尹 克 張素欣 段玉芹 陳 中 李天客
口腔鱗狀細(xì)胞癌(OSCC)是最常見的頭頸部惡性腫瘤之一,具有較強(qiáng)的侵襲性,常導(dǎo)致局部浸潤或早期淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移[1],且約60%的頭頸部癌癥患者就診時已到中晚期,致死率較高[2]。因此,OSCC 的早期診斷及治療對于患者的生存和發(fā)展及術(shù)后生活質(zhì)量的提高至關(guān)重要。研究[3~5]表明,MAFbx 可能具有潛在的腫瘤抑制功能,可以作為組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶(EZH2) 抑制劑誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞凋亡。卵巢癌細(xì)胞MAFbx 的表達(dá)失活可能與其啟動子區(qū)甲基化有關(guān)。但是在OSCC 中關(guān)于MAFbx基因的作用及甲基化狀態(tài)的研究尚未見報(bào)道。本研究通過檢測OSCC 及相應(yīng)癌旁組織中MAFbx基因表達(dá)及甲基化狀態(tài),分析其表達(dá)與甲基化的相關(guān)性,探討MAFbx在OSCC發(fā)生及發(fā)展中的作用及其與患者預(yù)后的關(guān)系,為OSCC 患者的靶向治療提供新思路。
1.臨床資料:隨機(jī)選取本院2010~2012年間的OSCC 患者手術(shù)切除標(biāo)本,共53 例。上述標(biāo)本均經(jīng)病理證實(shí)為口腔鱗癌組織和相應(yīng)的正??谇火つ?。每例標(biāo)本均為術(shù)后半小時內(nèi)采集完成,液氮保存用于DNA 和RNA 的提取。其中男性31例,女性22例,年齡37~76 歲,中位年齡61 歲。吸煙25 例,不吸煙28 例;飲酒25例,不飲酒28例;Ⅰ期5例(9.43%),Ⅱ期30例(60.38%),Ⅲ期14 例(26.42%),Ⅳ期4例(7.55%);有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移34例(64.15%),無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移19例(35.85%)。本研究中所有研究對象簽署知情同意,并經(jīng)醫(yī)院倫理委員會通過。上述病例以患者術(shù)后出院為觀察起點(diǎn),結(jié)合復(fù)診病歷,利用電話、電子通訊等手段對患者及其家屬進(jìn)行隨訪,隨訪截止于2017年12月。
2.主要試劑:RPMI 1640 培養(yǎng)液、胰酶(美國Gibco公司),5-氮雜-2'-脫氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine,5-Aza-dC)(Sigma公司);蛋白酶K(Merck公司);DNA 亞硫酸氫鹽純化試劑盒(德國QIAGEN 公司);組織RNA 提取試劑盒(天根生化科技有限公司);逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(Invitrogen 公司);本研究所用引物均在北京賽百盛公司合成。
3 細(xì)胞培養(yǎng):SCC-15和OC3細(xì)胞購自ATCC 細(xì)胞庫,用含有10%胎牛血清的RPMI 1640 培養(yǎng),置于5% CO2的培養(yǎng)箱常規(guī)培養(yǎng)。取待細(xì)胞處于對數(shù)生長期時,加入5-Aza-dC(終濃度10μmol/L)作為實(shí)驗(yàn)組,以未經(jīng)5-Aza-dC 處理的細(xì)胞作為對照組。加藥后繼續(xù)培養(yǎng)細(xì)胞48h,其中每24h 更換培養(yǎng)液,之后換全血清培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)24h 后收集細(xì)胞并提取DNA 及RNA。
4.RT-qPCR 檢測口腔癌細(xì)胞系及OSCC 組織中MAFbx 的表達(dá):按TRIzol 試劑說明書提取細(xì)胞系中的RNA,按照組織RNA 提取試劑盒說明書提取53例組織中的總RNA,并參照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書將RNA 逆轉(zhuǎn)錄成cDNA。用于檢測MAFbx 表達(dá)的引物為:上游:5’-AAGTCTGTGCTGGTCGGGAA-3’,下游5’-AGTGAAGGTGAGGCCTTTGAAG-3’(產(chǎn) 物123bp);內(nèi)參照GAPDH 的引物序列為:上游5’-AGGTGAAGGTCGGAGTCAACG-3’,下 游 5’-AGGGGTCATTGATGGCAACA-3’(產(chǎn) 物226bp)。qPCR 反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性1min;94℃變性30s,58℃退火30s,72℃延伸30s,共40 個循環(huán)。以2-ΔΔCt表示MAFbx基因的相對表達(dá)量,ΔCt =CtmRNA-CtGAPDH,ΔΔCt=ΔCt病例組-ΔCt對照組。
5.BS-MSP 法檢測MAFbx 甲基化:采用常規(guī)酚/氯仿法提取5-Aza-dC 處理前后口腔癌細(xì)胞系和OSCC 患者組織的基因組DNA,按照亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑盒,每個樣本中均取2μg DNA,進(jìn)行亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化。運(yùn)用UCSC (University of California Santa Cruz)基因序列數(shù)據(jù)庫和Genebank 結(jié)合進(jìn)行序列檢索,在線軟件Methprimer 預(yù)測基因CpG 島分布情況,發(fā)現(xiàn)在MAFbx基因啟動子及部分第一外顯子區(qū)存在兩個CpG 島。本研究應(yīng)用BS-MSP 對啟動子區(qū)CpG 島進(jìn)行甲基化分析。并結(jié)合引物設(shè)計(jì)軟件設(shè)計(jì)第一輪PCR 引物,上下游引物序均不含有CG位點(diǎn)。在此片段范圍內(nèi)設(shè)計(jì)MSP 引物,引物擴(kuò)增范圍分別為:-475bp 到-288bp。以第一輪擴(kuò)增片段為模板加入MSP 引物再進(jìn)行擴(kuò)增。第一輪PCR 引物序列為:上游:5'-TTGGTTAGTGATAGTTAAGG-3';下游5'-TAACTTTATTTATAAACT-3'(產(chǎn)物519bp)。MSP引物序列為:甲基化引物序列:上游5'-TTAGTTTTGCGGACGGTTCGGGAGG-3',下游5'-ACGCTTAAAAAAATACGCCCCGATC-3'(產(chǎn)物188bp); 非甲基化引物序列:上游5'-TTAGTTTTGTGGATGGTTTGGGAGG-3',下游5'-ACACTTAAAAAAATACACCCCAATC-3'(產(chǎn)物188bp)。PCR 反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性10min 后,95℃變性45s,退火45s,72℃延伸1min,35 個循環(huán)后,72℃延伸7min。陽性對照選用經(jīng)甲基化酶(Sss I)處理的基因組DNA,滅菌雙蒸水取代DNA 模板進(jìn)行PCR 作為陰性對照。并隨機(jī)選取10%標(biāo)本進(jìn)行重復(fù)。
6.統(tǒng)計(jì)學(xué)處理:采用SPSS 軟件包(22.0版)進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。計(jì)量資料采用t檢驗(yàn),以表示;計(jì)數(shù)資料采用檢驗(yàn)和校正檢驗(yàn);相關(guān)性分析采用spearman 分析,均為雙側(cè)檢驗(yàn)。預(yù)后分析采用Kaplan-Meier 生存曲線。以P<0.05或P<0.01 表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
1.口腔癌細(xì)胞系中MAFbx 的表達(dá)及甲基化狀態(tài)(圖1):5-Aza-dC 處理前后SCC-15 和OC3 細(xì)胞中MAFbx 的相對表達(dá)量分別為(0.265±0.021 vs 0.534±0.015)和(0.094±0.001 vs 0.455±0.039),差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。5-Aza-dC 處理前2種OSCC 細(xì)胞系中MAFbx基因均有甲基化條帶擴(kuò)出,經(jīng)過5-Aza-dC 處理后,OC3 細(xì)胞系中MAFbx甲基化程度降低,非甲基化程度增加,SCC-15 細(xì)胞系中MAFbx 表現(xiàn)為非甲基化狀態(tài)。
2.OSCC 組織及相應(yīng)癌旁組織中MAFbx基因的mRNA 的相對表達(dá)量(圖2,表1):OSCC 組織中MAFbx 的相對表達(dá)量為(1.000±0.001),顯著低于癌旁正常組織(1.813±0.392)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=-12.973,P<0.01)。
該基因的表達(dá)量與患者的TNM 分期[t=3.019,P<0.01)]和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移[t=-3.231,P<0.01)]有關(guān),而與患者的性別、年齡、吸煙、飲酒無關(guān)(P>0.05)。
圖1 OSCC 細(xì)胞系中MAFbx基因mRNA 表達(dá)(A)及甲基化狀態(tài)(B)
3.MAFbx在OSCC 組織中的表達(dá)與患者預(yù)后的關(guān)系(圖3):對53 例OSCC 患者進(jìn)行隨訪,共8 人失訪,失訪率為15.1%。結(jié)果表明,MAFbx 低表達(dá)組(與癌旁組織相對表達(dá)量相比低于2 倍者為低表達(dá))患者生存率為17.6%(28/34),平均生存時間為(30.79±3.01)個月;MAFbx 高表達(dá)組患者生存率為47.4%(10/19),平均生存時間為(47.73±4.48)個月。兩組生存率與生存時間比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=7.642,P<0.05;t=-2.653,P<0.05)。
4.OSCC 組織和相應(yīng)癌旁正常組織中MAFbx基因啟動子區(qū)的甲基化狀態(tài)(圖4,表1):OSCC 組織中甲基化率為64.15%(34/53),顯著高于其對應(yīng)的癌旁組織24.53%(13/53)(χ2=16.858,P<0.01)。分析53 例OSCC 患者的各臨床病理參數(shù)發(fā)現(xiàn),該基因啟動子區(qū)的甲基化狀態(tài)與患者的TNM 分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)(P<0.05),而與患者吸煙、飲酒、性別及年齡無關(guān)(P>0.05)。
圖2 RT-qPCR 法檢測OSCC 組織中MAFbx基因的mRNA 表達(dá)
表1 OSCC組織中MAFbx基因表達(dá)水平及甲基化狀態(tài)與患者臨床病理資料的關(guān)系
圖3 MAFbx高表達(dá)組和低表達(dá)組患者的生存曲線
同時,53 例OSCC 組織中,發(fā)生MAFbx 甲基化的組織中其mRNA 相對表達(dá)量顯著低于未發(fā)生甲基化的組織[(0.054±0.033)vs(0.090±0.047),t=2.948,P<0.01]。
圖4 BG-MSP法檢測OSCC組織中MAFbx基因甲基化狀態(tài)
MAFbx(也稱為atrogin-1)是F-box 蛋白家族的成員,最初被鑒定為肌肉特異性F-box 蛋白,并且構(gòu)成參與肌肉萎縮的蛋白連接酶復(fù)合物,在泛素化和靶蛋白活化或降解中起關(guān)鍵作用[6,7]。該基因定位于人染色體8q24.13,v-akt 鼠胸腺瘤病毒致癌基因(蛋白激酶B,AKT)信號通路對MAFbx 具有負(fù)向調(diào)節(jié)作用,且MAFbx 可能作為一種新型細(xì)胞凋亡調(diào)節(jié)因子,在多種腫瘤中表達(dá)沉默,促進(jìn)腫瘤的發(fā)生[8,9]。
近年來研究表明,MAFbx 啟動子區(qū)甲基化可能是導(dǎo)致其表達(dá)沉默的重要機(jī)制之一,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中起重要作用[10]。DNA 甲基化作為人體中表觀遺傳事件之一,其甲基化模式的改變可能在腫瘤發(fā)生中起重要作用[11,13]。研究發(fā)現(xiàn),異常的DNA甲基化是腫瘤發(fā)生過程中最早的分子事件之一,在正常細(xì)胞向腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)化的過程中就可以被檢測到并且在某些條件下還可以被調(diào)節(jié)或逆轉(zhuǎn)[12]。因此,基因的異常DNA 甲基化檢測可能在惡性腫瘤早期篩查中具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。
Chou 等[14]在對卵巢癌的研究中發(fā)現(xiàn),MAFbx在卵巢癌細(xì)胞系中表達(dá)缺失,其在卵巢癌中低表達(dá)可能與其DNA 啟動子區(qū)異常高甲基化有關(guān);MAFbx高甲基化與晚期卵巢癌患者預(yù)后不良有關(guān);MAFbx低表達(dá)可能增加卵巢癌細(xì)胞對順鉑的耐藥性。在對乳腺癌、結(jié)腸癌及食管癌的研究中,MAFbx基因啟動子區(qū)甲基化是導(dǎo)致其表達(dá)沉默的重要抑制機(jī)制[15~17]。Guo 等[17]的研究發(fā)現(xiàn),MAFbx在食管癌中甲基化率高達(dá)52.27%,其啟動子區(qū)甲基化與患者預(yù)后不良有關(guān)。本研究結(jié)果顯示MAFbx在OSCC 細(xì)胞系及組織中的表達(dá)顯著下調(diào),且MAFbx 低表達(dá)與OSCC 患者不良預(yù)后有關(guān)。同時我們在編號為GSE38823 的表達(dá)譜芯片中發(fā)現(xiàn)5-Aza-dC 處理SCC-15 細(xì)胞系后,MAFbx基因的表達(dá)較處理前上調(diào)。因此,本研究組推測MAFbx基因在OSCC 表達(dá)下調(diào)可能與DNA 甲基化有關(guān),并可通過甲基化轉(zhuǎn)移酶抑制劑處理后發(fā)生逆轉(zhuǎn)。本研究中選取口腔鱗癌系SCC-15 和OC3,應(yīng)用5-Aza-dC 處理后發(fā)現(xiàn)MAFbx 的mRAN 表達(dá)顯著上調(diào)。為了降低甲基化檢測的假陽性率,我們還應(yīng)用BG-MSP 的方法進(jìn)一步驗(yàn)證OSCC 細(xì)胞系及OSCC 組織中的甲基化情況,結(jié)果顯示MAFbx在OSCC 組織中呈高甲基化狀態(tài),應(yīng)用5-Aza-dC 處理后細(xì)胞中呈現(xiàn)非甲基化狀態(tài),提示甲基化可能是該基因在OSCC 中表達(dá)失活的重要機(jī)制之一。
此外,MAFbx 作為一種E3 泛素連接酶,參與EMT 相關(guān)的分子標(biāo)志物表達(dá)和潛在的表型變化過程[7]。在乳腺癌中,MAFbx基因可以靶向抑制KLF4,從而抑制腫瘤細(xì)胞體外生長和增殖[18]。MAFbx 過表達(dá)可以顯著增強(qiáng)5-FU 誘導(dǎo)的AGS/5-FU 和SGC-7901/5-FU 細(xì)胞凋亡,增加兩種胃癌細(xì)胞系對藥物的敏感性[19]。因此,對于該基因在OSCC 發(fā)生中作用機(jī)制的研究,可能為OSCC 的治療及預(yù)后評估提供新的分子靶點(diǎn)。