張 偉,王世銀 ,鄧雙義,石國慶
(1. 新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院,新疆昌吉 831100;2. 新疆農(nóng)墾科學(xué)院,新疆石河子 832000)
羊肉是人類重要的動物蛋白質(zhì)來源,提高綿羊產(chǎn)肉量和肉品質(zhì)始終是綿羊育種的重要方向。綿羊產(chǎn)肉量主要受兩個因素的影響,一是骨骼肌中肌纖維的數(shù)量;二是骨骼肌纖維的粗細和長度[1]。已有的研究結(jié)果表明,動物骨骼肌纖維數(shù)量在初生前已經(jīng)基本確定。在胚胎發(fā)育階段,來源于胚胎中胚層的成肌細胞(myoblast)遷移到軀干和四肢,先進行分裂增殖,達到一定數(shù)量后單核的成肌細胞相互融合為多核的肌管(myotube)并最終發(fā)育成肌纖維[2],少量成肌細胞轉(zhuǎn)變?yōu)楣趋兰⌒l(wèi)星細胞(skeletal muscle satellite cell),以靜息狀態(tài)存在于肌纖維肌膜與基底膜之間[3]。動物初生后,肌纖維的數(shù)量不再發(fā)生變化,肌肉組織的生長、肌肉量的增加,主要靠肌纖維長度的生長以及周徑的增加來實現(xiàn)[2]。但是當(dāng)肌肉組織受到損傷或者外界的刺激,例如人的體育鍛煉、賽馬的訓(xùn)練以及役用家畜參加高強度的勞動等,肌肉組織需要修復(fù)或者再生,以維持組織的完整性或者使肌組織能夠適應(yīng)高強度的工作時,骨骼肌衛(wèi)星細胞便被激活而完成上述過程[4]。
miRNA(microRNA)是一類小分子非編碼RNA,約為22個核苷酸大小,通過與其靶基因mRNA互補結(jié)合造成mRNA降解或翻譯抑制,從而參與細胞增殖、分化、凋亡、代謝、發(fā)育和腫瘤轉(zhuǎn)移等多種生物學(xué)過程,超過35%的人類基因受miRNA調(diào)控[5],目前miRBase已收錄miRNA的已達38 592條(http://www.mirbase.org/,Release 22)。近年來,miRNA對綿羊骨骼肌發(fā)育的調(diào)控機制已有相關(guān)文獻報道,其中對Texel羊雙肌性狀分子機制的闡釋最為經(jīng)典。Texel羊是優(yōu)良的肉羊品種,具有明顯的雙肌性狀。Clop等[6]的研究結(jié)果表明,Texel羊myostatin基因3′-UTR區(qū)發(fā)生了g+6223G/A突變,恰好成為miR-1和miR-206的靶位點,使該基因的表達受到抑制,其對骨骼肌發(fā)育的抑制作用解除,進而引起Texel羊骨骼肌過度發(fā)育,表現(xiàn)出雙肌性狀。
oar-miR-133在小鼠骨骼肌和心肌中高表達,通過促進成肌細胞的增殖而參與小鼠肌肉組織生長發(fā)育的調(diào)控[7]。綿羊oar-miR-133位于13號染色體上[8],但其在綿羊骨骼肌發(fā)育過程中的生物學(xué)功能尚未見文獻報道。巴什拜羊是新疆優(yōu)良的羔羊肉型地方綿羊品種,其優(yōu)良的肉質(zhì)性狀在國內(nèi)外綿羊品種中并不多見。在自然放牧情況下,4、5月齡羔羊平均日增質(zhì)量300 g左右,平均體質(zhì)量可達35 kg,屠宰率高達56%,胴體質(zhì)量19.66 kg,凈肉率45.7%,骨肉比1∶4.1,名列世界前茅,且羊肉品質(zhì)高,素有“貴族羊”之稱[9],但其優(yōu)良肉質(zhì)性狀的分子調(diào)控機制尚未被闡明。鑒于此,本試驗對oar-miR-133在巴什拜羊不同組織及不同發(fā)育階段骨骼肌中的表達情況,及其對巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞增殖和分化的影響進行初步研究,以期為巴什拜羊的持續(xù)選育提高提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
采集巴什拜羊胎兒期40 d、60 d、80 d、100 d和120 d,以及初生當(dāng)天、6月齡和周歲階段后肢骨骼肌,同時采集胎兒期第100天時心、肝、脾、肺、腎、胃、腸、心肌和大腦組織。以上組織采集后立即投入液氮速凍,然后置于-80 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
以β-actin基因的表達作為內(nèi)參基因,對oar-miR-133的表達量進行定量分析。根據(jù)miRBase中收錄的綿羊(Ovis aris) oar-miR-133序列(MI0014122)及GenBank中公布的牛(Bostaurus)β-actin序列(NM_173979.3)和MyHC序列(NM_174117.1)序列設(shè)計RT-PCR引物。oar-miR-133反轉(zhuǎn)錄引物采用特殊的頸環(huán)(stem-loop)結(jié)構(gòu)引物[10],β-actin基因RT-PCR引物使用Oligo 6.0軟件設(shè)計,所有引物均由上海生工生物工程有限公司合成。引物相關(guān)信息見表1。
按照TRIzol(Invitrogen,美國)說明提取各組織總RNA,使用分光光度計(ND2000,Thermo,美國)結(jié)合瓊脂糖凝膠電泳檢測總RNA質(zhì)量及濃度。按照M-mLV Reverse Transcriptase 試劑盒(Invitrogen,美國)的操作要求反轉(zhuǎn)錄得到oar-miR-133和β-actin的cDNA,其中oar-miR-133的反轉(zhuǎn)錄引物見表1,β-actin的反轉(zhuǎn)錄引物為試劑盒自帶的引物oligo(dT)[12-18]。
表1 oar-miR-133、MyHC和β-actin反轉(zhuǎn)錄引物及RT-PCR引物Table 1 RT-PCR and reverse transcription primers of oar-miR-133,MyHC and β-actin
注:引物oar-miR-133RTP帶下劃線的堿基為與oar-miR-133序列5′端互補的8個堿基,引物oar-miR-133qL帶下劃線的堿基為oar-miR-133序列3′端的14個堿基。
Note: Bases of primer oar-miR-133 with underlines were complementary with 8 bases of 5′ end sequence of oar-miR-133, and the ones of primer oar-miR-133qL and 5sqL were 14 bases of 3′ end sequence of oar-miR-133.
以胎兒期第100天各組織cDNA為模板,對巴什拜羊不同組織中oar-miR-133的表達情況進行半定量分析,擴增反應(yīng)采用25 μL體系:10×PCR buffer 2.5 μL,上下游引物(10 μmol/L)各0.5 μL,dNTPs(10 mmol/L)2 μL,cDNA模板1 μL,TaqDNA聚合酶(2.5 U/μL)0.5 μL,加ddH2O至25 μL。PCR反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,共35個循環(huán),72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。PCR產(chǎn)物用2.5 g/mL的瓊脂糖凝膠電泳檢測。
不同發(fā)育階段骨骼肌組織和不同發(fā)育狀態(tài)骨骼肌衛(wèi)星細胞中oar-miR-133表達量的變化采用qRT-PCR進行精確定量分析。反應(yīng)體系共計20 μL:SYBR Green master mix 2×(Thermo,美國) 10 μL,上下游引物(10 μmol/L)各0.5 μL,cDNA模板1 μL,ddH2O至20 μL。反應(yīng)條件:激活50 ℃ 2 min,95 ℃ 2 min;循環(huán)95 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,共計40個循環(huán)。
從液氮罐中取出一管凍存的巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞(本實驗室通過原代分離培養(yǎng)獲得),迅速置于50 ℃水浴中,待完全融化后取出,吸水紙擦干,φ=75%酒精認真擦拭凍存管外壁進行徹底消毒,然后轉(zhuǎn)入15 mL無菌離心管中,加入10 mL DMEM培養(yǎng)基,離心棄上清后用完全培養(yǎng)基(φ=84%DMEM+φ=15%胎牛血清+φ=1%雙抗)重懸細胞,然后轉(zhuǎn)入6 cm培養(yǎng)皿中,加入適量完全培養(yǎng)基,置于37 ℃、φ=5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),定期換液,待細胞生長至覆蓋培養(yǎng)皿底80%,進行傳代培養(yǎng)。
巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞的誘導(dǎo)分化采用低血清培養(yǎng)基完成,使用完全培養(yǎng)基培養(yǎng)細胞,待細胞生長至覆蓋培養(yǎng)皿底80%左右時,更換誘導(dǎo)分化培養(yǎng)基(φ=97% DMEM/F-12+φ=2%馬血清+φ=1%雙抗),同時觀察細胞的生長分化狀態(tài)。
上述處于增殖、分化狀態(tài)的骨骼肌衛(wèi)星細胞,培養(yǎng)至第5天時收集細胞,提取總RNA,采用qRT-PCR檢測不同狀態(tài)時oar-miR-133表達量的變化。
巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞中oar-miR-133的過表達和抑制表達,通過轉(zhuǎn)入外源的oar-miR-133 mimics和inhibitor實現(xiàn)。將骨骼肌衛(wèi)星細胞接種至6孔板,共接種35孔,每孔約5 000個細胞,加入完全培養(yǎng)基培養(yǎng)至細胞完全貼壁生長。參照Lipofectamine 2000(Invitrogen,美國)操作說明將人工合成的oar-miR-133 mimics和inhibitor及其陰性對照(由吉瑪基因合成,序列見表2)轉(zhuǎn)入巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞,不轉(zhuǎn)染任何試劑作為空白對照組,每個處理轉(zhuǎn)染7孔細胞,共計35孔細胞。每個處理留1孔細胞觀察細胞的生長狀態(tài),其余6孔每隔24 h消化1孔,計數(shù)細胞數(shù)量,以評估各處理對細胞增殖的影響。
表2 oar-miR-133 mimics、oar-miR-133 inhibitor及其陰性對照序列Table 2 Sequence of oar-miR-133 mimics, oar-miR-133 inhibitor and their negative controls
采用TargetScan軟件預(yù)測oar-miR-133靶基因,條件設(shè)置為總背景值(total context score)小于-0.5,總Pct值(aggregate Pct)大于0.4,得到的預(yù)測結(jié)果再與miRanda和Pictar 2個軟件獨立預(yù)測結(jié)果進行比較,取至少出現(xiàn)在2個軟件預(yù)測結(jié)果中的靶基因進行分析[11]。使用Blast2GO對預(yù)測到的靶基因進行功能注釋[12-13],并采用KOBA2.0(KEGG Orthology Based Annotation System)對其參與的KEGG通路進行分析[14-15]。
oar-miR-133的表達量采用2-△△Ct計算,每個試驗重復(fù)3次,結(jié)果用“平均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差”表示,不同發(fā)育階段骨骼肌組織以胎兒期第100 天的表達量作為對照,不同發(fā)育狀態(tài)骨骼肌衛(wèi)星細胞以誘導(dǎo)分化狀態(tài)的表達量為對照進行相對定量。對結(jié)果采用SPSS 13.0進行單因素方差分析,P<0.05為差異顯著。
從各個組織中提取的總RNA無明顯降解(圖1-A),OD260/OD280比值在1.8~2.2之間,表明提取的總RNA質(zhì)量較高,可以用于后續(xù)試驗。
oar-miR-133在巴什拜羊不同組織中的表達量存在明顯的差異,在心肌和骨骼肌中高表達,在肺、腸和胃中表達量較低,未檢測到oar-miR-133表達或者表達量極低(圖1-B)。
在巴什拜羊骨骼肌不同發(fā)育階段,oar-miR-133的表達量出現(xiàn)了較大的波動(圖1-C)。胎兒期第40 天(E40)和第60 天(E60)表達量很低,第80 天(E80)前后表達量迅速上升,至第100天(E100)時達到峰值,其后迅速降低,至第120天(E120)時降至較低表達水平,其后又小幅上升,至初生時達到較高的表達量,后又逐漸下降至較低的表達水平,直至周歲。巴什拜羊不同發(fā)育階段骨骼肌中oar-miR-133表達量的波動與其骨骼肌生長發(fā)育調(diào)控的關(guān)聯(lián)性,尚需后續(xù)試驗驗證。
A.巴什拜羊部分組織提取總RNA瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果,1~4泳道分別為骨骼肌、腸、腎和肝組織 Agarose gel electrophoresis image of total RNA of Bashbay sheep, 1-4 lane is skeletal muscle, intestine, kidney and liver tissue respectively;B.巴什拜羊不同組織中oar-miR-133表達情況,1~10泳道分別是肺、肝、脾、腎、胃、腸、腦、脂肪、心肌和骨骼肌 Expression of oar-miR-133 in different tissues of Bashbay sheep, 1-10 lane is lung, liver, spleen, kidney, stomach, intestine, brain, fat, cardiac muscle and skeletal muscle;C.巴什拜羊骨骼肌不同發(fā)育階段oar-miR-133表達量變化 Expression of oar-miR-133 at different development stages of Bashbay sheep skeletal muscle
圖1巴什拜羊不同組織和不同發(fā)育階段骨骼肌中oar-miR-133表達情況
Fig.1Expressionofoar-miR-133indifferenttissuesandatdifferentdevelopmentstagesofskeletalmuscleofBashbaysheep
巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞處于增殖狀態(tài)時,細胞中oar-miR-133表達量較低。當(dāng)采用誘導(dǎo)分化培養(yǎng)基誘導(dǎo)骨骼肌衛(wèi)星細胞處于分化狀態(tài)時,細胞內(nèi)oar-miR-133表達量迅速上升,顯著高于增殖狀態(tài)時的表達量(P<0.05)(圖2-A)。說明巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞增殖狀態(tài)和分化狀態(tài)的轉(zhuǎn)換,可能與oar-miR-133表達量的上調(diào)存在關(guān)聯(lián)性。
為了進一步研究oar-miR-133表達量的變化與巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞增殖分化狀態(tài)的關(guān)聯(lián)性。通過轉(zhuǎn)染oar-miR-133 mimics和oar-miR-133 inhibitor進入骨骼肌衛(wèi)星細胞,造成細胞內(nèi)oar-miR-133的水平上調(diào)或下調(diào),發(fā)現(xiàn)當(dāng)細胞內(nèi)oar-miR-133的水平上調(diào)時(轉(zhuǎn)入oar-miR-133 mimics組),骨骼肌衛(wèi)星細胞的增殖受到抑制(圖2-B-e和圖2-D),而其余處理組細胞生長狀態(tài)與空白對照組未見明顯差異(圖2-B-a, b, c, d和圖2-D)。另外,當(dāng)細胞內(nèi)oar-miR-133的水平上調(diào)時,即使培養(yǎng)基中的血清體積分?jǐn)?shù)保持在15%,骨骼肌衛(wèi)星細胞仍然停止增殖轉(zhuǎn)入分化狀態(tài),細胞有相互融合形成肌管的趨勢(圖2-B-e和圖2-D),同時骨骼肌衛(wèi)星細胞中標(biāo)志著細胞分化的MyHC基因高表達,而同期的其他處理組細胞中未檢測到該基因的表達(圖2-C)。
綜合以上數(shù)據(jù),可以確定oar-miR-133表達量的上調(diào),與巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞分化過程的啟動密切相關(guān)。
使用TargetScan軟件預(yù)測oar-miR-133靶基因,共得到128個預(yù)測的靶基因。經(jīng)與miRanda和Pictar 2個軟件獨立預(yù)測結(jié)果進行比較,選擇至少出現(xiàn)在2個軟件預(yù)測結(jié)果中的靶基因,最終得到96個符合條件的預(yù)測靶基因。
使用Blast2GO分別對預(yù)測的96個靶基因進行功能注釋,有74個靶基因得到注釋信息,其中分別有23(31%)、18(24%)和33(45%)的候選靶基因分別參與分子功能(molecular function, MF)、細胞成分(cellular component, CC)和生物過程(biological process, BP)(圖3)。
為了進一步了解oar-miR-133預(yù)測靶基因的功能,采用KOBA2.0(KEGG Orthology Based Annotation System)對其參與的KEGG通路進行分析,共有82個預(yù)測靶基因參與35條KEGG通路,例如MAPK信號通路(map04010)、WNT信號通路(map04310)和心肌收縮(map04260)等重要的通路。表3中列出了參與的部分KEGG通路。
A.骨骼肌衛(wèi)星細胞增殖和誘導(dǎo)分化狀態(tài)oar-miR-133表達量變化,不同字母表示差異顯著(P<0.05) Expression of oar-miR-133 in proliferative and differentiated skeletal muscle satellite cells, different letters mean significant difference(P<0.05);B.轉(zhuǎn)染空白對照(a)、oar-miR-133 mimics陰性對照(b), oar-miR-133 inhibitor(c),oar-miR-133 inhibitor 陰性對照(d)和oar-miR-133 mimics(e)的骨骼肌衛(wèi)星細胞生長狀態(tài)(放大200×) States of skeletal muscle satellite cells transfected blank(a), oar-miR-133 mimics(b), oar-miR-133 inhibitor(c), oar-miR-133 inhibitor(d) and oar-miR-133 mimics(e) respectively;C.不同轉(zhuǎn)染組骨骼肌衛(wèi)星細胞中MyHC基因表達情況,M為100 bp Marker,1~5泳道分別為轉(zhuǎn)染oar-miR-133 mimics、oar-miR-133 mimics陰性對照、oar-miR-133 inhibitor,oar-miR-133 inhibitor 和空白對照組骨骼肌衛(wèi)星細胞組 Expression ofMyHCgene in transfected skeletal muscle satellite cells, M lane is 100 bp Marker, 1-5 lane is skeletal muscle satellite cells transfected oar-miR-133 mimics, oar-miR-133 mimics negative control, oar-miR-133 inhibitor , oar-miR-133 inhibitor negative control and blank control respectively;D.oar-miR-133表達量對骨骼肌衛(wèi)星細胞生長的影響 Effect of oar-miR-133 expression on proliferation of skeletal muscle satellite cells
圖2 Oar-miR-133表達量與巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞發(fā)育的關(guān)系Fig.2 Relationship between oar-miR-133 expression and development of skeletal muscle satellite cell of Bashbay sheep
目前,miRBase V22.0收錄的miRNA已達38 589條(http://www.mirbase.org/),其中有一些miRNA的表達具有明顯的組織特異性,例如miR-1、miR-133家族、miR-206和miR-208a/b等僅在骨骼肌和心肌中表達[16-18],又被稱為肌肉miRNA。本研究采用RT-PCR對巴什拜羊胎兒期第100天時心肌、骨骼肌、肝、脾、肺、腎、胃、腸、脂肪、腦等10個組織中oar-miR-133的表達情況進行半定量檢測,結(jié)果表明oar-miR-133除了在 巴什拜羊骨骼肌和心肌中高表達,還在胃、腸和肺組織中微量表達(圖1-B)。由于胃和腸主要是由平滑肌組織構(gòu)成,推測oar-miR-133可能也在巴什拜羊平滑肌組織的生長發(fā)育過程中發(fā)揮作用,相關(guān)調(diào)控機制未見文獻報道,需要后續(xù)試驗驗證。
A.預(yù)測靶基因GO功能注釋 GO functional annotation of predicted target genes of oar-miR-133;B.預(yù)測靶基因參與的細胞組分調(diào)控情況 Predicted target genes participating regulation of cellular component;C.預(yù)測靶基因參與分子功能調(diào)控情況 Predicted target genes participating regulation of molecular function;D.預(yù)測靶基因參與生物過程調(diào)控情況 Predicted target genes participating regulation of biological process
圖3Oar-miR-133預(yù)測靶基因功能GO分析
Fig.3GOfunctionanalysisofpredictedtargetgenesofoar-miR-133
miR-133參與骨骼肌發(fā)育的調(diào)控已有相關(guān)文獻報道,小鼠miR-133和miR-1成簇排列,位于第2和第18號染色體上,但二者獨立完成轉(zhuǎn)錄,對小鼠骨骼肌發(fā)育的調(diào)控作用也存在很大的差異,miR-133可通過抑制肌源性基因的表達而抑制成肌細胞的分化,使其保持增殖狀態(tài),而miR-1的表達可誘導(dǎo)成肌細胞進入分化狀態(tài),相互融合為肌管[17]。綿羊oar-miR-133位于13號染色體上[8],巴什拜羊骨骼肌發(fā)育不同時期oar-miR-133的表達量有較大的波動,尤其是在胎兒期第100天前后oar-miR-133的表達量出現(xiàn)了明顯的上調(diào)(圖1-C)。由于胎兒期是骨骼肌組織發(fā)育的關(guān)鍵時期,推測oar-miR-133表達量的變化可能與其成肌細胞的增殖和分化調(diào)控有關(guān)。
進一步的研究結(jié)果表明,當(dāng)巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞處于增殖狀態(tài)時oar-miR-133處于低表達水平,而當(dāng)骨骼肌衛(wèi)星細胞處于誘導(dǎo)分化狀態(tài)時oar-miR-133的表達量迅速上調(diào)(圖2-A)。另外,當(dāng)通過轉(zhuǎn)入oar-miR-133 mimics使巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞中oar-miR-133的水平上升時,巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞即使處于增殖培養(yǎng)基中,也停止增殖轉(zhuǎn)而進入分化狀態(tài)(圖2-B,2-C,2-D)。由此可以確定,在巴什拜羊生長發(fā)育過程中,oar-miR-133通過誘導(dǎo)成肌細胞分化而參與巴什拜羊骨骼肌生長發(fā)育的調(diào)控,進而影響其產(chǎn)肉性能和肉質(zhì)。據(jù)文獻報道,在小鼠骨骼肌中miR-133的上調(diào)可抑制成肌細胞分化,使其保持增殖狀態(tài)[17]。另外,在瘦肉型豬和脂肪型豬品種骨骼肌的發(fā)育過程中,miR-133等骨骼肌中特異表達的miRNA的表達模式也存在顯著差異[19],而經(jīng)雌激素處理的虹鱒魚,骨骼肌中miR-133的表達量顯著上調(diào),進而骨骼肌的生長發(fā)育受到抑制[20]。由此推斷miR-133的表達及其作用可能存在物種甚至品種差異性,具體機制有待后續(xù)深入研究。
miRNA通過調(diào)控靶基因而發(fā)揮其生物學(xué)功能,所以確定miRNA調(diào)控的靶基因是進一步研究其生物功能基礎(chǔ)。但是,由于miRNA與其靶基因作用的復(fù)雜性,以及動物miRNA與其靶基因并非通過完全堿基互補進行結(jié)合,所以到目前為止已經(jīng)實驗驗證的miR-133靶基因數(shù)量還非常有限。巴什拜羊oar-miR-133通過調(diào)控哪些靶基因而誘導(dǎo)骨骼肌衛(wèi)星細胞分化的是一個值得深入研究的問題。已有研究結(jié)果表明,miR-133可以通過調(diào)控Prdm16基因而影響小鼠骨骼肌衛(wèi)星細胞分化為肌組織還是褐色脂肪組織[21]。在C2C12細胞中,miR-133通過調(diào)控血清應(yīng)答因子(Serum response factor,SRF)的表達而抑制肌細胞的分化,而miR-133的表達又受長鏈非編碼RNA Malat1的調(diào)控[22]。另外,在大鼠心肌中miR-133可以通過抑制Caspase-9的表達而延緩心肌細胞的凋亡[23]。但在巴什拜羊骨骼肌發(fā)育過程中oar-miR-133調(diào)控的靶基因尚未見文獻報道。本研究采用生物信息學(xué)分析的方法共預(yù)測到oar-miR-133的靶基因96個,GO分析結(jié)果表明共有74個預(yù)測靶基因分別參與分子功能(molecular function, MF)、細胞成分(cellular component, CC)和生物過程(biological process, BP)等重要的細胞生物學(xué)過程(圖3)。靶基因參與KEGG信號通路分析結(jié)果表明,共有82個預(yù)測靶基因參與35條KEGG通路,其中涉及一些諸如肌動蛋白細胞骨架調(diào)控(map04810)、MAPK信號通路(map04010)等重要的信號通路。但是由于生物信息學(xué)分析結(jié)果存在較大比例的假陽性結(jié)果,所以后期需要通過實驗室驗證最終確定oar-miR-133調(diào)控的靶基因,以便更為準(zhǔn)確地解析其調(diào)控巴什拜羊骨骼肌發(fā)育的分子機制。
本研究對巴什拜羊不同組織和不同發(fā)育階段骨骼肌中oar-miR-133的表達情況進行研究,初步揭示oar-miR-133的表達與巴什拜羊骨骼肌衛(wèi)星細胞增殖和分化狀態(tài)轉(zhuǎn)換的關(guān)系,為進一步闡明oar-miR-133對巴什拜羊骨骼肌發(fā)育的調(diào)控機制奠定了基礎(chǔ),相關(guān)研究成果將為巴什拜羊的持續(xù)選育提高提供理論依據(jù)。