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        主成分分析法對甜仁用杏品種 “龍王帽”種子苗優(yōu)良類型的篩選

        2019-04-09 01:47:52羅新凱羅振興王志遠田振鐸楊淑梅冷志巍馮淑華
        陜西農(nóng)業(yè)科學 2019年3期
        關(guān)鍵詞:分析

        羅新凱,羅振興,王 利,王志遠,田振鐸,楊淑梅,冷志巍,馮淑華

        (1.白城市林業(yè)科學研究院,吉林 白城 137000;2.通榆縣林業(yè)局,吉林 通榆 137200;3.白城市種子管理站,吉林 白城 137000)

        甜仁用杏是我國的特有樹種,甜杏仁不僅口感香甜,而且營養(yǎng)價值極高,據(jù)馮小雨研究杏仁中粗脂肪含量50.33%,總糖21.24%,蛋白質(zhì)19.25%,還含有K、Ca、Na、Mg、Fe、Zn、Mn和Cu等8種礦質(zhì)元素[1]。目前甜仁用杏主栽品種為“龍王帽”、“一窩蜂”和“優(yōu)一”等,抗寒性好,耐旱能力極強,年降雨量達到300 mm即可滿足其生長結(jié)實的需要[2],因此適合在我國北方干旱地區(qū)栽培。但目前我國甜仁用杏栽培面積極小,年產(chǎn)量僅1 100 t(2008年統(tǒng)計),人均占有量僅0.55 g[3],每年還需對臺灣和香港大量出口,因此擴大甜仁用杏的生產(chǎn)面積對提高人民生活水平,發(fā)展中國特色農(nóng)業(yè)經(jīng)濟意義重大。

        吉林省白城市位于科爾沁草原東部,具有大面積的風沙地和半山區(qū)丘陵,氣候干旱少雨,非常適合甜仁用杏的栽培,當?shù)噩F(xiàn)有“龍王帽”等品種生產(chǎn)園70 hm2,即使靠自然降雨,每年也能有較高的產(chǎn)量,因此當?shù)乜纱竺娣e發(fā)展甜仁用杏栽培。

        目前甜仁用杏育種主要通過對生產(chǎn)園等資源調(diào)查來發(fā)現(xiàn)一些變異,如1998年遼寧省果樹研究所選育出“超仁”、“國仁”、“油仁”和“豐仁”[4],2007年河北省圍場選育出“圍選1號”[5]等,通過雜交育種進行新品種選育工作做得極少,白城市林業(yè)科學研究院通過播種龍王帽種子2016年從中選育出2個優(yōu)良無性系[6]。

        主成分分析法可對多個變量進行綜合分析,趙曉梅采用主成分分析法對杏品種進行了經(jīng)濟性狀分析并進行了優(yōu)良品種選擇[7],郭愛華對杏各品種抗寒性進行主成分分析[8],在育種方面國內(nèi)對甜玉米育種和蟹爪蘭資源采用了主成分分析[9,10],此次我們將對龍王帽種子苗通過主成分分析進行優(yōu)良品系篩選。

        1 材料和方法

        2008年播種龍王帽種子,獲得60株實生苗,2013年開始結(jié)果,其中苦仁類型52株,甜仁類型8株。試驗地在白城市林業(yè)科學研究院甜仁用杏雜種圃內(nèi),土壤為黑鈣土,pH值8.06,含鹽量0.66%,土壤有機質(zhì)2.81%;試驗樹木為龍王帽種子苗實生苗甜仁類型,株距2 m,行距1 m,試驗時間為2016年,對甜仁類型調(diào)查果實產(chǎn)量、核重、仁重、樹高和地徑,使用spss軟件對試驗結(jié)果進行主成分分析,確定優(yōu)良品系。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 各品系主要形狀調(diào)查結(jié)果

        各品系主要性狀調(diào)查結(jié)果表1。

        將原始數(shù)據(jù)進行標準化處理得到表2。

        2.2 相關(guān)系數(shù)分析

        對各性狀兩兩之間進行相關(guān)性分析,分析結(jié)果見表3。

        相關(guān)系數(shù)絕對值0~0.09為沒有相關(guān)性, 0.1~0.3為弱相關(guān),0.3~0.5為中等相關(guān),0.5~1.0為強相關(guān)。

        通過性關(guān)系數(shù)分析看出,地徑與樹高之間為強相關(guān)性,與單仁重、單核重和果實產(chǎn)量為弱的負相關(guān)性;樹高與單核重和單仁重為弱相關(guān),與果實產(chǎn)量為負的中等相關(guān),即樹體越高的品系產(chǎn)量越低;果實產(chǎn)量與單核重為中等相關(guān),與單仁重為強相關(guān);單核重與單仁重之間為強相關(guān)。

        表3 各指標相關(guān)系數(shù)

        2.3 主成分分析

        首先進行KMO檢驗,5個性狀指標KMO值為0.386,KMO值小于0.5時不適合做主成分分析,通過上面相關(guān)系數(shù)分析我們知道地徑只與樹高呈強相關(guān),與各經(jīng)濟指標為弱的負相關(guān),因此去掉該項指標對其余4個性狀指標重新做KMO檢驗,結(jié)果KMO值=0.541,可以進行主成分分析。

        通過各指標相關(guān)矩陣可求出4個主成分,并得出各主成分的方差貢獻率,各主成分初始特征值及對應(yīng)的方差貢獻率見表4。根據(jù)表4,第一和第二主成分值大于1,其方差貢獻率累計達到93.117%,保存了各指標的絕大多數(shù)信息,因此提出這2個主成分,記作Y1和Y2。

        表4 各主成分方差貢獻率

        求出各性狀指標的成分系數(shù)得分矩陣,見表5。

        表5 各指標的成分系數(shù)得分矩陣

        通過表5,得出2個主成分由各性狀變量的線性組合公式為:

        (代數(shù)式1)

        可以看出第一主成分Y1主要受單仁重和單核重影響,果實產(chǎn)量影響也較大,第二主成分Y2主要受樹高的影響和果實產(chǎn)量的負影響,單仁重和單核重得分系數(shù)小,對Y2影響不大。

        將表2的數(shù)據(jù)代入代數(shù)式1中,得出各品系第1和第2主成分得分,用 FAC1和FAC2表示,結(jié)果見表6。

        表6 各品系主成分得分

        第一主成分“23號”得分最高,其次是“24號”和“5號”,這三個品系仁重、核重等經(jīng)濟指標高于其他品系。

        將表6中各品系2個主成分得分作出散點圖,見圖1,可更直觀表示各品系的性狀。

        圖1 各品系主成分得分散點圖

        “2號”、“5號”和“23號”處于第一象限,F(xiàn)AC1>0,因此經(jīng)濟性狀好,但“2號”FAC1值太小,與“5號”相差太大,經(jīng)濟性狀不夠理想;FAC2>0,因此“5號”和“23號”樹體具有高度優(yōu)勢,其生長勢略強?!?4號”位于第四象限,F(xiàn)AC1>0并且超過“5號”,因此經(jīng)濟性狀非常好,F(xiàn)AC2<0,說明其不具備高度優(yōu)勢,生長勢弱。

        其余品系處于第二、第三象限和縱坐標軸上,F(xiàn)AC1<=0,經(jīng)濟性狀都很差。

        通過上述分析,可篩選出“5號”、“23號”和“24號”3個經(jīng)濟性狀優(yōu)良的品系。

        3 結(jié)論

        (1)雜種后代的篩選需要考慮包括經(jīng)濟性狀在內(nèi)的多個性狀,在初選階段如果對各個性狀逐個比較分析往往顧此失彼,既抓不住重點,又會遺漏一些問題,因此采用主成分分析法降維,可將所有的性狀指標轉(zhuǎn)化成幾個綜合指標,在損失較少信息的前提下分析問題既全面又簡化[11];筆者試驗第一和第二主成分方差累計貢獻率達到93.117%,可以表達全部性狀信息。

        (2)第一主成分在單仁重方面的得分系數(shù)最大,單核重略次之,在果實產(chǎn)量方面得分系數(shù)也較大,因此第一主成分代表經(jīng)濟性狀,得分高的品系即為優(yōu)良品系,得分最高的前3個品系“23號”、“24號”和“5號”可確定為優(yōu)良品系;第二主成分主要代表樹高這一生長勢性狀,“23號”和“5號”第二主成分得分>0,因此具有一定的生長優(yōu)勢。

        (3)筆者試驗在進行主成分分析前進行了KMO測度,KNO測度是判斷變量(指標)是否適合做因子分析的統(tǒng)計檢驗方法之一,只有KMO值大于0.5時,才可進行因子分析,在樣品數(shù)量較少情況下,變量過多也很難滿足KMO值>0.5。筆者試驗在開始KMO值過低的情況下刪除了地徑這一相關(guān)性不強的變量,使KMO值符合了因子分析的要求,從而保證分析過程正當合理,結(jié)果正確可信。

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