Thr雜合錯義突變有關(guān),但其確切的分子致病機(jī)制有待進(jìn)一步研究。

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