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        嘉興市主栽葡萄品種中主要病毒病原的檢測(cè)

        2019-03-30 03:06:54陳婕曹奎榮王曄青孫祥良
        浙江農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年3期
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        陳婕,曹奎榮,王曄青,孫祥良*

        (1.嘉興市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,浙江 嘉興 314016; 2.嘉興市農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)局,浙江 嘉興 314050)

        葡萄(VitisviniferaL.)是嘉興市種植面積最大的果樹(shù)之一,在嘉興市農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)中占有重要地位[1]。隨著葡萄產(chǎn)業(yè)迅猛發(fā)展,葡萄栽培面積和苗木繁育數(shù)量急劇增加,與此同時(shí),主要通過(guò)苗木和繁殖材料傳播的病毒病害也進(jìn)一步擴(kuò)展蔓延,危害日益嚴(yán)重。由于葡萄長(zhǎng)期進(jìn)行無(wú)性繁殖,容易感染和積累多種病毒,并隨著苗木和接穗的調(diào)運(yùn)不斷擴(kuò)散,導(dǎo)致果實(shí)品質(zhì)不斷下降、嫁接成活率降低,樹(shù)體逐年衰退,給葡萄的優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)帶來(lái)嚴(yán)重的影響。

        目前,已報(bào)道的侵染葡萄的病毒約65種[2],由這些病毒引起的病害中,分布最廣、危害最重的主要有葡萄卷葉病、葡萄扇葉病、葡萄斑點(diǎn)病和葡萄皺木復(fù)合病[3]。因此,本研究利用RT-PCR檢測(cè)結(jié)合PCR產(chǎn)物測(cè)序的方法,對(duì)嘉興市葡萄主栽品種進(jìn)行病毒病原檢測(cè),以期對(duì)嘉興地區(qū)主栽葡萄品種的病毒病種類(lèi)、帶毒率進(jìn)行系統(tǒng)的了解,并為以后無(wú)病毒苗木的繁育及推廣工作奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 樣品采集

        從嘉興市的南湖區(qū)、秀洲區(qū)、嘉善縣、海鹽縣和桐鄉(xiāng)市等5個(gè)縣區(qū)采集6個(gè)葡萄品種共162份樣品,包括藤稔47份,紅地球38份,醉金香34份,陽(yáng)光玫瑰33份,早生內(nèi)瑪斯6份和夏黑4份。春天采集嫩葉,采集方法是在新梢生長(zhǎng)期隨機(jī)選擇植株生長(zhǎng)點(diǎn)周?chē)哪廴~進(jìn)行采集。秋天在休眠期采集成熟枝條韌皮部,樣品采集后置于密封袋,并注明采集日期和地點(diǎn)。

        1.2 試劑

        用于檢測(cè)葡萄扇葉病毒(Grapevine fanleaf virus,GFLV)、葡萄卷葉相關(guān)病毒1(Grapevine leafroll-associated virus 1,GLRaV-1)、葡萄卷葉相關(guān)病毒3(Grapevine leafroll-associated virus 3,GLRaV-3)、葡萄病毒A(Grapevine virus A,GVA)、葡萄病毒B(Grapevine virus B,GVB)沙地葡萄莖痘病毒(Grapevine rupestris stem pitting-associated virus,GRSPaV)和葡萄斑點(diǎn)病毒(Grapevine fleck virus,GFkV)等6種病毒[4]的特異性引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,引物序列信息見(jiàn)表1。反轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自美國(guó)Promega公司,PCR試劑盒購(gòu)自日本TaKaRa公司,其他試劑均為國(guó)產(chǎn)或進(jìn)口分析純?cè)噭?/p>

        1.3 儀器

        樣品粉碎所用Tissuelyser-64組織研磨儀,購(gòu)自上海凈信實(shí)業(yè)發(fā)展有限公司;PCR擴(kuò)增所用TC-XP-D PCR儀,購(gòu)自杭州博日科技有限公司;凝膠成像系統(tǒng)購(gòu)自上海培清科技有限公司。

        1.4 檢測(cè)方法

        RNA提?。簠⒄辗缎駯|等[5]的方法,在此基礎(chǔ)上用組織研磨儀研磨樣品,以便節(jié)約時(shí)間。

        表1 用于葡萄主要病毒病原RT-PCR檢測(cè)的引物

        RT-PCR:逆轉(zhuǎn)錄cDNA鏈的合成在500 μL無(wú)酶離心管中進(jìn)行,總體系為20 μL。第一步:離心管中依次加入DEPC水7.0 μL,6 bp隨機(jī)引物(TaKaRa公司)1.0 μL,總RNA 2 μL,混勻并瞬時(shí)離心后,95 ℃水浴7 min,冰上放置3 min。第二步:離心管中繼續(xù)依次加入5×M-MLV緩沖液 4.0 μL,DEPC水4.0 μL,10 mmol·L-1dNTP 1.0 μL,200 U·μL-1M-MLV酶0.5 μL,50 U·L-1RNase Inhibitor 0.5 μL。將所有試劑混勻并瞬時(shí)離心后,置于37 ℃水浴1.5 h。反應(yīng)完成后將產(chǎn)物用于PCR擴(kuò)增或置于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        PCR擴(kuò)增:PCR反應(yīng)體系為25 μL,分別加入無(wú)菌去離子水18.75 μL,10×PCR緩沖液2.5 μL,10 mmol·L-1dNTP 0.5 μL,10 μmol·L-1的上下游引物(表1)各0.5 μL,5 U·μL-1r-Taq0.25 μL,cDNA 2 μL。擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s,各引物相應(yīng)退火溫度條件下30 s,72 ℃延伸45 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min。

        PCR產(chǎn)物純化與測(cè)序:將擴(kuò)增到的目的片段進(jìn)行切膠回收,用北京艾德萊瓊脂糖凝膠純化回收試劑盒進(jìn)行純化,純化后的產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行雙向測(cè)序。測(cè)序結(jié)果在NCBI網(wǎng)站進(jìn)行序列比對(duì)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 6個(gè)品種葡萄的帶病毒狀況

        RT-PCR檢測(cè)結(jié)合PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果表明(表2),162個(gè)葡萄樣品帶毒率高達(dá)91.4%(148/162),其中單一病毒侵染率為30.9%(50/162),兩種及兩種以上病毒復(fù)合侵染率為60.5%(98/162):2種、3種、4種及5種病毒復(fù)合侵染率分別為34.6%(56/162)、14.8%(24/162)、7.4%(12/162)和3.7%(6/162)。除紅地球(帶毒率63.2%)以外,其他5個(gè)葡萄品種(藤稔、醉金香、陽(yáng)光玫瑰、早生內(nèi)瑪斯和夏黑)的帶毒率均為100%。

        表2 162份葡萄樣品病毒檢測(cè)結(jié)果

        2.2 7種病毒的檢出率以及在不同葡萄品種上的侵染率

        對(duì)7種病毒的檢測(cè)結(jié)果分析表明(表2),葡萄扇葉病毒GFLV在所有樣品中均未檢測(cè)到;引起葡萄卷葉病的GLRaV-1檢出率為1.2%(2/162),僅在陽(yáng)光玫瑰樣品中檢測(cè)到陽(yáng)性,而同樣引起卷葉病的GLRaV-3的陽(yáng)性率為34.6%(52/162),該病毒在除夏黑以外的5個(gè)品種中均檢測(cè)到陽(yáng)性樣品;引起皺木復(fù)合病的GRSPaV、GVA和GVB三種病毒的檢出率分別為29.6%(48/162)、36.4%(59/162)和11.1%(18/162);引起葡萄斑點(diǎn)病的GFkV的檢出率最高,為84%(136/162)。但這些病毒在不同品種上的侵染率無(wú)明顯偏向性。6種病毒RT-PCR瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果如圖1所示。

        3 討論

        葡萄為多年生果樹(shù),一旦被病毒侵染便終生帶毒,且無(wú)有效化學(xué)藥劑能控制[6]。葡萄病毒檢測(cè)技術(shù)的應(yīng)用是實(shí)現(xiàn)葡萄無(wú)毒化栽培的重要保障,本研究利用RT-PCR分子檢測(cè)技術(shù)對(duì)嘉興市不同縣區(qū)的主栽葡萄品種的帶病毒狀況進(jìn)行檢測(cè)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)6個(gè)主栽品種的帶毒率均較高,且復(fù)合侵染現(xiàn)象嚴(yán)重。生產(chǎn)上,如果對(duì)病毒病不加以重視,將會(huì)對(duì)許多優(yōu)良品種的產(chǎn)量和品質(zhì)造成嚴(yán)重威脅,影響果農(nóng)經(jīng)濟(jì)收入。因此,在新品種引進(jìn)時(shí),要做好病毒檢疫檢測(cè),保證苗木的質(zhì)量,同時(shí)注意控制新老果園的距離,降低昆蟲(chóng)傳毒的概率。

        圖1 6種病毒RT-PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳

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